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| Registros recuperados : 58 | |
| 25. |  | MALUF, M. P.; SILVESTRINI, M.; RUGGIERO, L. M. de C.; GUERREIRO FILHO, O.; COLOMBO, C. A. Genetic diversity of cultivated Coffea arabica inbred lines assessed by RAPD, AFLP and SSR marker systems. Scientia Agricola, v. 62, n. 4, p. 366-373, 2005. Título em português: Caracterização da diversidade genética de linhagens comerciais de Coffea arabica através de marcadores moleculares do tipo RAPD, AFLP e SSR.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 26. | | ORTEGA, H. M.; PADILHA, L.; GUERREIRO FILHO, O.; GONÇALVES, W.; MALUF, M. P.; BRAGINI, M. T. Microssatellite for fingerprinting Coffea arabica clones. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. Programme & abstracts. [S.l.]: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 202| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 27. | | PEZZOPANE, C. de G.; FAVARIN, J. L.; MALUF, M. P.; PEZZOPANE, J. R. M.; GUERREIRO FILHO, O. Atributos fenológicos e agronômicos em cultivares de cafeeiro arábica. In.: CIÊNCIA RURAL, Santa Maria, v.39, n.3, p.711-717, mai-jun. 2009. Título em inglês: Phenological and agronimic attributes in arabica cultivars of coffee tree.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 28. | | RIBEIRO, F. N. S.; EIRA, M. T. S. da; REIS, R. B. dos; GUERREIRO FILHO, O.; FAZUOLI, L. C. Criopreservação de sementes de Coffea racemosa. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 3., 2003, Porto Seguro. Resumos... Brasília, DF: Embrapa Café, 2003.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 29. | | MARTINATI, J. C.; CARDOSO, D. C.; GUERREIRO-FILHO, O.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; MALUF, M. P. Caracterização molecular da interação cafeeiro/bicho-mineiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 30. | | MARTINATI, J. de C.; MOLINA, J. V. D.; BONTURI, N.; MARTARELLO, F. H. H.; GUERREIRO FILHO, O.; MALUF, M. P. Expressão de genes relacionados ao metabolismo de nitrogênio, fósforo de potássio em cafeeiros submetidos ao estresse biótico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 31. | | MAIA, F. M.; STRAZZA, B. A.; SCHENK, J. C. M.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Expressão gênica em resposta a deficiência nutricional em folhas resistentes e suscetíveis ao bicho-mineiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 32. | | FATOBENE, B. J. dos R.; RENCI, P. F.; SCHENK, J. C. M.; MALUF, M. P.; GUERREIRO FILHO. O.; SILVAROLLA, M. B.; GONÇALVES, W. Análise de expressão gênica da interação entre cafeeiros silvestres de Coffea arabica E Meloidogyne paranaensis. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 33. | | MALUF, M. P.; SILVA, C. C. da; OLIVEIRA, M. de P. A. de; TAVARES, A. G.; SILVAROLLA, M. B.; GUERREIRO FILHO, O. Altered expression of the caffeine synthase gene in a naturally caffeine-free mutant of Coffea arabica. Genetics and Molecular Biology, v. 34, n. 2, p. 802-810, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 34. | | GHINI, R.; TORRE NETO, A.; DENTZIEN, A. F. M.; BETTIOL, W.; PATRICIO, F. R. A.; GUERREIRO FILHO, O.; THOMAZIELLO, R. A.; BRAGHINI, M. T.; FAZUOLI, L. C. Brazilian coffee free-air carbon dioxide enrichment (face) facility: predicting the impact of climate change. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. [Programme & abstracts...] Costa Rica: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 918-921.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 35. | | GHINI, R.; TORRE NETO, A.; DENTZIEN, A. F. M.; BETTIOL, W.; PATRICIO, F. R. A.; GUERREIRO FILHO, O.; THOMAZIELLO, R. A.; BRAGHINI, M. T.; FAZUOLI, L. C. Brazilian coffee free-air carbon dioxide enrichment (face) facility: predicting the impact of climate change. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. [Programme & Abstracts...] Costa Rica: Association for Science and Information on Coffee - ASIC, 2012. Ref. PA 152. p. 276.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 36. | | NONATO, J. V. A.; CARVALHO, H. F.; BORGES, K. L. R.; PADILHA, L.; MALUF, M. P.; FRITSCHE NETO, R.; GUERREIRO FILHO, O. Association mapping reveals genomic regions associated with bienniality and resistance to biotic stresses in arabica coffee. Euphytica, v. 217, n. 10, p. 1-19, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 37. | | OLIVEIRA, K. C. de; GUIMARÃES, P. de S.; BAZIOLI, J. M.; MARTINATI, J. C.; SANTOS, M. M. dos; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Effects of somatic embryogenesis on gene expression of cloned coffee heterozygous hybrids. Acta Physiologiae Plantarum, v. 41, n. 7, July 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 38. | | BAZIOLI, J. M.; GUIMARÃES, P. de S.; STRAZZA, B. A.; SCHENK, J. C. M.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Desenvolvimento de marcadores associados à resistência do bicho-mineiro: seleção e validação de SNPs. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. Título em inglês: Development of molecular markers associated with leaf-miner resistance: selection and validation of SNPs.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 39. | | VIDAL, L. de A.; ALMEIDA, J. D. de; PINTO, E. R. de C.; VEIGA, A. D.; FERNANDEZ, D.; GUERREIRO FILHO, O.; ALBUQUERQUE, E. V. S. de. Obtenção de RNA de bicho-mineiro (Leucoptera coffeella) para transcritômica e silenciamento gênico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 40. | | CARVALHO, A. M. de; BOTELHO, C. E.; FERREIRA, A. D.; TERAMOTO, E. T.; LIMA, A. E.; MIYAZAKI JUNIOR, F. S.; GUERREIRO FILHO, O. Initial vegetative and reproductive development of coffee cultivars in Vale do Ribeira Paulista Semina. Ciências Agrárias, v. 43, n. 3, p. 961-972, maio./jun. 2022. Título em português: Desenvolvimento vegetativo e reprodutivo inicial de cultivares de café no Vale do Ribeira Paulista.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| Registros recuperados : 58 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
