| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Cerrados. Para informações adicionais entre em contato com cpac.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
06/11/2023 |
|
Data da última atualização: |
06/11/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
MORAES, A. da C. L.; MOLLINARI, M.; FERREIRA, R. C. U.; AONO, A.; LARA, L. A. de C.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; BARRIOS, S. C. L.; GARCIA, A. A. F.; VALLE, C. B. do; SOUZA, A. P. de; VIGNA, B. B. Z. |
|
Afiliação: |
ALINE DA COSTA LIMA MORAES, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; MARCELO MOLLINARI, NORTH CAROLINA STATE UNIVERSITY; REBECCA CAROLINE ULBRICHT FERREIRA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ALEXANDRE AONO, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; LETÍCIA APARECIDA DE CASTRO LARA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; MARCO AURÉLIO CALDAS DE PINHO PESSO, CPAC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; ANETE PEREIRA DE SOUZA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; BIANCA BACCILI ZANOTTO VIGNA, CPPSE. |
|
Título: |
Advances in genomic characterization of Urochloa humidicola: exploring polyploid inheritance and apomixis. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 136, n. 11, 2023. |
|
Páginas: |
17 p. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00122-023-04485-w |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Tropical forage grasses are an important food source for animal feeding, with Urochloa humidicola, also known as Koronivia grass, being one of the main pasture grasses for poorly drained soils in the tropics. However, genetic and genomic resources for this species are lacking due to its genomic complexity, including high heterozygosity, evidence of segmental allopolyploidy, and reproduction by apomixis. These complexities hinder the application of marker-assisted selection (MAS) in breeding programs. Here, we developed the highest-density linkage map currently available for the hexaploid tropical forage grass U. humidicola. This map was constructed using a biparental F1 population generated from a cross between the female parent H031 (CIAT 26146), the only known sexual genotype for the species, and the apomictic male parent H016 (BRS cv. Tupi). The linkage analysis included 4873 single nucleotide polymorphism (SNP) markers with allele dosage information. It allowed mapping of the ASGR locus and apospory phenotype to linkage group 3, in a region syntenic with chromosome 3 of Urochloa ruziziensis and chromosome 1 of Setaria italica. We also identified hexaploid haplotypes for all individuals, assessed the meiotic configuration, and estimated the level of preferential pairing in parents during the meiotic process, which revealed the autopolyploid origin of sexual H031 in contrast to apomictic H016, which presented allopolyploid behavior in preferential pairing analysis. These results provide new information regarding the genetic organization, mode of reproduction, and allopolyploid origin of U. humidicola, potential SNPs markers associated with apomixis for MAS and resources for research on polyploids and tropical forage grasses. MenosTropical forage grasses are an important food source for animal feeding, with Urochloa humidicola, also known as Koronivia grass, being one of the main pasture grasses for poorly drained soils in the tropics. However, genetic and genomic resources for this species are lacking due to its genomic complexity, including high heterozygosity, evidence of segmental allopolyploidy, and reproduction by apomixis. These complexities hinder the application of marker-assisted selection (MAS) in breeding programs. Here, we developed the highest-density linkage map currently available for the hexaploid tropical forage grass U. humidicola. This map was constructed using a biparental F1 population generated from a cross between the female parent H031 (CIAT 26146), the only known sexual genotype for the species, and the apomictic male parent H016 (BRS cv. Tupi). The linkage analysis included 4873 single nucleotide polymorphism (SNP) markers with allele dosage information. It allowed mapping of the ASGR locus and apospory phenotype to linkage group 3, in a region syntenic with chromosome 3 of Urochloa ruziziensis and chromosome 1 of Setaria italica. We also identified hexaploid haplotypes for all individuals, assessed the meiotic configuration, and estimated the level of preferential pairing in parents during the meiotic process, which revealed the autopolyploid origin of sexual H031 in contrast to apomictic H016, which presented allopolyploid behavior in preferential pairing analysis. These r... Mostrar Tudo |
|
Thesaurus Nal: |
Animal feeding; Forage grasses; Plant breeding; Polyploidy; Urochloa humidicola. |
|
Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02743naa a2200325 a 4500
001 2157776
005 2023-11-06
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00122-023-04485-w$2DOI
100 1 $aMORAES, A. da C. L.
245 $aAdvances in genomic characterization of Urochloa humidicola$bexploring polyploid inheritance and apomixis.$h[electronic resource]
260 $c2023
300 $a17 p.
