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| Registros recuperados : 70 | |
| 41. |  | MARTINATI, J. de C.; MOLINA, J. V. D.; BONTURI, N.; MARTARELLO, F. H. H.; GUERREIRO FILHO, O.; MALUF, M. P. Expressão de genes relacionados ao metabolismo de nitrogênio, fósforo de potássio em cafeeiros submetidos ao estresse biótico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 42. | | MAIA, F. M.; STRAZZA, B. A.; SCHENK, J. C. M.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Expressão gênica em resposta a deficiência nutricional em folhas resistentes e suscetíveis ao bicho-mineiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 43. | | MARTINATI, J. C.; CARDOSO, D. C.; GUERREIRO-FILHO, O.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; MALUF, M. P. Caracterização molecular da interação cafeeiro/bicho-mineiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 44. | | SCHENK, J. C. M.; PADILHA, L.; MALUF, M. P.; PIRES, D. A.; PEREIRA, L. A.; ROSA, S. D. V. F. da. Gene expression profiles in arabica coffee seeds submitted to different post-harvest processing, drying and storage. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia. Leveraging knowledge for coffee sustainability: proceedings. Armenia: Association for Science and Information on Coffee, 2014. p. 272.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 45. | | GUIMARÃES, P. S.; SCHENK, J. C. M.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; SILVAROLLA, M. B.; PADILHA, L.; MALUF, M. P. Large-scale prospection of genes on caffeine-free Coffea arabica plants - discovery of novel markers associated with development and secondary metabolism. Plant Gene, v. 27, p. 1-9, Sept. 2021. Article 100314.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café. |
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| 46. | | PADILHA, L.; PEREIRA, G. S.; VON PINHO, E. V. R.; TEIXEIRA, R. K. S.; CARVALHO, C. H. S. de; MALUF, M. P.; CARVALHO, B. L. Microsatellite markers in analysis of resistance to coffee leaf miner in arabica coffee. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. Programme & abstracts. [S.l.]: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 192| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 47. | | PEREIRA, G. S.; PADILHA, L.; PINHO, E. V. R. V.; TEIXEIRA, R. de K. S.; CARVALHO, C. H. S. de; MALUF, M. P.; CARVALHO, B. L. de. Microsatellite markers in analysis of resistance to coffee leaf miner in Arabica coffee. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 12, p. 1650-1656, dez. 2011 Título em português: Marcadores microssatélites na análise de resistência ao bicho?mineiro em café arábica.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 48. | | PEREIRA, G. S.; PADILHA, L.; VON PINHO, E. V. R.; TEIXEIRA, R. de K. S.; CARVALHO, C. H. S. de; MALUF, M. P.; CARVALHO, B. L. de. Microsatellite markers in analysis of resistance to coffee leaf miner in Arabica coffee. Pesquisa agropecuária Brasileira, Brasília, v.46, n.12, p.1650-1656, dez. 2011| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 49. | | SILVA, M. S.; PATRICIO, F. R. A.; BRAGHINI, M. T.; SALOMÃO, D.; MALUF, M. P.; MARTINATI, J.; FAZUOLI, L. C.; GUERREIRO FILHO, O. Selection of coffee plants resistant to brown eye spot: genetic variability and influence of the nutritional condition on the expression of resistance to the pathogen. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. Programme & abstracts. [S.l.]: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 201| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 50. | | NONATO, J. V. A.; CARVALHO, H. F.; BORGES, K. L. R.; PADILHA, L.; MALUF, M. P.; FRITSCHE NETO, R.; GUERREIRO FILHO, O. Association mapping reveals genomic regions associated with bienniality and resistance to biotic stresses in arabica coffee. Euphytica, v. 217, n. 10, p. 1-19, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 51. | | FAVORETTO, P.; SILVA, C. C. da; TAVARES, A. G.; GIATTI, G.; MORAES, P. F.; LOBATO, M. T. V.; SILVAROLLA, M. B.; OLIVEIRO FILHO, G.; MALUF, M. P. Assisted-selection of naturally caffeine-free coffee cultivars-characterization of SNPs from a methyltransferase gene. Molecular Breeding, v. 37, n. 31, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 52. | | FAVORETTO, P.; MORAES, P. F.; GIATTI, G.; TAVARES, A. G.; LEAL, R. R.; SILVAROLLA, B. M.; MALUF, M. P.; OLIVEIRO FILHO, G. Assisted-selection of naturaly caffeine-free cultivar: SNPs characterization. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. Programme & abstracts. [S.l.]: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 75| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 53. | | FATOBENE, B. J. dos R.; RENCI, P. F.; SCHENK, J. C. M.; MALUF, M. P.; GUERREIRO FILHO. O.; SILVAROLLA, M. B.; GONÇALVES, W. Análise de expressão gênica da interação entre cafeeiros silvestres de Coffea arabica E Meloidogyne paranaensis. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 54. | | BANDEIRA, T. A. F. P.; ROSA, D. L.; TIMBÓ, R. V.; GAPARI-PEZZOPANE, C.; MALUF, M. P.; SILVA, A. C. da; POLEZ, V. L. P.; CAMPOS, E. G. Ação antioxidante de Coffea arabica cultivar mundo novo IAC 388-17 em diferentes graus de torra. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 55. | | MALUF, M. P.; SILVA, C. C. da; OLIVEIRA, M. de P. A. de; TAVARES, A. G.; SILVAROLLA, M. B.; GUERREIRO FILHO, O. Altered expression of the caffeine synthase gene in a naturally caffeine-free mutant of Coffea arabica. Genetics and Molecular Biology, v. 34, n. 2, p. 802-810, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 56. | | SIMÕES, B. I. E.; SCHENK, J. C. M.; SILVA, K. A. da; GUIMARÃES, P. de S.; MALUF, M. P.; PADILHA, L. Diversidade genética de populações do bicho-mineiro em regiões cafeeiras do Brasil. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 57. | | OLIVEIRA, K. C. de; GUIMARÃES, P. de S.; BAZIOLI, J. M.; MARTINATI, J. C.; SANTOS, M. M. dos; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Effects of somatic embryogenesis on gene expression of cloned coffee heterozygous hybrids. Acta Physiologiae Plantarum, v. 41, n. 7, July 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 58. | | MARTINATI, J. C.; CARDOSO, D. C.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Large-escale expression of genes related to phytoalexins, phenols, flavonoids and lignin biosynthesis in coffee plants infested with leaf-miner. