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| Registros recuperados : 138 | |
| 121. |  | FREITAS, L. A. de; SAVEGNAGO, R. P.; GRUPIONI, N. V.; RAMOS, S. B.; STAFUZZA, N. B.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; SCHMIDT, G. S.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Reduced-rank estimation of genetic parameters for egg production traits and cluster analyses with predicted breeding values. Acta Agriculturae Scandinavica, Section A ? Animal Science, v. 68, n. 2, p. 81-86, 2019| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 122. | | STARLING, J. M. C.; RIBEIRO, A. R. B.; ALENCAR, M. M. de; MUNARI, D. P.; SAVEGNAGO, R. P.; FERNANDES JÚNIOR, J. A.; PAÇO, A. L.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A. Termorregulação de novilhas Senepol submetidas a um teste de tolerância ao calor na região Sudeste do Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda - anais. Salvador: SBZ: UFBA, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 123. | | ROSA, J. O.; VENTURINI, G. C.; CHUD, T. C. S.; PIRES, B. C.; BUZANSKAS, M. E.; STAFUZZA, N. B.; FURQUIM, G. R.; CRUZ, V. A. R. da; SCHMIDT, G. S.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; LIMA, V. F. M. H. de; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Bayesian inference of genetic parameters for reproductive and performance traits in white leghorn hens. Czech Journal of Animal Science, v. 63 n. 6, p. 230-236, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 124. | | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds. Plos One, v. 12, n. 3, p. 1-15, 2017. Artigo e0173954. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 125. | | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Single nucleotide variants and indels identified from whole-genome resequencing of Gyr, Girolando, and Holstein cattle breeds. Journal of Animal Science, v. 95, n. 4, p. 80-81, 2017. Edição dos abstracts do Breeding and Genetics Symposium, Baltimore, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 126. | | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Single nucleotide variants and indels identified from whole-genome resequencing of Gyr, Girolando, and Holstein cattle breeds. Journal of Animal Science, v. 95, p. 80-81, 2017. Suplemento 4, Resumo 164. Edição de Abstracts do ASAS-CSAS Annual Meeting and Trade Show, Baltimore, 2017. Na publicação: A. Zerlotini, M. V. G. B. da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 127. | | BUZANSKAS, M. E.; VENTURA, R. V.; CHUD, T. C. S.; BERNARDES, P. A.; SANTOS, D. J. de A.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MUDADU, M. de A.; ZANELLA, R.; SILVA, M. V. G. B.; LI, C.; SCHENKE, F. S.; MUNARI, D. P. Study on the introgression of beef breeds in canchim cattle using single nucleotide polymorphism markers. Plos one, v. 12, p. 1-16, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 128. | | CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CARVALHEIRO, R.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; MOKRY, F. B.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Strategies for genotype imputation in composite beef cattle. BMC Genomics, v. 16, n. 99, 2015. 10 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 129. | | BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C. O; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Genome-wide association for growth traits in Canchim beef cattle. Plos One, v. 9, n. 4, e94802 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 130. | | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R. S.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Genetic variants with potencial loss of function in Gyr, Girolando, and Guzerat cattle breeds by resequencing. Journal of Animal Science, v. 95, n. 4, p. 81, 2017. Edição dos abstracts do of Breeding and Genetics Symposium, Baltimore, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 131. | | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Genetic variants with potential loss of function in Gyr, Girolando, and Guzerat cattle breeds by resequencing. Journal of Animal Science, v. 95, p. 81, 2017. Suplemento 4, Resumo 165. Edição de Abstracts do ASAS-CSAS Annual Meeting and Trade Show, Baltimore, 2017. Na publicação: A. Zerlotini, M. V. G. B. da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 132. | | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R. S.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Genetiv variants with potencial loss of function in Gyr, Girolando, and Guzerat cattle breeds by resequencing. Journal of Animal Science, v. 95, n. suppl. 4, p. 81, 2017. Abstract of Breeding and Genetics Symposium, Baltimore, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 133. | | BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CHUD, T. C. S.; STAFUZZA, N. B.; ROLA, L. D.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; SILVA, M. V. G. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle. Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 8, p. 1-10, 2017. Artigo 67. Na publicação: Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 134. | | BUZANSKAS, M. E.; VENTURA, R. V.; CHUD, T. C. S.; SANTOS, D. J. A.; BERNARDES, P. A.; SILVA, T. B. R.; MUDADU, M. A.; REGITANO, L. C. A.; SILVA, M. V. G. B.; LI, C.; SCHENKEL, F. S.; ALENCAR, M. M.; MUNARI, D. P. Admixture analysis in Brazillian synthetic cattle. In: ADSA ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2015, Orlando. Proceedings... Orlando: ADSA: ASAS, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 135. | | PERIPOLLI, E.; METZGER, J.; LEMOS, M. V. A. de; STAFUZZA, N. B.; KLUSKA, S.; OLIVIERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; BERTON, M. P.; LOPES, F. B.; MUNARI, D. P.; LOBO, R. B.; MAGNABOSCO, C. de U.