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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Para informações adicionais entre em contato com cenargen.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
25/02/2010 |
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Data da última atualização: |
20/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
FERNANDES, F. R. |
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Afiliação: |
Fernanda Rausch Fernandes, Universiade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Caracterização molecular e biológica de begomovirus de soja (Glycine max) e leiteiro (Euphorbia heterophylla) e resistência a vírus mediada por RNA interferente em plantas transgênicas de soja. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
2009 |
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Páginas: |
121p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Fitopatologia) - Universiadade Federal de Viçosa. Orientador: Francisco Murilo Zerbini Junior, co-orientador: Francisco José Lima Aragão, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, co-orientadora: Poliane Alfenas Zerbini. |
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Conteúdo: |
A caracterização molecular de begomovírus é um aspecto de crucial importância para a compreensão dos mecanismos de variabilidade destes fitopatógenos. A análise dos genomas permite a compreensão da contribuição dos mecanismos de mutação e recombinação para a evolução de novas espécies de geminivírus. No Brasil, poucos relatos de ocorrência de begomovírus na cultura da soja foram registrados até o presente. Amostras de folhas de soja com sintomas claros da infecção por vírus foram obtidas em campo de produção de soja em Santo Antônio de Goiás (GO) e analisadas quanto à presença de begomovírus. Após a confirmação da infecção viral via PCR, os genomas completos foram amplificados a partir das amostras infectadas por meio de RCA (rolling circle-amplification). Os clones obtidos foram seqüenciados e a análise das sequências demonstrou a infecção por três vírus distintos: Bean golden mosaic virus (BGMV), Sida micrantha mosaic virus (SiMMV) e Okra mottle virus (OMoV), este último relatado recentemente em plantas de quiabeiro e, pela primeira vez, em soja. Um isolado de begomovírus detectado em leiteiro (Euphorbia heterophy/la), uma planta daninha comumente associada à cultura da soja, também foi clonado e demonstrou-se tratar de um isolado de uma possível nova espécie, o Euphorbia mosaic Peru virus. O carlavírus Cowpea míld mottle vírus (CpMMV) é um fitopatógeno de ocorrência relativamente recente na cultura da soja, se apresentando como um possível risco para a cultura nas condições brasileiras. O silenciamento de RNA é um mecanismo natural de defesa de plantas contra vírus que tem sido largamente empregado na geração de plantas transgênicas resistentes. Neste trabalho, o silenciamento de RNA foi direcionado para uma sequência do gene que codifica a proteína capsidial (CP) do CpMMV, a fim de gerar plantas transgênicas de soja resistentes ao vírus. Também foram usadas, em outra construção, sequências dos genes Rep do SiMMV e CP do potyvírus Soybean mosaíc vírus (SMV) para a geração de plantas transgênicas de soja resistentes aos dois vírus simultaneamente. O vetor pCARLA contém um fragmento de DNA de 493 pares de bases (pb) do gene CP do CpMMV, e foi utilizado para a transformação de embriões de soja pela técnica de bombardeamento. O vetor pGEMPOTY contém um fragmento de 303 pb do gene CP do SMV e um fragmento de 404 pb do gene Rep do SiMMV. Plântulas oriundas do bombardeamento com o vetor pGEMPOTY foram regeneradas em meio seletivo, e aguardam a confirmação da presença do transgene por meio de PCR. Foram obtidas cinco plantas transformantes com o vetor pCARLA, as quais foram desafiadas com o vírus CpMMV. As plantas transformantes, assim como os controles, não demonstraram sintomas visíveis da infecção pelo vírus. A progênie das plantas transformantes oriundas do bombardeamento com o vetor pCARLA será desafiada com o CpMMV a fim de confirmar esses resultados e verificar a herança e expressão do transgene. MenosA caracterização molecular de begomovírus é um aspecto de crucial importância para a compreensão dos mecanismos de variabilidade destes fitopatógenos. A análise dos genomas permite a compreensão da contribuição dos mecanismos de mutação e recombinação para a evolução de novas espécies