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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
23/07/2021 |
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Data da última atualização: |
23/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LÜHRS, L.; SOUSA, V. A. de; ROSSINI, B. C.; KESTRING, D. R.; AGUIAR, A. V. de. |
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Afiliação: |
LARISSA LÜHRS, Bolsista Embrapa Florestas; VALDERES APARECIDA DE SOUSA, CNPF; BRUNO CÉSAR ROSSINI, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; DAIANE RIGONI, CNPF; ANANDA VIRGINIA DE AGUIAR, CNPF. |
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Título: |
Identificação de microssatélites e síntese de primes para erva-mate a partir de programas de bioinformática. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
In: EVENTOS ARAUCÁRIA: PESQUISA, INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA SISTEMAS DE PRODUÇÃO, ERVA-MATE XXI: INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA O SETOR ERVATEIRO, 2020, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2021. |
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Páginas: |
p. 50. |
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Série: |
(Embrapa Florestas. Documentos, 344). |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo. |
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Conteúdo: |
A erva-mate (Ilex paraguariensis S. T. Hill) gera o produto florestal não madeireiro mais importante do agronegócio da região Sul do Brasil. A demanda internacional pela erva-mate vem aumentando, favorecendo o desenvolvimento da sua produção e competitividade. A caracterização genética é indispensável para o estabelecimento de estratégias de conservação e melhoramento genéticos para essa espécie. Atualmente, diferentes ferramentas genômicas estão disponíveis para desenvolvimento de marcadores moleculares, sendo os microssatélites, ou SSRs (sequências simples repetidas) uma das mais utilizadas no estudo genético de populações. Assim, o objetivo desde trabalho foi identificar e desenvolver microssatélites para erva-mate. O DNA de um indivíduo foi utilizado para realizar, a partir da plataforma Illumina-Miseq, um total de 12.933.970 leituras. Para a sua identificação, foram utilizados diferentes programas: PERF, SSR_pipeline e Primer3Plus. Com o auxílio do PERF, foram analisadas as sequências (em arquivo fasta), totalizando 17.715 ocorrências repetidas para variados números de motifs repetidos. O SSR_pipeline utilizou outros arquivos de entrada (fastq) com 12.933.970 leituras e identificou inúmeros SSRs. Assim, associando os resultados dos dois programas, pares de primers flanqueando os microssatélites foram desenhados no Primer3Plus para 18 marcadores. Alguns parâmetros especificados foram: tamanhos, temperaturas e porcentagem de GC (mínimos, ideais e máximos). Seis potenciais marcadores identificados serão validados para a confecção dos iniciadores para esta espécie. Essa ferramenta deverá ser aplicada para análises genéticas diversas, na caracterização genética de populações naturais e sintéticas e em bancos de germoplasma. Novos recursos de bioinformática poderão ser explorados para essa mesma finalidade. MenosA erva-mate (Ilex paraguariensis S. T. Hill) gera o produto florestal não madeireiro mais importante do agronegócio da região Sul do Brasil. A demanda internacional pela erva-mate vem aumentando, favorecendo o desenvolvimento da sua produção e competitividade. A caracterização genética é indispensável para o estabelecimento de estratégias de conservação e melhoramento genéticos para essa espécie. Atualmente, diferentes ferramentas genômicas estão disponíveis para desenvolvimento de marcadores moleculares, sendo os microssatélites, ou SSRs (sequências simples repetidas) uma das mais utilizadas no estudo genético de populações. Assim, o objetivo desde trabalho foi identificar e desenvolver microssatélites para erva-mate. O DNA de um indivíduo foi utilizado para realizar, a partir da plataforma Illumina-Miseq, um total de 12.933.970 leituras. Para a sua identificação, foram utilizados diferentes programas: PERF, SSR_pipeline e Primer3Plus. Com o auxílio do PERF, foram analisadas as sequências (em arquivo fasta), totalizando 17.715 ocorrências repetidas para variados números de motifs repetidos. O SSR_pipeline utilizou outros arquivos de entrada (fastq) com 12.933.970 leituras e identificou inúmeros SSRs. Assim, associando os resultados dos dois programas, pares de primers flanqueando os microssatélites foram desenhados no Primer3Plus para 18 marcadores. Alguns parâmetros especificados foram: tamanhos, temperaturas e porcentagem de GC (mínimos, ideais e máximos). Seis pote... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Erva-mate. |
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Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Ilex Paraguariensis. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224637/1/EmbrapaFlorestas-2021-AnaisErvamateEAraucaria-Documentos344-pg50.pdf
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Marc: |
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300 $ap. 50.