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. Programme & abstracts. [S.l.]: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 83. B11. ASIC 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 59. | | MARTINATI, J. C.; CARDOSO, D. C.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; OLIVEIRA FILHO, G.; MALUF, M. P. Large-escale expression of genes related to phytoalexins, phenols, flavonoids and lignin biosynthesis in coffee plants infested with leaf-miner. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. Programme & abstracts. [S.l.]: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 83 B11. ASIC 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 60. | | CARDOSO, D. C.; MARTINATI, J. C.; GIACHETTO, P. F.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Large-scale analysis of differential gene expression in coffee genotypes resistant and susceptible to leaf miner-toward the identification of candidate genes for marker assisted-selection. BMC Genomics, London, v. 15, p. 1-20, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café. |
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| Registros recuperados : 70 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café. |
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Data corrente: |
22/06/2021 |
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Data da última atualização: |
23/06/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 3 |
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Autoria: |
GUIMARÃES, P. S.; SCHENK, J. C. M.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; SILVAROLLA, M. B.; PADILHA, L.; MALUF, M. P. |
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Afiliação: |
PAULA SOUZA GUIMARÃES, IAC; JULIANA CAMARGO MARTINATI SCHENK, IAC; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MARIA BERNADETE SILVAROLLA, IAC; LILIAN PADILHA, CNPCa; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa. |
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Título: |
Large-scale prospection of genes on caffeine-free Coffea arabica plants - discovery of novel markers associated with development and secondary metabolism. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Gene, v. 27, p. 1-9, Sept. 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.plgene.2021.100314 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article 100314. |
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Conteúdo: |
Abstract. Differential gene expression profiles and metabolic networks are valuable tools for the genetic characterization of agronomic traits. In this study, we used large-scale expression analyses to identify modified biological processes in caffeine-free coffee plants. The first step was the large-scale sequencing of RNA from young and developing tissues of caffeine-free plants (AC1) and plants with normal concentrations of the compound (MN). The resulting 65,000 sequences were analyzed in silico for identification of 171 genes with differential expression between treatments, and establishment of metabolic networks associated with levels of caffeine. Few genes were mapped onto metabolic pathways, indicating that low caffeine has no major effects on physiological processes. The differential expression observed in silico was validated for 12 selected genes in field experiments using qPCR. The expression profile of 5 genes differed on the analyses, and the rest confirmed the in silico profile. Among the validated genes two of them, FIG and LSM-l, may control other agronomic traits associated with low caffeine content in coffee tissues. These genes are potential markers for use in association with other current markers for assisted selection of low-caffeine coffee. Therefore, they may improve the efficiency and effectiveness of coffee breeding programs. |
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Palavras-Chave: |
Assisted-selection; Caffeine-free plants; Coffee; Differential expression; Expressão gênica; RNAseq; Seleção assistida. |
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Thesagro: |
Café Descafeinado; Cafeína; Coffea Arábica. |
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Thesaurus NAL: |
Caffeine; Gene expression. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02480naa a2200361 a 4500
001 2132519
005 2021-06-23
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.plgene.2021.100314$2DOI
100 1 $aGUIMARÃES, P. S.
245 $aLarge-scale prospection of genes on caffeine-free Coffea arabica plants - discovery of novel markers associated with development and secondary metabolism.$h[electronic resource]
260 $c2021
500 $aArticle 100314.
520 $aAbstract. Differential gene expression profiles and metabolic networks are valuable tools for the genetic characterization of agronomic traits. In this study, we used large-scale expression analyses to identify modified biological processes in caffeine-free coffee plants. The first step was the large-scale sequencing of RNA from young and developing tissues of caffeine-free plants (AC1) and plants with normal concentrations of the compound (MN). The resulting 65,000 sequences were analyzed in silico for identification of 171 genes with differential expression between treatments, and establishment of metabolic networks associated with levels of caffeine. Few genes were mapped onto metabolic pathways, indicating that low caffeine has no major effects on physiological processes. The differential expression observed in silico was validated for 12 selected genes in field experiments using qPCR. The expression profile of 5 genes differed on the analyses, and the rest confirmed the in silico profile. Among the validated genes two of them, FIG and LSM-l, may control other agronomic traits associated with low caffeine content in coffee tissues. These genes are potential markers for use in association with other current markers for assisted selection of low-caffeine coffee. Therefore, they may improve the efficiency and effectiveness of coffee breeding programs.
650 $aCaffeine
650 $aGene expression
650 $aCafé Descafeinado
650 $aCafeína
650 $aCoffea Arábica
653 $aAssisted-selection
653 $aCaffeine-free plants
653 $aCoffee
653 $aDifferential expression
653 $aExpressão gênica
653 $aRNAseq
653 $aSeleção assistida
700 1 $aSCHENK, J. C. M.
700 1 $aCINTRA, L. C.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aSILVAROLLA, M. B.
700 1 $aPADILHA, L.
700 1 $aMALUF, M. P.
773 $tPlant Gene$gv. 27, p. 1-9, Sept. 2021.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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