| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com rosangela.lacerda@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
|
Data corrente: |
04/04/2023 |
|
Data da última atualização: |
22/08/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. |
|
Afiliação: |
RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa. |
|
Título: |
Runs of homozygosity and signatures of selection for number of oocytes and embryos in the Gir Indicine cattle. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 482-496, 2023. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-023-09989-w |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Runs of homozygosity (ROH) and signatures of selection are the results of selection processes in livestock species that have been shown to afect several traits in cattle. The aim of the current work was to verify the profle of ROH and inbreeding depression in the number of total (TO) and viable oocytes (VO) and the number of embryos (EMBR) in Gir Indicine cattle. In addition, we aim to identify signatures of selection, genes, and enriched regions between Gir subpopulations sorted by breeding value for these traits. The genotype fle contained 2093 animals and 420,718 SNP markers. Breeding values used to sort Gir animals were previously obtained. ROH and signature of selection analyses were performed using PLINK software, followed by ROH-based (FROH) and pedigree-based inbreeding (Fped) and a search for genes and their functions. An average of 50±8.59 ROHs were found per animal. ROHs were separated into classes according to size, ranging from 1 to 2 Mb (ROH1?2Mb: 58.17%), representing ancient inbreeding, ROH2?4Mb (22.74%), ROH4-8Mb (11.34%), ROH8-16Mb (5.51%), and ROH>16Mb (2.24%). Combining our results, we conclude that the increase in general FROH and Fped signifcantly decreases TO and VO; however, in diferent chromosomes traits can increase or decrease with FROH. In the analysis for signatures of selection, we identifed 15 genes from 47 signifcant genomic regions, indicating diferences in populations with high and low breeding value for the three traits. |
|
Palavras-Chave: |
Homozigose; Ovócito. |
|
Thesagro: |
Bovino; Embrião Animal; Gado Gir. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
Marc: |
LEADER 02311naa a2200277 a 4500
001 2152954
005 2023-08-22
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-023-09989-w$2DOI
100 1 $aROCHA, R. de F. B.
245 $aRuns of homozygosity and signatures of selection for number of oocytes and embryos in the Gir Indicine cattle.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aRuns of homozygosity (ROH) and signatures of selection are the results of selection processes in livestock species that have been shown to afect several traits in cattle. The aim of the current work was to verify the profle of ROH and inbreeding depression in the number of total (TO) and viable oocytes (VO) and the number of embryos (EMBR) in Gir Indicine cattle. In addition, we aim to identify signatures of selection, genes, and enriched regions between Gir subpopulations sorted by breeding value for these traits. The genotype fle contained 2093 animals and 420,718 SNP markers. Breeding values used to sort Gir animals were previously obtained. ROH and signature of selection analyses were performed using PLINK software, followed by ROH-based (FROH) and pedigree-based inbreeding (Fped) and a search for genes and their functions. An average of 50±8.59 ROHs were found per animal. ROHs were separated into classes according to size, ranging from 1 to 2 Mb (ROH1?2Mb: 58.17%), representing ancient inbreeding, ROH2?4Mb (22.74%), ROH4-8Mb (11.34%), ROH8-16Mb (5.51%), and ROH>16Mb (2.24%). Combining our results, we conclude that the increase in general FROH and Fped signifcantly decreases TO and VO; however, in diferent chromosomes traits can increase or decrease with FROH. In the analysis for signatures of selection, we identifed 15 genes from 47 signifcant genomic regions, indicating diferences in populations with high and low breeding value for the three traits.
650 $aBovino
650 $aEmbrião Animal
650 $aGado Gir
653 $aHomozigose
653 $aOvócito
700 1 $aGARCIA, A. O.
700 1 $aOTTO, P. I.
700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
700 1 $aMARTINS, M. F.
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aPANETTO, J. C. do C.
700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F.