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; DENISE, S.; PEREIRA, A. S. C.; BALDI, F. Autozygosity islands and ROH patterns in Nellore lineages: evidence of selection for functionally important traits. BMC Genomics, v. 19, 680, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 136. | | WELLER, M. M. D. C. A.; FONSECA, I.; SBARDELLA, A. P.; PINTO, I. S. B.; VICCINI, L. F.; BRANDAO, H. de M.; GERN, J. C.; CARVALHO, W. A.; GUIMARÃES, A. S.; BRITO, M. A. V. P.; MUNARI, D. P.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F. Isolated perfused udder model fortranscriptome analysis in response to Streptococcus agalactiae. Journal of Dairy Research, v. 86, n. 3, p. 307-314, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 137. | | KLUSKA, S.; OLIVIERI, B. F.; BONAMY, M.; CHIAIA, H. L. J.; FEITOSA, F. L. B.; BERTON, M. P.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; TONUSSI, R. L.; LOBO, R. B.; MAGNABOSCO, C. de U.; CI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; PEREIRA, A. S. C.; MUNARI, D. P.; BEZERRA, L. A.; LOPES, F. B.; BALDI, F. Estimates of genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Nelore cattle using the single step genomic BLUP procedure. Livestock Science, v. 216, p. 203-209, October 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 138. | | MARCHESI, J. A. P.; BUZANSKAS, M. E.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; JOAQUIM, L. B.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; SBARDELLA, A. P.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.; LEDUR, M. C. Relationship of runs of homozygosity with adaptive and production traits in a paternal broiler line. Animal, v. 12, n. 6, p. 1126-1134, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| Registros recuperados : 138 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Suínos e Aves. Para informações adicionais entre em contato com cnpsa.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
17/10/2018 |
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Data da última atualização: |
18/10/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
MARCHESI, J. A. P.; BUZANSKAS, M. E.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; JOAQUIM, L. B.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; SBARDELLA, A. P.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
JORGE AUGUSTO PETROLI MARCHESI, UNESP/Jaboticabal; MARCOS ELI BUZANSKAS, UFPB; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; LETÍCIA BORGES JOAQUIM, UNESP/Jaboticabal; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; THAIS FERNANDA GODOY, ESALQ; ANA PAULA SBARDELLA, UNESP/Jaboticabal; ELSIO ANTONIO PEREIRA DE FIGUEIREDO, CNPSA; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ; DANÍSIO PRADO MUNARI, UNESP/Jaboticabal; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Relationship of runs of homozygosity with adaptive and production traits in a paternal broiler line. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal, v. 12, n. 6, p. 1126-1134, 2018. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Genomic regions under high selective pressure present specific runs of homozygosity (ROH), which provide valuable information on the genetic mechanisms underlying the adaptation to environment imposed challenges. In broiler chickens, the adaptation to conventional production systems in tropical environments lead the animals with favorable genotypes to be naturally selected, increasing the frequency of these alleles in the next generations. In this study, ~1400 chickens from a paternal broiler line were genotyped with the 600 K Affymetrix® Axiom® high-density (HD) genotyping array for estimation of linkage disequilibrium (LD), effective population size (Ne), inbreeding and ROH. The average LD between adjacent single nucleotide polymorphisms (SNPs) in all autosomes was 0.37, and the LD decay was higher in microchromosomes followed by intermediate and macrochromosomes. The Ne of the ancestral population was high and declined over time maintaining a sufficient number of animals to keep the inbreeding coefficient of this population at low levels. The ROH analysis revealed genomic regions that harbor genes associated with homeostasis maintenance and immune system mechanisms, which may have been selected in response to heat stress. Our results give a comprehensive insight into the relationship between shared ROH regions and putative regions related to survival and production traits in a paternal broiler line selected for over 20 years. These findings contribute to the understanding of the effects of environmental and artificial selection in shaping the distribution of functional variants in the chicken genome. Resumo: As regiões genômicas sob alta pressão seletiva apresentam corridas específicas de homozigose (ROH), que fornecem informações valiosas sobre os mecanismos genéticos subjacentes à adaptação aos desafios impostos pelo ambiente. Em frangos de corte, a adaptação a sistemas convencionais de produção em ambientes tropicais leva os animais com genótipos favoráveis ??a serem naturalmente selecionados, aumentando a freqüência desses alelos nas próximas gerações. Neste estudo, ~ 1400 galinhas de uma linhagem de frangos de corte foram genotipadas com o arranjo de genótipos de alta densidade (HD) Affymetrix® Axiom® 600 K para estimativa do desequilíbrio de ligação (LD), tamanho efetivo da população (Ne), endogamia e ROH. A LD média entre os polimorfismos de nucleotídeo único adjacentes (SNPs) em todos os autossomos foi de 0,37, e o decaimento LD foi maior nos microcromossomos, seguido por intermediários e macrocromossomos. O Ne da população ancestral era alto e declinou com o tempo mantendo um número suficiente de animais para manter o coeficiente de endogamia desta população em níveis baixos. A análise da ROH revelou regiões genômicas que abrigam genes associados à manutenção da homeostase e mecanismos do sistema imunológico, que podem ter sido selecionados em resposta ao estresse