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| Registros recuperados : 126 | |
| 61. |  | SOUZA, M. I. F.; VISOLI, M. C.; TORRES, T. Z.; OSAWA, C. C.; SILVA, A. R. da; GIACHETTO, P. F.; NHANI JUNIOR, A.; FALCAO, P. R. K. Catalogação de datasets ômicos no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa. Revista Brasileira de Biblioteconomia e Documentação, v. 18, p. 1-28, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 62. | | HERAI, R. H.; GIACHETTO, P. F.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. Detecção de erros de montagens em regiões gênicas. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., Brasília, DF, 2010. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 63. | | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P553.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 64. | | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P553.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 65. | | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Embrapa Bioinformatic Multi-user laboratory. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster 1017.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 66. | | KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; HIGA, R.; VIEIRA, F. Embrapa Bioinformatics Multi-Users Laboratory - LMB. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 67. | | GIACHETTO, P. F.; SILVA, J. M. da; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Genomic variant hotspots in nelore cattle revealed by missing genotypes. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. Não paginado. PAG 2015. Pôster P0289.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 68. | | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Genomic Variants Revealed by Invariably Missing Genotypes in Nelore Cattle. PLoS ONE, v. 10, n. 8, p. 1-18, 2015| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 69. | | DABBAS, K. M.; FERRO, M. I. T.; BARROS, N. M. de; LAIA, M. L. de; ZINGARETTI, S. M.; GIACHETTO, P. F.; MORAES, V. A. de; FERRO, J. A. Genes diferencialmente expressos em cana-de-açúcar inoculada com Xanthomonas albilineans, o agente causal da escaldadura da folha. Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 32, n. 4, p. 328-338, Oct./Dec. 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 70. | | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Genome-wide copy number variation (CNV) detection in Nelore cattle reveals highly frequent variants in genome regions harboring QTLs affecting production traits. BMC Genomics, London, v. 17, p. 1-14, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 71. | | SILVA, V. H. da; REGITANO, L. C. de A.; GEISTLINGER, L.; PÉRTILLE, F.; GIACHETTO, P. F.; BRASSALOTI, R. A.; MOROSINI, N. S.; ZIMMER, R.; COUTINHO, L. L. Genome-wide detection of CNVs and their association with meat tenderness in Nelore cattle. Plos One, june 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 72. | | JOVINO, D. F. R.; DABBAS, K. M.; LAIA, M. L. de; GIACHETTO, P. F.; MORAES, F. E. de; GUIMARÃES, A. R.; FERRO, M. I. T.; FERRO, J. A. Genes induzidos em plântulas de cana-de-açúcar (Saccharum ssp) exclusivamente após 6 horas de inoculação com Xanthomonas albilineans. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas. Resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2009. Não paginado. CBM 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 73. | | IBELLI, A. M. G.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A. Genes e vias metabólicas envolvidos nos mecanismos de resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 74.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 74. | | ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; SILVA, M. V. G. B.; GIACHETTO, P. F.; FREITAS, M.; LOPES, J.; LEDUR, M. C. Genetic associations of farrowing length in two maternal lines of pigs. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 75. | | DABBAS, K. M.; LAIA, M. L. de; JOVINO, D. F. R.; GIACHETTO, P. F.; MORAES, F. E. de; FERRO, J. A.; FERRO, M. I. T. Avaliação do perfil de expressão gênica em cana-de-açúcar após inoculação com Xanthomonas albilineans utilizando a técnica de macroarranjos de cDNA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas. Resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2009. Não paginado. CBM 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 76. | | DITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; SOUZA JUNIOR, M. T.; GIACHETTO, P. F.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense. Phytopathology, v. 101, n. 6, Supplement, p. S43, 2011. Trabalhos apresentados no: APS-IPPC 2011 Joint Meeting in Honolulu, Hawaii, August 6–10, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 77. | | RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G. B.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J. Comparative transcriptome analyses and genome assembly of fusarium oxysporum f. sp. cubense. Acta Horticulturae, n. 986, p. 165-168, 2013. 4p. Trabalho apresentado no ISHS - ProMusa Symposium on Bananas and Plantains: Towards Sustainable Global Production and Improved Uses.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 78. | | RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. Comparative transcriptome analysis and genome assembly of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: ISHS / PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador, BH. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: program and abstracts. Leuven: ISHS, 2011. p. 58| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 79. | | SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA JUNIOR, G.; REY, F. S. B.; GIACHETTO, P. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; FERRAZ, J. B. S. Descriptive analysis of copy number variation regions in a population of dairy Gyr cattle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: American Society of Animal Science, 2014. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 126 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
