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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
26/08/2002 |
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Data da última atualização: |
26/08/2002 |
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Autoria: |
NASCIMENTO, A. C. |
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Título: |
Avaliacao da umidade no perfil do solo a partir de sensoriamento remoto. |
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Ano de publicação: |
2002 |
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Fonte/Imprenta: |
Brasilia: UnB, 2002. |
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Páginas: |
91 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese Mestrado. |
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Conteúdo: |
O teor de umidade no solo e um dos fatores determinantes de alguns processos hidrologicos em uma bacia hidrografica, como por exemplo na separacao entre as parcelas da precipitacao que infiltra e a que escoa superficialmente, bem como, e um dado imprescindivel para a agricultura. No entanto, dependendo das dimensoes de aplicacao, os processos tradicionais de obtencao de dados de umidade in situ podem ser lentos e dispendiosos.
Na literatura especializada ha relatos de algumas pesquisas, em que se utilizou a resposta espectral da superficie do solo, no intervalo de 0,40 a 2,50 gm, obtida por espectrorradiometria de campo ou por imagens de satelites, para estimativa da umidade nas camadas subsuperficiais do mesmo, incluindo os primeiros 50 cm. Porem, como as metodologias empregadas nessas pesquisas previam a variacao da umidade em todo o perfil do solo, nao se podia inferir categoricamente a existencia de correlacao efetiva entre as mudancas no teor de umidade a uma determinada profundidade e a resposta espectral superficial.
Dessa forma, neste trabalho foi utilizada uma metodologia para avaliacao da sensibilidade do fator de reflectancia bidirecional (FRB) as mudanças no teor de umidade nas camadas subsuperficiais do solo, correspondendo aos primeiros 50 cm, sem a alteracao da umidade do solo proximo a superficie. A pesquisa foi desenvolvida no Laboratorio de Hidraulica da UnB, por meio da montagem de duas colunas de solos, em que se aumentaram os teores de umidade no solo por meio da elevacao da frente de saturacao, no sentido das camadas inferiores ate a superficie. Os dados espectrais foram coletados utilizando o espectrorradiometro GER 2600.
Os resultados obtidos mostram que a espectroscopia de reflectancia nao e sensivel as alteracoes da umidade no perfil do solo, porque nao foram constatadas alteracoes notaveis no comportamento espectral em resposta a elevacao da frente de saturacao nas colunas de solo. As mudancas no espectro ocorreram apenas quando a frente de umedecimento alcancou a superficie. MenosO teor de umidade no solo e um dos fatores determinantes de alguns processos hidrologicos em uma bacia hidrografica, como por exemplo na separacao entre as parcelas da precipitacao que infiltra e a que escoa superficialmente, bem como, e um dado imprescindivel para a agricultura. No entanto, dependendo das dimensoes de aplicacao, os processos tradicionais de obtencao de dados de umidade in situ podem ser lentos e dispendiosos.
Na literatura especializada ha relatos de algumas pesquisas, em que se utilizou a resposta espectral da superficie do solo, no intervalo de 0,40 a 2,50 gm, obtida por espectrorradiometria de campo ou por imagens de satelites, para estimativa da umidade nas camadas subsuperficiais do mesmo, incluindo os primeiros 50 cm. Porem, como as metodologias empregadas nessas pesquisas previam a variacao da umidade em todo o perfil do solo, nao se podia inferir categoricamente a existencia de correlacao efetiva entre as mudancas no teor de umidade a uma determinada profundidade e a resposta espectral superficial.
Dessa forma, neste trabalho foi utilizada uma metodologia para avaliacao da sensibilidade do fator de reflectancia bidirecional (FRB) as mudanças no teor de umidade nas camadas subsuperficiais do solo, correspondendo aos primeiros 50 cm, sem a alteracao da umidade do solo proximo a superficie. A pesquisa foi desenvolvida no Laboratorio de Hidraulica da UnB, por meio da montagem de duas colunas de solos, em que se aumentaram os teores de umidade no sol... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Soil testing. |
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Thesagro: |
Análise do Solo; Cerrado; Sensoriamento Remoto; Solo; Umidade do Solo. |
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Thesaurus Nal: |
remote sensing; soil; soil water content. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
13/12/2023 |
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Data da última atualização: |
18/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
MARTINS, F. B.; AONO, A. H.; MORAES, A. da C. L.; FERREIRA, R. C. U.; VILELA, M. de M.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; RODRIGUES-MOTTA, M.; SIMEÃO, R. M.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
FELIPE BITENCOURT MARTINS, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ALEXANDRE HILD AONO, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ALINE DA COSTA LIMA MORAES, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; REBECCA CAROLINE ULBRICHT FERREIRA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; MARIANE DE MENDONCA VILELA, CNPGC; MARCO AURÉLIO CALDAS DE PINHO PESSO, CPAC; MARIANA RODRIGUES-MOTTA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ROSANGELA MARIA SIMEAO, CNPGC; ANETE PEREIRA DE SOUZA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS. |
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Título: |
Genome-wide family prediction unveils molecular mechanisms underlying the regulation of agronomic traits in Urochloa ruziziensis. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 14, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1303417 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Na publicação: Marco Pessoa-Filho. |
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Conteúdo: |
