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181. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BARBOSA, D. A.; MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; CARANHATO, A. L. H.; CARNEIRO, E. A.; QUEIROZ, A. A.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Teste de seleção de plantas geneticamente modificadas com o herbicida glufosinato de amônio. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA, 36., 2017, Londrina, PR. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2017. p. 176-178. (Embrapa Soja. Documentos, 388). Editado por Alvadi Antonio Balbinot Junior, Fernando Augusto Henning, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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182. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEUMAIER, N.; CARVALHO, J. F. C.; ROLLA-SANTOS, A. A. P.; ENGELS, C.; FARIAS, J. R. B.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; MARIN, S. R. R.; MIZOI, J.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Testing dreb genetically modified soybean plants for drought tolerance in both greenhouse and field conditions. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 9., 2013, Durban. [Proceedings...]. Durban: OPDT: OPOT, 2013. Abst. 216. 1 CD-ROM. WSRC. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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183. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | STOLF, R.; MEDRI, M. E.; BROGIN, R. L.; MOLINA, J. C.; SILVEIRA, C. A. da; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; LEMOS, N. G.; PIOTTO, E. C. S.; DIAS, J.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Tolerance to drought in Glycine max (L.) Merril: ecophysiological aspects. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 185. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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184. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; BARBOSA, D. de A.; KAFER, J. M.; MARIN, D. C.; MARIN, S. R. R.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L.; RECH FILHO, E. L. Screening de proteínas bioativas com potencial antioxidante em proteoma de soja cv. BRS 537. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno, editores técnicos. resumo 154. p. 174. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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185. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; BARBOSA, D. de A.; KAFER, J. M.; MARIN, D. C.; MARIN, S. R. R.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L.; RECH FILHO, E. L. Screening de proteínas bioativas com potencial antioxidante em proteoma de soja cv. BRS 537. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno, editores técnicos. resumo 154. p. 174. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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188. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; PAIVA, A. A. R.; ABDELNOOR, R. V.; POLIZEL, A. M.; LUGLE, S. M. Transformação genética em soja pela inserção da construção gênica contendo a região promotora do gene rd29A e a região codante do gene DREB1A de Arabidopsis thaliana, visando tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 47. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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189. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ABDELNOOR, R. V.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transformação genética de soja com promotor e fator de transcrição estresse induzidos visando tolerancia à seca. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005. Cornélio Procópio. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 108-109. (Embrapa Soja. Documentos, 257). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Simone Ery Grosskopf. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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190. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEPOMUCENO, A. L.; BENEVENTI, M. A., YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ABDELNOOR, R.; PAIVA, A. A. R.; POLIZEL, A. M. Transformação genética em soja visando tolerância à seca. In: CONGRESO DE SOJA DEL MERCOSUR, 3., 2006, Rosário. Mercosoja 2006: mesas científico-técnicas, resúmenes expandidos / comunicaciones. Rosário: Associación de la Cadena de Soja Argentina, 2006. p. 242-245. Nome correto do décimo primeiro autor ABDELNOOR, R. V. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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191. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEPOMUCENO, A. L.; LUGLE, S. M.; ARIAS, C. A. A.; BRIGHENTI, A. M.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; BINNECK, E.; MOLINA, J.; LEMOS, N. G.; STOLF, R. Transformação de plantas de soja por biobalística com genes de interesse (04.2000.322-05). In: HOFFMANN-CAMPO, C. B.; SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2002: ecofisiologia e biologia molecular. Londrina: Embrapa Soja, 2003. p. 39-46. (Embrapa Soja. Documentos, 217). Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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192. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | ENGELS, C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; KANAMORI, N.; ROLLA, A. A. P.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; MARCELINO, F. C.; MIZOI, J.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Transgene copy number quantification by qPCR in GM soybean lines containing the rd29A:AtDREB2A construction. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 197. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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193. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BENEVENTE, M. A.; NEPOMECENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ABDELNOOR, R.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transferência genética de soja com promotor e fator de transcrição estresse induzidos visando tolerancia à seca. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005, Cornélio Procópio, PR. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005, Cornélio Procópio. 2005., p.108-109. (Embrapa Soja. Documentos, 265). Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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194. