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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
20/10/2016 |
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Data da última atualização: |
01/04/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, V. H. da; REGITANO, L. C. de A.; GEISTLINGER, L.; PÉRTILLE, F.; GIACHETTO, P. F.; BRASSALOTI, R. A.; MOROSINI, N. S.; ZIMMER, R.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
VINICIUS HENRIQUE DA SILVA, USP/ESALQ; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; LUDWIG GEISTLINGER, Ludwig-Maximilians- Universität München; FÁBIO PÉRTILLE, USP/ESALQ; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; RICARDO AUGUSTO BRASSALOTI, USP/ESALQ; NATÁLIA SILVA MOROSINI, USP/ESALQ; RALF ZIMMER, Ludwig-Maximilians- Universität München; LUIZ LEHMANN COUTINHO, USP/ESALQ. |
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Título: |
Genome-wide detection of CNVs and their association with meat tenderness in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, june 2016. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0157711 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Brazil is one of the largest beef producers and exporters in the world with the Nelore breed representing the vast majority of Brazilian cattle (Bos taurus indicus). Despite the great adaptability of the Nelore breed to tropical climate, meat tenderness (MT) remains to be improved. Several factors including genetic composition can influence MT. In this article, we report a genome-wide analysis of copy number variation (CNV) inferred from Illumina1 High Density SNP-chip data for a Nelore population of 723 males. We detected >2,600 CNV regions (CNVRs) representing 6.5% of the genome. Comparing our results with previous studies revealed an overlap in 1400 CNVRs (>50%). A total of 1,155 CNVRs (43.6%) overlapped 2,750 genes. They were enriched for processes involving guanosine triphosphate (GTP), previously reported to influence skeletal muscle physiology and morphology. Nelore CNVRs also overlapped QTLs for MT reported in other breeds (8.9%, 236 CNVRs) and from a previous study with this population (4.1%, 109 CNVRs). Two CNVRs were also proximal to glutathione metabolism genes that were previously associated with MT. Genome-wide association study of CN state with estimated breeding values derived from meat shear force identified 6 regions, including a region on BTA3 that contains genes of the cAMP and cGMP pathway. Ten CNVRs that overlapped regions associated with MT were successfully validated by qPCR. Our results represent the first comprehensive CNV study in Bos taurus indicus cattle and identify regions in which copy number changes are potentially of importance for the MT phenotype. MenosBrazil is one of the largest beef producers and exporters in the world with the Nelore breed representing the vast majority of Brazilian cattle (Bos taurus indicus). Despite the great adaptability of the Nelore breed to tropical climate, meat tenderness (MT) remains to be improved. Several factors including genetic composition can influence MT. In this article, we report a genome-wide analysis of copy number variation (CNV) inferred from Illumina1 High Density SNP-chip data for a Nelore population of 723 males. We detected >2,600 CNV regions (CNVRs) representing 6.5% of the genome. Comparing our results with previous studies revealed an overlap in 1400 CNVRs (>50%). A total of 1,155 CNVRs (43.6%) overlapped 2,750 genes. They were enriched for processes involving guanosine triphosphate (GTP), previously reported to influence skeletal muscle physiology and morphology. Nelore CNVRs also overlapped QTLs for MT reported in other breeds (8.9%, 236 CNVRs) and from a previous study with this population (4.1%, 109 CNVRs). Two CNVRs were also proximal to glutathione metabolism genes that were previously associated with MT. Genome-wide association study of CN state with estimated breeding values derived from meat shear force identified 6 regions, including a region on BTA3 that contains genes of the cAMP and cGMP pathway. Ten CNVRs that overlapped regions associated with MT were successfully validated by qPCR. Our results represent the first comprehensive CNV study in Bos taurus indicu... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
CNV; Genômica; Maciez da carne; Nelore. |
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Thesagro: |
Gado Nelore. |
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Thesaurus Nal: |
