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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pantanal; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
09/05/2016 |
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Data da última atualização: |
10/05/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HADI, S. I. I. A; SANTANA, H.; BRUNALE, P. P. M.; GOMES, T. G.; OLIVEIRA, M. D. de; MATTHIENSEN, A.; OLIVEIRA, M. E. C.; SILVA, F. C. P.; BRASIL, B. dos S. A. F. |
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Afiliação: |
SÁMED, I. I. A. HADI, UFT; HUGO SANTANA, UFBA; PATRÍCIA P. M. BRUNALE, UnB; TAÍSA G. GOMES, UFT; MARCIA DIVINA DE OLIVEIRA, CPAP; ALEXANDRE MATTHIENSEN, CNPSA; MARCOS ENE CHAVES OLIVEIRA, CPATU; FLÁVIA C. P. SILVA; BRUNO DOS SANTOS ALVES FIGUEIREDO B, CNPAE. |
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Título: |
DNA barcoding green microalgae isolated from neotropical inland waters. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 11, n. 2, Feb. 2016. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0149284 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study evaluated the feasibility of using the Ribulose Bisphosphate Carboxylase Large subunit gene (rbcL) and the Internal Transcribed Spacers 1 and 2 of the nuclear rDNA (nuITS1 and nuITS2) markers for identifying a very diverse, albeit poorly known group, of green microalgae from neotropical inland waters. Fifty-one freshwater green microalgae strains isolated from Brazil, the largest biodiversity reservoir in the neotropics, were submitted to DNA barcoding. Currently available universal primers for ITS1-5.8S-ITS2 region amplification were sufficient to successfully amplify and sequence 47 (92%) of the samples. On the other hand, new sets of primers had to be designed for rbcL, which allowed 96% of the samples to be sequenced. Thirty-five percent of the strains could be unambiguously identified to the species level based either on nuITS1 or nuITS2 sequences? using barcode gap calculations. nuITS2 Compensatory Base Change (CBC) and ITS1-5.8S-ITS2 region phylogenetic analysis, together with morphological inspection, confirmed the identification accuracy. In contrast, only 6% of the strains could be assigned to the correct species based solely on rbcL sequences. In conclusion, the data presented here indicates that either nuITS1 or nuITS2 are useful markers for DNA barcoding of freshwater green microalgae, with advantage for nuITS2 due to the larger availability of analytical tools and reference barcodes deposited at databases for this marker. |
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Palavras-Chave: |
Análise molecular; Identificação morfológica; Microalgas; Sequenciamento genético. |
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Thesagro: |
Alga. |
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Thesaurus Nal: |
Algae; Microalgae. |
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Categoria do assunto: |
--
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra
V Taxonomia de Organismos |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/176636/1/journal.pone.0149284.PDF
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152647/1/journal.pone.0149284.PDF
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Marc: |
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700 1 $aOLIVEIRA, M. E. C.
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700 1 $aBRASIL, B. dos S. A. F.
773 $tPlos One$gv. 11, n. 2, Feb. 2016.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 1. |  | FREIRE, R. M. M.; FARIAS, S. R. de; NARAIN, N.; MOREIRA, R. de A.; SANTOS, R. C. dos. Aminoacido e acidos graxos em genotipos de amendoim do grupo virginia. Revista de Oleaginosas e Fibrosas, Campina Grande, v.5, n.1, p.273-281,Jan-Abr. 2002.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 3. | | FREIRE, R. M. M.; NARAIN, N.; MOREIRA, R. de A.; SANTOS, R. C. dos; FARIAS, S. R. de; QUEIROZ, M. do S. R. de. Avaliacao proteica da farinha desengordurada de genotipos de amendoim. Revista Oleaginosa e Fibrasas, v.4, n.3, p.193-199, ago-dez, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 4. | | AGUIAR, R. P. de; MIRANDA, M. R. A. de; OLIVEIRA, L. de S.; MOSCA, J. L.; MOREIRA, R. de A.; ENÉAS FILHO, J. Conservação pós-colheita e atividade de enzimas antioxidantes de mangas 'tommy atkins' recobertas por película de galactomana. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL AGRICULTURE, 54., 2008, Vitória. Livro de resumos. Vitória: Incaper, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 5. | | MENEZES, R. de C. A. A.; VIEIRA, L. da S.; CAVALCANTE, A. C. R.; CAVADA, B. S.; OLIVEIRA, J. T. A.; MOREIRA, R. de A. "In vitro" preliminary studies of ovicidal effects of leaves and seeds from four legumes upon Haemonchus contortus of goats. In: CONGRESSO MUNDIAL DE VETERINÁRIA, 24., 1991, Rio de Janeiro. Resumos... Rio de Janeiro: Sadia: FINEP: CNPq, 1991. p. 57. Ref. 3.1.2.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | ALEXANDRE, J. DE B.; BARROSO, T. L. C. T.; OLIVEIRA, M. DE A.; MENDES, F. R. DA S.; COSTA, J. M. C. DA; MOREIRA, R. DE A.; FURTADO, R. F. Cross-linked coacervates of cashew gum and gelatin in the encapsulation of pequi oil. Ciência Rural, Santa Maria, v. 49, n. 12, artigo e20190079, 12 p. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 7. | | MENDES, L. G.; MENDES, F. R. da S.; FURTADO, R. F.; BASTOS, M. do S. R.; OLIVEIRA, M. de A.; COSTA, J. M. C. da; CHENG, H. N.; BISWAS, A.; MOREIRA, R. de A. Cashew gum-galactomannan blends for rosemary essential oil encapsulation. In: BARBOSA NETO, O.; PRAXEDES, M. F. da S.; SILVA, P. F. da; CARVALHO JÚNIOR, F. F. de (org.). Ciências Biológicas e da Saúde: integrando saberes em diferentes contextos. São Paulo: Científica Digital, 2023. cap. 5. v. 3 p. 73-88. Autoria: (Huain [i.e. Huai] Nan Cheng).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 8. | | HOLANDA, D. K. R.; WURLITZER, N. J.; DIONISIO, A. P.; BARROS, A. R. C.; MOREIRA, R. DE A.; SOUSA, P. H. M. DE; BRITO, E. S. de; RIBEIRO, P. R. V.; COSTA, A. M.; IUNES, M. F. Garlic passion fruit (Passiflora tenuifila Killip): assessment of eventual acute toxicity, anxiolytic, sedative, and anticonvulsant effects using in vivo assays. Food Research International, Amsterdam, v. 128, artigo 108813, 8 p. Feb. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 9. | | SILVA, V. P. A. da; FURTADO, R. F.; CARVALHO, J. B. de; PIMENTA, G. R.; ALVES, C. R.; MOREIRA, R. de A.; MOREIRA, A. C. de O. M.; DUTRA, R. A. F. Purificação de lectinas de torta de mamona utilizando cromatografia de afinidade de matrizes de goma de guar e xiloglucana. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 10. | | LOVERA, M.; CASTRO, G. M. C. D.; PIRES, N. da R.; BASTOS, M. do S. R.; HOLANDA-ARAÚJO, M. L.; LAURENTIN, A.; MOREIRA, R. de A.; OLIVEIRA, H. D. de. Pyrodextrinization of yam (Dioscorea sp.) starch isolated from tubers grown in Brazil and physicochemical characterization of yellow pyrodextrins. Carbohydrate Polymers, v. 242, art. no. 116382, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 11. | | HOLANDA, D. K. R.; WURLITZER, N. J.; DIONISIO, A. P.; CAMPOS, A. R.; BRITO, E. S. de; SILVA, L. M. A. e; RIBEIRO, P. R. V.; COSTA, A. M.; SOUZA, P. H. M.; LIMA. F. A. V.; MOREIRA, R. de A. Passiflora tenuifila Killip: Assessment of chemical composition by 1H NMR and UPLC-ESI-Q-TOF-MSE and its bioactive properties in a rotenone-induced rat model of Parkinson's disease. Journal of Functional Foods, v. 62, art. 103529, 2019. 9 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Cerrados. |
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| 12. | | HOLANDA, D. K. R.; WURLITZER, N. J.; DIONISIO, A. P.; BARROS, A. R. C.; BRITO, E. S. de; SILVA, L. M. A. e; RIBEIRO, P. R. V.; COSTA, A. M.; SOUZA, P. H. M. DE; LIMA, F. A. V.; MOREIRA, R. DE A. Passiflora tenuifila Killip: assessment of chemical composition by ¹H NMR and UPLC-ESI-Q-TOF-MSe and its bioactive properties in a rotenone-induced rat model of Parkinson's disease. Journal of Functional Foods, Amsterdam, v. 62, artigo 103529, p. 1-9, Nov. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 13. | | BEZERRA JUNIOR, R. Q.; ELOY, A. M. X.; FURTADO, J. R.; PINHEIRO, R. R.; ANDRIOLI, A.; MORENO, F. B.; LOBO, M. D. P.; MONTEIRO-MOREIRA, A. C. O.; MOREIRA, R. de A.; PINTO, T. M. F.; TEIXEIRA, M. F. da S. A panel of protein candidates for comprehensive study of Caprine Arthritis Encephalitis (CAE) infection. Tropical Animal Health and Production, v. 50, n. 1, n. 7, p. 43-48, Oct. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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