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| Registros recuperados : 126 | |
| 81. |  | RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. Comparative transcriptome analysis and genome assembly of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: ISHS / PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador, BH. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: program and abstracts. Leuven: ISHS, 2011. p. 58| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 82. | | BAMBINI, M. D.; OSAWA, C. C.; SANTOS, A. D. dos; BARBEDO, J. G. A.; VAZ, G. J.; GIACHETTO, P. F.; SPERANZA, E. A.; TELLES, G. A. de S. Contribuição da Embrapa Informática Agropecuária para um Brasil Inovador e competitivo: proteção da propriedade intelectual dos resultados de pesquisa e geração de inovações. In: CONGRESSO DA ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DAS INSTITUIÇÕES DE PESQUISA TECNOLÓGICA E INOVAÇÃO, 7., 2012, Brasília, DF. Tecnologia para um Brasil inovador e competitvo: trabalhos selecionados para apresentação no congresso. Brasília, DF: ABIPTI, 2012. p. 168-178. 1 CD-ROM. ABIPTI 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 83. | | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Embrapa Bioinformatic Multi-user laboratory. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster 1017.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 84. | | KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; HIGA, R.; VIEIRA, F. Embrapa Bioinformatics Multi-Users Laboratory - LMB. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 85. | | GIACHETTO, P. F.; NHANI JUNIOR, A.; CASTRO, G. M. de; RODRIGUES, V. da S.; GARCIA, M. V.; BARROS, J. C.; ANDREOTTI, R. Differential gene expression in the cattle tick Rhipicephalus microplus fed on resistant and susceptible cattle. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2019. Na publicação: Jacqueline Cavalcanti Barros, Renato Andreotti. PAG 2019. PE0246.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 86. | | ZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Applications of bioinformatics in agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (ed.). Digital agriculture: research, development and innovation in production chains. Brasília, DF: Embrapa, 2023. cap. 10, p. 179-194.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 87. | | ZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Aplicações da bioinformática na agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (Ed.). Agricultura digital: pesquisa, desenvolvimento e inovação nas cadeias produtivas. Brasília, DF: Embrapa, 2020. cap. 10, p. 234-257.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 88. | | DABBAS, K. M.; LAIA, M. L. de; JOVINO, D. F. R.; GIACHETTO, P. F.; MORAES, F. E. de; FERRO, J. A.; FERRO, M. I. T. Avaliação do perfil de expressão gênica em cana-de-açúcar após inoculação com Xanthomonas albilineans utilizando a técnica de macroarranjos de cDNA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas. Resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2009. Não paginado. CBM 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 89. | | SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA JUNIOR, G.; REY, F. S. B.; GIACHETTO, P. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; FERRAZ, J. B. S. Descriptive analysis of copy number variation regions in a population of dairy Gyr cattle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: American Society of Animal Science, 2014. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite. |
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| 90. | | HERAI, R. H.; GIACHETTO, P. F.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. Detecção de erros de montagens em regiões gênicas. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., Brasília, DF, 2010. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 91. | | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P553.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 92. | | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P553.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 93. | | DABBAS, K. M.; FERRO, M. I. T.; BARROS, N. M. de; LAIA, M. L. de; ZINGARETTI, S. M.; GIACHETTO, P. F.; MORAES, V. A. de; FERRO, J. A. Genes diferencialmente expressos em cana-de-açúcar inoculada com Xanthomonas albilineans, o agente causal da escaldadura da folha. Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 32, n. 4, p. 328-338, Oct./Dec. 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 94. | | JOVINO, D. F. R.; DABBAS, K. M.; LAIA, M. L. de; GIACHETTO, P. F.; MORAES, F. E. de; GUIMARÃES, A. R.; FERRO, M. I. T.; FERRO, J. A. Genes induzidos em plântulas de cana-de-açúcar (Saccharum ssp) exclusivamente após 6 horas de inoculação com Xanthomonas albilineans. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas. Resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2009. Não paginado. CBM 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 95. | | IBELLI, A. M. G.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A. Genes e vias metabólicas envolvidos nos mecanismos de resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 74.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 98. | | BELLI, A. M. G; GIACHETTO, P. F.; OLIVEIRA, M. C. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; VENERONI, G. