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| Registros recuperados : 213 | |
| 142. |  | CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M.; GOMES, C. C. G.; ROSO, V. M.; HIGA, R. H.; YOKOO, M. J.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I. Cluster cross-validation for genomic prediction of tick resistance in Braford and Hereford cattle. In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of knowledge in animal production: abstracts. Campinas: SBZ, 2013. Não paginado. Resumo 6HAX.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 143. | | CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M.; GULIAS-GOMES, C. C.; ROSO, V. M.; HIGA, R. H.; YOKOO, M. J. I.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I. Cluster cross-validation for genomic prediction of tick resistance in Braford and Hereford cattle. In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of knowledge in animal production: abstracts. Campinas: SBZ, 2013. Não paginado. 1 CD-ROM. Resumo 6HAX.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 144. | | COMIN, H. B.; SOLLERO, B. P.; JUNQUEIRA, V. S.; CARDOSO, L. L.; HIGA, R. H.; CAETANO, A. R.; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. Controle de qualidade de genótipos e amostras utilizados na seleção genômica das raças Braford e Hereford In: SEMINÁRIO INTERINSTITUCIONAL DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 18.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16,; MOSTRA DE EXTENSÃO, 11., 2013, Cruz Alta. Ciência, conhecimento e sociedade de risco: anais. Cruz Alta: Unicruz, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 146. | | BIEGELMEYER, P.; OLIVEIRA, M. M.; CARDOSO, L. L.; GOMES, C. C. G.; HIGA, R. H.; DIONELLO, N. J. L.; CAETANO, A. R.; STEIBEL, J. P.; CARDOSO, F. F. Estimation of linkage disequilibrium, persistence of phase and effective population size of Brazilian Hereford and Braford breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 147. | | BIEGELMEYER, P.; OLIVEIRA, M. M.; CARDOSO, L. L.; GOMES, C. C. G.; HIGA, R. H.; DIONELLO, N. J. L.; CAETANO, A. R.; STEIBEL, J. P.; CARDOSO, F. F. Estimation of linkage disequilibrium, persistence of phase and effective population size of Brazilian Hereford and Braford breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 148. | | BIEGELMEYER, P.; OLIVEIRA, M. M.; CARDOSO, L. L.; GULIAS-GOMES, C. C.; HIGA, R. H.; DIONELLO, N. J. L.; CAETANO, A. R.; STEIBEL, J. P.; CARDOSO, F. F. Estimation of linkage disequilibrium, persistence of phase and effective population size of Brazilian Hereford and Braford breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 149. | | IBELLI, A. M. G.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A. Genes e vias metabólicas envolvidos nos mecanismos de resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 74.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 150. | | FALCAO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2004. 5 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 64). Na publicação: Michel Eduardo Beleza Yamaghishi.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 151. | | BIEGELMEYER, P.; OLIVEIRA, M. M.; GOMES, C. C. G.; HIGA, R. H.; CAETANO, A. R.; STEIBEL, J. P.; CARDOSO, F. F. Linkage disequilibrium and persistence of phase in Hereford and Braford cattle. In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of knowledge in animal production: abstracts. Campinas: SBZ, 2013. Não paginado. Resumo 6GYR.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 152. | | BIEGELMEYER, P.; OLIVEIRA, M. M.; GULIAS-GOMES, C. C.; HIGA, R. H.; CAETANO, A. R.; STEIBEL, J. P.; CARDOSO, F. F. Linkage disequilibrium and persistence of phase in Hereford and Braford cattle. In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of knowledge in animal production: abstracts. Campinas: SBZ, 2013. Não paginado. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 154. | | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Rotâmeros raros no Java Protein Dossier. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. 6 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 76).| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 155. | | OLIVEIRA, S. R. de M.; PAVANELLI, D. S.; ALMEIDA, G. V.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER, P. R.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B. da; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. STING_DB: a relational database of structural parameters for protein analysis. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 132. Na publicação: Paula R. Kuser, Edgard H. Santos. X-meeting 2005. Presented Posters.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 156. | | HIGA, R. H.; TOGAWA, R. C.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. C. F.; OKIMOTO, I. K. S.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Sting Millennium Suite: integrated software for extensive analyses of 3d structures of proteins and their complexes. BMC Bioinformatics, v. 5, p. 1-9, 2004. Na publicação: Paula R Kuser.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 157. | | HIGA, R. H.; TOGAWA, R. C.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. C. F.; OKIMOTO, I. K. S.