520 $aTropical forage grasses are an important food source for animal feeding, with Urochloa humidicola, also known as Koronivia grass, being one of the main pasture grasses for poorly drained soils in the tropics. However, genetic and genomic resources for this species are lacking due to its genomic complexity, including high heterozygosity, evidence of segmental allopolyploidy, and reproduction by apomixis. These complexities hinder the application of marker-assisted selection (MAS) in breeding programs. Here, we developed the highest-density linkage map currently available for the hexaploid tropical forage grass U. humidicola. This map was constructed using a biparental F1 population generated from a cross between the female parent H031 (CIAT 26146), the only known sexual genotype for the species, and the apomictic male parent H016 (BRS cv. Tupi). The linkage analysis included 4873 single nucleotide polymorphism (SNP) markers with allele dosage information. It allowed mapping of the ASGR locus and apospory phenotype to linkage group 3, in a region syntenic with chromosome 3 of Urochloa ruziziensis and chromosome 1 of Setaria italica. We also identified hexaploid haplotypes for all individuals, assessed the meiotic configuration, and estimated the level of preferential pairing in parents during the meiotic process, which revealed the autopolyploid origin of sexual H031 in contrast to apomictic H016, which presented allopolyploid behavior in preferential pairing analysis. These results provide new information regarding the genetic organization, mode of reproduction, and allopolyploid origin of U. humidicola, potential SNPs markers associated with apomixis for MAS and resources for research on polyploids and tropical forage grasses.
650 $aAnimal feeding
650 $aForage grasses
650 $aPlant breeding
650 $aPolyploidy
650 $aUrochloa humidicola
700 1 $aMOLLINARI, M.
700 1 $aFERREIRA, R. C. U.
700 1 $aAONO, A.
700 1 $aLARA, L. A. de C.
700 1 $aPESSOA FILHO, M. A. C. de P.
700 1 $aBARRIOS, S. C. L.
700 1 $aGARCIA, A. A. F.
700 1 $aVALLE, C. B. do
700 1 $aSOUZA, A. P. de
700 1 $aVIGNA, B. B. Z.
773 $tTheoretical and Applied Genetics$gv. 136, n. 11, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
|
Data corrente: |
25/11/2022 |
|
Data da última atualização: |
10/04/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
DAMASCENO, M. D.; GOMES, A. F. N.; MELO, J. P. P. de; CASTRO, F. de F. A. de; GUIMARÃES, A. S.; LANGE, C. C.; SOUZA, G. N. de. |
|
Afiliação: |
MARCILENE DANIEL DAMASCENO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE JUIZ DE FORA; ANA FLÁVIA NOVAES GOMES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE JUIZ DE FORA; JOÃO PEDRO FERREIRA DE MELO, UNIVERSIDADE FEDERAL FLUMINENSE; FÚLVIA DE FÁTIMA ALMEIDA DE CASTRO, CENTRO UNIVERSITÁRIO PRESIDENTE ANTÔNIO CARLOS; ALESSANDRO DE SA GUIMARAES, CNPGL; CARLA CHRISTINE LANGE, CNPGL; GUILHERME NUNES DE SOUZA, CNPGL. |
|
Título: |
Dinâmica e padrão de infecção dos casos de mastite subclínica e clínica em rebanho bovino mantido em Compost Barn, 2020 a 2022. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE PIBIC/CNPQ, 26., 2022, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2022. |
|
Páginas: |
p. 44-48. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O estudo teve como objetivo avaliar a dinâmica e padrão de infecção intramamária subclínica e clínica de um rebanho bovino mantido em Compost Barn no período de 2020 a 2022. Foram realizadas análises laboratoriais para contagem de células somáticas (CCS) e identificação de patógenos causadores de mastite subclínica. A cultura na fazenda foi realizada para identificação dos patógenos causadores de mastite clínica. Indicadores de dinâmica de mastite subclínica e clínica foram estimados e comparados com os indicadores considerados ideais. Foi observado que dos cinco indicadores de mastite subclínica, dois estavam de acordo ou próximo aos indicadores considerados ideais. Os indicadores relacionados à prevalência da mastite subclínica e ao processo de cronicidade da infecção intramamária não estavam de acordo com o ideal. O principal patógeno envolvido nos casos subclínicos de mastite foi Staphylococcus coagulase negativo. Em relação à mastite clínica, foi observada uma incidência três vezes maior que o ideal e uma reincidência de casos clínicos no mesmo animal acima do limite ideal. O padrão de infecção intramamária dos casos clínicos é por bactérias Gram positivo, sendo Streptococcus uberis (ambiental) e Staphylococcus coagulase negativo (contagioso) os dois principais patógenos. A probabilidade de reincidência de casos de