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| Registros recuperados : 246 | |
| 41. |  | FRIGO, A.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Identificação de SNPs nos genes MYH2 e CLIC4 associados à hérnia umbilical em suínos. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 32-33. JINC 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 42. | | MARCELINO, D. E. P.; VENDRUSCOLO, A.; SANTOS, C. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Superexpressão dos genes ADA, AVBD2 e ANGPTL7 na cartilagem de frangos de corte afetados com necrose da cabeça do fêmur aos 21 dias de idade. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2020, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2020. p. 25-26.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 43. | | GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A. Transcriptional networks reconstruction: identification of genes involved on cattle response to tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus infestation. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 154. Na publicação: Regitano, L.C.A. X-meeting 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 47. | | ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; COUTINHO, L. L.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C. Análise integrada do transcriptoma e exoma revela novos genes relacionados ao acometimento de hérnia escrotal em suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador. Anais... Salvador: SBMA, 2019. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 48. | | ALENCAR, M. M. de; RIBEIRO, A. R. B.; FREITAS, A. R. de; REGITANO, L. C. de A.; IBELLI, A. M. G. Análise por componentes principais, de medidas fisiológicas de bovinos submetidos a teste de tolerâncias ao calor. In: REUNIÓN BIENAL ALPA, 21., 2009, San Juan. Producción animal em tiempos de crisis: anales... San Juan: ALPA, 2009 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 49. | | GOUVEIA, J. J. S.; SANTIAGO, A. C.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; ESTEVES, S. N.; BARIONI JUNIOR, W.; REGITANO, L. C. de A. Associação entre microssatélite localizado no cromossomo OAR3 e peso ao abate de ovinos pertencentes a três grupos genéticos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008 p. 214| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 50. | | TIZIOTO, P. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; GASPARIN, G.; IBELLI, A. M. G.; OLIVIERA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Associação entre polimorfismos de única base (SNP) dos genes PPARGC1A e PSMC1 com espessura de gordura subcutânea em animais da raça Canchim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009. p. 210.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 51. | | GIGLIOTI, R.; PAÇO, A. L.; RIBEIRO, A. R. B.; IBELLI, A. M. G.; CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; OLIVEIRA, H. N. de. Avaliação do comportamento em matrizes de ovinos com diferentes níveis de infecção por helmintos gastrintestinais. In: JORNADA CIENTÍFICA-EMBRAPA SÃO CARLOS, 2009, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2009. Editado por Luiz Francisco Zafalon, Simone Cristina Méo Niciura. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documento 90)| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 52. | | XAVIER SILVA, J.; ARAUJO, A. C.; BRITO, L.; LEDUR, M. C.; PAIVA, S. R.; ABREU JÚNIOR, P. B. de; IBELLI, A. M. G.; CARNEIRO, P. L. S. Análise preliminar da estrutura genética populacional de galinhas nigerianas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020. Recursos genéticos e bioeconomia: inovação para um futuro sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020. Trabalho 678. Evento online.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 53. | | CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Associação do receptor da adiponectina com cortes nobres e características relacionadas à deposição de gordura em uma linhagem paterna de frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Belo Horizonte: SBMA, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 54. | | CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; ONO, R. K.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Associação de um SNP no gene da calmodulina com características de integridade da tíbia em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 69-70. JINC.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 55. | | IBELLI, A. M. G.; FONGARO, G.; TESSMANN, A. L.; RIBEIRO, J. B.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Association of an InDel in the ghrelin gene with performance traits in a paternal broiler line. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: SBG, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 56. | | GRUPIONI, N. V.; STAFUZZA, N. B.; CARVAJAL, A. B.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Association of RUNX2 and TNFSF11 genes with production traits in a paternal broiler line. Genetics and Molecular Research, v. 16, n.1, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 57. | | CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; PANDOLFI, J. R. C.; SETTLES, M.; LEDUR, M. C. Age effects on gene expression related to the bacterial chondronecrosis with osteomyelitis in broiler. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 23., 2015, San Diego, CA. Abstracts? San Diego, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 58. | | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; ROCHA, M. I. P.; IBELLI, A. M. G.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Comparação de diferentes protocolos para visualização de DNA separado por eletroforese em gel de agarose utilizando-se os corantes fluorescentes brometo de etídeo e GelRedr. