| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
|
Data corrente: |
18/10/2018 |
|
Data da última atualização: |
18/10/2018 |
|
Autoria: |
BRONZATO, G. F.; OLIVA, M. S.; ALVIN, M. G.; PRIBUL, B. R.; RODRIGUES, D. P.; COELHO, S. M. O.; COELHO, I. S.; SOUZA, M. M. S. |
|
Afiliação: |
Greiciane F. Bronzato, Departamento de Microbiologia e Imunologia Veterinária/Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro - UFRRJ; Marcelo S. Oliva, Departamento de Microbiologia e Imunologia Veterinária/Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro - UFRRJ; Marisol G. Alvin, Departamento de Microbiologia e Imunologia Veterinária/Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro - UFRRJ; Bruno R. Pribul, Laboratório de Enterobactérias/Departamento de Bacteriologia/Instituto Oswaldo Cruz/Fiocruz; Dália P. Rodrigues, Laboratório de Enterobactérias/Departamento de Bacteriologia/Instituto Oswaldo Cruz/Fiocruz; Shana M. O. Coelho, Departamento de Microbiologia e Imunologia Veterinária/Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro - UFRRJ; Irene S. Coelho, Departamento de Microbiologia e Imunologia Veterinária/Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro - UFRRJ; Miliane M. S. Souza, Departamento de Microbiologia e Imunologia Veterinária/Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro - UFRRJ. |
|
Título: |
MALDI-TOF MS as a tool for the identification of Vibrio alginolyticus from Perna perna mussels (Linnaeus, 1758). |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 38, n 8, p. 1511-1517, agosto 2018 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Título em português: MALDI-TOF MS como ferramenta na identificação de Vibrio alginolyticus isolados de mexilhões Perna perna (Linnaeus, 1758). |
|
Conteúdo: |
Vibrio species are ubiquitous in aquatic environments, including coastal and marine habitats. Vibrio alginolyticus is an opportunistic pathogen for fish, crustaceans and mussels and their identification by biochemical tests may be impaired due their nutritional requirements. The study used Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) to identify 49 Vibrio spp. isolates associated with mussels (Perna perna) from different locations along the Rio de Janeiro coast. The rpoA gene was used as a genus-specific marker of Vibrio spp. and was positive in all 209 isolates. MALDI-TOF MS confirmed 87.8% of V. alginolyticus when compared to the results of the biochemical tests. Four isolates were identified as Shewanella putrefaciens (8.16%) and one was identified as V. parahaemolyticus (2.0%). Just one isolate was not identified by this technique (2.0%). The pyrH sequencing confirmed 75% of the proteomic technique results. MALDI-TOF MS is an excellent optionfor characterization of bacterial species, as it is efficient, fast and easy to apply. In addition, our study confirms its high specificity and sensitivity in these marine bacteria identification. |
|
Palavras-Chave: |
MALDI-TOF MS; Militicultura; Mitiliculture. |
|
Thesaurus Nal: |
Mussels; Perna perna; Vibrio alginolyticus. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/184663/1/Maldi-tof-MS-as-a-tool-for-the-identification.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02208naa a2200289 a 4500
001 2097726
005 2018-10-18
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aBRONZATO, G. F.
245 $aMALDI-TOF MS as a tool for the identification of Vibrio alginolyticus from Perna perna mussels (Linnaeus, 1758).$h[electronic resource]
260 $c2018
500 $aTítulo em português: MALDI-TOF MS como ferramenta na identificação de Vibrio alginolyticus isolados de mexilhões Perna perna (Linnaeus, 1758).
520 $aVibrio species are ubiquitous in aquatic environments, including coastal and marine habitats. Vibrio alginolyticus is an opportunistic pathogen for fish, crustaceans and mussels and their identification by biochemical tests may be impaired due their nutritional requirements. The study used Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) to identify 49 Vibrio spp. isolates associated with mussels (Perna perna) from different locations along the Rio de Janeiro coast. The rpoA gene was used as a genus-specific marker of Vibrio spp. and was positive in all 209 isolates. MALDI-TOF MS confirmed 87.8% of V. alginolyticus when compared to the results of the biochemical tests. Four isolates were identified as Shewanella putrefaciens (8.16%) and one was identified as V. parahaemolyticus (2.0%). Just one isolate was not identified by this technique (2.0%). The pyrH sequencing confirmed 75% of the proteomic technique results. MALDI-TOF MS is an excellent optionfor characterization of bacterial species, as it is efficient, fast and easy to apply. In addition, our study confirms its high specificity and sensitivity in these marine bacteria identification.
650 $aMussels
650 $aPerna perna
650 $aVibrio alginolyticus
653 $aMALDI-TOF MS
653 $aMiliticultura
653 $aMitiliculture
700 1 $aOLIVA, M. S.
700 1 $aALVIN, M. G.
700 1 $aPRIBUL, B. R.
700 1 $aRODRIGUES, D. P.
700 1 $aCOELHO, S. M. O.
700 1 $aCOELHO, I. S.
700 1 $aSOUZA, M. M. S.
773 $tPesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF$gv. 38, n 8, p. 1511-1517, agosto 2018
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
|
Data corrente: |
29/12/2017 |
|
Data da última atualização: |
29/12/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 2 |
|
Autoria: |
OLIVEIRA, L. M.; ORÍLIO, A. F.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T.; BLAWID, R. |
|
Afiliação: |
LAYSSA M. OLIVEIRA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA, DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA CELULAR; ANELISE F. ORÍLIO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA, DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA CELULAR; ALICE KAZUKO INOUE NAGATA, CNPH; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA, DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA CELULAR; ROSANA BLAWID, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA, DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA CELULAR. |
|
Título: |
A novel vitivirus-like sequence found in Arracacia xanthorrhiza plants by high throughput sequencing. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 162, n. 7, p. 2141-2144, July 2017. |
|
ISSN: |
0304-8608 |
|
DOI: |
10.1007/s00705-017-3326-0 |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Here we describe the complete genome of a new vitivirus-like sequence that was found in arracacha (Arracacia xanthorrhiza) plants using HTS technology. The complete genome sequence was validated by Sanger sequencing. The genomic organization of the new putative vitivirus resembles that of grapevine virus B (GVB) and grapevine virus D (GVD). |
|
Thesagro: |
Arracacia Xanthorrhiza; Mandioquinha salsa. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 01020naa a2200217 a 4500
001 2083996
005 2017-12-29
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0304-8608
024 7 $a10.1007/s00705-017-3326-0$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, L. M.
245 $aA novel vitivirus-like sequence found in Arracacia xanthorrhiza plants by high throughput sequencing.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aHere we describe the complete genome of a new vitivirus-like sequence that was found in arracacha (Arracacia xanthorrhiza) plants using HTS technology. The complete genome sequence was validated by Sanger sequencing. The genomic organization of the new putative vitivirus resembles that of grapevine virus B (GVB) and grapevine virus D (GVD).
650 $aArracacia Xanthorrhiza
650 $aMandioquinha salsa
700 1 $aORÍLIO, A. F.
700 1 $aINOUE-NAGATA, A. K.
700 1 $aNAGATA, T.
700 1 $aBLAWID, R.
773 $tArchives of Virology$gv. 162, n. 7, p. 2141-2144, July 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