mastite em um mesmo quarto mamário foi maior que a probabilidade de reincidência em quarto mamário diferente. Os resultados mostraram que o rebanho precisa de um ajuste no programa de controle e prevenção da mastite com ênfase na linha de ordenha e no descarte de vacas com infecção crônica e reincidência de casos clínicos. MenosO estudo teve como objetivo avaliar a dinâmica e padrão de infecção intramamária subclínica e clínica de um rebanho bovino mantido em Compost Barn no período de 2020 a 2022. Foram realizadas análises laboratoriais para contagem de células somáticas (CCS) e identificação de patógenos causadores de mastite subclínica. A cultura na fazenda foi realizada para identificação dos patógenos causadores de mastite clínica. Indicadores de dinâmica de mastite subclínica e clínica foram estimados e comparados com os indicadores considerados ideais. Foi observado que dos cinco indicadores de mastite subclínica, dois estavam de acordo ou próximo aos indicadores considerados ideais. Os indicadores relacionados à prevalência da mastite subclínica e ao processo de cronicidade da infecção intramamária não estavam de acordo com o ideal. O principal patógeno envolvido nos casos subclínicos de mastite foi Staphylococcus coagulase negativo. Em relação à mastite clínica, foi observada uma incidência três vezes maior que o ideal e uma reincidência de casos clínicos no mesmo animal acima do limite ideal. O padrão de infecção intramamária dos casos clínicos é por bactérias Gram positivo, sendo Streptococcus uberis (ambiental) e Staphylococcus coagulase negativo (contagioso) os dois principais patógenos. A probabilidade de reincidência de casos de mastite em um mesmo quarto mamário foi maior que a probabilidade de reincidência em quarto mamário diferente. Os resultados mostraram que o rebanho precisa d... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Infecção crônica; Staphylococcus coagulase negativo. |
|
Thesagro: |
Bovino; Doença Animal. |
|
Thesaurus NAL: |
Streptococcus uberis. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1148776/1/Dinamica-e-padrao-de-infeccao-dos-casos-de-mastite.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02644nam a2200253 a 4500
001 2148776
005 2024-04-10
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aDAMASCENO, M. D.
245 $aDinâmica e padrão de infecção dos casos de mastite subclínica e clínica em rebanho bovino mantido em Compost Barn, 2020 a 2022.$h[electronic resource]
260 $aIn: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE PIBIC/CNPQ, 26., 2022, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite$c2022
300 $ap. 44-48.
520 $aO estudo teve como objetivo avaliar a dinâmica e padrão de infecção intramamária subclínica e clínica de um rebanho bovino mantido em Compost Barn no período de 2020 a 2022. Foram realizadas análises laboratoriais para contagem de células somáticas (CCS) e identificação de patógenos causadores de mastite subclínica. A cultura na fazenda foi realizada para identificação dos patógenos causadores de mastite clínica. Indicadores de dinâmica de mastite subclínica e clínica foram estimados e comparados com os indicadores considerados ideais. Foi observado que dos cinco indicadores de mastite subclínica, dois estavam de acordo ou próximo aos indicadores considerados ideais. Os indicadores relacionados à prevalência da mastite subclínica e ao processo de cronicidade da infecção intramamária não estavam de acordo com o ideal. O principal patógeno envolvido nos casos subclínicos de mastite foi Staphylococcus coagulase negativo. Em relação à mastite clínica, foi observada uma incidência três vezes maior que o ideal e uma reincidência de casos clínicos no mesmo animal acima do limite ideal. O padrão de infecção intramamária dos casos clínicos é por bactérias Gram positivo, sendo Streptococcus uberis (ambiental) e Staphylococcus coagulase negativo (contagioso) os dois principais patógenos. A probabilidade de reincidência de casos de mastite em um mesmo quarto mamário foi maior que a probabilidade de reincidência em quarto mamário diferente. Os resultados mostraram que o rebanho precisa de um ajuste no programa de controle e prevenção da mastite com ênfase na linha de ordenha e no descarte de vacas com infecção crônica e reincidência de casos clínicos.
650 $aStreptococcus uberis
650 $aBovino
650 $aDoença Animal
653 $aInfecção crônica
653 $aStaphylococcus coagulase negativo
700 1 $aGOMES, A. F. N.
700 1 $aMELO, J. P. P. de
700 1 $aCASTRO, F. de F. A. de
700 1 $aGUIMARÃES, A. S.
700 1 $aLANGE, C. C.
700 1 $aSOUZA, G. N. de
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
