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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
09/12/2015 |
Data da última atualização: |
26/04/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. |
Afiliação: |
ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, CENARGEN; DANIELLE A. FARIA; DARIO GRATTAPAGLIA, CENARGEN. |
Título: |
A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
New Phytologist, v. 206, n. 4, p. 1527(14), 2015. |
Idioma: |
Inglês |
Palavras-Chave: |
Pooled resequencing; Single-nucleotide polymorphism (SNP) ascertainment bias; Trans-spe. |
Thesagro: |
Myrtaceae. |
Thesaurus Nal: |
population structure. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/135248/1/silva-junior2015.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
19/08/2013 |
Data da última atualização: |
15/05/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; REGITANO, L. C. de A.; SCHENKEL, F. S.; ALENCAR, M. M. de; MUNARI, D. P. |
Afiliação: |
MARCOS E. BUZANSKAS, UNESP; DANIELA A. GROSSI, University of Guelph; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FLAVIO S. SCHENKEL, University of Guelph; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; DANÍSIO P. MUNARI, UNESP. |
Título: |
Associações genômicas para perímetro escrotal ao desmame em bovinos da raça Canchim. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Belo Horizonte: SBMA, 2013. |
Páginas: |
3 p. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi estudar a associação entre polimorfismos de base única (SNP) com os valores genéticos do perímetro escrotal mensurado ao desmame (PED) em bovinos de corte de raça sintética. Neste estudo foram utilizados 285 animais da raça Canchim e 114 animais do grupo genético MA (utilizados na formação da raça Canchim), genotipados com o painel de alta densidade (786.799 SNPs). Após o controle de qualidade de informações (genótipos e fenótipos) restaram 672.778 SNPs e 392 animais. Foram observadas associações para PED nos cromossomos 20 e 28. Após a correção para múltiplos testes (?false discovery rate?) ao nível de 10%, 12 SNPs foram significativamente associados, ao longo do cromossomo, com PED. Novos e promissores genes associados com características reprodutivas foram identificados, como os genes SRD5A1 (steroid-5- alpha-reductase, alpha polypeptide 1), NSUN2 (NOP2/Sun domain family, member 2) e LOC100297493 (Odorant-binding protein-like). Estes genes podem ser destacados, pois os dois primeiros parecem atuar no crescimento corporal; desenvolvimento do sistema reprodutivo de machos devido à produção de hormônios andrógenos e espermatogênese; enquanto que o último atua no sistema olfativo. As regiões polimórficas identificadas apresentaram funções moleculares e processos biológicos que podem estar envolvidas na manutenção do organismo e no desempenho reprodutivo de machos. Genes associados à processos hormonais poderiam ser utilizados como genes candidatos para a melhoria do desempenho reprodutivo na raça Canchim. No entanto, é necessária a validação destes resultados em outra população de bovinos Canchim para confirmação das associações genômicas MenosO objetivo deste trabalho foi estudar a associação entre polimorfismos de base única (SNP) com os valores genéticos do perímetro escrotal mensurado ao desmame (PED) em bovinos de corte de raça sintética. Neste estudo foram utilizados 285 animais da raça Canchim e 114 animais do grupo genético MA (utilizados na formação da raça Canchim), genotipados com o painel de alta densidade (786.799 SNPs). Após o controle de qualidade de informações (genótipos e fenótipos) restaram 672.778 SNPs e 392 animais. Foram observadas associações para PED nos cromossomos 20 e 28. Após a correção para múltiplos testes (?false discovery rate?) ao nível de 10%, 12 SNPs foram significativamente associados, ao longo do cromossomo, com PED. Novos e promissores genes associados com características reprodutivas foram identificados, como os genes SRD5A1 (steroid-5- alpha-reductase, alpha polypeptide 1), NSUN2 (NOP2/Sun domain family, member 2) e LOC100297493 (Odorant-binding protein-like). Estes genes podem ser destacados, pois os dois primeiros parecem atuar no crescimento corporal; desenvolvimento do sistema reprodutivo de machos devido à produção de hormônios andrógenos e espermatogênese; enquanto que o último atua no sistema olfativo. As regiões polimórficas identificadas apresentaram funções moleculares e processos biológicos que podem estar envolvidas na manutenção do organismo e no desempenho reprodutivo de machos. Genes associados à processos hormonais poderiam ser utilizados como genes candidato... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Melhoramento genético; Seleção genômica. |
Thesagro: |
Gado de Corte. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/87944/1/PROCI-2013.00088.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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