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| Registros recuperados : 134 | |
| 2. |  | DANTAS, W. de M. F.; RIBEIRO FILHO, J. D.; GUIMARÃES, J. D.; GUIMARÃES, S. E. F. Perfil metabólico e ponderal de leitões submetidos a dietas com diferentes teores de fósforo em ambientes térmicos distintos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 11, p. 901-910, nov. 2014. Título em inglês: Metabolic profile and body weight of piglets fed with different levels of phosphorus in distinct thermal environments.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 3. | | PIRES, A. V.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GUIMARAES, C. T.; PEIXOTO, J. O. Mapeamento de locos de características quantitativas associados à composição de carcaça, no cromossomo seis de suíno Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 60, n. 3, p. 725-732, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 5. | | ARAÚJO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; COLUMBIANO, V. S.; TEIXEIRA, M. R.; LOPES, P. S. Descrição de cinco loci de microsatélite em uma população de caprinos da raça Alpina e sua utilização em testes de confirmação de paternidade em casos onde o genótipo materno é ou não informado. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2003. 5 f. 1 CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 7. | | PEIXOTO, J. de O.; FARIA, D. A. de; SILVA, P. V.; FONSECA, I.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Association between leptin genes single nucleotide polymorphisms and carcass traits in pigs Revista Brasileira de Zootecnia, v.38, n.2, p.271-276, 2009 Subprojeto: 16.00.30004-00| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 8. | | SOLLERO, B. P.; YAMAKI, M.; GUIMARÃES, S. E. F.; CARNEIRO, P. L. S.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S. Análise de componentes principais como ferramenta na avaliação da diversidade genética de suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | DOMINGUES, R.; GASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; REIS, D. R. L.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential expression of CXCL10 in peripheral blood of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | FONSECA, I.; ANTUNES, G. R.; PAIVA, D. de S.; LANGE, C. C.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F. Differential expression of genes during mastitis in Holstein-Zebu crossbreed dairy cows. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 3, p. 1295-1303, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | DOMINGUES, R.; PALLA, P. C.; CESTARO, L. S.; CUNHA, A. C. L. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential gene expression profiles in skin of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 13. | | ARAÚJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA C. S.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T.; COLUMBIANO, V. S. Paternidade em rebanhos caprinos por meio de microssatélites de DNA. In: SIMPÓSIO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO ANIMAL, 5., 2004, Pirassunuga, SP. Anais... Pirassunuga: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2004. 4 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 15. | | FONSECA, I.; SILVA, P. V.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S.; LANGE, C. C.; GUIMARÃES, M. F. M. Perfil da expressão dos genes IL-4 e IFN-y em células do leite de vacas da raça Gir Leiteiro saudáveis e com mastite clínica. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 16. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 6, p. 619-626, jun. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | ARAÚJO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; RODRIGUES, M. T.; PAIVA, A. L. C.; LOPES, P. S.; COLUMBIANO, V. S. Sistema Multiplex de microssatélite para teste de paternidade em caprinos da raça Alpina. Revista Brasileira de Reprodução Animal, Belo Horizonte, v. 27, n. 3, p. 590-591, 2003.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 19. | | FONSECA, I.; SILVA, P. V.; MIRANDA, C. L.; GUIMARÃES, M. F. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Expressão diferencial do gene interleucina 6 em células do leite de vacas sadias e com mastite. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 97.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 134 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
17/07/2023 |
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Data da última atualização: |
22/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 4 |
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Autoria: |
ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. |
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Afiliação: |
RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MATEUS GUIMARÃES DOS SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-coding genes ARNT, EGR1, HIF1A, AHR, and PAX2 are good markers for the production of oocytes and embryos in Gir cattle. MenosGenome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Associação genômica. |
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Thesagro: |
Bovino; Embrião Animal; Gado Gir; Genética Animal. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02508naa a2200289 a 4500
001 2154972
005 2023-08-22
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0$2DOI
100 1 $aROCHA, R. de F. B.
245 $aSingle-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aGenome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-coding genes ARNT, EGR1, HIF1A, AHR, and PAX2 are good markers for the production of oocytes and embryos in Gir cattle.
650 $aBovino
650 $aEmbrião Animal
650 $aGado Gir
650 $aGenética Animal
653 $aAssociação genômica
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700 1 $aOTTO, P. I.
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700 1 $aMARTINS, M. F.
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aPANETTO, J. C. do C.
700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F.
773 $tMammalian Genome$gv. 34, p. 497-508, 2023.
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Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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