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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Arroz e Feijão. Para informações adicionais entre em contato com cnpaf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
13/10/2020 |
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Data da última atualização: |
19/03/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TEIXEIRA, N. C.; WENDLAND, A.; OLIVEIRA, M. I. de S.; BRANDÃO, L. T. D.; SOUZA, T. L. P. O. de; FARIA, J. C. de; DEL PELOSO, M. J.; CORTES, M. V. de C. B. |
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Afiliação: |
NARA CRISTINA TEIXEIRA, bolsista CNPAF; ADRIANE WENDLAND FERREIRA, CNPAF; MAYTHSULENE INACIO DE SOUZA OLIVEIRA, bolsista CNPAF; LIVIA TEIXEIRA DUARTE BRANDAO, CNPAF; THIAGO LIVIO PESSOA OLIV DE SOUZA, CNPAF; JOSIAS CORREA DE FARIA, CNPAF; MARIA JOSE DEL PELOSO, CNPAF; MARCIO VINICIUS DE C BARROS CORTES, CNPAF. |
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Título: |
Rapid identification of RNA-interference-based resistance to Bean golden mosaic virus in transgenic common beans via loop-mediated isothermal amplification. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 60, n. 6, p. 3004-3012, Nov./Dec. 2020. |
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ISSN: |
1435-0653 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1002/csc2.20107 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Amolecular toolwas adapted for practical identification of theworld?s first transgenic event (Embrapa 5.1) in common bean (Phaseolus vulgaris L.). Based on the technology of RNA interference and on the transformation of plants via the Biobalistic method, a transgenic bean was created with effective resistance to Bean golden mosaic virus, its principal virus. To support the monitoring of this technology, the development of new cultivars, and the process of producing, benefiting, and distributing of seeds and grains, a molecular detection tool based on loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was developed. This tool can facilitating diagnosis, making it fast, specific, low-cost, and easily executed. Based on the gene Ahas (GenBank M88686) of the Embrapa 5.1 event, sets of initiators were planned (forward outer primer?backward outer primer and forward inner primer?backward inner primer) that are characteristic of the LAMP method. These were evaluated for their sensitivity and specificity in detecting their target. The LAMP method allows direct visual interpretation. The Neutral Red (NR) pH indicator was adopted to facilitate molecular diagnosis in moderately well equipped environments, thus reducing the risk of contamination and the need for skilled labor. This agility in diagnosis occurs because several phases commonly used inmolecular techniques, such as polymerase chain reaction, can be excluded. The LAMPmethod, combined with a rapid DNA extraction method (modified NaOH) and the addition of NR, provides technological support for addressing issues of biosafety, traceability, and identification of the Embrapa 5.1 event in beans in the field and in industry. MenosAmolecular toolwas adapted for practical identification of theworld?s first transgenic event (Embrapa 5.1) in common bean (Phaseolus vulgaris L.). Based on the technology of RNA interference and on the transformation of plants via the Biobalistic method, a transgenic bean was created with effective resistance to Bean golden mosaic virus, its principal virus. To support the monitoring of this technology, the development of new cultivars, and the process of producing, benefiting, and distributing of seeds and grains, a molecular detection tool based on loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was developed. This tool can facilitating diagnosis, making it fast, specific, low-cost, and easily executed. Based on the gene Ahas (GenBank M88686) of the Embrapa 5.1 event, sets of initiators were planned (forward outer primer?backward outer primer and forward inner primer?backward inner primer) that are characteristic of the LAMP method. These were evaluated for their sensitivity and specificity in detecting their target. The LAMP method allows direct visual interpretation. The Neutral Red (NR) pH indicator was adopted to facilitate molecular diagnosis in moderately well equipped environments, thus reducing the risk of contamination and the need for skilled labor. This agility in diagnosis occurs because several phases commonly used inmolecular techniques, such as polymerase chain reaction, can be excluded. The LAMPmethod, combined with a rapid DNA extraction method (modified NaO... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
DNA; Feijão; Mosaico Dourado; Phaseolus Vulgaris; Planta Transgênica. |
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Thesaurus Nal: |