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | ALMEIDA, A. M. R.; VLIET, H. van der; KITAJIMA, E. W.; PIUGA, F. F.; MARIN, S. R. R.; VALENTIN, N.; BITTNECK, E.; BENATO, L. C.; NEPOMUCENO, A. L.; OLIVEIRA, T. G. Vírus da necrose da haste: ocorrência no Brasil e controle. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 24., 2002, São Pedro, SP. Ata... Londrina: Embrapa Soja; Piracicaba: ESALQ, 2002. p. 57-73. (Embrapa Soja. Documentos, 186) Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Aúreo Francisco Lantmann. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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195. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MARINHO, J. P.; KANAMORI, N.; FERREIRA, L. C.; CARVALHO, J. F. C.; FREITAS, R. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; RODRIGUES, F. A; HENNING, L. M. M.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; YOSHIDA, T.; FUJITA, Y.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NAKASHIMA, K.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da expressão de genes induzidos por déficit hídrico em soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015. 3 p. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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196. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NAKASHIMA, K.; KANAMORI, N.; NAGATOSHI, Y.; FUJITA, Y.; TAKASAKI, H.; URANO, K.; MOGAMI, J.; MIZOI, J.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; SHINOZAKI, K.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Application of biotechnology to generate drought-tolerant soybean plants in brazil: development of genetic engineering technology of crops with stress tolerance against degradation of global environment. In: KOKUBUN, M.; ASANUMA, S. (Ed.). Crop production under stressful conditions: application of cutting edge Science and technology in developing countries. Singapore: Springer, c2018. p. 111-130. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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197. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FUGANTI-PAGLIARINI, R; FERREIRA, L. C.; RODRIGUES, F. A.; MOLINARI, H. B. C.; MARIN, S. R. R.; MOLINARI, M. D. C.; MARCOLINO-GOMES, J.; MERTZ-HENNING, L. M.; FARIAS, J. R. B.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEUMAIER, N.; KANAMORI, N.; FUJITA, Y.; MIZOI, J.; NAKASHIMA, K.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Characterization of soybean genetically modified for drought tolerance in field conditions. Frontiers in Plant Science, v. 8, artigo 448, 2017. Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Soja. |
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198. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MARINHO, J. P.; KANAMORI, N.; FERREIRA, L. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; CARVALHO, J. de F. C.; FREITAS, R. A.; MARIN, S. R. R.; RODRIGUES, F. A.; MERTZ-HENNING, L. M.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; OLIVEIRA, M. C. N. de; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; YOSHIDA, T.; FUJITA, Y.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NAKASHIMA, K.; NEPOMUCENO, A. L. Characterization of molecular and physiological responses under water deficit of genetically modified soybean plants overexpressing the ATAREB1 transcription fator. Plant Molecular Biology Reporter, v. 34, n. 2, p. 410-426, 2016. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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199. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MARTINS, M. T. B.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELlNO, F. C.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R.; MARIN S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA K.; PAIVA, A. A. R.; BENEVENTI, M. A.; STOLF, R.; OLIVEIRA, G. B. A. de. Caracterização molecular de eventos transformados com a construção rd29A: DREB1 A. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2008, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 125-128 (Embrapa Soja. Documentos, 297). Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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200. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | STOLF, R.; LEMOS, E. G. M.; CARARETO-ALVES, L. M.; KISHI, L.; PEREIRA, R. M.; MARCONDES, J.; PAIVA, A. A. R.; BINNECK, E.; POLIZEL, A. M.; MARIN, S. R. R.; YAMANAKA, N.; MOLINA, J. C.; FARIASJ. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Caracterização fisiológica e expressão gênica por microarranjos de DNA em duas cultivares de soja durante déficit hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p.46. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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![](/consulta/web/img/deny.png) | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
07/04/2004 |
Data da última atualização: |
27/07/2007 |
Autoria: |
BINNECK, E.; SILVA, J. F. V.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; ALMEIDA, A. M. R.; MARIN, S. R. R.; WENDLAND, A.; SILVEIRA, C. A. da; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; STOLF, R.; NEPOMUCENO, A. L. |
Título: |
Bioinformatics tools for sequence analysis and annotation applied to soybean functional genome. |
Ano de publicação: |
2004 |
Fonte/Imprenta: |
In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. |
Páginas: |
p. 248-249. |
Série: |
(Embrapa Soja. Documentos, 228). |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi. |
Conteúdo: |
Worldwide functional genomics studies are making an important role on biotechnology for the identification of genes that can be use in the improvement of specific biological processes in plants. Large-scale gene discovery projects like that depend on high accuracy of the data. The data should not only be trustworthy but should be correctly annotated for various features it contains. In this work we report a bioinformatics system designed to process and annotate the expressed sequence tags (ESTs) obtained by the project Functional Genome of Soybean Roots at Embrapa Soybean (http://www.cnpso.embrapa.br/bioinformatica). The system is made of Perl and PHP scripts, which performs the automated sequence analysis and support the annotation process based on a MySQL database. Various Perl scripts was written to assist the sequence analysis process that includes basecalling, clustering and assembling the reads, filtering of contaminating, repetitive and low quality