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| Registros recuperados : 31 | |
| 5. |  | NASCIMENTO, D. C. do; ROBLES, C. S.; VALLE, C. B. do; MEIRELES, K. G. X. Alterações no proteoma de Brachiaria brizantha relacionadas à resistência as cigarinhas-das-pastagens. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 72-74 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | ROBLES, C. S.; MEIRELES, K. G. X.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C. Análise da expressão diferencial de proteínas envolvidas nos mecanismos de resistência as cigarrinhas-das-pastagens em Brachiaria brizantha. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE,5., 2009, Campo Grande, MS. [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | ROBLES, C. S.; NASCIMENTO, D. C. do; VALLE, C. B. do; MEIRELES, K. G. X. Análise proteômica de um genótipo susceptível de Brachiaria brizantha durante infestação com as cigarrinhas-das-pastagens. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 46-48 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | AMORIM, T. R; SILVA, M. J. da; FERNANDES, C. D.; JANK, L.; MEIRELES, K. G. X. Avaliação de genótipos de Panicum maximum quanto à resistência a Bipolaris maydis. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 254-257 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | BRAGA, D. P.; MEIRELES, K. G. X.; JANK, L.; VALLE, C. B. do. Avaliação proteômica da interação Panicum maximum x Bipolaris maydis. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | CHIARI, L.; RESENDE, R. M. S.; JUNGMANN, L.; MEIRELES, K. G. X. Caracterização molecular de acessos da leguminosa forrageira Stylosanthes guianensis (AUBL.) SW. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 550 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert. p. 209| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 12. | | NASCIMENTO, D. C. do; MEIRELES, K. G. X.; ROBLES, C. S.; COSTA, P. P. O. L. da. Prospecção de metodologia para extração protéica em gramíneas forrageiras compatível com análise proteômica. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE,5., 2009, Campo Grande, MS. [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | NASCIMENTO, D. C. do; MEIRELES, K. G. X.; ROBLES, C. S.; COSTA, P. P. O. L. da. Prospecção de metodologias de extração protéica em gramíneas forrageiras visando aplicação em proteômica. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | MEIRELES, K. G. X.; VALLE, C. B. do; CHIARI, L.; ROBLES, C.; NASCIMENTO, D.; COSTA, P. P. Proteínas expressas em Brachiaria brizantha envolvidas nos mecanismos de resistência às cigarrinhas-das-pastagens. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Disponível em: . Acesso em: 25 fev. 2010. 1 p. Poster 047.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 15. | | JANK, L.; VALLE, C. B. do; RESENDE, R. M. S.; CHIARI, L.; JUNGMANN, L.; MEIRELES, K. G. X. Forage breeding at Embrapa Beef Catle. In: JANK, L.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; RESENDE, R. M. S. (Ed.). Forage breeding and biotechnology. Brasília, DF: Embrapa; Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2013. p. 1-24| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 17. | | CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; JANK, L.; MEIRELES, K. G. X.; JUNGMANN, L.; RESENDE, R. M. S.; SPANGENBERG, G. Melhoramento molecular como ferramenta para aumentar a qualidade das forrageiras tropicais Brachiaria brizantha e Panicum maximum. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Disponível em: . Acesso em: 25 fev. 2010. 1 p. Poster 058.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | PIRES, L. P.; COLADO, M. L. Z.; VILELA, M. de M.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; MEIRELES, K. G. X. Diferenciação molecular de genótipos de Panicum maximum. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 66-67. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 19. | | RESENDE, R. M. S.; VILELA, M. de M.; CHIARI, L.; MEIRELES, K. G. X.; JANK, L.; VALLE, C. B. do. Seleção genômica no melhoramento de forrageiras. In: AZEVEDO, A. L. S.; PEREIRA, J. F.; MACHADO, J. C. (Ed.). Melhoramento de forrageiras na era genômica. Brasília, DF: Embrapa, 2019. 262 p. il. color| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 20. | | MATIAS, F. I.; VIDOTTI, M. S.; MEIRELES, K. G. X.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; CARLEY, C. A. S.; FRITSCHE-NETO, R. Association Mapping Considering Allele Dosage: An Example of Forage Traits in an Interspecific Segmental Allotetraploid Urochloa spp. Crop Science, v. 59, n. 5, p. 2062-2076, september-october, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Registros recuperados : 31 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
27/12/2019 |
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Data da última atualização: |
27/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
MATIAS, F. I.; VIDOTTI, M. S.; MEIRELES, K. G. X.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; CARLEY, C. A. S.; FRITSCHE-NETO, R. |
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Afiliação: |
Filipe Inácio Matias, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética; Miriam Suzane Vidotti, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética; KAREM GUIMARAES XAVIER MEIRELES, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; Cacilda Borges do Valle, Colaboradora da Embrapa Gado de Corte; Cari A. Schmitz Carley; Roberto Fritsche-Neto, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de GenéticaUniversidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética. |
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Título: |
