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Registros recuperados : 137 | |
81. | | SOLLERO, B. P.; PAIVA, S. R.; FARIA, D. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; BERTRANI, G. R.; MAMANI, E.; ALBUQUERQUE, M. do S. M. de; CASTRO, S. T. R.; GERMANO, J. L.; MARIANTE, A. da S. Genetic diversity in naturalized and commercial pig breeds in Brazil. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 8., 2006, Belo Horizonte, MG. Proceedings... Belo Horizonte: Instituto Prociência, 2006. Não paginado. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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82. | | ARAUJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, T. M. M.; LOPES, P. S.; PEREIRA, C. S.; SILVA, F. L. R. da; RODRIGUES, M. T.; COLUMBIANO, V. de S.; FONSECA, C. G. da. Genetic diversity between herds of Alpine and Saanen dairy goats and the naturalized Brazilian Moxotó breed. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 29, n. 1, p. 67-79, 2006. Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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83. | | AZEVEDO, A. L. S.; NASCIMENTO, C. S.; STEINBERG, R. S.; CARVALHO, M. R. S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Genetic polymorphism of the kappa-casein gene in Brazilian cattle. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 7, n. 3, p. 623-630, 2008. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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84. | | SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Genomic growth curves of an outbred pig population. Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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85. | | SOUZA, C. dos A. de; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S.; GUIMARÃES, S. E. F.; DUTRA JUNIOR, W. M.; SILVA, E. C. da; PIOVEZAN, U.; BERTANI, G.; LEDUR, M. C.; PEREIRA, PEREIRA, R. W. Haplótipos de DNA mitocondrial (mtDNA) como ferramenta para diferenciar estoques comerciais e locais de suínos no Brasil. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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86. | | SOUZA, C. dos A. de; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S.; GUIMARÃES, S. E. F.; DUTRA JUNIOR, W. M.; SILVA, E. C. da; PIOVEZAN, U.; BERTANI, G. R.; LEDUR, M. C.; PEREIRA, R. W. Haplótipos de DNA mitocondrial (mtDNA) como ferramenta para diferenciar estoques comerciais e locais de suínos no Brasil. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais. São Carlos, SP: SBMA, 2008. 4 p. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10. Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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87. | | SOUZA, C. A.; PEREIRA, R. P.; MARIANTE, A. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; DUTRA JUNIOR, W. M.; SILVA, E. C.; PIOVEZAN, U.; BERTANI, G.; LEDUR, M. C.; PAIVA, S. R. Haplótipos de DNA mitocondrial (mtDNA) em suínos no Brasil: diferenciação entre estoques comerciais e locais. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 160. p. 213. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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88. | | SOUZA, C. A.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. S.; MURATA, L. S.; SERENO, J. R. B.; GUIMARÃES, S. E. F.; DUTRA JR. W. M.; PIOVEZAN, U.; BERTANI, G.; LEDUR, M. C.; PEREIRA, R. W. Origem das raças locais de suínos no Brasil a partir do DNA mitocondrial: perpectivas para a conservação da espécie. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Anais. Águas de Lindóia: SGB, 2007. p. 317 Projeto n. 01.02.10.210-10. Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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89. | | SOUZA, C. A.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. S.; MURATA, L. S.; SERENO, J. R. B.; GUIMARÃES, S. E. F.; DUTRA JÚNIOR, W. M.; PIOVEZAN, U.; BERTANI, G.; LEDUR, M. C.; PEREIRA, R. W. Origem das raças locais de suínos no Brasil a partir do DNA mitocondrial: perspectivas para a conservação da espécie. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2007. p. 317. Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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90. | | SOUZA, C. A.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. S.; MURATA, L. S.; SERENO, J. R. B.; GUIMARÃES, S. E. F.; DUTRA JUNIOR, W. M.; PIOVEZAN, U.; BERTANI, G. R.; LEDUR, M. C.; PEREIRA, R. W. Origem das raças locais de suínos NO Brasil a partir do DNA Mitocondrial: perspectivas para a conservação da espécie. In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 204. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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91. | | PAIVA, S. R.; FARIA, D. A.; SILVÉRIO, V. C.; MCMANUS, C.; EGITO, A. A.; DERGAM, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; CASTRO, S. R.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; MARIANTE, A. S. Phylogenetic relationships among brazilian sheep breeds. In: THE ROLE OF BIOTECHNOLOGY, 2005, Turin, Italy. [Anais...]. [S.l.: s.n.], 2005. p. 197-198. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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92. | | FONSECA, I.; PEREIRA, W. P.; CARNEIRO, J. da C.; BRITO, M. A. V. P. e; FERREIRA, M. B. D.; BRANDAO, H. de M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F. Perfil de expressão do gene TGF-B1 em vacas gir infectadas com Streptococcus agalactiae. