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Registros recuperados : 23 | |
1. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Presence of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in sheep in Dormentes state fo Pernambuco, Brazil. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 107-108 Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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2. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Presence of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in sheep in Dormentes state fo Pernambuco, Brazil. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 107-108 Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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3. | | GUIMARAES, A. S.; CARMO, F. B.; HEINEMANN, M. B.; PORTELA, R. W. D.; MEYER, R.; LAGE, A. P.; SEYFFERT, N.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G. High sero-prevalence of caseous lymphadenitis identified in slaughterhouse samples as a consequence of deficiencies in sheep farm management in the state of Minas Gerais, Brazil. BMC Veterinary Research, v. 7, article 68, 2011. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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4. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliation of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in goats milking of Sisal area in state of Bahia. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 105-106. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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5. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliation of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in goats milking of Sisal area in state of Bahia. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 105-106. Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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6. | | GUIMARAES, A. S.; DORNELES, E. M. S.; ANDRADE, G. I.; LAGE, A. P.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; HEINEMANN, M. B. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolates using ERIC-PCR. Veterinary Microbiology, v. 153, n. 3/4, p. 299-306, 2011. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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7. | | MIYOSHI, A.; ROSINHA, G. M. S.; CAMARGO I. L. B. C.; TRANT, C. M. C.; CARDOSO, F. C.; AZEVEDO, V.; OLIVEIRA, S. C. The role of the vacB gene in the pathogenesis of Brucella abortus. Microbes and infections, v. 9, n. 3, p. 375-381, Mar. 2007. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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8. | | GOUVEIA, A. M. G.; SILVA, M. X.; MAIA, J. M. S.; BRANDAO, H. de M.; SEYFFERT, N.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GUIMARAES, A. S. Technological level and epidemiological aspects of sheep husbandry in Minas Gerais, southeastern Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 34, n. 9, p. 865-868, 2014. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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9. | | LOBO, F. P.; RODRIGUES, M. R.; RODRIGUES, G. O. L.; HILÁRIO, H. O.; SOUZA, R. A.; TAUCH, A.; MIYOSHI, A.; FRANCO, G. C.; AZEVEDO, V.; FRANCO, G. R. KOMODO: a web tool for detecting and visualizing biased distribution of groups of homologous genes in monophyletic taxa. Nucleic Acids Research, Oxford, v. 40, p. W491-W497, 2012. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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10. | | CARMO, F. B. DO; GUIMARAES, A. S.; PAULETTI, R. B.; LAGE, A. P.; GONÇALVES, V. S. P.; MEYER, R.; PORTELA, R. W. B.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; HEINEMANN, M. B. Prevalência de anticorpos contra a linfadenite caseosa em criações comerciais de ovinos no Distrito Federal, Brasil. Arquivos do Instituto Biológico, v. 79, n. 2, p. 293-298, 2012. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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11. | | CARMO, F. B. do; GUIMARÃES, A. S.; PAULETTI, R. B.; LAGE, A. P.; GONÇALVES, V. S. P.; MEYER, R.; PORTELA, R. W. D.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; HEINEMANN, M. B. Prevalência de anticorpos contra a linfadenite caseosa em criações comerciais de ovinos no Distrito Federal, Brasil. Arquivos do Instituto Biológico, v. 79, n. 2, p. 293-298, abr./jun. 2012. Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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12. | | MARTINS, R. de J.; VESCHI, J. L. A.; CARMO, F. B.; AZEVEDO, V.; SEYFFERT, N; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; PEIXOTO, R. M.; COSTA, M. M. da; ZAFALON, L. F.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliação da presença de anticorpos anti-Corynebacterium pseudotuberculosis em caprinos leiteiros do Território do Sisal, BA. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 5., 2010, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2010. p. 25-31. (Embrapa Semiárido. Documentos, 228.). Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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13. | | MARTINS, R. de J.; VESCHI, J. L. A.; LANDIM, A. M. de S.; CARMO, F. B. do; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; ZAFALON, L. F.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliação da presença de anticorpos anti-Corynebacterium pseudotuberculosis em ovinos do Município de Dormentes, PE In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 6., 2011, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2011. p. 397-403. (Embrapa Semiárido. Documentos, 238). Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Semiárido. |
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14. | | DORNELES, E. M. S.; ANDRADE, G. I.; SANTOS, E. L. DE S.; SANTANA, J. A.; LAGE, A. P.; GUIMARAES, A. S.; MOTA, R. A.; SANTOS, A. DE S.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolated from goats using ERIC-PCR. In: Encontro Nacional de Patologia Veterinária, 15., 2011, Goiânia. Resumos... Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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15. | | DORNELES, E. M. S.; ANDRADE, G. I.; SANTOS, E. L. DE S.; SANTANA, J. A.; LAGE, A. P.; GUIMARAES, A. S.; MOTA, R. A.; SANTOS, A. DE S.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; HEINEMANN, M. B. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolated from goats using eric-PCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu. Resumos. Foz do Iguaçu: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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16. | | DORNELES, E. M. S.; SANTANA, J. A.; ANDRADE, G. I.; SANTOS, E. L. S.; GUIMARAES, A. S.; MOTA, R. A.; SANTOS, A. S.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; GOUVEIA, A. M. G.; LAGE, A. P.; HEINEMANN, M. B. Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis isolated from goats using ERIC-PCR. Genetics and Molecular Research, v. 153, n. 3/4, p. 299-306, 2011 Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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17. | | PACHECO, L. G. C.; PENA, R. R.; CASTRO, T. L. P.; DORELLA, F. A.; BAHIA, R. C.; CARMINATI, R.; FROTA, M. N. L.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; ALVES, F. S. F.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V. Multiplex PCR assay for identification of Corynebacterium pseudotuberculosis from pure cultures and for rapid detection of this pathogen in clinical samples. Journal of Medical Microbiology, v. 56, n. 4, p. 480-486, Apr. 2007. Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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18. | | DORELLA, F. A.; ESTEVAM, E. M.; PACHECO, L. G. C.; GUIMARAES, C. T.; LANA, U. G. P.; GOMES, E. A.; BARSANTE, M. M.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V. In vivo insertional mutagenesis in Corynebacterium pseudotuberculosis: an efficient means to identify DNA sequences encoding exported proteins. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 72, n. 11, p. 7368-7372, 2006. Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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19. | | ANTUNES, C. A.; GUIMARAES, A. S.; SILVA, W. M.; CASTRO, T. L. DE P.; RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; SILVA, R. DE F.; GALA-GARCIA, A.; CARVALHO, R. D. DE O.; MORAES, P.; ROCHA, F. S.; MAGALHÃES, A.; ALMEIDA, S. S. DE; EL AOUAR FILHO, R. A.; GOUVEIA, A. M. G.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V.; SEYFFERT, N. Avaliação de um teste intradérmico de hipersensibilidade com antígenos secretados de Corynebacterium pseudotuberculosis para o diagnóstico subclínico da linfadenite caseosa em caprinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu. Resumos. Foz do Iguaçu: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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20. | | DORNELES, E. M. S.; SANTANA, J. A.; RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; GUIMARAES, A. S.; MOAWAD, M. S.; SELIM, S. A.; GARALDI, A. L. M.; MIYOSHI, A.; RIBEIRO, M. G.; GOUVEIA, A. M. G.; AZEVEDO, V.; HEINEMANN, M. B.; LAGE, A. P. Evaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates. Plos One, v. 9, n. 6, e98758, 2014. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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Registros recuperados : 23 | |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
23/08/2012 |
Data da última atualização: |
08/01/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