Association Mapping Considering Allele Dosage: An Example of Forage Traits in an Interspecific Segmental Allotetraploid Urochloa spp. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 59, n. 5, p. 2062-2076, september-october, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The breeding process in tropical segmental allopolyploid forage Urochloa is challenging due to the complex genetic control of the traits. Knowledge about genes associated with forage traits, expressed in the different cutting seasons, are extremely useful to support breeding programs and development of new cultivars. Thus, the aims of our study were (i) to identify genomic regions related to forage traits through genomewide association studies (GWAS), and (ii) to verify the influence of allele dosage on these results. A panel of 272 genotypes of Urochloa spp. [U. brizantha (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster ´ U. ruziziensis (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster] was evaluated in both the wet and dry seasons. The GWAS analyses were performed with 26,535 single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genotyping-by-sequencing (GBS) using diploid and tetraploid allele dosage configurations. Furthermore, we evaluated scenarios including additive, dominance, and epistatic effects. Seven candidate genomic regions associated with the main forage traits of Urochloa spp. were identified. The importance of the diploid and tetraploid molecular configuration in GWAS analyses for segmental allopolyploid species was demonstrated to identify the genomic behavior of important regions. Results demonstrated that it is possible to identify the same regions using both ploidy configurations; however, in some cases, the allele substitution effect can be biased mainly for regions with dominance and epistatic effects. Finally, this study contributes to the understanding of genetic control of tropical forage traits and genomics to accelerate the selection and reduce the cost to release new cultivars. MenosThe breeding process in tropical segmental allopolyploid forage Urochloa is challenging due to the complex genetic control of the traits. Knowledge about genes associated with forage traits, expressed in the different cutting seasons, are extremely useful to support breeding programs and development of new cultivars. Thus, the aims of our study were (i) to identify genomic regions related to forage traits through genomewide association studies (GWAS), and (ii) to verify the influence of allele dosage on these results. A panel of 272 genotypes of Urochloa spp. [U. brizantha (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster ´ U. ruziziensis (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster] was evaluated in both the wet and dry seasons. The GWAS analyses were performed with 26,535 single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genotyping-by-sequencing (GBS) using diploid and tetraploid allele dosage configurations. Furthermore, we evaluated scenarios including additive, dominance, and epistatic effects. Seven candidate genomic regions associated with the main forage traits of Urochloa spp. were identified. The importance of the diploid and tetraploid molecular configuration in GWAS analyses for segmental allopolyploid species was demonstrated to identify the genomic behavior of important regions. Results demonstrated that it is possible to identify the same regions using both ploidy configurations; however, in some cases, the allele substitution effect can be biased mainly for regions with dominance and ep... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Tropical regions. |
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Thesaurus NAL: |
Animal performance; Animal proteins; Cattle feeding; Forage; Pastures; Urochloa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207880/1/Association-mapping-considering-Allele-dosage.pdf
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Marc: |
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520 $aThe breeding process in tropical segmental allopolyploid forage Urochloa is challenging due to the complex genetic control of the traits. Knowledge about genes associated with forage traits, expressed in the different cutting seasons, are extremely useful to support breeding programs and development of new cultivars. Thus, the aims of our study were (i) to identify genomic regions related to forage traits through genomewide association studies (GWAS), and (ii) to verify the influence of allele dosage on these results. A panel of 272 genotypes of Urochloa spp. [U. brizantha (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster ´ U. ruziziensis (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster] was evaluated in both the wet and dry seasons. The GWAS analyses were performed with 26,535 single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genotyping-by-sequencing (GBS) using diploid and tetraploid allele dosage configurations. Furthermore, we evaluated scenarios including additive, dominance, and epistatic effects. Seven candidate genomic regions associated with the main forage traits of Urochloa spp. were identified. The importance of the diploid and tetraploid molecular configuration in GWAS analyses for segmental allopolyploid species was demonstrated to identify the genomic behavior of important regions. Results demonstrated that it is possible to identify the same regions using both ploidy configurations; however, in some cases, the allele substitution effect can be biased mainly for regions with dominance and epistatic effects. Finally, this study contributes to the understanding of genetic control of tropical forage traits and genomics to accelerate the selection and reduce the cost to release new cultivars.
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Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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