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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F. A tecnologia de microarranjos na identificação de genes de interesse na bovinocultura. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 35 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 111).

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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2.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F. Transcriptoma do carrapato dos bovinos. In: ANDREOTI, R.; GARCIA, M. V.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos na cadeia produtiva de bovinos. Brasília, DF: Embrapa, 2019. cap. 16, p. 205-222.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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3.Imagem marcado/desmarcadoANDREOTTI, R.; GIACHETTO, P. F. Phylogenetic of phylogeographic relations of Rhipicephalus microplus ( Acari: ixodidae) in Brazil. In: AMERICAN ASSOCIATION OF VETERINARY PARASITOLOGISTS ANNUAL MEETING, 60.; LIVESTOCK INSECT WORKERS CON-FERENCE, 59.; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ECTOPARASITES OF PETS, 13.,2015, Boston, MA. Parasitic Evolution Scientific Revolu-tion: Proceedings... Boston, MA: American Association of Veterinary Parasitologists, 2015. Resumo 146. 1 p.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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4.Imagem marcado/desmarcadoSIQUEIRA, F.; GIACHETTO, P. F. CNV: uma ferramenta promissora para aplicação em programas de melhoramento genético de bovinos. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2019. 34 p. (Embrapa Gado de Corte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento , 45)

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte.

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5.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HERAI, R. H. BOS_ANNOTATION: Pipeline baseado em bancos de dados públicos para associação e anotação automática de transcriptomas bovinos. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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6.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; OKURA, V. K. Código na linguagem estatística R que automatiza o processo de construção e análise de redes gênicas para dados de microarranjos da plataforma Affymetrix, utilizando a metodologia WGCNA. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.

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7.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Multilab bioinformática: laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 folder.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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8.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformática aplicada à agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 4. p. 67-83.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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9.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformatics applied to agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Information and communication technologies and their relations with agriculture. Brasília, DF: Embrapa, 2016. ch. 4, p. 67-86.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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10.Imagem marcado/desmarcadoGONÇALVES, A. R.; GIACHETTO, P. F. Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de gentipagem de SNPs com chips de alta densidade. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 183-186.

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11.Imagem marcado/desmarcadoSALMAN, A. K. D.; GIACHETTO, P. F. Identificação de polimorfismos no gene da leptina bovina. Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2008. 9 p. (Embrapa Rondônia. Comunicado Técnico, 336).

Biblioteca(s): Embrapa Rondônia.

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12.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; GONÇALVES, A. R. CNP_ID: um pipeline para identificação das CNVs mais frequentes na população (CNPs, de Copy Number Polymorphisms), por meio da ferramenta CNstream. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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13.Imagem marcado/desmarcadoSALMAN, A. K. D.; GIACHETTO, P. F. Conceitos estatísticos aplicados à experimentação zootécnica. PUBVET, Londrina, v. 8, n. 12, art. 1734, jun. 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Rondônia.

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14.Imagem marcado/desmarcadoSALMAN, A. K.; GIACHETTO, P. F. Conceitos estatísticos aplicados à experimentação zootécnica. PUBVET, Londrina v. 8, n. 12, art. 1734, jun. 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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15.Imagem marcado/desmarcadoGOZZO, V. C.; GIACHETTO, P. F. Utilização da metodologia WGCNA na construção de redes gênicas e identificação de mecanismos envolvidos na resposta de vacas à mastite. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 76-79.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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16.Imagem marcado/desmarcadoANDREOTTI, R.; GIACHETTO, P. F.; CUNHA, R. C. Advances in tick vaccinology in Brazil: from gene expression to immunoprotection. Frontiers in Bioscience - Scholar, v. 10, n. 1, p. 127-142, Jan. 2018

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte.

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17.Imagem marcado/desmarcadoDIAS-SALMAN, A. K.; GIACHETTO, P. F.; MALAGO JÚNIOR, W. Marcadores moleculares na bovinocultura de corte. Revista Electrónica de Veterinária, v. 10, n. 2, p. 1-17, 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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18.Imagem marcado/desmarcadoSALMAN, A. K. D.; GIACHETTO, P. F.; MALAGO JUNIOR, W. Marcadores moleculares na bovinocultura de corte. Revista Electronica de Veterinaria, v. 10, n. 2, 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Rondônia.

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19.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; PEREIRA, F. C. de P. CNV_ID: um pipeline para detecção e análise de variações no número de cópias do genoma (CNVs) utilizando a ferramenta PennCNV. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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20.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, F. C. de P.; GIACHETTO, P. F. Construção de um pipeline para identificação e análise de CNVs utilizando dados de chips de genotipagem de SNPs. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 179-182.

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Biblioteca(s):  Embrapa Café.
Data corrente:  23/10/2019
Data da última atualização:  23/10/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Anais de Congresso
Autoria:  GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P.
Afiliação:  Paula de Sousa Guimarães, Bolsista do Consórcio Pesquisa Café; Juliana Camargo Martinati Schenk, Instituto Agronômico de Campinas - IAC. Bolsista INCT/CNPq; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LILIAN PADILHA, CNPCa; Maria Bernadete Silvarolla, Instituto Agronômico de Campinas - IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa.
Título:  Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.
Idioma:  Português
Notas:  Título em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression.
Conteúdo:  A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.
Palavras-Chave:  Assisted-selection; Melhoramento molecular; Molecular breeding; RNAseq; Seleção-assistida.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Café (CNPCa)
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