Meat tenderness. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/149047/1/pone.0157711.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
15/07/2009 |
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Data da última atualização: |
08/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
MASCIOLI, A. dos S.; MOURA NETO, J. B. de; PEREIRA, L. G. R.; YAMAMOTO, S. M.; ARAGÃO. A. S. L. de; CHIZZOTTI, M. L.; SANTOS, G. A. |
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Afiliação: |
ARTHUR DOS SANTOS MASCIOLI, UNIVASF; JOÃO BANDEIRA DE MOURA NETO, UNIVASF; LUIZ GUSTAVO RIBEIRO PEREIRA, CPATSA; SANDRA MARI YAMAMOTO, UNIVASF; ALEX SANTOS LUSTOSA DE ARAGÃO, UNIVASF; MÁRIO LUIZ CHIZZOTTI, UNIVASF; GENILSON AMARAL SANTOS, UNIVASF. |
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Título: |
Efeito do farelo do fruto da manga na composição tecidual do lombo de ovinos Santa Inês. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Avaliaram-se as medidas do músculo Longissimus dorsi e a composição tecidual do corte do lombo de 24 ovinos Santa Inês, castrados, mantidos em baias individuais e alimentados com quatro níveis de substituição do milho grão pelo farelo do fruto da manga (0; 33; 66 ou 100%), utilizando-se como volumoso o capim elefante (Pennisetum purpureum Schum.) in natura, na proporção de 40%. O delineamento utilizado foi inteiramente casualizado com quatro tratamentos e seis repetições. Não foram observadas diferenças significativas (P>0,05) para a composição tecidual do lombo, assim como para a área de olho de lombo e espessuras máxima e mínima sob o perfil do músculo Longissimus dorsi. As proporções de músculo, gordura e osso do corte do lombo não foram diferentes (P>0,05) entre os tratamentos, apresentando médias de 54,56%; 23,08% e 18,19 %, respectivamente. As médias encontradas para área de olho de lombo (11,52 cm2) e espessuras mínima (0,13 cm) e máxima (1,12 cm) de gordura do músculo L. dorsi não foram influenciadas pelas diferentes dietas. A substituição do milho pelo farelo do fruto de manga, nos níveis estudados, não alterou as características quantitativas do lombo de cordeiros Santa Inês, podendo ser utilizada como alimento alternativo na produção de ovinos em confinamento |
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Palavras-Chave: |
Raça Santa Inês. |
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Thesagro: |
Alimento Alternativo; Confinamento; Cordeiro; Músculo; Ovino. |
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Thesaurus NAL: |
Feedlots; Lambs; Muscles. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CPATSA-2009-09/40977/1/OPB2338.pdf
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Marc: |
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100 1 $aMASCIOLI, A. dos S.
245 $aEfeito do farelo do fruto da manga na composição tecidual do lombo de ovinos Santa Inês.
260 $aIn: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM$c2009
300 $c1 CD-ROM.
520 $aAvaliaram-se as medidas do músculo Longissimus dorsi e a composição tecidual do corte do lombo de 24 ovinos Santa Inês, castrados, mantidos em baias individuais e alimentados com quatro níveis de substituição do milho grão pelo farelo do fruto da manga (0; 33; 66 ou 100%), utilizando-se como volumoso o capim elefante (Pennisetum purpureum Schum.) in natura, na proporção de 40%. O delineamento utilizado foi inteiramente casualizado com quatro tratamentos e seis repetições. Não foram observadas diferenças significativas (P>0,05) para a composição tecidual do lombo, assim como para a área de olho de lombo e espessuras máxima e mínima sob o perfil do músculo Longissimus dorsi. As proporções de músculo, gordura e osso do corte do lombo não foram diferentes (P>0,05) entre os tratamentos, apresentando médias de 54,56%; 23,08% e 18,19 %, respectivamente. As médias encontradas para área de olho de lombo (11,52 cm2) e espessuras mínima (0,13 cm) e máxima (1,12 cm) de gordura do músculo L. dorsi não foram influenciadas pelas diferentes dietas. A substituição do milho pelo farelo do fruto de manga, nos níveis estudados, não alterou as características quantitativas do lombo de cordeiros Santa Inês, podendo ser utilizada como alimento alternativo na produção de ovinos em confinamento
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700 1 $aCHIZZOTTI, M. L.
700 1 $aSANTOS, G. A.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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