Bean golden mosaic virus; Beans; Loop-mediated isothermal amplification; RNA interference; Transgenic plants. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aAmolecular toolwas adapted for practical identification of theworld?s first transgenic event (Embrapa 5.1) in common bean (Phaseolus vulgaris L.). Based on the technology of RNA interference and on the transformation of plants via the Biobalistic method, a transgenic bean was created with effective resistance to Bean golden mosaic virus, its principal virus. To support the monitoring of this technology, the development of new cultivars, and the process of producing, benefiting, and distributing of seeds and grains, a molecular detection tool based on loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was developed. This tool can facilitating diagnosis, making it fast, specific, low-cost, and easily executed. Based on the gene Ahas (GenBank M88686) of the Embrapa 5.1 event, sets of initiators were planned (forward outer primer?backward outer primer and forward inner primer?backward inner primer) that are characteristic of the LAMP method. These were evaluated for their sensitivity and specificity in detecting their target. The LAMP method allows direct visual interpretation. The Neutral Red (NR) pH indicator was adopted to facilitate molecular diagnosis in moderately well equipped environments, thus reducing the risk of contamination and the need for skilled labor. This agility in diagnosis occurs because several phases commonly used inmolecular techniques, such as polymerase chain reaction, can be excluded. The LAMPmethod, combined with a rapid DNA extraction method (modified NaOH) and the addition of NR, provides technological support for addressing issues of biosafety, traceability, and identification of the Embrapa 5.1 event in beans in the field and in industry.
650 $aBean golden mosaic virus
650 $aBeans
650 $aLoop-mediated isothermal amplification
650 $aRNA interference
650 $aTransgenic plants
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700 1 $aDEL PELOSO, M. J.
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773 $tCrop Science$gv. 60, n. 6, p. 3004-3012, Nov./Dec. 2020.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pantanal. Para informações adicionais entre em contato com cpap.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
03/11/2014 |
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Data da última atualização: |
29/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 5 |
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Autoria: |
EGITO, A. A. do; LARA, M. A. C.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; MARTINEZ, A. M.; LANDI, V.; JULIANO, R. S.; DELGADO, J. V.; FIORAVANTI, M. C. S. |
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Afiliação: |
ANDREA ALVES DO EGITO, CNPGC; INSTITUTO DE ZOOTECNIA; MARIA DO SOCORRO MAUES ALBUQUERQUE, CENARGEN; UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA; UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA; RAQUEL SOARES JULIANO, CPAP; UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA; UFG. |
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Título: |
Estrutura populacional e diversidade genética de raças bovinas brasileiras localmente adaptadas. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Actas Iberoamericanas de Conservación Animal, v. 4, p. 16-18, 2014. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Como o intuito de averiguar a estrutura populacional de raças localmente adaptadas de bovinos do Brasil genotipou-se 237 indivíduos das raças Caracu (n=50), Crioula Lageana (n=39), Curraleira (n=50), Mocha Nacional (n=50) e Pantaneira (n=48) com 28 locos microssatélites escolhidos a partir de listas da FAO/ISAG e do projeto BIOBOVIS. Índices de diversidade genética foram calculados a partir do programa FSAT e a estrutura populacional foi obtida com base em análise Bayesiana implementada pelo programa STRUCTURE. Observou-se uma diferenciação genética significativa (p<0,05) entre as raças estudadas, sendo a porcentagem de variação observada entre as populações de 4,64%. De um modo geral a heterozigosidade esperada foi superior a observada (0,751 vs 0,696). A raça Crioula Lageana apresentou a maior riqueza alélica (8,9) enquanto que a menor riqueza foi observada na raça Caracu (7,07). O maior FIS foi observado na raça Curraleira (0,106) e o menor na raça Mocho Nacional (0,035). Pela análise Bayesiana foi possível observar que as raças Curraleira e Pantaneira compartilham o maior número de alelos enquanto que a raça Caracu se distingue rapidamente das demais. Os resultados obtidos são condizentes com o histórico da formação destas populações a partir da sua introdução no Brasil pelos colonizadores. Além