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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
03/10/2022 |
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Data da última atualização: |
03/10/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
COMIN, H.; CAMPOS, G. S.; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; SOLLERO, B. P.; CARDOSO, F. F. |
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Afiliação: |
HELENA B. COMIN, Universidade Federal de Pelotas; G. S. CAMPOS, Universidade Estadual Paulista; ROBERT DOMINGUES, CPPSUL; EMANUELLE BALDO GASPAR, CPPSUL; BRUNA PENA SOLLERO, GPM; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
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Título: |
Genetic parameters and accuracy of traditional and genomic breeding values for resistance to infectious bovine keratoconjunctivitis in Hereford. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 264, 105078, Oct. 2022. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A B S T R A C T The objectives of this research were to estimate genetic parameters using a threshold animal model by traditional (pedigree and phenotype), single-step genomic BLUP (ssGBLUP) and Weighted ssGBLUP (WssGBLUP) methods, and assess the relative increase in accuracy with the addition of genomic information on the estimation of breeding values for the incidence of infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) in Hereford cattle. The data used in this study were obtained from animals belonging to four farms of Delta G breeders association and genetically evaluated by the Delta G breeding program, born between 2015 and 2017, totaling 293,716 individuals in the pedigree data and 1,579 phenotypes for IBK (1 = absence of disease or 2 = presence of disease). The genotypic data, after quality control, retained 37,505 SNP markers and 1,401 samples. A Bayesian framework and a threshold animal model were used to estimate variance components and to predict breeding values. Animals with genotype and phenotype for the traits studied were divided into 3 groups by random and k-means clustering cross-validation strategies. The estimate of direct heritability for resistance to IBK was 0.12 ± 0.01 and 0.10 ± 0.01 through PBLUP and ssGBLUP methods. The mean realized prediction accuracies based on linear regression statistics were 0.36, 0.65 and 0.70, respectively for PBLUP, ssGBLUP and WssGBLUP; therefore, the use of the genomic relationship matrices was superior to the pedigree-based method. When using the WssGBLUP method, there was an additional increase in prediction accuracy when compared to the ssGBLUP method, which was already substantially better than PBLUP. The prediction of breeding values using genomic information by the single-step methods should result in more accurate selection decisions compared to traditional pedigree evaluations and, consequently, genomic selection can be readily applied with moderately high reliability to help reduce the incidence of IBK in Hereford cattle. MenosA B S T R A C T The objectives of this research were to estimate genetic parameters using a threshold animal model by traditional (pedigree and phenotype), single-step genomic BLUP (ssGBLUP) and Weighted ssGBLUP (WssGBLUP) methods, and assess the relative increase in accuracy with the addition of genomic information on the estimation of breeding values for the incidence of infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) in Hereford cattle. The data used in this study were obtained from animals belonging to four farms of Delta G breeders association and genetically evaluated by the Delta G breeding program, born between 2015 and 2017, totaling 293,716 individuals in the pedigree data and 1,579 phenotypes for IBK (1 = absence of disease or 2 = presence of disease). The genotypic data, after quality control, retained 37,505 SNP markers and 1,401 samples. A Bayesian framework and a threshold animal model were used to estimate variance components and to predict breeding values. Animals with genotype and phenotype for the traits studied were divided into 3 groups by random and k-means clustering cross-validation strategies. The estimate of direct heritability for resistance to IBK was 0.12 ± 0.01 and 0.10 ± 0.01 through PBLUP and ssGBLUP methods. The mean realized prediction accuracies based on linear regression statistics were 0.36, 0.65 and 0.70, respectively for PBLUP, ssGBLUP and WssGBLUP; therefore, the use of the genomic relationship matrices was superior to the pedigree-based ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Resistência a doença; Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Gado de Corte; Parâmetro Genético. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Cocais; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
16/06/2011 |
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Data da última atualização: |
23/11/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
GUALTER, R. M. R.; BODDEY, R. M.; RUMJANEK, N. G.; FREITAS, A. C. R. de; XAVIER, G. R. |
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Afiliação: |
RÉGIA MARIA REIS GUALTER, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Departamento de Agronomia e Ciência do Solo.; ROBERT MICHAEL BODDEY, CNPAB; NORMA GOUVEA RUMJANEK, CNPAB; ANTONIO CARLOS REIS DE FREITAS, CPACP; GUSTAVO RIBEIRO XAVIER, CNPAB. |
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Título: |
Eficiência agronômica de estirpes de rizóbio em feijão-caupi cultivado na região da Pré-Amazônia maranhense. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 3, p. 303-308, mar. 2011. |
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Páginas: |
6 p. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo - O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência agronômica de estirpes de rizóbio para inoculação em campo, da cultivar BRS Guariba de feijão-caupi. Os experimentos foram realizados em duas áreas em Santa Luzia do Paruá, MA, na região de Pré-Amazônia, em 2009. Foram testadas as estirpes de Bradyrhizobium BR 3299, BR 3262, e INPA 03-11B, um controle absoluto e um tratamento nitrogenado (80 kg ha-1 de N). As avaliações foram realizadas aos 30 e 50 dias após a emergência (DAE) das plantas. Aos 65 DAE, foi avaliada a produtividade de grãos. Foram avaliados número e massa de matéria seca de nódulos, massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea. As estirpes proporcionaram maior número e massa de matéria seca de nódulos, bem como maior produtividade em comparação ao controle absoluto, sem inoculação e sem ureia, nas duas áreas. Para massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea, a estirpe BR 3299 diferiu significativamente do controle absoluto, aos 30 DAE, em uma das propriedades. O feijão-caupi responde positivamente à inoculação com as estirpes, especialmente a BR 3299. |
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Palavras-Chave: |
Aculumo de N; Acúmulo de N; Adubação nitrogenada; Massa de matéria; Massa de matéria seca. |
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Thesagro: |
Inoculação; Inoculante; Vigna Unguiculata. |
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Categoria do assunto: |
--
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/47525/1/Caupi-Pre-Amazonia-46n03a11.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/172537/1/Eficiencia-agronomica-de-estirpes-de-rizobio-em-feijao-caupi.pdf
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Marc: |
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245 $aEficiência agronômica de estirpes de rizóbio em feijão-caupi cultivado na região da Pré-Amazônia maranhense.
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520 $aResumo - O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência agronômica de estirpes de rizóbio para inoculação em campo, da cultivar BRS Guariba de feijão-caupi. Os experimentos foram realizados em duas áreas em Santa Luzia do Paruá, MA, na região de Pré-Amazônia, em 2009. Foram testadas as estirpes de Bradyrhizobium BR 3299, BR 3262, e INPA 03-11B, um controle absoluto e um tratamento nitrogenado (80 kg ha-1 de N). As avaliações foram realizadas aos 30 e 50 dias após a emergência (DAE) das plantas. Aos 65 DAE, foi avaliada a produtividade de grãos. Foram avaliados número e massa de matéria seca de nódulos, massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea. As estirpes proporcionaram maior número e massa de matéria seca de nódulos, bem como maior produtividade em comparação ao controle absoluto, sem inoculação e sem ureia, nas duas áreas. Para massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea, a estirpe BR 3299 diferiu significativamente do controle absoluto, aos 30 DAE, em uma das propriedades. O feijão-caupi responde positivamente à inoculação com as estirpes, especialmente a BR 3299.
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773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 3, p. 303-308, mar. 2011.
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Registro original: |
Embrapa Cocais (CPACP) |
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