490 $a(Embrapa Florestas. Documentos, 344).
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
01/11/2010 |
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Data da última atualização: |
29/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
BROCK, I.; RODRIGUES, R. A.; FLOGIO, M. A.; MAGALHÃES, P. M. de; OLIVEIRA, M. C. de S.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
INGRID BROCK, INICEP/SÃO CARLOS, SP; RODNEY A. RODRIGUES, PESQ. UNICAMP/CAMPINAS; ANN M. FLOGIO, PESQ. UNICAMP/CAMPINAS; PEDRO M. DE MAGALHÃES, PESQ. UNICAMP/CAMPINAS; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; SERGIO NOVITA ESTEVES, CPPSE; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
Avaliação da contagem de ovos por grama de fezes de ovinos infectados com nematóides gastrintestinais e tratados com extratos de Artemisia annua. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 2., 2010, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária: Embrapa Pecuária Sudeste, 2010. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O uso intensivo de antiparasitários tem contribuído, a nível mundial, para uma situação de resistência dos parasitas a estes. Muitos princípios ativos comercialmente disponíveis frequentemente não possuem a eficácia desejada em várias propriedades que criam pequenos ruminantes. Conforme levantamentos científicos, (Asteraceae) tem diversas aplicações no campo medicinal, pois possui propriedades anti-inflamatória, sedativa, vermífuga, além de uso no controle da malária. Atualmente, os estudos fitoquímicos de extratos vegetais fornecem informações quanto à natureza dos bioativos, o que pode servir de embasamento para elaboração de formulações antiparasitárias. Este trabalho teve como objetivo primordial verificar a eficácia do extrato diclorometano obtido a partir de no controle antiparasitário ( ) de ovinos. Para a execução do presente estudo, utilizou-se 24 ovinos da raça Santa Inês do rebanho da Embrapa Pecuária Sudeste, localizada em São Carlos, SP, que foram tratados com antihelmíntico e infectados artificialmente com 4.000 larvas (no 3º estágio de desenvolvimento) de . Os animais foram divididos em 4 grupos de 6 animais para os seguintes tratamentos: controle (água), extrato de bicarbonato de sódio de , extrato diclorometano de (ambos via oral, 2g/kg p.v.) e fosfato de levamisol injetável na dose de 4,7 mg/kg. A média de ovos por grama (OPG) de fezes dos grupos no dia zero foi de: 1.741, 1.733, 1.758 e 1.741, respectivamente. Foram realizadas contagens nos dias 3, 7, 10 e 14. A porcentagem de eficácia dos tratamentos realizados foi calculada usando-se o programa RESO para o OPG de fezes do 14° dia dos grupos tratados em relação ao controle. Os dois extratos foram produzidos no Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA) da Unicamp. Detectou-se a presença da artemisinina em 0,6% no extrato de bicarbonato e em 11% do extrato diclorometano. Ao final do experimento (dia 14), pôde-se observar uma redução de 94% do OPG para o grupo levamisol em relação ao controle e de 0% para os extratos vegetais. Concluiu-se que os extratos de não se mostraram eficazes, embora o extrato de diclorometano contivesse uma quantidade elevada de artemisinina. Essa substância é considerada ativa no controle dos parasitas causadores da malária, mas não apresentou eficácia sobre o nematóide gastrintestinal , considerado o mais importante na criação de ovinos. MenosO uso intensivo de antiparasitários tem contribuído, a nível mundial, para uma situação de resistência dos parasitas a estes. Muitos princípios ativos comercialmente disponíveis frequentemente não possuem a eficácia desejada em várias propriedades que criam pequenos ruminantes. Conforme levantamentos científicos, (Asteraceae) tem diversas aplicações no campo medicinal, pois possui propriedades anti-inflamatória, sedativa, vermífuga, além de uso no controle da malária. Atualmente, os