de geminivírus. No Brasil, poucos relatos de ocorrência de begomovírus na cultura da soja foram registrados até o presente. Amostras de folhas de soja com sintomas claros da infecção por vírus foram obtidas em campo de produção de soja em Santo Antônio de Goiás (GO) e analisadas quanto à presença de begomovírus. Após a confirmação da infecção viral via PCR, os genomas completos foram amplificados a partir das amostras infectadas por meio de RCA (rolling circle-amplification). Os clones obtidos foram seqüenciados e a análise das sequências demonstrou a infecção por três vírus distintos: Bean golden mosaic virus (BGMV), Sida micrantha mosaic virus (SiMMV) e Okra mottle virus (OMoV), este último relatado recentemente em plantas de quiabeiro e, pela primeira vez, em soja. Um isolado de begomovírus detectado em leiteiro (Euphorbia heterophy/la), uma planta daninha comumente associada à cultura da soja, também foi clonado e demonstrou-se tratar de um isolado de uma possível nova espécie, o Euphorbia mosaic Peru virus. O carlavírus Cowpea míld mottle vírus (CpMMV) é um fitopatógeno de ocorrência relativamente recente na cultura da soja, se apresentando como um possível risco para a cultura nas condiçõ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Doenças; Pragas; Virus de planta. |
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Thesagro: |
Resistência; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Begomovirus; Potyvirus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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500 $aTese (Doutorado em Fitopatologia) - Universiadade Federal de Viçosa. Orientador: Francisco Murilo Zerbini Junior, co-orientador: Francisco José Lima Aragão, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, co-orientadora: Poliane Alfenas Zerbini.
520 $aA caracterização molecular de begomovírus é um aspecto de crucial importância para a compreensão dos mecanismos de variabilidade destes fitopatógenos. A análise dos genomas permite a compreensão da contribuição dos mecanismos de mutação e recombinação para a evolução de novas espécies de geminivírus. No Brasil, poucos relatos de ocorrência de begomovírus na cultura da soja foram registrados até o presente. Amostras de folhas de soja com sintomas claros da infecção por vírus foram obtidas em campo de produção de soja em Santo Antônio de Goiás (GO) e analisadas quanto à presença de begomovírus. Após a confirmação da infecção viral via PCR, os genomas completos foram amplificados a partir das amostras infectadas por meio de RCA (rolling circle-amplification). Os clones obtidos foram seqüenciados e a análise das sequências demonstrou a infecção por três vírus distintos: Bean golden mosaic virus (BGMV), Sida micrantha mosaic virus (SiMMV) e Okra mottle virus (OMoV), este último relatado recentemente em plantas de quiabeiro e, pela primeira vez, em soja. Um isolado de begomovírus detectado em leiteiro (Euphorbia heterophy/la), uma planta daninha comumente associada à cultura da soja, também foi clonado e demonstrou-se tratar de um isolado de uma possível nova espécie, o Euphorbia mosaic Peru virus. O carlavírus Cowpea míld mottle vírus (CpMMV) é um fitopatógeno de ocorrência relativamente recente na cultura da soja, se apresentando como um possível risco para a cultura nas condições brasileiras. O silenciamento de RNA é um mecanismo natural de defesa de plantas contra vírus que tem sido largamente empregado na geração de plantas transgênicas resistentes. Neste trabalho, o silenciamento de RNA foi direcionado para uma sequência do gene que codifica a proteína capsidial (CP) do CpMMV, a fim de gerar plantas transgênicas de soja resistentes ao vírus. Também foram usadas, em outra construção, sequências dos genes Rep do SiMMV e CP do potyvírus Soybean mosaíc vírus (SMV) para a geração de plantas transgênicas de soja resistentes aos dois vírus simultaneamente. O vetor pCARLA contém um fragmento de DNA de 493 pares de bases (pb) do gene CP do CpMMV, e foi utilizado para a transformação de embriões de soja pela técnica de bombardeamento. O vetor pGEMPOTY contém um fragmento de 303 pb do gene CP do SMV e um fragmento de 404 pb do gene Rep do SiMMV. Plântulas oriundas do bombardeamento com o vetor pGEMPOTY foram regeneradas em meio seletivo, e aguardam a confirmação da presença do transgene por meio de PCR. Foram obtidas cinco plantas transformantes com o vetor pCARLA, as quais foram desafiadas com o vírus CpMMV. As plantas transformantes, assim como os controles, não demonstraram sintomas visíveis da infecção pelo vírus. A progênie das plantas transformantes oriundas do bombardeamento com o vetor pCARLA será desafiada com o CpMMV a fim de confirmar esses resultados e verificar a herança e expressão do transgene.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