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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93. | | CAMPOS, F. G.; IBELLI, A. M. G.; OLIVEIRA, H. C. de; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; TEIXEIRA, S. A.; COSTA, K. A.; LEDUR, M. C.; GUIMARÃES, S. E. F. Manual para identificação de RNAs longos não codificantes (lncRNAs) por meio de ferramentas bioinformáticas na análise de transcriptomas. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2023. 41 p. (Embrapa Suínos e Aves. Documentos, 244). Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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94. | | ROCHA, R. de F. B.; OTTO, P. I.; GARCIA, A. O.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; CALUS, M. P. L.; GUIMARÃES, S. E. F. A genética envolvida na produção de oócitos e embriões em Gir leiteiro. Balde Branco, ano 59, n. 703, p. 56-59, 2024. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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95. | | MARTINS, M. F.; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; SANTOS, A. S. O.; VIEIRA, F. O.; MARTINS, S. A. V.; FOGAÇA, G. N.; LIMA, K. R.; CARDOSO, F. F.; GUIMARÃES, S. E. F. Gene expression profile of AATK in milk cells from dairy Gyr cows infected with Streptococcus agalactiae. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 187. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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96. | | MARTINS, M. F.; PINTO, I. S. B.; SANTOS, A. S. O.; VIEIRA, F. O.; MARTINS, S. A. V.; FOGAÇA, G. N.; LIMA, K. R.; CARDOSO, F. F.; GUIMARÃES, S. E. F. Gene expression profile of AATK in milk cells from dairy gyr cows infected with Streptococcus agalactiae. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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97. | | FONSECA, I.; CARDOSO, F. F.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; BRANDAO, H. de M.; BRITO, M. A. V. P. e; FERREIRA, M. B. D.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F. Gene expression profile in zebu dairy cows (Bos taurus indicus) with mastitis caused by Streptococcus agalactiae. Livestock Science, v. 180, p. 47-57, Oct. 2015. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sul. |
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98. | | SOLLERO, B. P.; PAIVA, S. R.; FARIA, D. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; EGITO, A. A.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; CASTRO, S. T. R.; MURATA, L. S.; MARIANTE, A. S. Estrutura genética de cinco raças naturalizadas e comerciais de suínos do Brasil. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006. p. 185. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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99. | | NASCIMENTO, C. S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PEIXOTO, J. de O.; FURLONG, J.; PRATA, M. C. de A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LOPES, P. S. Expressed sequenced tags profiling of resistant and susceptible Gyr x Holstein cattle infested with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 4, 2011. 14 p. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
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100. | | VIEIRA, F. O.; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; SANTOS, A. S. O.; MARTINS, S. A. V.; FOGAÇA, G. N.; LIMA, K. R.; CARDOSO, F. F.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F. Expression analysis of CCL20 in cells from the milk of gyr cows before and 24 hours after artificial infection with Streptococcus agalactiae. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sul. |
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Registros recuperados : 137 | |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
17/07/2023 |
Data da última atualização: |
22/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 4 |
Autoria: |
ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. |
Afiliação: |
RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MATEUS GUIMARÃES DOS SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa. |
Título: |
Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Genome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-coding genes ARNT, EGR1, HIF1A, AHR, and PAX2 are good markers for the production of oocytes and embryos in Gir cattle. MenosGenome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-co... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Associação genômica. |
Thesagro: |
Bovino; Embrião Animal; Gado Gir; Genética Animal. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
Marc: |
LEADER 02508naa a2200289 a 4500 001 2154972 005 2023-08-22 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0$2DOI 100 1 $aROCHA, R. de F. B. 245 $aSingle-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aGenome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-coding genes ARNT, EGR1, HIF1A, AHR, and PAX2 are good markers for the production of oocytes and embryos in Gir cattle. 650 $aBovino 650 $aEmbrião Animal 650 $aGado Gir 650 $aGenética Animal 653 $aAssociação genômica 700 1 $aGARCIA, A. O. 700 1 $aOTTO, P. I. 700 1 $aSANTOS, M. G. dos 700 1 $aSILVA, M. V. G. B. 700 1 $aMARTINS, M. F. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aPANETTO, J. C. do C. 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 773 $tMammalian Genome$gv. 34, p. 497-508, 2023.
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