BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
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Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  26/11/2015
Data da última atualização:  15/03/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CARVALHEIRO, R.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; MOKRY, F. B.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P.
Afiliação:  TATIANE C. S. CHUD, UNESP; RICARDO V. VENTURA, UNESP; FLAVIO S. SCHENKEL, University of Guelph; ROBERTO CARVALHEIRO, UNESP; MARCOS E. BUZANSKAS, UNESP; JAQUELINE O. ROSA, UNESP; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; FABIANA B. MOKRY, Federal University of São Carlos; CINTIA RIGHETTI MARCONDES, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; DANÍSIO P. MUNARI, UNESP.
Título:  Strategies for genotype imputation in composite beef cattle.
Ano de publicação:  2015
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, v. 16, n. 99, 2015.
Páginas:  10 p.
DOI:  10.1186/s12863-015-0251-7
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Genotype imputation has been used to increase genomic information, allow more animals in genome-wide analyses, and reduce genotyping costs. In Brazilian beef cattle production, many animals are resulting from crossbreeding and such an event may alter linkage disequilibrium patterns. Thus, the challenge is to obtain accurately imputed genotypes in crossbred animals. The objective of this study was to evaluate the best fitting and most accurate imputation strategy on the MA genetic group (the progeny of a Charolais sire mated with crossbred Canchim X Zebu cows) and Canchim cattle. The data set contained 400 animals (born between 1999 and 2005) genotyped with the Illumina BovineHD panel. Imputation accuracy of genotypes from the Illumina-Bovine3K (3K), Illumina-BovineLD (6K), GeneSeek-Genomic-Profiler (GGP) BeefLD (GGP9K), GGP-IndicusLD (GGP20Ki), Illumina-BovineSNP50 (50K), GGP-IndicusHD (GGP75Ki), and GGP-BeefHD (GGP80K) to Illumina-BovineHD (HD) SNP panels were investigated. Seven scenarios for reference and target populations were tested; the animals were grouped according with birth year (S1), genetic groups (S2 and S3), genetic groups and birth year (S4 and S5), gender (S6), and gender and birth year (S7). Analyses were performed using FImpute and BEAGLE software and computation run-time was recorded. Genotype imputation accuracy was measured by concordance rate (CR) and allelic R square (R2).
Palavras-Chave:  Canchim breed; Crossbred cattle; Genomic data; Low density panel.
Thesaurus Nal:  single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1029694/1/regitano4.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CPPSE23160 - 1UPCAP - DDPROCI-2015.00098CHU2015.00098
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1.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. P. Potencial biotecnológico de bactérias para o controle de diferentes patógenos da cultura do tomate, Solanum lycopersicum L. 2023. 55 f. Dissertação (Mestrado em Agricultura no Trópico Úmido) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus. Orientador: Gilvan Ferreira da Silva; Coorientadora: Fernanda Fátima Caniato.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. F. A notícia institucional. In: DUARTE, J. (Org.). Assessoria de imprensa e relacionamento com a mídia: teoria e técnica. p. 140-159
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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3.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. F. Marketing científico ou comunicação pública: por que vale a pena estar na mídia. In: DUARTE, J.; RIBEIRO, R. M. Comunicação em ciência etecnologia: estudo da Embrapa. p. 201-224
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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4.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. F.; GALANTE, M. Análise e Melhoria do Processo de Organização e Gestão de Eventos: a experiência da Embrapa com feiras e exposições. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIAS DA COMUNICAÇÃO, 34., 2011, Recife. [Anais...] São Paulo: Sociedade Brasileira de Estudos Interdisciplinares da Comunicação, 2011. 12 p.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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5.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. G.; UTIDA, M. K.; CRUZ, J. C.; OLIVEIRA, A. C. de; MARRIEL, I. E. Atividade da urease e arginase em solo sob diferentes cobertura vegetal em um sítio agroecológico. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 26.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 10.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 8.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 5., 2004, Lages, SC. FertBio 2004: avaliação das conquistas: bases para estratégias futuras. Lages: [s. n.], 2004. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.
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6.Imagem marcado/desmarcadoPROVAZI, M.; MONTEIRO, G.; CORRÊA, L. de A.; SANTOS, P. M. Acúmulo de matéria seca dos capins Panicum maximum cv. Tanzânia, cv. Tobiatã e Pennisetum purpureum. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA USP - SIICUSP, 11., 2003, São Paulo. Resumos eletrônicos... São Paulo: USP, 2003. Disponível em: <http://www.usp.br/siicusp/11osiicusp/ficha3770.htm>. Acesso em: 10 dez. 2003.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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7.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, J. R. da; COLARES, L. M. L.; MONTEIRO, G. R. Caracterização da flora e da fauna em estudo ambiental simplificado na Amazônia central. Revista Biodiversidade, v. 21, n. 3, p. 72-88, 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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8.Imagem marcado/desmarcadoGOMEZ, H.; MINATEL, I.; LIMA, G.; MARQUES. M.; RITSCHEL, P. S.; BORGES, C.; MONTEIRO, G. Biogenic amines in wine and juice from new cultivars of vitis labrusca. In: WORLD VINE AND WINE CONGRESS, 39.; GENERAL ASSEMBLY OF THE OIV, 14., 2016, Bento Gonçalves. Vitiviniculture: technological advances to market challenges: abstracts. Bento Gonçalves: International Organisation of Vine and Wine, Poster 2016-2069, 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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9.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. P.; CANIATO, F. F.; HANADA, R. E.; SILVA, G. F. da. Seleção e aplicação da microbiota amazônica no desenvolvimento de soluções para controle de Ralstonia solanacearum em tomateiro (Solanum lycopersicum L.). In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 16.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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10.Imagem marcado/desmarcadoUTIDA, M. K.; MONTEIRO, G. G.; SCOTTI, M. R.; SA, M. H. de; OLIVEIRA, A. C. de; MARRIEL, I. E. Atividade enzimática e diversidade funcional da microbiota de cinco ecossistemas em um solo de cerrado. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 26.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 10.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 8.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 5., 2004, Lages, SC. FertBio 2004: avaliação das conquistas: bases para estratégias futuras. Lages: [s. n.], 2004. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.