térmico. Nossos resultados fornecem uma visão abrangente sobre a relação entre regiões ROH compartilhadas e regiões putativas relacionadas a características de sobrevivência e produção em uma linha de frangos de corte paterna selecionada por mais de 20 anos. Estes resultados contribuem para a compreensão dos efeitos da seleção ambiental e artificial na formação da distribuição de variantes funcionais no genoma da galinha. MenosAbstract: Genomic regions under high selective pressure present specific runs of homozygosity (ROH), which provide valuable information on the genetic mechanisms underlying the adaptation to environment imposed challenges. In broiler chickens, the adaptation to conventional production systems in tropical environments lead the animals with favorable genotypes to be naturally selected, increasing the frequency of these alleles in the next generations. In this study, ~1400 chickens from a paternal broiler line were genotyped with the 600 K Affymetrix® Axiom® high-density (HD) genotyping array for estimation of linkage disequilibrium (LD), effective population size (Ne), inbreeding and ROH. The average LD between adjacent single nucleotide polymorphisms (SNPs) in all autosomes was 0.37, and the LD decay was higher in microchromosomes followed by intermediate and macrochromosomes. The Ne of the ancestral population was high and declined over time maintaining a sufficient number of animals to keep the inbreeding coefficient of this population at low levels. The ROH analysis revealed genomic regions that harbor genes associated with homeostasis maintenance and immune system mechanisms, which may have been selected in response to heat stress. Our results give a comprehensive insight into the relationship between shared ROH regions and putative regions related to survival and production traits in a paternal broiler line selected for over 20 years. These findings contribute to the und... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Frango de Corte; Melhoramento Genético Animal. |
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Thesaurus NAL: |
Animal breeding; Artificial selection; Breeding and Genetic Improvement; Broiler chickens; Gallus gallus; Genomics; Inbreeding; Natural selection; Oxidative stress. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
LEADER 04587naa a2200397 a 4500
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520 $aAbstract: Genomic regions under high selective pressure present specific runs of homozygosity (ROH), which provide valuable information on the genetic mechanisms underlying the adaptation to environment imposed challenges. In broiler chickens, the adaptation to conventional production systems in tropical environments lead the animals with favorable genotypes to be naturally selected, increasing the frequency of these alleles in the next generations. In this study, ~1400 chickens from a paternal broiler line were genotyped with the 600 K Affymetrix® Axiom® high-density (HD) genotyping array for estimation of linkage disequilibrium (LD), effective population size (Ne), inbreeding and ROH. The average LD between adjacent single nucleotide polymorphisms (SNPs) in all autosomes was 0.37, and the LD decay was higher in microchromosomes followed by intermediate and macrochromosomes. The Ne of the ancestral population was high and declined over time maintaining a sufficient number of animals to keep the inbreeding coefficient of this population at low levels. The ROH analysis revealed genomic regions that harbor genes associated with homeostasis maintenance and immune system mechanisms, which may have been selected in response to heat stress. Our results give a comprehensive insight into the relationship between shared ROH regions and putative regions related to survival and production traits in a paternal broiler line selected for over 20 years. These findings contribute to the understanding of the effects of environmental and artificial selection in shaping the distribution of functional variants in the chicken genome. Resumo: As regiões genômicas sob alta pressão seletiva apresentam corridas específicas de homozigose (ROH), que fornecem informações valiosas sobre os mecanismos genéticos subjacentes à adaptação aos desafios impostos pelo ambiente. Em frangos de corte, a adaptação a sistemas convencionais de produção em ambientes tropicais leva os animais com genótipos favoráveis ??a serem naturalmente selecionados, aumentando a freqüência desses alelos nas próximas gerações. Neste estudo, ~ 1400 galinhas de uma linhagem de frangos de corte foram genotipadas com o arranjo de genótipos de alta densidade (HD) Affymetrix® Axiom® 600 K para estimativa do desequilíbrio de ligação (LD), tamanho efetivo da população (Ne), endogamia e ROH. A LD média entre os polimorfismos de nucleotídeo único adjacentes (SNPs) em todos os autossomos foi de 0,37, e o decaimento LD foi maior nos microcromossomos, seguido por intermediários e macrocromossomos. O Ne da população ancestral era alto e declinou com o tempo mantendo um número suficiente de animais para manter o coeficiente de endogamia desta população em níveis baixos. A análise da ROH revelou regiões genômicas que abrigam genes associados à manutenção da homeostase e mecanismos do sistema imunológico, que podem ter sido selecionados em resposta ao estresse térmico. Nossos resultados fornecem uma visão abrangente sobre a relação entre regiões ROH compartilhadas e regiões putativas relacionadas a características de sobrevivência e produção em uma linha de frangos de corte paterna selecionada por mais de 20 anos. Estes resultados contribuem para a compreensão dos efeitos da seleção ambiental e artificial na formação da distribuição de variantes funcionais no genoma da galinha.
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700 1 $aBUZANSKAS, M. E.
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