16/07/2013 |
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Data da última atualização: |
16/07/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 2 |
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Autoria: |
RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G. B.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J. |
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Afiliação: |
MIGUEL ANGEL DITA RODRIGUEZ, CNPMF; R. HERAI, UNICAMP; C. WAALWIJK, Plant Research International B. V.; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; GILVAN BARBOSA FERREIRA, CNPA; M. SOUZA; G.H.J. KEMA, Plant Research International B. V. |
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Título: |
Comparative transcriptome analyses and genome assembly of fusarium oxysporum f. sp. cubense. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, n. 986, p. 165-168, 2013. |
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Páginas: |
4p. |
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ISSN: |
0567-7572 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Trabalho apresentado no ISHS - ProMusa Symposium on Bananas and Plantains: Towards Sustainable Global Production and Improved Uses. |
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Conteúdo: |
Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), the causal agent of Fusarium wilt of banana, is a highly destructive and genetically diverse pathogen. Despite its economic importance, genomic information about Foc is limited and no transcriptomic analyses have been reported so far. By using 454 sequencing technology, we generated >2.5 million expressed sequenced tags (ESTs) from four Foc isolates representing different vegetative compatibility groups (VCGs) and races that infect banana: race 1 (R1, VCG unknown but different from the others here described), race 2 (R2, VCG 0124), subtropical race 4 (SR4, VCG 0120) and tropical race 4 (TR4, VCG 01213). The ESTs were obtained from libraries prepared from mRNA extracted from three physiological states (mycelium, conidia and germinated conidia), which were pooled in a 2:2:1 ratio. Most genes are represented in all libraries, but in silico comparative analyses identified a set of unique ESTs for each isolate (689 for R1, 974 for R2, 296 for SR4 and 555 for TR4), which are excellent candidates for diagnostics development, future plant-pathogen interaction studies and functional analyses. In subsequent analyses, a 40× sequencing-coverage (Illumina single reads) of TR4 genomic DNA was assembled in a de novo based methodology, resulting in a 45.5 Mb genome. Preliminary analyses show a high colinearity of EST and genomic data that significantly contributes to the quality of the assembly. |
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Thesagro: |
Banana; Fusariose; Fusarium. |
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Thesaurus NAL: |
Bananas; Fusarium oxysporum f. sp. cubense; Fusarium wilt; Genome. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02421naa a2200325 a 4500
001 1962176
005 2013-07-16
008 2013 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0567-7572
100 1 $aRODRIGUEZ, M. A. D.
245 $aComparative transcriptome analyses and genome assembly of fusarium oxysporum f. sp. cubense.
260 $c2013
300 $a4p.
500 $aTrabalho apresentado no ISHS - ProMusa Symposium on Bananas and Plantains: Towards Sustainable Global Production and Improved Uses.
520 $aFusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), the causal agent of Fusarium wilt of banana, is a highly destructive and genetically diverse pathogen. Despite its economic importance, genomic information about Foc is limited and no transcriptomic analyses have been reported so far. By using 454 sequencing technology, we generated >2.5 million expressed sequenced tags (ESTs) from four Foc isolates representing different vegetative compatibility groups (VCGs) and races that infect banana: race 1 (R1, VCG unknown but different from the others here described), race 2 (R2, VCG 0124), subtropical race 4 (SR4, VCG 0120) and tropical race 4 (TR4, VCG 01213). The ESTs were obtained from libraries prepared from mRNA extracted from three physiological states (mycelium, conidia and germinated conidia), which were pooled in a 2:2:1 ratio. Most genes are represented in all libraries, but in silico comparative analyses identified a set of unique ESTs for each isolate (689 for R1, 974 for R2, 296 for SR4 and 555 for TR4), which are excellent candidates for diagnostics development, future plant-pathogen interaction studies and functional analyses. In subsequent analyses, a 40× sequencing-coverage (Illumina single reads) of TR4 genomic DNA was assembled in a de novo based methodology, resulting in a 45.5 Mb genome. Preliminary analyses show a high colinearity of EST and genomic data that significantly contributes to the quality of the assembly.
650 $aBananas
650 $aFusarium oxysporum f. sp. cubense
650 $aFusarium wilt
650 $aGenome
650 $aBanana
650 $aFusariose
650 $aFusarium
700 1 $aHERAI, R.
700 1 $aWAALWIJK, C.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aFERREIRA, G. B.
700 1 $aSOUZA, M.
700 1 $aKEMA, G. H. J.
773 $tActa Horticulturae$gn. 986, p. 165-168, 2013.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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