sequences, identification of sequence features, BLASTing and reports generation. BLAST (Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402) outputs are processed and disposed on a way that is easily accessed by the personal that performs the massive handle of the data for annotation. Also, PHP scripts was written to make a friendly annotation interface through dynamical Web pages that perform the database operations needed for the complete annotation of the genes, whish comprise data retrieval aided by query searches linked to key words, data insertion, update, and generation of intuitive reports describing the results. These tools are helping to direct our work on identification, cloning and characterization of genes and regulatory sequences potentially useful in the improvement of soybean through genetic engineering. As results nearly 8,000 ESTs was obtained form cDNA clones derived from soybean roots in drought stress and nematode infection conditions. Consensus sequences are being functionally annotated and used to construct cDNA microarrays that will be useful for analyze gene expression under a broad variety of conditions. Initially we are studying drought stress and nematode infection conditions. Analysis of interactions of soybean roots with this defiance conditions will be used do identify new possible sources of resistance and tolerance. Candidate genes will be deeply studied and can be used on the production of transgenic plants. This work was supported by grants from CNPq, PRODETAB, Jircas and Embrapa. MenosWorldwide functional genomics studies are making an important role on biotechnology for the identification of genes that can be use in the improvement of specific biological processes in plants. Large-scale gene discovery projects like that depend on high accuracy of the data. The data should not only be trustworthy but should be correctly annotated for various features it contains. In this work we report a bioinformatics system designed to process and annotate the expressed sequence tags (ESTs) obtained by the project Functional Genome of Soybean Roots at Embrapa Soybean (http://www.cnpso.embrapa.br/bioinformatica). The system is made of Perl and PHP scripts, which performs the automated sequence analysis and support the annotation process based on a MySQL database. Various Perl scripts was written to assist the sequence analysis process that includes basecalling, clustering and assembling the reads, filtering of contaminating, repetitive and low quality sequences, identification of sequence features, BLASTing and reports generation. BLAST (Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402) outputs are processed and disposed on a way that is easily accessed by the personal that performs the massive handle of the data for annotation. Also, PHP scripts was written to make a friendly annotation interface through dynamical Web pages that perform the database operations needed for the complete annotation of the genes, whish comprise data retrieval aided by query searches li... Mostrar Tudo |
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LEADER 03743naa a2200313 a 4500 001 1466823 005 2007-07-27 008 2004 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aBINNECK, E. 245 $aBioinformatics tools for sequence analysis and annotation applied to soybean functional genome. 260 $c2004 300 $ap. 248-249. 490 $a(Embrapa Soja. Documentos, 228). 500 $aEditado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi. 520 $aWorldwide functional genomics studies are making an important role on biotechnology for the identification of genes that can be use in the improvement of specific biological processes in plants. Large-scale gene discovery projects like that depend on high accuracy of the data. The data should not only be trustworthy but should be correctly annotated for various features it contains. In this work we report a bioinformatics system designed to process and annotate the expressed sequence tags (ESTs) obtained by the project Functional Genome of Soybean Roots at Embrapa Soybean (http://www.cnpso.embrapa.br/bioinformatica). The system is made of Perl and PHP scripts, which performs the automated sequence analysis and support the annotation process based on a MySQL database. Various Perl scripts was written to assist the sequence analysis process that includes basecalling, clustering and assembling the reads, filtering of contaminating, repetitive and low quality sequences, identification of sequence features, BLASTing and reports generation. BLAST (Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402) outputs are processed and disposed on a way that is easily accessed by the personal that performs the massive handle of the data for annotation. Also, PHP scripts was written to make a friendly annotation interface through dynamical Web pages that perform the database operations needed for the complete annotation of the genes, whish comprise data retrieval aided by query searches linked to key words, data insertion, update, and generation of intuitive reports describing the results. These tools are helping to direct our work on identification, cloning and characterization of genes and regulatory sequences potentially useful in the improvement of soybean through genetic engineering. As results nearly 8,000 ESTs was obtained form cDNA clones derived from soybean roots in drought stress and nematode infection conditions. Consensus sequences are being functionally annotated and used to construct cDNA microarrays that will be useful for analyze gene expression under a broad variety of conditions. Initially we are studying drought stress and nematode infection conditions. Analysis of interactions of soybean roots with this defiance conditions will be used do identify new possible sources of resistance and tolerance. Candidate genes will be deeply studied and can be used on the production of transgenic plants. This work was supported by grants from CNPq, PRODETAB, Jircas and Embrapa. 700 1 $aSILVA, J. F. V. 700 1 $aNEUMAIER, N. 700 1 $aFARIAS, J. R. B. 700 1 $aARIAS, C. A. A. 700 1 $aALMEIDA, A. M. R. 700 1 $aMARIN, S. R. R. 700 1 $aWENDLAND, A. 700 1 $aSILVEIRA, C. A. da 700 1 $aMOLINA, J. C. 700 1 $aLEMOS, N. G. 700 1 $aFUGANTI, R. 700 1 $aSTOLF, R. 700 1 $aNEPOMUCENO, A. L. 773 $tIn: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004.
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