| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
|
Data corrente: |
18/12/2023 |
|
Data da última atualização: |
29/01/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
VENKATARAMAN, M.; YÑIGEZ-GUTIERREZ, A.; INFANTE, V.; MACINTYRE, A.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ANÉ, J.-M.; PFLEGER, B. |
|
Afiliação: |
MAYA VENKATARAMAN; AUDREY YÑIGEZ-GUTIERREZ; VALENTINA INFANTE; APRIL MACINTYRE; PAULO IVAN FERNANDES JUNIOR, CPATSA; JEAN-MICHEL ANÉ; BRIAN PFLEGER. |
|
Título: |
Synthetic biology toolbox for nitrogen-fixing soil microbes. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
ACS Synthetic Biology, v. 12, n. 12, p. 3623-3634, 2023. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1021/acssynbio.3c00414 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The soil environment adjacent to plant roots, termed the rhizosphere, is home to a wide variety of microorganisms that can significantly affect the physiology of nearby plants. Microbes in the rhizosphere can provide nutrients, secrete signaling compounds, and inhibit pathogens. These processes could be manipulated with synthetic biology to enhance the agricultural performance of crops grown for food, energy, or environmental remediation, if methods can be implemented in these nonmodel microbes. A common first step for domesticating nonmodel organisms is the development of a set of genetic engineering tools, termed a synthetic biology toolbox. A toolbox comprises transformation protocols, replicating vectors, genome engineering (e.g., CRISPR/Cas9), constitutive and inducible promoter systems, and other gene expression control elements. This work validated synthetic biology toolboxes in three nitrogen-fixing soil bacteria: Azotobacter vinelandii, Stutzerimonas stutzeri (Pseudomonas stutzeri), and a new isolate of Klebsiella variicola. All three organisms were amenable to transformation and reporter protein expression, with several functional inducible systems available for each organism. S. stutzeri and K. variicola showed more reliable plasmid-based expression, resulting in successful Cas9 recombineering to create scarless deletions and insertions. Using these tools, we generated mutants with inducible nitrogenase activity and introduced heterologous genes to produce resorcinol products with relevant biological activity in the rhizosphere. MenosThe soil environment adjacent to plant roots, termed the rhizosphere, is home to a wide variety of microorganisms that can significantly affect the physiology of nearby plants. Microbes in the rhizosphere can provide nutrients, secrete signaling compounds, and inhibit pathogens. These processes could be manipulated with synthetic biology to enhance the agricultural performance of crops grown for food, energy, or environmental remediation, if methods can be implemented in these nonmodel microbes. A common first step for domesticating nonmodel organisms is the development of a set of genetic engineering tools, termed a synthetic biology toolbox. A toolbox comprises transformation protocols, replicating vectors, genome engineering (e.g., CRISPR/Cas9), constitutive and inducible promoter systems, and other gene expression control elements. This work validated synthetic biology toolboxes in three nitrogen-fixing soil bacteria: Azotobacter vinelandii, Stutzerimonas stutzeri (Pseudomonas stutzeri), and a new isolate of Klebsiella variicola. All three organisms were amenable to transformation and reporter protein expression, with several functional inducible systems available for each organism. S. stutzeri and K. variicola showed more reliable plasmid-based expression, resulting in successful Cas9 recombineering to create scarless deletions and insertions. Using these tools, we generated mutants with inducible nitrogenase activity and introduced heterologous genes to produce resorci... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Biologia sintética; Caixa de ferramentas; Cas9; CRISPR; Edição de genoma. |
|
Thesagro: |
Nitrogenase; Solo. |
|
Thesaurus Nal: |
Genome; Synthetic biology. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159849/1/SyntheticBiologyToolboxfor-Nitrogen-FixingSoil-Microbes-2023.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02445naa a2200313 a 4500
001 2159849
005 2024-01-29
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1021/acssynbio.3c00414$2DOI
100 1 $aVENKATARAMAN, M.
