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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Milho e Sorgo. Para informações adicionais entre em contato com rosangela.lacerda@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
20/05/2025 |
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Data da última atualização: |
07/10/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RIBEIRO, P. C. O.; HOWARD, R.; JARQUIN, D.; OLIVEIRA, I. C. M.; CHAVES, S.; CARNEIRO, P. C. S.; SOUZA, V. F.; SCHAFFERT, R. E.; DAMASCENO, C. M. B.; PARRELLA, R. A. da C.; DIAS, K. O. G.; PASTINA, M. M. |
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Afiliação: |
PEDRO C. O. RIBEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; REKA HOWARD, UNIVERSITY OF NEBRASKA; DIEGO JARQUIN, UNIVERSITY OF FLORIDA; ISADORA C. M. OLIVEIRA; SAULO CHAVES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; PEDRO C. S. CARNEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; VANDER F. SOUZA; ROBERT EUGENE SCHAFFERT, CNPMS; CYNTHIA MARIA BORGES DAMASCENO, CNPMS; RAFAEL AUGUSTO DA COSTA PARRELLA, CNPMS; KAIO OLIMPIO G. DIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
Prediction of biomass sorghum hybrids using environmental feature‑enriched genomic combining ability models in tropical environments. |
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Ano de publicação: |
2025 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 138, article 113, 2025. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00122-025-04895-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Gathering environmental and genomic information can beneft the breeding of sorghum hybrids by overcoming complications imposed by the genotype-by-environment interaction (GEI). In this study, we explored the value of combining environmental features (EFs) and genomic data to enhance predictions for biomass sorghum hybrid breeding, addressing GEI complexities. We also investigated if considering specifc time windows for EFs improves the prediction. We used a historical dataset from a tropical biomass sorghum breeding program featuring 253 genotypes across 64 trials. Initially, a frst-stage analysis was performed to obtain the adjusted means (EBLUEs) and scrutinize the impact of 29 EFs (geographic, climatic, and soil-related EFs) on GEI. Subsequently, in the second-stage analysis, we used data from 221 hybrids that had both parents genotyped to evaluate the predictive ability and assertiveness of 12 models with diferent efects. The most relevant EFs included soil organic carbon, insolation on a horizontal surface, longitude, temperature at dew point, and nitrogen content. Across three cross-validation scenarios (CV1, CV0, and CV00), the most efective model encompassed main combining ability efects, GEI, and G휔I (genotype-by-specifc environmental efects interaction), utilizing an environmental kinship matrix (Ω) derived from mean EF values. Only in CV2, a model with a similar structure but utilizing Ω from specifc time windows outperformed others. Our fndings highlight the potential of integrating environmental and genomic data to refne predictive models for optimizing biomass sorghum hybrid breeding strategies. MenosGathering environmental and genomic information can beneft the breeding of sorghum hybrids by overcoming complications imposed by the genotype-by-environment interaction (GEI). In this study, we explored the value of combining environmental features (EFs) and genomic data to enhance predictions for biomass sorghum hybrid breeding, addressing GEI complexities. We also investigated if considering specifc time windows for EFs improves the prediction. We used a historical dataset from a tropical biomass sorghum breeding program featuring 253 genotypes across 64 trials. Initially, a frst-stage analysis was performed to obtain the adjusted means (EBLUEs) and scrutinize the impact of 29 EFs (geographic, climatic, and soil-related EFs) on GEI. Subsequently, in the second-stage analysis, we used data from 221 hybrids that had both parents genotyped to evaluate the predictive ability and assertiveness of 12 models with diferent efects. The most relevant EFs included soil organic carbon, insolation on a horizontal surface, longitude, temperature at dew point, and nitrogen content. Across three cross-validation scenarios (CV1, CV0, and CV00), the most efective model encompassed main combining ability efects, GEI, and G휔I (genotype-by-specifc environmental efects interaction), utilizing an environmental kinship matrix (Ω) derived from mean EF values. Only in CV2, a model with a similar structure but utilizing Ω from specifc time windows outperformed others. Our fndings highlight the pote... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Combinação genômica; Interação genótipo-ambiente. |
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Thesagro: |
Biomassa; Hibrido; Melhoramento Vegetal; Sorgo. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
LEADER 02694naa a2200337 a 4500
001 2175793
005 2025-10-07
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520 $aGathering environmental and genomic information can beneft the breeding of sorghum hybrids by overcoming complications imposed by the genotype-by-environment interaction (GEI). In this study, we explored the value of combining environmental features (EFs) and genomic data to enhance predictions for biomass sorghum hybrid breeding, addressing GEI complexities. We also investigated if considering specifc time windows for EFs improves the prediction. We used a historical dataset from a tropical biomass sorghum breeding program featuring 253 genotypes across 64 trials. Initially, a frst-stage analysis was performed to obtain the adjusted means (EBLUEs) and scrutinize the impact of 29 EFs (geographic, climatic, and soil-related EFs) on GEI. Subsequently, in the second-stage analysis, we used data from 221 hybrids that had both parents genotyped to evaluate the predictive ability and assertiveness of 12 models with diferent efects. The most relevant EFs included soil organic carbon, insolation on a horizontal surface, longitude, temperature at dew point, and nitrogen content. Across three cross-validation scenarios (CV1, CV0, and CV00), the most efective model encompassed main combining ability efects, GEI, and G휔I (genotype-by-specifc environmental efects interaction), utilizing an environmental kinship matrix (Ω) derived from mean EF values. Only in CV2, a model with a similar structure but utilizing Ω from specifc time windows outperformed others. Our fndings highlight the potential of integrating environmental and genomic data to refne predictive models for optimizing biomass sorghum hybrid breeding strategies.
