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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
31/01/2012 |
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, M. R.; GUIMARÃES, M. D. C.; VEIGA, V. M. de O.; MOREIRA, A. dos S.; COSTA, R. R. da; ABI-ZAID, K. C. F.; ROCHA, A. da S.; SUFFYS, P. N. |
Afiliação: |
MARCIO ROBERTO SILVA, CNPGL; MARK DREW CROSLAND GUIMARÃES, UFMG; VANIA MARIA DE OLIVEIRA VEIGA, CNPGL; ALINE DOS SANTOS MOREIRA, Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática; RONALDO RODRIGUES DA COSTA, UFJF; FHEMIG; KELLY CRISTINA FERREIRA ABI-ZAID, FHEMIG; ADALGIZA DA SILVA ROCHA, FIOCRUZ; PHILIP NOEL SUFFYS, FIOCRUZ. |
Título: |
Identification of Mycobacterium tuberculosis complex based on amplification and sequencing of the oxyR pseudogene from stored Ziehl-Neelsen-stained sputum smears in Brazil. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 106, n. 1, p. 9-15, 2011. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S0074-02762011000100002 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A cross-sectional analysis of stored Ziehl-Neelsen (ZN)-stained sputum smear slides (SSS) obtained from two public tuberculosis referral laboratories located in Juiz de Fora, Minas Gerais, was carried out to distinguish Mycobacterium bovis from other members of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC). A two-step approach was used to distinguish M. bovis from other members of MTC: (i) oxyR pseudogene amplification to detect MTC and, subsequently, (ii) allele-specific sequencing based on the polymorphism at position 285 of this gene. The oxyR pseudogene was successfully amplified in 100 of 177 (56.5%) SSS available from 99 individuals. No molecular profile of M. bovis was found. Multivariate analysis indicated that acid-fast bacilli (AFB) results and the source laboratory were associated (p < 0.05) with oxyR pseudogene amplification. SSS that were AFB++ SSS showed more oxyR pseudogene amplification than those with AFB0, possibly due to the amount of DNA. One of the two source laboratories presented a greater chance of oxyR pseudogene amplification, suggesting that differences in sputum conservation between laboratories could have influenced the preservation of DNA. This study provides evidence that stored ZN-SSS can be used for the molecular detection of MTC. |
Palavras-Chave: |
Molecular sequence data; OxyR pseudogene; Sputum smear. |
Thesagro: |
Mycobacterium Bovis. |
Thesaurus Nal: |
Mycobacterium tuberculosis; polymerase chain reaction. |
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/53227/1/Artigo-meta-2011-MInstOC-Marcio-2.pdf
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Marc: |
LEADER 02293naa a2200289 a 4500 001 1913965 005 2024-02-05 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S0074-02762011000100002$2DOI 100 1 $aSILVA, M. R. 245 $aIdentification of Mycobacterium tuberculosis complex based on amplification and sequencing of the oxyR pseudogene from stored Ziehl-Neelsen-stained sputum smears in Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2011 520 $aA cross-sectional analysis of stored Ziehl-Neelsen (ZN)-stained sputum smear slides (SSS) obtained from two public tuberculosis referral laboratories located in Juiz de Fora, Minas Gerais, was carried out to distinguish Mycobacterium bovis from other members of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC). A two-step approach was used to distinguish M. bovis from other members of MTC: (i) oxyR pseudogene amplification to detect MTC and, subsequently, (ii) allele-specific sequencing based on the polymorphism at position 285 of this gene. The oxyR pseudogene was successfully amplified in 100 of 177 (56.5%) SSS available from 99 individuals. No molecular profile of M. bovis was found. Multivariate analysis indicated that acid-fast bacilli (AFB) results and the source laboratory were associated (p < 0.05) with oxyR pseudogene