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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
24/10/1997 |
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Data da última atualização: |
02/06/2006 |
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Autoria: |
PIPOLO, A. E.; DOMIT, L. A.; MIRANDA, L. C.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A.; GARCIA, A. |
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Afiliação: |
Embrapa Soja, Cx. Postal 231, CEP 86001-970 Londrina-PR. |
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Título: |
Difusao de cultivares de soja desenvolvidas pela EMBRAPA-CNPSo. |
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Ano de publicação: |
1997 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIAO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIAO CENTRAL DO BRASIL, 18., 1996, Uberlandia. Ata e resumos. Uberlandia: UFU / DEAGRO, 1997. |
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Páginas: |
p.266-267. |
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Idioma: |
Português |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Cultivar; Parana; Soybean; Variety. |
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Thesagro: |
Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Brazil. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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700 1 $aALMEIDA, L. A.
700 1 $aGARCIA, A.
773 $tIn: REUNIAO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIAO CENTRAL DO BRASIL, 18., 1996, Uberlandia. Ata e resumos. Uberlandia: UFU / DEAGRO, 1997.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
28/01/2011 |
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Data da última atualização: |
13/04/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Software |
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Autoria: |
HIGA, R. H. |
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Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA. |
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Título: |
Upload/GenBank/Chado. Versão 1.0. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O pacote bioperl (http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page) fornece um script, chamado bp_genbank2gff3.pl que converte arquivos em formato GeneBank (GBK) para GFF3. Contudo, este script não permite que, a partir de um arquivo centrado em contigs, que é o padrão para arquivos GBK, seja gerado um arquivo GFF3 centrado no cromossomo. Este pacote contorna o problema apresentado acima, disponibilizando 2 scripts Python para utilização em conjunto com o script bp_genbank2gff3.pl. A solução apresentada foi desenvolvida no escopo do projeto Rede Genômica Animal, mas pode ser utilizada por qualquer projeto que precise gerar arquivos GFF3 a partir de arquivos GBK, por exemplo para inserção no esquema de banco de dados Chado (http://gmod.org/wiki/Overview#Chado_and_BioSQL) e utilização do genome browser GBrowse (http://gmod.org/wiki/GBrowse). |
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Palavras-Chave: |
Arquivo GFF3; Conversão de arquivos; Projeto Rede Genômica Animal; Software. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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260 $aCampinas: Embrapa Informática Agropecuária$c2010
300 $c1 CD-ROM.
520 $aO pacote bioperl (http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page) fornece um script, chamado bp_genbank2gff3.pl que converte arquivos em formato GeneBank (GBK) para GFF3. Contudo, este script não permite que, a partir de um arquivo centrado em contigs, que é o padrão para arquivos GBK, seja gerado um arquivo GFF3 centrado no cromossomo. Este pacote contorna o problema apresentado acima, disponibilizando 2 scripts Python para utilização em conjunto com o script bp_genbank2gff3.pl. A solução apresentada foi desenvolvida no escopo do projeto Rede Genômica Animal, mas pode ser utilizada por qualquer projeto que precise gerar arquivos GFF3 a partir de arquivos GBK, por exemplo para inserção no esquema de banco de dados Chado (http://gmod.org/wiki/Overview#Chado_and_BioSQL) e utilização do genome browser GBrowse (http://gmod.org/wiki/GBrowse).
653 $aArquivo GFF3
653 $aConversão de arquivos
653 $aProjeto Rede Genômica Animal
653 $aSoftware
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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