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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
12/02/2008 |
Data da última atualização: |
24/07/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BERGER, I. J.; FREITAS-ÁSTUA, J.; REIS, M. S.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. |
Afiliação: |
Irving J. Berger, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcelo S. Reis, APTA; Maria Luísa P.N. Targon, APTA; Marcos A. Machado, APTA. |
Título: |
In silico prediction of gene expression patterns in Citrus flavedo. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 752-760, 2007. |
ISSN: |
1415-4757 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Out of the 18,942 flavedo expressed sequences (clusters plus singletons) in Citrus sinensis from the Citrus EST Project (CitEST), 25 were statistically supported to be differentially expressed in this tissue after a double in silico hybridization strategy against leaf-, flower-, and bark-derived ESTs. Five of them, two terpene synthases and three O-methyltransferases, are absent in the other citrus tissues with concomitant 2x2 statistics, supporting the hypothesis that they are putative flavedo-specific expressed sequences. The pattern of these differentially expressed sequences during fruit development suggests that most of them are developmentally regulated. Some expressed gene products, including a putative germin-like protein highly expressed in flavedo, are shown to be promising candidates for further characterization. In addition to promoter seeking, this kind of analysis can lead to gene discovery, tissue-specific and tissue-enriched expression pattern predictions (as shown herein) and can also be adopted as an in silico first, and probably reliable approach, for detecting expression profiles from EST sequencing efforts before experimental validation is available or for heuristically guiding that validation. |
Palavras-Chave: |
EST; Fruit; Orange; Tissue-specific. |
Thesaurus Nal: |
gene expression. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registros recuperados : 7 | |
2. |  | FONSECA, E. M. da; BAPTISTA NETO, J. A.; MCALISTER, J.; SMITH, B.; FERNANDEZ, M. A.; BALIEIRO, F. C. The role of the humic substances in the fractioning of heavy metals in Rodrigo de Freitas Lagoon, Rio de Janeiro - Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciências, Rio de Janeiro, v. 85, n. 4, p. 1289-1301, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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4. |  | FONSECA, E. M. B.; ABREU, L. B. de; CARVALHO, G. S.; NASCIMENTO, R. S. M. P.; PASSOS, L. P.; MARQUES, J. J. Determinação de mercúrio em resíduos de siderurgia. In: ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 21., 2007, Uberlândia. Integrando os pesquisadores em química do estado de Minas Gerais: anais. [Uberlândia: UFU], 2007.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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6. |  | NUNES, J. D.; AZEVEDO, A. L. S.; LEDO, F. J. da S.; PEREIRA, A. V.; FONSECA, E. M.; SILVA, T. A. In vivo genomic duplication of interspecific hybrids from napier grass and pearl millet. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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7. |  | MORAES, S da S.; NICODEMO, M. L. F.; VAZ, E. C.; PIRES, P. P.; CATANANTE, M. C.; THIAGO, L. R. L. de S.; VIEIRA, J. M.; FONSECA, E. M. Avaliação da deficiência subclínica de zinco em vacas de cria e a relação com a higidez de seus bezerros. Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2001. 7 p. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado Tecnico, 65). CNPGC.Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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Registros recuperados : 7 | |
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