Tropical forage grasses, particularly those belonging to the Urochloa genus, play a crucial role in cattle production and serve as the main food source for animals in tropical and subtropical regions. The majority of these species are apomictic and tetraploid, highlighting the significance of U. ruziziensis, a sexual diploid species that can be tetraploidized for use in interspecific crosses with apomictic species. As a means to support breeding programs, our study investigates the feasibility of genome-wide family prediction in U. ruziziensis families to predict agronomic traits. Fifty half-sibling families were assessed for green matter yield, dry matter yield, regrowth capacity, leaf dry matter, and stem dry matter across different clippings established in contrasting seasons with varying available water capacity. Genotyping was performed using a genotyping-by-sequencing approach based on DNA samples from family pools. In addition to conventional genomic prediction methods, machine learning and feature selection algorithms were employed to reduce the necessary number of markers for prediction and enhance predictive accuracy across phenotypes. To explore the regulation of agronomic traits, our study evaluated the significance of selected markers for prediction using a tree-based approach, potentially linking these regions to quantitative trait loci (QTLs). In a multiomic approach, genes from the species transcriptome were mapped and correlated to those markers. A gene coexpression network was modeled with gene expression estimates from a diverse set of U. ruziziensis genotypes, enabling a comprehensive investigation of molecular mechanisms associated with these regions. The heritabilities of the evaluated traits ranged from 0.44 to 0.92. A total of 28,106 filtered SNPs were used to predict phenotypic measurements, achieving a mean predictive ability of 0.762. By employing feature selection techniques, we could reduce the dimensionality of SNP datasets, revealing potential genotype-phenotype associations. The functional annotation of genes near these markers revealed associations with auxin transport and biosynthesis of lignin, flavonol, and folic acid. Further exploration with the gene coexpression network uncovered associations with DNA metabolism, stress response, and circadian rhythm. These genes and regions represent important targets for expanding our understanding of the metabolic regulation of agronomic traits and offer valuable insights applicable to species breeding. Our work represents an innovative contribution to molecular breeding techniques for tropical forages, presenting a viable marker-assisted breeding approach and identifying target regions for future molecular studies on these agronomic traits. MenosTropical forage grasses, particularly those belonging to the Urochloa genus, play a crucial role in cattle production and serve as the main food source for animals in tropical and subtropical regions. The majority of these species are apomictic and tetraploid, highlighting the significance of U. ruziziensis, a sexual diploid species that can be tetraploidized for use in interspecific crosses with apomictic species. As a means to support breeding programs, our study investigates the feasibility of genome-wide family prediction in U. ruziziensis families to predict agronomic traits. Fifty half-sibling families were assessed for green matter yield, dry matter yield, regrowth capacity, leaf dry matter, and stem dry matter across different clippings established in contrasting seasons with varying available water capacity. Genotyping was performed using a genotyping-by-sequencing approach based on DNA samples from family pools. In addition to conventional genomic prediction methods, machine learning and feature selection algorithms were employed to reduce the necessary number of markers for prediction and enhance predictive accuracy across phenotypes. To explore the regulation of agronomic traits, our study evaluated the significance of selected markers for prediction using a tree-based approach, potentially linking these regions to quantitative trait loci (QTLs). In a multiomic approach, genes from the species transcriptome were mapped and correlated to those markers. A gene coex... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Feature selection; Gene coexpression networks; Genomic prediction; Machine learning; Major importance markers; RNA-Seq. |
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Thesaurus NAL: |
Forage grasses. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159688/1/Genome-wide-family-prediction-2023.pdf
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Marc: |
LEADER 03815naa a2200325 a 4500
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520 $aTropical forage grasses, particularly those belonging to the Urochloa genus, play a crucial role in cattle production and serve as the main food source for animals in tropical and subtropical regions. The majority of these species are apomictic and tetraploid, highlighting the significance of U. ruziziensis, a sexual diploid species that can be tetraploidized for use in interspecific crosses with apomictic species. As a means to support breeding programs, our study investigates the feasibility of genome-wide family prediction in U. ruziziensis families to predict agronomic traits. Fifty half-sibling families were assessed for green matter yield, dry matter yield, regrowth capacity, leaf dry matter, and stem dry matter across different clippings established in contrasting seasons with varying available water capacity. Genotyping was performed using a genotyping-by-sequencing approach based on DNA samples from family pools. In addition to conventional genomic prediction methods, machine learning and feature selection algorithms were employed to reduce the necessary number of markers for prediction and enhance predictive accuracy across phenotypes. To explore the regulation of agronomic traits, our study evaluated the significance of selected markers for prediction using a tree-based approach, potentially linking these regions to quantitative trait loci (QTLs). In a multiomic approach, genes from the species transcriptome were mapped and correlated to those markers. A gene coexpression network was modeled with gene expression estimates from a diverse set of U. ruziziensis genotypes, enabling a comprehensive investigation of molecular mechanisms associated with these regions. The heritabilities of the evaluated traits ranged from 0.44 to 0.92. A total of 28,106 filtered SNPs were used to predict phenotypic measurements, achieving a mean predictive ability of 0.762. By employing feature selection techniques, we could reduce the dimensionality of SNP datasets, revealing potential genotype-phenotype associations. The functional annotation of genes near these markers revealed associations with auxin transport and biosynthesis of lignin, flavonol, and folic acid. Further exploration with the gene coexpression network uncovered associations with DNA metabolism, stress response, and circadian rhythm. These genes and regions represent important targets for expanding our understanding of the metabolic regulation of agronomic traits and offer valuable insights applicable to species breeding. Our work represents an innovative contribution to molecular breeding techniques for tropical forages, presenting a viable marker-assisted breeding approach and identifying target regions for future molecular studies on these agronomic traits.
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Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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