245 $aSynthetic biology toolbox for nitrogen-fixing soil microbes.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aThe soil environment adjacent to plant roots, termed the rhizosphere, is home to a wide variety of microorganisms that can significantly affect the physiology of nearby plants. Microbes in the rhizosphere can provide nutrients, secrete signaling compounds, and inhibit pathogens. These processes could be manipulated with synthetic biology to enhance the agricultural performance of crops grown for food, energy, or environmental remediation, if methods can be implemented in these nonmodel microbes. A common first step for domesticating nonmodel organisms is the development of a set of genetic engineering tools, termed a synthetic biology toolbox. A toolbox comprises transformation protocols, replicating vectors, genome engineering (e.g., CRISPR/Cas9), constitutive and inducible promoter systems, and other gene expression control elements. This work validated synthetic biology toolboxes in three nitrogen-fixing soil bacteria: Azotobacter vinelandii, Stutzerimonas stutzeri (Pseudomonas stutzeri), and a new isolate of Klebsiella variicola. All three organisms were amenable to transformation and reporter protein expression, with several functional inducible systems available for each organism. S. stutzeri and K. variicola showed more reliable plasmid-based expression, resulting in successful Cas9 recombineering to create scarless deletions and insertions. Using these tools, we generated mutants with inducible nitrogenase activity and introduced heterologous genes to produce resorcinol products with relevant biological activity in the rhizosphere.
650 $aGenome
650 $aSynthetic biology
650 $aNitrogenase
650 $aSolo
653 $aBiologia sintética
653 $aCaixa de ferramentas
653 $aCas9
653 $aCRISPR
653 $aEdição de genoma
700 1 $aYÑIGEZ-GUTIERREZ, A.
700 1 $aINFANTE, V.
700 1 $aMACINTYRE, A.
700 1 $aFERNANDES JUNIOR, P. I.
700 1 $aANÉ, J.-M.
700 1 $aPFLEGER, B.
773 $tACS Synthetic Biology$gv. 12, n. 12, p. 3623-3634, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 258 | |
| 201. |  | AJULO, A. A.; ASOBIA, W. C.; OLIVEIRA, R. S. de; BEZERRA, G. de A.; GONÇALVES, A. R.; FILIPPI, M. C. C. de. Screening bacterial isolates for biocontrol of sheath blight in rice plants. Journal of Environmental Science and Health, Part B, v. 58, n. 5, p. 426-435, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
|    |
| 202. | | MOURA, M. F. G. G.; BEZERRA, G. de A.; AJULO, A. A.; CARDOSO, M. A. A.; OLIVEIRA, R. S. de; FILIPPI, M. C. C. de. Screening de bactérias multifuncionais do filoplano de plantas de arroz de terras altas. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 16., 2022, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2022. p. 45.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
|  |
| 203. | | AJULO, A. A.; ASOBIA, P. C.; OLIVEIRA, R. S. de; BEZERRA, G. de A.; GONÇALVES, A. R.; FILIPPI, M. C. C. de. Screening de isolados bacterianos para biocontrole da queima-da-bainha do arroz. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 53., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2023. p. 218.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 204. | | CHAIBUB, A. A.; SENA, A. P. A.; CORTES, M. V. de C. B.; FILIPPI, M. C. C. de; ARAÚJO, L. G. de. Supressão de brusone foliar em arroz com o uso de Epicoccum sp. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 32. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Apresentação oral - Pós-graduação.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 205. | | ELIAS, M. T. A.; ARRIEL, G. C. T. F.; BEZERRA, G. de A.; SEVERINO, V. G. P.; FILIPPI, M. C. C. de. Supressão de brusone foliar em plantas de arroz com o uso de extratos de Bacillus thuringiensis e Serratia marcescens. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 77. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 206. | | PAGNO, A. L. A.; QUIRINO, A. C. C.; SANTOS, L. A. dos; NASCIMENTO, L. M.; FILIPPI, M. C. C. de; GONÇALVES, F. J.; SOUZA, A. C. A. de. Supressão da brusone (Magnaphorte grisea) e promoção de crescimento da cultura do trigo com o uso de bioagentes e silício. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 52., 2021. Anais... [Brasília, DF]: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2021. p. 309. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 207. | | MAGALHÃES, M. S.; NOGUEIRA, T. A.; FILIPPI, M. C. C. de; SILVA-LOBO, V. L. da; CORTES, M. V. de C. B.; PRABHU, A. S. Supressão das doenças de arroz por isolados de bactérias. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 56-57. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 208. | | ARRUDA, R. L.; SOUSA, T. P. de; FILIPPI, M. C. C. de; CORTES, M. V. de C. B.; CONCEIÇÃO, E. C. da. Utilização de extrato vegetal de Ruta graveolens L. no controle de Magnaporthe oryzae. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 74. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 209. | | MACHADO, P. L. O. de A.; KLUTHCOUSKI, J.; FILIPPI, M. C. C. de; LOBO, V. L. da S.; NAUMOV, A.; OLIVEIRA, J. P. de. Utilização do cloreto de potássio na supressão da brusone em arroz irrigado tropical. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 6., 2009, Porto Alegre. Estresses e sustentabilidade: desafios para a lavoura arrozeira: anais. Porto Alegre: Palotti, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 210. | | FRASCA, L. L. de M.; REZENDE, C. C.; SILVA, M. A.; FARIA, D. R.; LANNA, A. C.; FILIPPI, M. C. C. de; NASCENTE, A. S. Utilização de microrganismos multifuncionais nas principais culturas do cerrado. In: MOURA, P. H. A.; MONTEIRO, V. da F. C. (org.). Responsabilidade social, produção e meio ambiente nas ciências agrárias. Ponta Grossa: Atena, 2021. p. 211-224.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 211. | | FRASCA, L. L. de M.; SILVA, M. A.; REZENDE, C. C.; FERREIRA, E. P. de B.; FILIPPI, M. C. C. de; NASCENTE, A. S. Utilização de microrganismos multifuncionais na produtividade do feijão-comum. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 13., 2021, Goiânia. Conectividade tecnológica, intensificação sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 226. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 213. | | SILVA, G. B. da; ARAÚJO, L. G. de; LOBO, V. L. da S.; PRABHU, A. S.; RÊGO, M. C. F.; PAES, E. T.; FILIPPI, M. C. C. de. Use of local rice cultivars as additional differentials to identify pathotypes of Pyricularia oryzae. Bragantia, v. 70, n. 4, p. 860-868, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 214. | | SANTOS, A. B. dos; SANTOS, T. P. B.; FILIPPI, M. C. C. de; ALVES, K. D.; BOTELHO, T. H. A.; CALDAS, P. P. de C. Utilização de sensor portátil para recomendação de adubação nitrogenada associada ao uso de fungicidas em arroz irrigado. Revista Brasileira de Agropecuária Sustentável, Viçosa, MG, v. 7, n. 2, p. 86-95, jun. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 215. | | SOUSA, K. C. I.; ARAÚJO, L. G. de; CHAIBUB, A. A.; CARVALHO, J. C. B. de; SILVA, C. S.; CORTES, M. V. de C. B.; FILIPPI, M. C. C. de. Alterações enzimáticas relacionadas à resposta de defesa de plantas de arroz e supressão da brusone por fungos de controle biológico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 216. | | MARQUES, M. L. da S.; JESUS, J. M. I. de; OLIVEIRA, M. I. de S.; CÔRTES, M. V. de C. B.; FILIPPI, M. C. C. de; ROCHA, M. R. da. Biochemical response of resistant and susceptible Capsicum spp. to Meloidogyne enterolobii. Journal of Phytopathology, v. 171, n. 9, p. 430-441, Sept. 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 217. | | CÔRTES, M. V. de C. B.; DUARTE, L. T.; FILIPPI, M. C. C. de; LOBO, V. L. da S.; PRABHU, A. S.; GONÇALVES, F. J.; FREITAS, B. R. de; GUIMARÃES, L. A. F.; WENDLAND, A. A coleção de isolados de Magnaporthe oryzae da Embrapa Arroz e Feijão: uma micoteca para uso na pesquisa com brusone. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2010. 20 p. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 259).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 218. | | SILVA, M. A.; NASCENTE, A. S.; FRASCA, L. L. de M.; DUARTE, J. R. de M.; LACERDA, M. C.; FILIPPI, M. C. C. de; LANNA, A. C.; FERREIRA, E. P. de B. Coinoculação com microrganismos multifuncionais afetando a produtividade da soja na região do cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do Iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 225. MERCOSOJA 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 219. | | SILVA, M. A.; NASCENTE, A. S.; FRASCA, L. L. de M.; REZENDE, C. C.; LACERDA, M. C.; FILIPPI, M. C. C. de; LANNA, A. C.; FERREIRA, E. P. de B. Desempenho produtivo da soja cultivada sobre palhada de mix de plantas de cobertura. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do Iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 226. MERCOSOJA 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 220. | | MENDES, L. de M. O.; COSTA, N. D. L. da; ABREU, A. G. de; BORBA, T. C. de O.; FILIPPI, M. C. C. de; SILVA-LOBO, V. L.; MENEZES, I. P. P. de; HOFFMANN, L. V. Desenvolvimento de marcadores SNPS ligados a genes de avirulência de Magnaporthe oryzae. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 14., 2020, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 48.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| Registros recuperados : 258 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
