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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.
Data corrente:  02/01/2014
Data da última atualização:  22/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  GIACHETTO, P. F.; PEREIRA, F. C. P.; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. A.; SILVA, M. V.; NICIURA, S. C. M.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; MEIRELLES, S. L. C.; LIMA, A. O.; REGITANO, L. C. A.
Afiliação:  POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; FERNANDA C. P. PEREIRA; FABIANA B. MOKRY; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; SARAH L. C. MEIRELLES, UFV; ANDRESSA O. LIMA, UFSCar; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título:  Initial analysis of copy number variations in canchim beef cattle with extreme phenotypes for ribeye area.
Ano de publicação:  2013
Fonte/Imprenta:  In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013.
Páginas:  Não paginado.
Idioma:  Inglês
Notas:  Pôster P0572.
Conteúdo:  Genomic structural variation, in the form of large-scale insertions and deletions, as well as inversions and translocations, are referred to as copy number variations (CNVs). Compared to single nucleotide polymorphisms (SNPs), CNVs have potentially greater effects on gene structure, dosage and regulation, being an important source of phenotypic variation. In humans, CNVs are widespread in the genome and have been shown to be associated with complex traits. In livestock species, the characterization of this genetic variation is an important step toward linking genes or genomic regions with phenotypic traits of economic importance. Studies in cattle have revealed some CNVs associated with differences in host parasite resistance and breed-specific differences in adaptation, health, and production traits. We report initial data from an analysis of CNVs in Canchim, a synthetic cattle (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) that has been selected for meat production in Brazil. Using the PennCNV software and data from 192 Canchim DNA samples with extreme phenotypes for ribeye area, genotyped with Illumina BovineHD BeadChip, a total of 6,985 CNVs were detected. The regions ranged from 20,012bp to 4,157,122bp, with mean and median of 140,484bp and 81,303bp, respectively. Copy number gains (62.09%) were found to be more common than deletions. Gene content of discovered CNVs and functional enrichment analysis are being assessed using Ensembl genes and cattle RefSeq databases, and PANTHER classifica... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Bioinformática; Copy number variations; Polimorfismo de nucleotídeo único; Single nucleotide polymorphisms.
Thesagro:  Variação Genética.
Thesaurus Nal:  Bioinformatics; Genetic variation; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94588/1/P0572.odt
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/97848/1/P0572.odt
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA17699 - 1UPCRA - DD
CPPSUL13143 - 1UPCRA - DD
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Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Cerrados. Para informações adicionais entre em contato com cpac.biblioteca@embrapa.br.

Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Cerrados.
Data corrente:  16/08/2012
Data da última atualização:  13/08/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  BROSSARD, M.; FREGONEZI, G. A. DE F.; GUIMARÃES, M. de F.; MEDINA, C. de C.; PASINI, A.; VILELA, L.; AYARZA, M. A.
Afiliação:  MICHEL BROSSARD, INSTITUT DE RECHERCHE POUR LE DÉVELOPPEMENT; GUSTAVO ADOLFO DE FREITAS FREGONEZI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; MARIA DE FÁTIMA GUIMARÃES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; CRISTIANE DE CONTI MEDINA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; AMARILDO PASINI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; LOURIVAL VILELA, CPAC; MIGUEL ANGEL AYARZA, CORPORACIÓN COLOMBIANA DE INVESTIGACIÓ AGRÍCOLA.
Título:  Analysis of an illustrative interaction between structural features and earthworm populations in Brazilian ferralsols.
Ano de publicação:  2012
Fonte/Imprenta:  Comptes Rendus Geoscience, v. 344, p. 41-49, 2012.
Páginas:  p. 41-49.
ISSN:  1631-0713
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Ferralsols are characterized by poorly-defined horizons, weak macrostructure and strong development of a fine granular structure comprising subangular micro-aggregates. In this study, the morphological and physical modifications caused by earthworm activity in a clayey ferralsol were analysed. After describing soil structures, undisturbed samples were taken for evaluating aggregates and determining clod bulk density and particle density. Soil water retention properties were measured and an inventory of soil invertebrate macrofauna was created. The structural and porous transformations were due to aggregates created by earthworm activity. Changes in bulk density can be associated with pore modifications caused by a change in the proportions of aggregate types, and a notable reduction of total porosity was measured, tending to increase soil volume with dense aggregates. Structural modifications affected the topsoil down to 0.5 m and water retention between 1 and 33 kPa, the principal water compartment of these soils.
Palavras-Chave:  Ciência do solo.
Thesagro:  Estrutura do Solo; Latossolo; Minhoca.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Cerrados (CPAC)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CPAC33335 - 1UPCAP - PPCRI8063CRI8063
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