650 $aBiomassa
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 23 | |
| 1. |  | CRUZ, A. G.; ALVARES, V. de S.; SOUZA, J. M. L. de; TEIXEIRA, R. B.; GOMES, S. P. da S. Interferência do tempo de armazenamento na qualidade da farinha de mandioca com açafrão-da-terra. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 6., 2023, Rio Branco, AC. Sistemas agroalimentares sustentáveis e o futuro da Amazônia: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2024. p. 35-40. Apresentação oral. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 6). Coordenador: Jacson Rondinelli da Silva Negreiros.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 2. | | CAMPOS, M. M.; BORGES, A. L. DA C. C.; LOPES, F. C. F.; PANCOTI, C. G.; SILVA, R. R. E; SILVESTRE, T.; MACHADO, F. S.; GOMES, S. P. Consumo de dietas contendo cana de açúcar tratada ou não com óxido de cálcio em vacas em lactação Holandês x Gir. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 13.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 17.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 23.; SIMPÓSIO ALAGOANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 2., 2011, Maceió. Inovação tecnológica e mercado consumidor: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | FERREIRA, A. C. H.; RODRIGUEZ, N. M.; NEIVA, J. N. M.; PIMENTEL, P. G.; GOMES, S. P.; CAMPOS, W. E.; LOPES, F. C. F. Consumo de nutrientes da silagem de capim elefante com diferentes níveis de subprodutos da indústria do suco de caju. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 52., 2015, Belo Horizonte. Zootecnia: otimizando recursos e potencialidades: anais. Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2015. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | GOMES, S. P. da S.; ALVARES, V. de S.; SOUZA, J. M. L. de; CRUZ, A. G.; TEIXEIRA, R. B.; AMARAL, E. F. do. Caracterização físico-química de farinhas de mandioca produzidas na Terra Indígena Puyanawa, Mâncio Lima, Acre. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 6., 2023, Rio Branco, AC. Sistemas agroalimentares sustentáveis e o futuro da Amazônia: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2024. p. 16-21. Apresentação oral. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 6). Coordenador: Jacson Rondinelli da Silva Negreiros.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 5. | | CAMPOS, M. M.; BORGES, A. L. DA C. C.; LOPES, F. C. F.; PANCOTI, C. G.; SILVA, R. R. E; SILVESTRE, T.; MACHADO, F. S.; GOMES, S. P. Digestibilidade aparente de dietas contendo cana de açúcar tratada ou não com óxido de cálcio em vacas em lactação Holandês x Gir. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 13.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 17.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 23.; SIMPÓSIO ALAGOANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 2., 2011, Maceió. Inovação tecnológica e mercado consumidor: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | FERREIRA, A. C. H.; RODRIGUEZ, N. M.; NEIVA, J. N. M.; PIMENTEL, P. G.; GOMES, S. P.; CAMPOS, W. E.; LOPES, F. C. F. Digestibilidade aparente dos nutrientes da silagem de capim elefante com diferentes níveis de subprodutos da indústria do suco de caju. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 52., 2015, Belo Horizonte. Zootecnia: otimizando recursos e potencialidades: anais. Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2015. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | PANCOTI, C. G.; CAMPOS, M. M.; BORGES, A. L. DA C. C.; SILVA, R. R. E; SILVESTRE, T.; MACHADO, F. S.; GOMES, S. P. Parâmetros ruminais de dietas contendo cana de açúcar tratada ou não com óxido de cálcio, em fêmeas bovinas leiteiras Holandês x Gir. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 13.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 17.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 23.; SIMPÓSIO ALAGOANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 2., 2011, Maceió. Inovação tecnológica e mercado consumidor: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | FERREIRA, A. C. H.; RODRIGUEZ, N. M.; NEIVA, J. N. M.; PIMENTEL, P. G.; GOMES, S. P.; CAMPOS, W. E.; LOPES, F. C. F. Nutritional evaluation of elephant-grass silages with different levels of by-products from the cashew juice industry. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 44, n. 12, p. 434-442, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | GONTIJO, M. H. R.; BORGES, A. L. C. C.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; GOMES, S. P.; BORGES, I.; RODRIGUEZ, N. M.; CAMPOS, M. M. Potencial forrageiro de seis híbridos de sorgo com capim sudão. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 7, n. 1, p. 33-43, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | FERREIRA, A. C. H.; RODRIGUEZ, N. M.; NEIVA, J. N. M.; PIMENTEL, P. G.; LOPES, F. C. F.; GOMES, S. P.; MIZUBUTI, I. Y.; PINTO, A. P. In situ degradability of elephant grass ensiled with acerola by-product. Semina: Ciências Agrárias v. 40, n. 5, p. 2427-2438, 2019. Suppl. 1.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | PEREIRA, A. C.; GONÇALVES, L. C.; BORGES, A. L. C. C.; RODRIGUES, J. A. S.; GOMES, S. P.; BORGES, I.; RODRIGUEZ, N. M.; FERREIRA, J. J. C.; DELGADO, L. P.; CAMPOS, M. M. Avaliação da silagem do híbrido de sorgo BR 601 com aditivos: alterações nos teores de matéria seca, frações fibrosas e digestibilidade "in vitro" da matéria seca. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 7, n. 2, p. 153-163, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 12. | | PEREIRA, A. C.; SILVA, R. R. e; GONÇALVES, L. C.; BORGES, A. L. C. C.; BORGES, I.; GOMES, S. P.; RODRIGUES, J. A. S.; SALIBA, E. O. S.; FERREIRA, J. J. C.; SILVA, J. J. da. Avaliação da silagem do híbrido de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench) BR 601 com aditivos 1 pH, nitrogênio amoniacal, matéria seca, proteína bruta e carboidratos solúveis. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 6, n. 2, p. 211-222, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 13. | | PANCOTI, C. G.; PEREIRA, A. C.; BORGES, A. L. C. C.; GONÇALVES, L. C.; GOMES, S. P.; RODRIGUES, J. A. S.; BORGES, I.; CAMPOS, M. M.; SILVA, R. R. e; RODRIGUEZ, N. M.; LAGE, A. D.; SALIBA, E. O. S. Perfil de fermentação de silagens do híbrido de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench) BR 601 com aditivos: 3. frações fibrosas. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ: UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 14. | | PENNA, A. G.; BORGES, A. L. C. C.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; GOMES, S. P.; PENNA, C. F. A. M.; BORGES, I.; RODRIGUEZ, N. M.; SILVA, R. R. e. Produção de seis híbridos de sorgo com capim-sudão avaliados em três cortes e em duas épocas de semeadura. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 9, n. 1, p. 93-105, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 15. | | GONTIJO, M. H. R.; BORGES, A. L. C. C.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; GOMES, S. P.; BORGES, I.; RODRIGUEZ, N. M.; CAMPOS, M. M.; PANCOTI, C. G. Qualidade nutricional de seis híbridos de sorgo com capim sudão submetidos a épocas de plantio e cortes distintas. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 7, n. 1, p. 45-56, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 16. | | FERREIRA, A. C. H.; RODRIGUEZ, N. M.; NEIVA, J. N. M.; PIMENTEL, P. G.; GOMES, S. P.; CAMPOS, W. E.; LOPES, F. C. F.; MIZUBUTI, I. Y.; MOREIRA, G. R. In situ degradability of elephant grass ensiled with increasing levels of pineapple agro-industrial byproduct. Semina: Ciências Agrárias, v. 37, n. 4, p. 2807-2818, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | PENNA, A. G.; BORGES, A. L. C. C.; GONÇALVES, L. C.; GOMES, S. P.; RODRIGUES, J. A. S.; PENNA, C. F. A. M.; BORGES, I.; GRAÇA, D. S.; SILVA, R. R. e. Valor nutritivo de seis híbridos de sorgo com capim-sudão avaliados em três cortes e em duas épocas de semeadura. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 9, n. 2, p. 147-161, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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| 18. | | RIBEIRO JUNIOR, G. de O.; FERREIRA, J. J. da C.; BORGES, A. L. C. C.; GONÇALVES, L. C.; CAMPOS, M. M.; LIMA, J. B. M. P.; RODRIGUES, J. A. S.; GOMES, S. P.; SILVA, R. R. e; BORGES, I.; RIBEIRO, P. V.; RODRIGUEZ, N. M.; SALIBA, S. Ácidos orgânicos das silagens de seis genótipos de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ: UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | FERREIRA, J. J. C.; BORGES, A. L. C.; SILVA, R. R.; LIMA, J. B. M. P.; GUIMARES JUNIOR, R.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; BORGES, I.; CAMPOS, M. M.; RABELO, L. S.; SALIBA, E. O. S.; GOMES, S. P.; DELGADO, L. P. Dados agronômicos de seis genótipos de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench) para a produção de silagem. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ: UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 20. | | CAMPOS, M. M.; PEREIRA, A. C.; GONÇALVES, L. C.; BORGES, A. L. C. C.; GOMES, S. P.; RODRIGUES, J. A. S.; BORGES, I.; RODRIGUEZ, N. M.; SALIBA, E. de O. S.; SILVA, R. R. e; PANCOTI, C. G.; LAGE, A. D. Perfil de fermentação de silagens do híbrido de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench) BR 601 com aditivos: 1. teor de matéria seca, perdas de matéria seca e digestibilidade in vitro da matéria seca. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ; UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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