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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
03/10/2022 |
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Data da última atualização: |
03/10/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
COMIN, H.; CAMPOS, G. S.; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; SOLLERO, B. P.; CARDOSO, F. F. |
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Afiliação: |
HELENA B. COMIN, Universidade Federal de Pelotas; G. S. CAMPOS, Universidade Estadual Paulista; ROBERT DOMINGUES, CPPSUL; EMANUELLE BALDO GASPAR, CPPSUL; BRUNA PENA SOLLERO, GPM; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
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Título: |
Genetic parameters and accuracy of traditional and genomic breeding values for resistance to infectious bovine keratoconjunctivitis in Hereford. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 264, 105078, Oct. 2022. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A B S T R A C T The objectives of this research were to estimate genetic parameters using a threshold animal model by traditional (pedigree and phenotype), single-step genomic BLUP (ssGBLUP) and Weighted ssGBLUP (WssGBLUP) methods, and assess the relative increase in accuracy with the addition of genomic information on the estimation of breeding values for the incidence of infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) in Hereford cattle. The data used in this study were obtained from animals belonging to four farms of Delta G breeders association and genetically evaluated by the Delta G breeding program, born between 2015 and 2017, totaling 293,716 individuals in the pedigree data and 1,579 phenotypes for IBK (1 = absence of disease or 2 = presence of disease). The genotypic data, after quality control, retained 37,505 SNP markers and 1,401 samples. A Bayesian framework and a threshold animal model were used to estimate variance components and to predict breeding values. Animals with genotype and phenotype for the traits studied were divided into 3 groups by random and k-means clustering cross-validation strategies. The estimate of direct heritability for resistance to IBK was 0.12 ± 0.01 and 0.10 ± 0.01 through PBLUP and ssGBLUP methods. The mean realized prediction accuracies based on linear regression statistics were 0.36, 0.65 and 0.70, respectively for PBLUP, ssGBLUP and WssGBLUP; therefore, the use of the genomic relationship matrices was superior to the pedigree-based method. When using the WssGBLUP method, there was an additional increase in prediction accuracy when compared to the ssGBLUP method, which was already substantially better than PBLUP. The prediction of breeding values using genomic information by the single-step methods should result in more accurate selection decisions compared to traditional pedigree evaluations and, consequently, genomic selection can be readily applied with moderately high reliability to help reduce the incidence of IBK in Hereford cattle. MenosA B S T R A C T The objectives of this research were to estimate genetic parameters using a threshold animal model by traditional (pedigree and phenotype), single-step genomic BLUP (ssGBLUP) and Weighted ssGBLUP (WssGBLUP) methods, and assess the relative increase in accuracy with the addition of genomic information on the estimation of breeding values for the incidence of infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) in Hereford cattle. The data used in this study were obtained from animals belonging to four farms of Delta G breeders association and genetically evaluated by the Delta G breeding program, born between 2015 and 2017, totaling 293,716 individuals in the pedigree data and 1,579 phenotypes for IBK (1 = absence of disease or 2 = presence of disease). The genotypic data, after quality control, retained 37,505 SNP markers and 1,401 samples. A Bayesian framework and a threshold animal model were used to estimate variance components and to predict breeding values. Animals with genotype and phenotype for the traits studied were divided into 3 groups by random and k-means clustering cross-validation strategies. The estimate of direct heritability for resistance to IBK was 0.12 ± 0.01 and 0.10 ± 0.01 through PBLUP and ssGBLUP methods. The mean realized prediction accuracies based on linear regression statistics were 0.36, 0.65 and 0.70, respectively for PBLUP, ssGBLUP and WssGBLUP; therefore, the use of the genomic relationship matrices was superior to the pedigree-based ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Resistência a doença; Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Gado de Corte; Parâmetro Genético. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
04/12/1996 |
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Data da última atualização: |
05/05/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
FERREIRA, M. das G. R.; LIMA, P. C. F. |
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Afiliação: |
Maria das Graças Rodrigues Ferreira; PAULO CESAR FERNANDES LIMA, CPATSA. |
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Título: |
Fenologia de especies de Prosopis. |
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Ano de publicação: |
1996 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 47., 1996, Nova Friburgo. Resumos... Nova Friburgo: SBB, 1996. |
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Páginas: |
p. 411. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A falta de informacao quanto a fenologia de especies de uso multiplo para o semi-arido brasileiro, tem dificultado o planejamento agricola quanto a indicacao de especies para producao de forragem, principalmente nos periodos de seca, na regiao. Face a importancia do genero Prosopis para o semi-arido, iniciou-se em agosto de 1995, estudos objetivando correlacionar as epocas de emissao das folhas e frutificacao, em especies deste genero, introduzidas na regiao, com os dados meteorologicos locais. Quinzenalmente estao sendo observadas as fenofases mudanca foliar, floracao, frutificacao e exsudacao em Prosopis juliflora, P. cinearia e P. glandulosa var. glandulosa, plantadas em 1987, em espacamento 6 x 6 m. A presenca de flores vem ocorrendo desde agosto, sendo que em P. juliflora nao houve floracao no mes de outubro. A maior porcentagem de arvores florindo em P. juliflora foi nos meses de novembro e dezembro, entretanto, o aparecimento de frutos, se deu a partir de dezembro. Em P. glandulosa e P. cinearia, a presenca de frutos foi observada em todos os meses, sendo o pico, em emissao de folhas novas ocorreu nos meses de novembro e dezembro, para P. juliflora e P. glandulosa, e novembro e janeiro, para P. cineraria. Os meses de novembro, dezembro e janeiro foram os meses de maior precipitacao na regiao. |
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Palavras-Chave: |
Mesquite. |
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Thesagro: |
Algaroba; Fenologia. |
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Thesaurus NAL: |
phenology; Prosopis. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/199439/1/Congresso-de-Botanico-pag-411.pdf
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Marc: |
LEADER 01846nam a2200193 a 4500
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520 $aA falta de informacao quanto a fenologia de especies de uso multiplo para o semi-arido brasileiro, tem dificultado o planejamento agricola quanto a indicacao de especies para producao de forragem, principalmente nos periodos de seca, na regiao. Face a importancia do genero Prosopis para o semi-arido, iniciou-se em agosto de 1995, estudos objetivando correlacionar as epocas de emissao das folhas e frutificacao, em especies deste genero, introduzidas na regiao, com os dados meteorologicos locais. Quinzenalmente estao sendo observadas as fenofases mudanca foliar, floracao, frutificacao e exsudacao em Prosopis juliflora, P. cinearia e P. glandulosa var. glandulosa, plantadas em 1987, em espacamento 6 x 6 m. A presenca de flores vem ocorrendo desde agosto, sendo que em P. juliflora nao houve floracao no mes de outubro. A maior porcentagem de arvores florindo em P. juliflora foi nos meses de novembro e dezembro, entretanto, o aparecimento de frutos, se deu a partir de dezembro. Em P. glandulosa e P. cinearia, a presenca de frutos foi observada em todos os meses, sendo o pico, em emissao de folhas novas ocorreu nos meses de novembro e dezembro, para P. juliflora e P. glandulosa, e novembro e janeiro, para P. cineraria. Os meses de novembro, dezembro e janeiro foram os meses de maior precipitacao na regiao.
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650 $aAlgaroba
650 $aFenologia
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700 1 $aLIMA, P. C. F.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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