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE MÉTODOS DOS LABORATÓRIOS DA EMBRAPA, 15., 2010, Pelotas, RS. Novas perspectivas para os laboratórios da Embrapa. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 59. | | GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; GOUVEIA, J. J. de S.; LEDUR, M. C. Comprehensive analyses of bone and cartilage transcriptomes evince ion transport, inflammation and cartilage development-related genes involved in chickens femoral head separation. Animals, v. 12, n. 788, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 60. | | PETRY, B.; ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O. Comparação de métodos de homogeneização celular e congelamento para extração de RNA. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 7., 2013, Concórdia. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 13-14.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| Registros recuperados : 246 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
29/08/2022 |
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Data da última atualização: |
01/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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Autoria: |
OKINO, C. H.; IBELLI, A. M. G.; NICIURA, S. C. M.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
Transcriptoma abomasal comparativo de ovinos da raça Morada Nova com fenótipos divergentes de resistência a Haemonchus contortus. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2022. |
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Páginas: |
34 p. |
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Série: |
(Embrapa Pecuária Sudeste. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 54). |
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ISSN: |
1981-2078 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O presente estudo teve como objetivo comparar o transcriptoma abomasal de ovinos da raça Morada Nova com fenótipos divergentes de resistência a Haemonchus contortus. Para tanto, 287 cordeiros foram submetidos a dois desafios parasitários experimentais e monitorados quanto ao ganho de peso, ao volume globular e à contagem de ovos por
grama de fezes. Após análise de dados, foram selecionados 10 animais de cada extremo de fenótipo de resistência parasitária, sendo que metade desses animais foi submetida ao sequenciamento de RNA (RNAseq) da mucosa abomasal. Genes diferencialmente expressos (DE) relacionados às respostas imunes e outros processos biológicos foram observados entre os grupos extremos de resistência parasitária por RNAseq baseando-se nos três genomas ovinos disponíveis nas bases de dados públicas (NCBI Oar 2.0 - 21 genes DE, Ensembl Oar 1.0 - 11 genes DE e Ensembl Texel 3.1 - 14 genes DE). No entanto apenas cinco genes DE (B3GNT3, CLCA1, TFF3, PKLR e SELP) foram comuns aos três genomas. Para a validação dos resultados de RNAseq por RT-qPCR foram desenhados primers para 14 genes DE, para, no mínimo, duas regiões gênicas em éxons distintos por gene. Entretanto, só houve amplificação específica para oito genes, e apenas um gene apresentou concordância com os resultados de RNAseq. Concluiu-se que a validação por RT-qPCR não foi possível, provavelmente por dois motivos principais: 1) baixa quantidade de sequências atribuídas à maioria dos genes DE e 2) baixa qualidade de anotação do genoma ovino. Foram utilizadas três versões de referência atualizadas do genoma ovino que apresentam discordâncias quanto à montagem, localização e anotação dos genes. Isso impacta diretamente e negativamente nos resultados de validação por RT-qPCR, dado que, se as regiões gênicas (principalmente relacionadas à junção éxon-éxon) não estão bem anotadas, há dificuldades e falhas no desenho dos primers e na amplificação adequada. MenosO presente estudo teve como objetivo comparar o transcriptoma abomasal de ovinos da raça Morada Nova com fenótipos divergentes de resistência a Haemonchus contortus. Para tanto, 287 cordeiros foram submetidos a dois desafios parasitários experimentais e monitorados quanto ao ganho de peso, ao volume globular e à contagem de ovos por
grama de fezes. Após análise de dados, foram selecionados 10 animais de cada extremo de fenótipo de resistência parasitária, sendo que metade desses animais foi submetida ao sequenciamento de RNA (RNAseq) da mucosa abomasal. Genes diferencialmente expressos (DE) relacionados às respostas imunes e outros processos biológicos foram observados entre os grupos extremos de resistência parasitária por RNAseq baseando-se nos três genomas ovinos disponíveis nas bases de dados públicas (NCBI Oar 2.0 - 21 genes DE, Ensembl Oar 1.0 - 11 genes DE e Ensembl Texel 3.1 - 14 genes DE). No entanto apenas cinco genes DE (B3GNT3, CLCA1, TFF3, PKLR e SELP) foram comuns aos três genomas. Para a validação dos resultados de RNAseq por RT-qPCR foram desenhados primers para 14 genes DE, para, no mínimo, duas regiões gênicas em éxons distintos por gene. Entretanto, só houve amplificação específica para oito genes, e apenas um gene apresentou concordância com os resultados de RNAseq. Concluiu-se que a validação por RT-qPCR não foi possível, provavelmente por dois motivos principais: 1) baixa quantidade de sequências atribuídas à maioria dos genes DE e 2) baixa qualidade d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análise de transcriptoma; Bibliotecas de cDNA; Extração de RNA; Integridade de RNA; Nematódeos gastrintestinais; Resiliência; RNAseq; RT qPCR; Sequenciamento de RNA; Transcriptômica. |
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Thesagro: |
Cordeiro; Haemonchus Contortus; Nematóide; Ovino. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1145846/1/BOLETIM-54.pdf
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Marc: |
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Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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