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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
14/12/2010 |
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Data da última atualização: |
09/01/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
D'ALESSANDRO, C. P.; SILVA, J. J. da; LASTRA, C. C. L.; SOSA-GÓMEZ, D. R. |
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Afiliação: |
CELESTE P. D'ALESSANDRO, CEPAVE; JOSE JAIRO DA SILVA, CNPSO; CLAUDIA C. LOPEZ LASTRA, CEPAVE; DANIEL RICARDO SOSA GOMEZ, CNPSO. |
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Título: |
Caracterización molecular de aislamientos entomopatógenos de Isaria ssp. (Ascomycota: hypocreales) de Argentina y Brasil. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., Natal. [Anais...]. Natal: Emparn: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. Poster 690. |
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Idioma: |
Espanhol |
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Conteúdo: |
El hongo entomopatógeno Isaria spp. (Ascomycota: Hypocreales) es un agente de control natural de insectos plaga. La clasificación de las especies de Isaria generalmente se realiza por descripción de las características morfológicas, sin embargo, debido al carácter pleomórfico de algunas especies, su identificación se torna difícil. Así, es común observar variaciones morfológicas de las células conidiogénicas y sus conidios en función del medio de cultivo utilizado para su desarrollo. En este trabajo se identificó y caracterizó a 19 aislamientos de Isaria spp. provenientes de Argentina y Brasil mediante la amplificación del gen del factor de elongación alfa (EF1) y las regiones espaciadoras intergénicas (ITS1-ITS2). Las amplificaciones se llevaron a cabo con los primers EF1-983F y EF1-2218R para el factor de elongación, y los primers TW81 y AB28 para las regiones intergénicas. La reacción de PCR produjo un amplicón de 1100pb correspondiente al extremo 3’ del gen EF1 y un amplicón de 600pb de la región ribosomal de ITS1-ITS2. Estos fragmentos fueron digeridos con 6 enzimas de restricción obteniendo un patrón diferencial entre las especies de Isaria fumosorosea, Isaria farinosa e Isaria tenuipes con la enzima Hae III. Los aislamientos fúngicos sin poder identificar fueron comparados con el perfil de restricción de especies del género Isaria obtenidas de la colección de referencia mundial del USDA-ARS (ARSEF). Quince aislamientos provenientes de Trialeurodes vaporarioum (Hemiptera: Aleyrodidae) de la ciudad de La Plata, Buenos Aires, República Argentina, y 3 aislamientos provenientes de adultos de Bemisia tabaci biotipo B (Hemiptera: Aleyrodidae) de Brasilia, Brasil, produjeron un patrón de restricción de EF1 y ITS1-ITS2 idéntico a los aislamientos de referencia de I. fumosorosea. El patrón de restricción de un aislamiento proveniente de Himenopteros de la provincia de Buenos Aires, Argentina fue semejante al patrón de I. farinosa. La similaridad en el perfil de restricción de los genes EF1 y ITS1-ITS2 permitió caracterizar e identificar los 19 aislamientos con características morfológicas atípicas. MenosEl hongo entomopatógeno Isaria spp. (Ascomycota: Hypocreales) es un agente de control natural de insectos plaga. La clasificación de las especies de Isaria generalmente se realiza por descripción de las características morfológicas, sin embargo, debido al carácter pleomórfico de algunas especies, su identificación se torna difícil. Así, es común observar variaciones morfológicas de las células conidiogénicas y sus conidios en función del medio de cultivo utilizado para su desarrollo. En este trabajo se identificó y caracterizó a 19 aislamientos de Isaria spp. provenientes de Argentina y Brasil mediante la amplificación del gen del factor de elongación alfa (EF1) y las regiones espaciadoras intergénicas (ITS1-ITS2). Las amplificaciones se llevaron a cabo con los primers EF1-983F y EF1-2218R para el factor de elongación, y los primers TW81 y AB28 para las regiones intergénicas. La reacción de PCR produjo un amplicón de 1100pb correspondiente al extremo 3’ del gen EF1 y un amplicón de 600pb de la región ribosomal de ITS1-ITS2. Estos fragmentos fueron digeridos con 6 enzimas de restricción obteniendo un patrón diferencial entre las especies de Isaria fumosorosea, Isaria farinosa e Isaria tenuipes con la enzima Hae III. Los aislamientos fúngicos sin poder identificar fueron comparados con el perfil de restricción de especies del género Isaria obtenidas de la colección de referencia mundial del USDA-ARS (ARSEF). Quince aislamientos provenientes de Trialeurodes vaporarioum (Hemipt... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Controle biológico; Inseto. |
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Thesaurus Nal: |
Biological control; Insect control; Insects. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
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Data corrente: |
05/02/2024 |
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Data da última atualização: |
05/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 4 |
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Autoria: |
DUARTE, M. F.; ANDRADE, I. A. de; SILVA, J. M. F.; MELO, F. L. de; MACHADO, A. M.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T. |
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Afiliação: |
MACÁRIA FERREIRA DUARTE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; IKARO ALVES DE ANDRADE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; JOÃO MARCOS FAGUNDES SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; FERNANDO LUCAS DE MELO, UNIVERSIDADE DE BRASILIA; ANA MARIA MACHADO, COMPANHIA DE SANEAMENTO AMBIENTAL DO DF; ALICE KAZUKO INOUE NAGATA, CNPH; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
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Título: |
Metagenomic analyses of plant virus sequences in sewage water for plant viruses monitoring. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 48, p. 408-416, 2023. |
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DOI: |
10.1007/s40858-023-00575-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Frequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources. The potential use of sewage for a virus survey is discussed in this study. MenosFrequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources.... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
High-throughput sequencing. |
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Thesagro: |
Vírus. |
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Thesaurus NAL: |
Wastewater. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
LEADER 02294naa a2200241 a 4500
001 2161643
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100 1 $aDUARTE, M. F.
245 $aMetagenomic analyses of plant virus sequences in sewage water for plant viruses monitoring.$h[electronic resource]
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520 $aFrequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources. The potential use of sewage for a virus survey is discussed in this study.
650 $aWastewater
650 $aVírus
653 $aHigh-throughput sequencing
700 1 $aANDRADE, I. A. de
700 1 $aSILVA, J. M. F.
700 1 $aMELO, F. L. de
700 1 $aMACHADO, A. M.
700 1 $aINOUE-NAGATA, A. K.
700 1 $aNAGATA, T.
773 $tTropical Plant Pathology$gv. 48, p. 408-416, 2023.
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Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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