LOBO, F. P.; RODRIGUES, M. R.; RODRIGUES, G. O. L.; HILÁRIO, H. O.; SOUZA, R. A.; TAUCH, A.; MIYOSHI, A.; FRANCO, G. C.; AZEVEDO, V.; FRANCO, G. R. |
Afiliação: |
FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; MAÍRA R. RODRIGUES, UFMG; GISELE O. L. RODRIGUES, UFMG; HERON O. HILÁRIO, UFMG; RAONI A. SOUZA, Fundação Ezequiel Dias, MG; ANDREAS TAUCH, Bielefeld University; ANDERSON MIYOSHI, UFMG; GLAURA C. FRANCO, UFMG; VASCO AZEVEDO, UFMG; GLÓRIA R. FRANCO, UFMG. |
Título: |
KOMODO: a web tool for detecting and visualizing biased distribution of groups of homologous genes in monophyletic taxa. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Nucleic Acids Research, Oxford, v. 40, p. W491-W497, 2012. |
DOI: |
10.1093/nar/gks490 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The enrichment analysis is a standard procedure to interpret ?omics? experiments that generate large gene lists as outputs, such as transcriptomics and protemics. However, despite the huge success of enrichment analysis in these classes of experiments, there is a surprising lack of application of this methodology to survey other categories of large-scale biological data available. Here, we report Kegg Orthology enrichMent-Online DetectiOn (KOMODO), a web tool to systematically investigate groups of monophyletic genomes in order to detect significantly enriched groups of homologous genes in one taxon when compared with another. The results are displayed in their proper biochemical roles in a visual, explorative way, allowing users to easily formulate and investigate biological hypotheses regarding the taxonomical distribution of genomic elements. We validated KOMODO by analyzing portions of central carbon metabolism in two taxa extensively studied regarding their carbon metabolism profile (Enterobacteriaceae family and Lactobacillales order). Most enzymatic activities significantly biased were related to known key metabolic traits in these taxa, such as the distinct fates of pyruvate (the known tendency of lactate production in Lactobacillales and its complete oxidation in Enterobacteriaceae), demonstrating that KOMODO could detect biologically meaningful differences in the frequencies of shared genomic elements among taxa. KOMODO is freely available at http://komodotool.org. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Ferramenta web; Genomas. |
Thesagro: |
Atividade Enzimática. |
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Genome. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 02413naa a2200313 a 4500 001 1932006 005 2020-01-08 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1093/nar/gks490$2DOI 100 1 $aLOBO, F. P. 245 $aKOMODO$ba web tool for detecting and visualizing biased distribution of groups of homologous genes in monophyletic taxa.$h[electronic resource] 260 $c2012 520 $aThe enrichment analysis is a standard procedure to interpret ?omics? experiments that generate large gene lists as outputs, such as transcriptomics and protemics. However, despite the huge success of enrichment analysis in these classes of experiments, there is a surprising lack of application of this methodology to survey other categories of large-scale biological data available. Here, we report Kegg Orthology enrichMent-Online DetectiOn (KOMODO), a web tool to systematically investigate groups of monophyletic genomes in order to detect significantly enriched groups of homologous genes in one taxon when compared with another. The results are displayed in their proper biochemical roles in a visual, explorative way, allowing users to easily formulate and investigate biological hypotheses regarding the taxonomical distribution of genomic elements. We validated KOMODO by analyzing portions of central carbon metabolism in two taxa extensively studied regarding their carbon metabolism profile (Enterobacteriaceae family and Lactobacillales order). Most enzymatic activities significantly biased were related to known key metabolic traits in these taxa, such as the distinct fates of pyruvate (the known tendency of lactate production in Lactobacillales and its complete oxidation in Enterobacteriaceae), demonstrating that KOMODO could detect biologically meaningful differences in the frequencies of shared genomic elements among taxa. KOMODO is freely available at http://komodotool.org. 650 $aBioinformatics 650 $aGenome 650 $aAtividade Enzimática 653 $aBioinformática 653 $aFerramenta web 653 $aGenomas 700 1 $aRODRIGUES, M. R. 700 1 $aRODRIGUES, G. O. L. 700 1 $aHILÁRIO, H. O. 700 1 $aSOUZA, R. A. 700 1 $aTAUCH, A. 700 1 $aMIYOSHI, A. 700 1 $aFRANCO, G. C. 700 1 $aAZEVEDO, V. 700 1 $aFRANCO, G. R. 773 $tNucleic Acids Research, Oxford$gv. 40, p. W491-W497, 2012.
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