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11.Imagem marcado/desmarcadoAGUIAR, G. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; AMARAL, E. S. dos; DALCIM, M.; MONTEIRO, G. C. Avaliação da produtividade de girassol semeado em janeiro em Pelotas - RS. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 79-84. Editado por Ana Paula Schneid Afonso Rosa, Márcia Vizzotto, Simone Ery Grosskopf.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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12.Imagem marcado/desmarcadoAGUIAR, G. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; AMARAL, E. S. do; DALCIN, M.; MONTEIRO, G. C. Avaliação da produtividade de girassol semeado em janeiro em Pelotas-RS. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18., SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 79-84. Editado por Ana Claudia Barneche de Oliveira, Ana Paula Afonso Scheneid da Rosa e Márcia Vizzotto.
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.
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13.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. C.; FISCHER, G. R.; AGUIAR, L. J. G.; SCIVITTARO, W. B.; CONCEIÇÃO, L. F. C. da. Emissão de CO2 em culturas de soja e arroz irrigado - Safra 2013/2014 - RS. Revista Brasileira de Geografia Física, v.10, n.4, p. 1071-1078, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.
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14.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, A. C. B. de; EMYGDIO, B. M.; AGUIAR, G.; AMARAL, E. S.; MONTEIRO, G. C.; BERTAGNOLLI, P. F. Desempenho agronomico de genótipos de soja semeados em Pelotas. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO SUL, 37., 2009, Porto Alegre. Programa e resumos... Porto Alegre: UFRGS, 2009. p. 30-33. 1 CD-ROM. RPS010.pdf.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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15.Imagem marcado/desmarcadoMARRIEL, I. E.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; UTIDA, M. K.; MONTEIRO, G. G.; ALVARENGA, R. C.; CRUZ, J. C. Bioindicadores de qualidade do solo de cerrado sob sistemas de manejo para a produção orgânica. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2005. 6 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular técnica, 73).
Tipo: Circular Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.
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16.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, O. M. S.; SILVA, J. F.; MONTEIRO, G. F. P.; GONCALVES, J. R. P.; KLEHM, C. S. Período de convivência das plantas daninhas com cultivares de feijão-caupi em várzea no Amazonas. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 2., 2009, Belém, PA. Da agricultura de subsitência ao agronegócio: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. p. 703-707.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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17.Imagem marcado/desmarcadoMONTEIRO, G. F. P.; SILVA, J. F.; BORGES, J. E. C.; GARCIA, M. V. B.; GARCIA, T. B. Período crítico de interferência de plantas daninhas na cultura dos citros no Município de Manaus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande, MS. A Ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia. Palestras. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira da Ciência das Plantas Daninhas, 2012. p. 17-21.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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18.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. E. P. da; FREITAS, J. M. G. de; MONTEIRO, G. T.; LEMOS, O. F. de. Enraizamento in vitro de híbrido intraespecífico de pimenteira-do-reino com ácido naftalenoacético e ácido indolbutírico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 7., 2022. Multifuncionalidade e Qualidade de Vida: [anais...]. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2022.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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19.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, G. S. do; MAMBRINI, G. P.; MONTEIRO, G. C. M.; COLNAGO, L. A.; OLIVEIRA, C. R. de. Síntese, caracterização e atividade catalítica de TiO2, SnO2 e ZnO. In: JORNADA CIENTÍFICA-EMBRAPA SÃO CARLOS, 2009, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2009. p. 94 (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 90)
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.
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20.Imagem marcado/desmarcadoUTIDA, M. K.; MONTEIRO, G. G.; BORGES, M. T.; ALVES, V. M. C.; DURAES, F. O. M.; SCOTTI, M. R.; SA, N. M. H.; MARRIEL, I. E. Associação entre assimilação de amônio e eficiência de uso de nitrogênio em genótipos de milho contrastantes, cultivados em substrato hidropônico. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 25.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 1., 2004, Cuiabá, MT. Da agricultura familiar ao agronegócio: tecnologia, competitividade e sustentabilidade: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Cuiabá: Empaer, 2004. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.
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