estudos fitoquímicos de extratos vegetais fornecem informações quanto à natureza dos bioativos, o que pode servir de embasamento para elaboração de formulações antiparasitárias. Este trabalho teve como objetivo primordial verificar a eficácia do extrato diclorometano obtido a partir de no controle antiparasitário ( ) de ovinos. Para a execução do presente estudo, utilizou-se 24 ovinos da raça Santa Inês do rebanho da Embrapa Pecuária Sudeste, localizada em São Carlos, SP, que foram tratados com antihelmíntico e infectados artificialmente com 4.000 larvas (no 3º estágio de desenvolvimento) de . Os animais foram divididos em 4 grupos de 6 animais para os seguintes tratamentos: controle (água), extrato de bicarbonato de sódio de , extrato diclorometano de (ambos via oral, 2g/kg p.v.) e fosfato de levamisol injetável na dose de 4,7 mg/kg. A média de ovos por grama (OPG) de fezes dos grupos no dia zero foi de: 1.741, 1.733, 1.758 e 1.741, respectivamente. Foram realizadas contagens nos dias 3, 7, 10 e... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Nematóides gastrointestinais; Ovinos. |
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Thesagro: |
Artemisia Annua; Tratamento. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23400/1/PROCISNE2010.00168.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 2., 2010, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária: Embrapa Pecuária Sudeste$c2010
520 $aO uso intensivo de antiparasitários tem contribuído, a nível mundial, para uma situação de resistência dos parasitas a estes. Muitos princípios ativos comercialmente disponíveis frequentemente não possuem a eficácia desejada em várias propriedades que criam pequenos ruminantes. Conforme levantamentos científicos, (Asteraceae) tem diversas aplicações no campo medicinal, pois possui propriedades anti-inflamatória, sedativa, vermífuga, além de uso no controle da malária. Atualmente, os estudos fitoquímicos de extratos vegetais fornecem informações quanto à natureza dos bioativos, o que pode servir de embasamento para elaboração de formulações antiparasitárias. Este trabalho teve como objetivo primordial verificar a eficácia do extrato diclorometano obtido a partir de no controle antiparasitário ( ) de ovinos. Para a execução do presente estudo, utilizou-se 24 ovinos da raça Santa Inês do rebanho da Embrapa Pecuária Sudeste, localizada em São Carlos, SP, que foram tratados com antihelmíntico e infectados artificialmente com 4.000 larvas (no 3º estágio de desenvolvimento) de . Os animais foram divididos em 4 grupos de 6 animais para os seguintes tratamentos: controle (água), extrato de bicarbonato de sódio de , extrato diclorometano de (ambos via oral, 2g/kg p.v.) e fosfato de levamisol injetável na dose de 4,7 mg/kg. A média de ovos por grama (OPG) de fezes dos grupos no dia zero foi de: 1.741, 1.733, 1.758 e 1.741, respectivamente. Foram realizadas contagens nos dias 3, 7, 10 e 14. A porcentagem de eficácia dos tratamentos realizados foi calculada usando-se o programa RESO para o OPG de fezes do 14° dia dos grupos tratados em relação ao controle. Os dois extratos foram produzidos no Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA) da Unicamp. Detectou-se a presença da artemisinina em 0,6% no extrato de bicarbonato e em 11% do extrato diclorometano. Ao final do experimento (dia 14), pôde-se observar uma redução de 94% do OPG para o grupo levamisol em relação ao controle e de 0% para os extratos vegetais. Concluiu-se que os extratos de não se mostraram eficazes, embora o extrato de diclorometano contivesse uma quantidade elevada de artemisinina. Essa substância é considerada ativa no controle dos parasitas causadores da malária, mas não apresentou eficácia sobre o nematóide gastrintestinal , considerado o mais importante na criação de ovinos.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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