disto, verifica-se que populações que estão inseridas em programas de melhoramento, como a raça Caracu, apresentam uma menor diversidade genética quando comparadas com as demais, embora este fato não reflita necessariamente em um aumento da endogamia na população. Na raça Curraleira, os altos índices de endogamia podem estar refletindo a necessidade de intercâmbio entre os reprodutores dos diferentes criatórios amostrados. MenosComo o intuito de averiguar a estrutura populacional de raças localmente adaptadas de bovinos do Brasil genotipou-se 237 indivíduos das raças Caracu (n=50), Crioula Lageana (n=39), Curraleira (n=50), Mocha Nacional (n=50) e Pantaneira (n=48) com 28 locos microssatélites escolhidos a partir de listas da FAO/ISAG e do projeto BIOBOVIS. Índices de diversidade genética foram calculados a partir do programa FSAT e a estrutura populacional foi obtida com base em análise Bayesiana implementada pelo programa STRUCTURE. Observou-se uma diferenciação genética significativa (p<0,05) entre as raças estudadas, sendo a porcentagem de variação observada entre as populações de 4,64%. De um modo geral a heterozigosidade esperada foi superior a observada (0,751 vs 0,696). A raça Crioula Lageana apresentou a maior riqueza alélica (8,9) enquanto que a menor riqueza foi observada na raça Caracu (7,07). O maior FIS foi observado na raça Curraleira (0,106) e o menor na raça Mocho Nacional (0,035). Pela análise Bayesiana foi possível observar que as raças Curraleira e Pantaneira compartilham o maior número de alelos enquanto que a raça Caracu se distingue rapidamente das demais. Os resultados obtidos são condizentes com o histórico da formação destas populações a partir da sua introdução no Brasil pelos colonizadores. Além disto, verifica-se que populações que estão inseridas em programas de melhoramento, como a raça Caracu, apresentam uma menor diversidade genética quando comparadas com as demais,... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genética de populações; Microsatellites; Microssatélites; Naturalized breed; Raça naturalizada; STRUCTURE. |
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Thesaurus NAL: |
population genetics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02654naa a2200289 a 4500
001 1999006
005 2017-03-29
008 2014 bl --- 0-- u #d
100 1 $aEGITO, A. A. do
245 $aEstrutura populacional e diversidade genética de raças bovinas brasileiras localmente adaptadas.
260 $c2014
520 $aComo o intuito de averiguar a estrutura populacional de raças localmente adaptadas de bovinos do Brasil genotipou-se 237 indivíduos das raças Caracu (n=50), Crioula Lageana (n=39), Curraleira (n=50), Mocha Nacional (n=50) e Pantaneira (n=48) com 28 locos microssatélites escolhidos a partir de listas da FAO/ISAG e do projeto BIOBOVIS. Índices de diversidade genética foram calculados a partir do programa FSAT e a estrutura populacional foi obtida com base em análise Bayesiana implementada pelo programa STRUCTURE. Observou-se uma diferenciação genética significativa (p<0,05) entre as raças estudadas, sendo a porcentagem de variação observada entre as populações de 4,64%. De um modo geral a heterozigosidade esperada foi superior a observada (0,751 vs 0,696). A raça Crioula Lageana apresentou a maior riqueza alélica (8,9) enquanto que a menor riqueza foi observada na raça Caracu (7,07). O maior FIS foi observado na raça Curraleira (0,106) e o menor na raça Mocho Nacional (0,035). Pela análise Bayesiana foi possível observar que as raças Curraleira e Pantaneira compartilham o maior número de alelos enquanto que a raça Caracu se distingue rapidamente das demais. Os resultados obtidos são condizentes com o histórico da formação destas populações a partir da sua introdução no Brasil pelos colonizadores. Além disto, verifica-se que populações que estão inseridas em programas de melhoramento, como a raça Caracu, apresentam uma menor diversidade genética quando comparadas com as demais, embora este fato não reflita necessariamente em um aumento da endogamia na população. Na raça Curraleira, os altos índices de endogamia podem estar refletindo a necessidade de intercâmbio entre os reprodutores dos diferentes criatórios amostrados.
650 $apopulation genetics
653 $aGenética de populações
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653 $aMicrossatélites
653 $aNaturalized breed
653 $aRaça naturalizada
653 $aSTRUCTURE
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700 1 $aALBUQUERQUE, M. do S. M.
700 1 $aMARTINEZ, A. M.
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700 1 $aJULIANO, R. S.
700 1 $aDELGADO, J. V.
700 1 $aFIORAVANTI, M. C. S.
773 $tActas Iberoamericanas de Conservación Animal$gv. 4, p. 16-18, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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