21/08/2023 |
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Data da última atualização: |
21/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
CARVALHO, H. F.; FERRÃO, L. F. V.; GALLI, G.; NONATO, J. V. A.; PADILHA, L.; MALUF, M. P.; RESENDE JR., M. F. R. de; FRITSCHE-NETO, R.; GUERREIRO-FILHO, O. |
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Afiliação: |
HUMBERTO FANELLI CARVALHO, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS; LUÍS FELIPE VENTORIM FERRÃO, UNIVERSITY OF FLORIDA; GIOVANNI GALLI, LOUISIANA STATE UNIVERSITY; JULIANA VIEIRA ALMEIDA NONATO, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS; LILIAN PADILHA, CNPCa; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa; MÁRCIO FERNANDO RIBEIRO DE RESENDE JR., UNIVERSITY OF FLORIDA; ROBERTO FRITSCHE-NETO, LOUISIANA STATE UNIVERSITY; OLIVEIRO GUERREIRO-FILHO, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS. |
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Título: |
On the accuracy of threshold genomic prediction models for leaf miner and leaf rust resistance in arabica coffee. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 1, 2023. |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11295-022-01581-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Obtaining resistance cultivars for leaf miner and leaf rust are the main important strategy of Brazil?s national coffee breeding program. The narrow genetic basis, and founder effect consequences, lead to challenges in quantifying and detecting genetic diversity for these traits. Biotechnology tools allied with classical breeding strategies are powerful in detecting variability and deploying a precision selection. The selection based on the genetic merit of an individual obtained from thousands of single nucleotide polymorphism effects is known as genomic selection. The ordinal scale principally makes the resistance evaluation of the leaf rust and leaf miner of the score, categorizing the phenotypes following the discrete (ordinal) distribution. Hence, this distribution can be better analyzed by threshold models. Our goals were to optimize genomic prediction models for coffee resistance to leaf rust and leaf miner via threshold models and compare pedigree and genomic relationship matrices to underlying prediction models. We have observed that the genomic model with the genomic relationship matrix performed better for all scenarios. For the traits with at least five degrees of scores, the threshold models performed better, whereas for a trait with ten degrees of scores, we see no advantage to using a threshold model for genomic prediction. |
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Thesaurus NAL: |
Coffea arabica var. arabica; Genomics; Hemileia; Leaf rust; Leucoptera. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1156023/1/On-the-accuracy-of-threshold-genomic-prediction.pdf
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Marc: |
LEADER 02259naa a2200301 a 4500
001 2156023
005 2023-08-21
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11295-022-01581-8$2DOI
100 1 $aCARVALHO, H. F.
245 $aOn the accuracy of threshold genomic prediction models for leaf miner and leaf rust resistance in arabica coffee.$h[electronic resource]
260 $c2023
300 $a10 p.
520 $aObtaining resistance cultivars for leaf miner and leaf rust are the main important strategy of Brazil?s national coffee breeding program. The narrow genetic basis, and founder effect consequences, lead to challenges in quantifying and detecting genetic diversity for these traits. Biotechnology tools allied with classical breeding strategies are powerful in detecting variability and deploying a precision selection. The selection based on the genetic merit of an individual obtained from thousands of single nucleotide polymorphism effects is known as genomic selection. The ordinal scale principally makes the resistance evaluation of the leaf rust and leaf miner of the score, categorizing the phenotypes following the discrete (ordinal) distribution. Hence, this distribution can be better analyzed by threshold models. Our goals were to optimize genomic prediction models for coffee resistance to leaf rust and leaf miner via threshold models and compare pedigree and genomic relationship matrices to underlying prediction models. We have observed that the genomic model with the genomic relationship matrix performed better for all scenarios. For the traits with at least five degrees of scores, the threshold models performed better, whereas for a trait with ten degrees of scores, we see no advantage to using a threshold model for genomic prediction.
650 $aCoffea arabica var. arabica
650 $aGenomics
650 $aHemileia
650 $aLeaf rust
650 $aLeucoptera
700 1 $aFERRÃO, L. F. V.
700 1 $aGALLI, G.
700 1 $aNONATO, J. V. A.
700 1 $aPADILHA, L.
700 1 $aMALUF, M. P.
700 1 $aRESENDE JR., M. F. R. de
700 1 $aFRITSCHE-NETO, R.
700 1 $aGUERREIRO-FILHO, O.
773 $tTree Genetics & Genomes$gv. 19, n. 1, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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