amplification. SSS that were AFB++ SSS showed more oxyR pseudogene amplification than those with AFB0, possibly due to the amount of DNA. One of the two source laboratories presented a greater chance of oxyR pseudogene amplification, suggesting that differences in sputum conservation between laboratories could have influenced the preservation of DNA. This study provides evidence that stored ZN-SSS can be used for the molecular detection of MTC. 650 $aMycobacterium tuberculosis 650 $apolymerase chain reaction 650 $aMycobacterium Bovis 653 $aMolecular sequence data 653 $aOxyR pseudogene 653 $aSputum smear 700 1 $aGUIMARÃES, M. D. C. 700 1 $aVEIGA, V. M. de O. 700 1 $aMOREIRA, A. dos S. 700 1 $aCOSTA, R. R. da 700 1 $aABI-ZAID, K. C. F. 700 1 $aROCHA, A. da S. 700 1 $aSUFFYS, P. N. 773 $tMemorias do Instituto Oswaldo Cruz$gv. 106, n. 1, p. 9-15, 2011.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
03/03/2023 |
Data da última atualização: |
06/03/2023 |
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Autoria: |
KAMINSKI, J.; BRUNETTO, G.; SILVA, L. S. DA; MELO, G. W. B. de; GIROTTO, E. |
Afiliação: |
JOÃO KAMINSKI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA MARIA; GUSTAVO BRUNETTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA MARIA; LEANDRO SOUZA DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA MARIA; GEORGE WELLINGTON BASTOS DE MELO, CNPUV; EDUARDO GIROTTO, INSTITUTO FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL. |
Título: |
Evolução e fertilidade em solos e contaminação em vinhedos e pomares. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
In: BRUNETTO, G.; TRENTIN, E.; MELO, G. W. B. de; GIROTTO, E. Contaminação em solos de pomares e vinhedos: causas, efeitos e estratégias de manejo. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo - Núcleo Regional Sul, 2022. |
Páginas: |
p. 17-47 |
ISBN: |
978-65-89469-23-0 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Os solos ácidos e que não possuem a quantidade suficiente de nutrientes para suprir a demanda das plantas necessitam ser submetidos à calagem e adubação. A recomendação da calagem e adubação pode ser estabelecida em sistemas regionais. Assim, no presente capítulo, inicialmente apresentaremos a concepção e evolução histórica dos sistemas de clagem e adubação em solos, com ênfase ao sistema de recomendação estabelecido aos estados do Rio Grande do Sul (RS) e de Santa Catarina (SC). |
Thesagro: |
Contaminação; Fertilidade; Fertilidade do Solo; Solo; Solo Ácido. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152094/1/ID19088.pdf
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Marc: |
LEADER 01383naa a2200253 a 4500 001 2152094 005 2023-03-06 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 020 $a978-65-89469-23-0 100 1 $aKAMINSKI, J. 245 $aEvolução e fertilidade em solos e contaminação em vinhedos e pomares.$h[electronic resource] 260 $c2022 300 $ap. 17-47 520 $aOs solos ácidos e que não possuem a quantidade suficiente de nutrientes para suprir a demanda das plantas necessitam ser submetidos à calagem e adubação. A recomendação da calagem e adubação pode ser estabelecida em sistemas regionais. Assim, no presente capítulo, inicialmente apresentaremos a concepção e evolução histórica dos sistemas de clagem e adubação em solos, com ênfase ao sistema de recomendação estabelecido aos estados do Rio Grande do Sul (RS) e de Santa Catarina (SC). 650 $aContaminação 650 $aFertilidade 650 $aFertilidade do Solo 650 $aSolo 650 $aSolo Ácido 700 1 $aBRUNETTO, G. 700 1 $aSILVA, L. S. DA 700 1 $aMELO, G. W. B. de 700 1 $aGIROTTO, E. 773 $tIn: BRUNETTO, G.; TRENTIN, E.; MELO, G. W. B. de; GIROTTO, E. Contaminação em solos de pomares e vinhedos: causas, efeitos e estratégias de manejo. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo - Núcleo Regional Sul, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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