BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Mandioca e Fruticultura.
Data corrente:  12/02/2008
Data da última atualização:  24/07/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  BERGER, I. J.; FREITAS-ÁSTUA, J.; REIS, M. S.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A.
Afiliação:  Irving J. Berger, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcelo S. Reis, APTA; Maria Luísa P.N. Targon, APTA; Marcos A. Machado, APTA.
Título:  In silico prediction of gene expression patterns in Citrus flavedo.
Ano de publicação:  2007
Fonte/Imprenta:  Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 752-760, 2007.
ISSN:  1415-4757
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Out of the 18,942 flavedo expressed sequences (clusters plus singletons) in Citrus sinensis from the Citrus EST Project (CitEST), 25 were statistically supported to be differentially expressed in this tissue after a double in silico hybridization strategy against leaf-, flower-, and bark-derived ESTs. Five of them, two terpene synthases and three O-methyltransferases, are absent in the other citrus tissues with concomitant 2x2 statistics, supporting the hypothesis that they are putative flavedo-specific expressed sequences. The pattern of these differentially expressed sequences during fruit development suggests that most of them are developmentally regulated. Some expressed gene products, including a putative germin-like protein highly expressed in flavedo, are shown to be promising candidates for further characterization. In addition to promoter seeking, this kind of analysis can lead to gene discovery, tissue-specific and tissue-enriched expression pattern predictions (as shown herein) and can also be adopted as an in silico first, and probably reliable approach, for detecting expression profiles from EST sequencing efforts before experimental validation is available or for heuristically guiding that validation.
Palavras-Chave:  EST; Fruit; Orange; Tissue-specific.
Thesaurus Nal:  gene expression.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF)
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1.Imagem marcado/desmarcadoFONSECA, E. M. B.; PEREIRA, A. R.; CARNEIRO, M. G.; SIMPSON, J. G. P. Supressao de vegetacao em area de inundacao de reservatorios estudo de caso/barragem de salinas. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE ECONOMIA E PLANEJAMENTO FLORESTAL, 2., 1991, Curtiba. Anais. Colombo: EMBRAPA-CNPF, 1992. v.2. p.19-28.
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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2.Imagem marcado/desmarcadoFONSECA, E. M. da; BAPTISTA NETO, J. A.; MCALISTER, J.; SMITH, B.; FERNANDEZ, M. A.; BALIEIRO, F. C. The role of the humic substances in the fractioning of heavy metals in Rodrigo de Freitas Lagoon, Rio de Janeiro - Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciências, Rio de Janeiro, v. 85, n. 4, p. 1289-1301, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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3.Imagem marcado/desmarcadoNICODEMO, M. L. F.; MORAES, S. da S.; THIAGO, L. R. L. de S.; VAZ, E. C.; MADRUGA, C. R.; VIEIRA, J. M.; FONSECA, E. M. Respostas produtiva e fisiológica de vacas de cria nelore em pastejo à suplementação mineral e protéico-energética na seca. Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 1999. 6 p. (Embrapa Gado de Corte. Pesquisa em Andamento, 53). CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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4.Imagem marcado/desmarcadoFONSECA, E. M. B.; ABREU, L. B. de; CARVALHO, G. S.; NASCIMENTO, R. S. M. P.; PASSOS, L. P.; MARQUES, J. J. Determinação de mercúrio em resíduos de siderurgia. In: ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 21., 2007, Uberlândia. Integrando os pesquisadores em química do estado de Minas Gerais: anais. [Uberlândia: UFU], 2007.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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5.Imagem marcado/desmarcadoMOTTA, P. E. F. da; CURI, N.; SILVA, M. L. N.; MARQUES, J. J. G. de S. e M.; PRADO, N. J. S.; FONSECA, E. M. B. Levantamento pedológico detalhado, erosão dos solos, uso atual e aptidão agrícola das terras de microbacia piloto na região sob influência do reservatório da hidrelétrica de Itutinga/Camargos-MG. Lavras: UFLA: CEMIG, 2001. 51 p. il.
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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6.Imagem marcado/desmarcadoNUNES, J. D.; AZEVEDO, A. L. S.; LEDO, F. J. da S.; PEREIRA, A. V.; FONSECA, E. M.; SILVA, T. A. In vivo genomic duplication of interspecific hybrids from napier grass and pearl millet. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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7.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, S da S.; NICODEMO, M. L. F.; VAZ, E. C.; PIRES, P. P.; CATANANTE, M. C.; THIAGO, L. R. L. de S.; VIEIRA, J. M.; FONSECA, E. M. Avaliação da deficiência subclínica de zinco em vacas de cria e a relação com a higidez de seus bezerros. Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2001. 7 p. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado Tecnico, 65). CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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