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. A. Vias regulatórias envolvidas na resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: WORKSHOP EM GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Ceará. Resumos... Ceará: UECE, 2009. Não paginado. WSRGA 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 99. | | IBELLI, A. M. G.; GIACHETTO, P. F.; OLIVEIRA, M. C. de S.; YAMAGISHI, M. E. B.; VENERONI, G. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A. Vias regulatórias envolvidas na resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 100. | | IBELLI, A. M. G.; GIACHETTO, P. F.; CARDOSO, F. F.; HIGA, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; RIBEIRO, A. R. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A. Identification of new genes in cattle of different genetic groups activated in response to tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: REUNIÓN DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 22., 2011, Montevideo, Uruguay. Memorias... Montevideo: Asociación Uruguaya de Producción Animal, 2011. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| Registros recuperados : 126 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café. |
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Data corrente: |
05/02/2015 |
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Data da última atualização: |
06/02/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
CARDOSO, D. C.; MARTINATI, J. C.; GIACHETTO, P. F.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. |
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Afiliação: |
DANIELLE C. CARDOSO, IAC; JULIANA C MARTINATI, IAC; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; RAMON O. VIDAL; MARCELO F. CARAZZOLLE; LILIAN PADILHA, SAPC; OLIVEIRO GUERREIRO-FILHO, IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, SAPC. |
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Título: |
Large-scale analysis of differential gene expression in coffee genotypes resistant and susceptible to leaf miner-toward the identification of candidate genes for marker assisted-selection. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, London, v. 15, p. 1-20, 2014. |
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DOI: |
10.1186/1471-2164-15-66 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A successful development of herbivorous insects into plant tissues depends on coordination of metabolic processes. Plants have evolved complex mechanisms to recognize such attacks, and to trigger a defense response. To understand the transcriptional basis of this response, we compare gene expression profiles of two coffee genotypes, susceptible and resistant to leaf miner (Leucoptera coffella). A total of 22000 EST sequences from the Coffee Genome Database were selected for a microarray analysis. Fluorescence probes were synthesized using mRNA from the infested and non-infested coffee plants. Array hybridization, scanning and data normalization were performed using Nimble Scan® e ArrayStar® platforms. Genes with foldchange values +/-2 were considered differentially expressed. A validation of 18 differentially expressed genes was performed in infected plants using qRT-PCR approach. |
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Palavras-Chave: |
Microarranjo; Plant defense. |
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Thesagro: |
Café; Coffea Arábica. |
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Thesaurus NAL: |
Genes; Leafminers; Microarray technology. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117310/1/Large-scale-analysis.pdf
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Marc: |
LEADER 01841naa a2200301 a 4500
001 2007801
005 2015-02-06
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1186/1471-2164-15-66$2DOI
100 1 $aCARDOSO, D. C.
245 $aLarge-scale analysis of differential gene expression in coffee genotypes resistant and susceptible to leaf miner-toward the identification of candidate genes for marker assisted-selection.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aA successful development of herbivorous insects into plant tissues depends on coordination of metabolic processes. Plants have evolved complex mechanisms to recognize such attacks, and to trigger a defense response. To understand the transcriptional basis of this response, we compare gene expression profiles of two coffee genotypes, susceptible and resistant to leaf miner (Leucoptera coffella). A total of 22000 EST sequences from the Coffee Genome Database were selected for a microarray analysis. Fluorescence probes were synthesized using mRNA from the infested and non-infested coffee plants. Array hybridization, scanning and data normalization were performed using Nimble Scan® e ArrayStar® platforms. Genes with foldchange values +/-2 were considered differentially expressed. A validation of 18 differentially expressed genes was performed in infected plants using qRT-PCR approach.
650 $aGenes
650 $aLeafminers
650 $aMicroarray technology
650 $aCafé
650 $aCoffea Arábica
653 $aMicroarranjo
653 $aPlant defense
700 1 $aMARTINATI, J. C.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aVIDAL, R. O.
700 1 $aCARAZZOLLE, M. F.
700 1 $aPADILHA, L.
700 1 $aGUERREIRO-FILHO, O.
700 1 $aMALUF, M. P.
773 $tBMC Genomics, London$gv. 15, p. 1-20, 2014.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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