773 $tMammalian Genome$gv. 34, p. 482-496, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 18 | |
| 1. |  | FERNANDES, A. M.; KULCZYNSKI, S. M.; BARBOSA, M. M. M.; GRANDE, J. P.; GOMES, C. B. Levantamento de fitonematóides em hortas no municípios de Cassilândia-MS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 27., 2007, Goiânia. Anais: programação, palestras, resumos. Goiânia: UFG, 2007. p. 54-55| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
|   |
| 4. | | BELLÉ, C.; KULCZYNSKI, S. M.; GOMES, C. B.; KUHN, P. R.; LIMA-MEDINA, I. Diversidade de espécies de Meloidogyne em cana-de-açúcar no Rio Grande do Sul, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
|  |
| 5. | | KASPARY, T. E.; LAMEGO, F. P.; BELLÉ, C.; KULCZYNSKI, S. M.; PITTOL, D. Regulador de crescimento na produtividade e qualidade de sementes de aveia-branca. Planta Daninha, Viçosa, MG, v. 33, n. 4, p. 739-750, out./dez. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 6. | | KUHN, P. R.; KULCZYNSKI, S. M.; BELLÉ, C.; TREVISAN, R.; GOMES, C. B. Suscetibilidade de espécies frutíferas, forrageiras e daninhas a duas populações de mesocriconema xenoplax. Nematropica, v. 45, n. 2, p. 279-284, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 7. | | BELLÉ, C.; KUHN, P. R.; REINEHR, M.; KULCZYNSKI, S. M.; GOMES, C. B. Extratos aquosos de plantas daninhas, aromáticas e oleaginosa no controle de Meloidogyne incognita. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 32., 2015, Londrina. Nematologia: problemas emergentes e perspectivas: anais. Londrina: Sociedade Brasileira de Nematologia, 2015. p. 145| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 10. | | BELLÉ, C.; KULCZYNSKI, S. M.; KUHN, P. R.; DONINI, L. P.; GOMES, C. B. Reaction of sugarcane genotypes to parasitism of Meloidogyne javanica and Pratylenchus zeae. Revista Caatinga, Mossoró, v. 30, n. 2, p. 530-535, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 11. | | FERNANDES, D. S.; SORATTO, R. P.; KULCZYNSKI, S. M.; BISCARO, G. A.; REIS, C. J. dos. Produtividade e qualidade fisiológica de sementes de feijão em conseqüência da aplicação foliar de manganês. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 3, p. 419-426, mar. 2007 Título em inglês: Yield and physiological quality of common bean seeds as affected by manganese foliar application.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 12. | | KIRSCH, V. G.; KULCZYNSKI, S. M.; GOMES, C. B.; BISOGNIN, A. C.; GABRIEL, M.; BELLÉ, C.; LIMA-MEDINA, I. Caracterização de espécies de meloidogyne e de helicotylenchus associadas à soja no Rio Grande do Sul. Nematropica, v. 46, n. 2, p. 197-208, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 13. | | KUHN, P. R.; KULCZYNSKI, S. M.; GOMES, C. B.; BELLÉ, C.; KIRSCH, V. G.; GABRIEL, M.; PEDROSO, D. S. Hospedabilidade de plantas frutíferas, forrageiras e daninhas a Mesocriconema xenoplax. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 32., 2015, Londrina. Nematologia: problemas emergentes e perspectivas: anais. Londrina: Sociedade Brasileira de Nematologia, 2015. p. 121| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 14. | | BELLÉ, C.; KULCZYNSKI, S. M; KUHN, P. R.; CARNEIRO, R. M. D. G.; LIMA-MEDINA, I.; GOMES, C. B. First report of Meloidogyne ethiopica parasitizing sugarcane in Brazil. Plant Disease, v. 101, n. 4, p. 635, Apr. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 15. | | BELLE, C.; GOMES, C. B.; KULCZYNSKI, S. M.; KUHN, P. R.; SIGNORINI, C. B.; SILVA, S. D. A. Reação de genótipos de cana-de-açúcar adaptadas ao Rio Grande do Sul ao parasitismo por Meloidogyne javanica. reaction of adapted genotypes to rio grande do sul state to Meloidogyne javanica parasitism. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 31., 2013, Cuiabá. Nematoides: desafios e manejo - anais. Cuiabá: Sociedade Brasileira de Namatologia, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 17. | | GABRIEL, M.; KULCZYNSKI, S. M. K.; SANTOS, M. F. A.; SOUZA, C. F. B.; MUNIZ, M. F. B.; BOITEUX, L. S.; CARNEIRO, R. M. D. G. A novel virulent Brazilian pathotype of Meloidogyne javanica towards the tomato Mi-1.2 gene and pathogenicity to resistant rootstock. Journal of Plant Diseases and Protection, v. 129, p. 1269-1276, 2022.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 18. | | KULCZYNSKI, S. M.; TOMM, G. O.; CALDERAM, A.; KUHN, P. R.; BELLÉ, C.; KIRSCH, V. G.; PEDROSO, D. S.; WILLE, R. M.; PINHEIRO, M. O.; JASTER, T.; ABREU, C. C.; COSTA, K.; SCARANTTI, V. Reação de genótipos de canola à Leptosphaeria maculans no norte do Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO LATINO AMERICANO DE CANOLA, 1., 2014, Passo Fundo. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014. 6 p. Trabalho 2.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
| |
| Registros recuperados : 18 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