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Sting millennium suite: integrated software for extensive analyses of 3d structures of proteins and their complexes. BMC Bioinformatics, v. 5, n. 107, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 158. | | NESHICH, G.; MANCINI, A. L.; YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; FILETO, R.; PINTO, I. P.; PALANDRANI, J. F.; KRAUCHENCO, J. N.; BAUDET, C.; MONTAGNER, A. J.; HIGA, R. H. STING Report: convenient web-based application for graphic and tabular presentations of protein sequence, structure and function descriptors from the STING database. Nucleic Acids Research, v. 33, p. D269-D274, 2005. Na publicação: Paula R. Kuser.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 159. | | URBINATI, I.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, M. T.; CHUD, T. C. S.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; BUZANSKAS, M. E.; MUNARI, D. P. Selection signatures in Canchim beef cattle Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 7, p. 1-9, 2016. Na publicação: Luciana Correia de Almeida Regitano.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 160. | | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2005. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 67).| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| Registros recuperados : 213 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
04/08/2005 |
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Data da última atualização: |
17/01/2020 |
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Autoria: |
MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A.; DOMINIQUINI, F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. |
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Afiliação: |
ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; Cenargen; CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ROBERTO COITI TOGAWA, Cenargen; GORAN NESIC, CNPTIA. |
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Título: |
Sting contacts: a web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces. |
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Ano de publicação: |
2004 |
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Fonte/Imprenta: |
Bioinformatics, v. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004. |
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DOI: |
10.1093/bioinformatics/bth203 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Na publicação: P. R. Kuser. |
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Conteúdo: |
Amino acid contacts in terms of atomic interactions are essential factors to be considered in the analysis of the structure of a protein and its complexes. Consequently, molecular biologists do require specific tools for the identification and visualization of all such contacts. Graphical contacts (GC) and interface forming residue graphical contacts (IFRgc) presented here, calculate atomic contacts among amino acids based on a table of predefined pairs of the atom types and their distances, and then display them using number of different forms. The inventory of currently listed contact types by GC and IFRgc include hydrogen bonds (in nine different flavors), hydrophobic interactions, charge?charge interactions, aromatic stacking and disulfide bonds. Such extensive catalog of the interactions, representing the forces that govern protein folding, stability and binding, is the key feature of these two applications. GC and IFRgc are part of STING Millennium Suite. |
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Palavras-Chave: |
Sting Millennium Suite. |
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Thesagro: |
Aminoácido; Proteina. |
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Thesaurus NAL: |
Amino acids; Proteins. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 01880naa a2200289 a 4500
001 1009086
005 2020-01-17
008 2004 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1093/bioinformatics/bth203$2DOI
100 1 $aMANCINI, A. L.
245 $aSting contacts$ba web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces.$h[electronic resource]
260 $c2004
500 $aNa publicação: P. R. Kuser.
520 $aAmino acid contacts in terms of atomic interactions are essential factors to be considered in the analysis of the structure of a protein and its complexes. Consequently, molecular biologists do require specific tools for the identification and visualization of all such contacts. Graphical contacts (GC) and interface forming residue graphical contacts (IFRgc) presented here, calculate atomic contacts among amino acids based on a table of predefined pairs of the atom types and their distances, and then display them using number of different forms. The inventory of currently listed contact types by GC and IFRgc include hydrogen bonds (in nine different flavors), hydrophobic interactions, charge?charge interactions, aromatic stacking and disulfide bonds. Such extensive catalog of the interactions, representing the forces that govern protein folding, stability and binding, is the key feature of these two applications. GC and IFRgc are part of STING Millennium Suite.
650 $aAmino acids
650 $aProteins
650 $aAminoácido
650 $aProteina
653 $aSting Millennium Suite
700 1 $aHIGA, R. H.
700 1 $aOLIVEIRA, A.
700 1 $aDOMINIQUINI, F.
700 1 $aFALCAO, P. R. K.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
700 1 $aTOGAWA, R. C.
700 1 $aNESHICH, G.
773 $tBioinformatics$gv. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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