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Volume |
Status |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
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Data corrente: |
14/10/2022 |
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Data da última atualização: |
14/10/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Nota Técnica/Nota Científica |
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Autoria: |
NAKASU, E. Y. T.; SILVA, G.; MONTES, S. M. N. M.; MELLO, A. F. S. |
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Afiliação: |
ERICH YUKIO TEMPEL NAKASU, CNPH; GABRIELA SILVA, AGÊNCIA PAULISTA DE TECNOLOGIA DOS AGRONEGÓCIOS; SÔNIA M. N. M. MONTES, AGÊNCIA PAULISTA DE TECNOLOGIA DOS AGRONEGÓCIOS; ALEXANDRE FURTADO SILVEIRA MELLO, CNPH. |
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Título: |
Virome analysis of sweetpotato in three Brazilian regions using high-throughput sequencing. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, Oct. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s40858-022-00532-x |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) is a highly nutritious food crop that suffers severe yield losses due to viral diseases. These are unintentionally spread mainly by vegetative propagation techniques commonly used by farmers. Virus indexing of vine cuttings (slips) coupled with tools specifically developed for identification of the main viruses is therefore essential to avoid disease outbreaks. In this work, we assessed the viral diversity in sweetpotatoes collected in some of the main producing areas in Brazil. The cuttings were grafted onto Ipomoea setosa Ker Gawl. prior to being subjected to ELISA for ten different viruses. Total DNA and RNA were also extracted from sweetpotato and I. setosa leaves for high-throughput sequencing (HTS) on an Illumina platform. Using this HTS strategy, nine viral species known to infect sweetpotatoes were identified, being seven of those species also identified in grafted I. setosa, two species identified exclusively in sweetpotato and two exclusively on I. setosa. From the ten different viruses tested by ELISA, six were identified in the samples evaluated. The generated data will be useful for virus indexing of sweetpotato as well as for virus resistance screening in sweetpotato breeding programs. |
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Thesagro: |
Batata Doce; Ipomoea Batatas; Variedade Resistente; Vírus. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
LEADER 01914naa a2200217 a 4500
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520 $aSweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) is a highly nutritious food crop that suffers severe yield losses due to viral diseases. These are unintentionally spread mainly by vegetative propagation techniques commonly used by farmers. Virus indexing of vine cuttings (slips) coupled with tools specifically developed for identification of the main viruses is therefore essential to avoid disease outbreaks. In this work, we assessed the viral diversity in sweetpotatoes collected in some of the main producing areas in Brazil. The cuttings were grafted onto Ipomoea setosa Ker Gawl. prior to being subjected to ELISA for ten different viruses. Total DNA and RNA were also extracted from sweetpotato and I. setosa leaves for high-throughput sequencing (HTS) on an Illumina platform. Using this HTS strategy, nine viral species known to infect sweetpotatoes were identified, being seven of those species also identified in grafted I. setosa, two species identified exclusively in sweetpotato and two exclusively on I. setosa. From the ten different viruses tested by ELISA, six were identified in the samples evaluated. The generated data will be useful for virus indexing of sweetpotato as well as for virus resistance screening in sweetpotato breeding programs.
650 $aBatata Doce
650 $aIpomoea Batatas
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Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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