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| Registros recuperados : 78 | |
| 41. |  | PANETTO, J. C. C.; VAL, J. E.; MARCONDES, C. R.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; FERRAZ, J. B. S.; GOLDEN, B. L. Female fertility in a Guzerat dairy subpopulation: heterogeneity of variance components for calving intervals. Livestock Science, v. 145, n. 1-3, p. 87-94, may 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 42. | | OLIVEIRA, P. S.; SANTANA JÚNIOR, M. L.; PEDROSA, V. B.; OLIVEIRA, E. C. de M.; ELER, J. P.; FERRAZ, J. B. S. Estrutura populacional de rebanho fechado da raça Nelore da linhagem Lemgruber. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 6, p. 639-647, jun. 2011 Título em inglês: Population structure of a closed herd of Nellore cattle of the Lemgruber line.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 43. | | SANTANA JUNIOR, M. L.; ELER, J. P.; CARDOSO, F. F.; ALBUQUERQUE, L. G.; BALIEIRO, J. C. C.; PEREIRA, R. J.; FERRAZ, J. B. S. Genotype by environment interaction for post-weaning weight gain, scrotal circumference, and muscling score of composite beef cattle in different regions of Brazil. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 2, p. 3048-3059, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 44. | | OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; VENTURA, R.; FREITAS, B. G. de; SANTANA, M. H. A.; SILVA, M. V. G. B.; FERRAZ, J. B. S.; GARRICK, D. J. Genome-wide association study in reproductive trait of Nellore heifers. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 24., 2016, San Diego. [Proceedings...] San Diego: [s.n.], 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 45. | | FELÍCIO, A. M.; BOSCHIERO, C.; BALIEIRO, J. C. C.; LEDUR, M. C.; FERRAZ J. B. S.; MICHELAN FILHO, T.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Identification and association of polymorphisms in CAPN1 and CAP3 candidate genes related to performance and meat quality traits in chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 12, n. 1, p. 472-482, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 46. | | FIGUEIREDO, C. L.; BALIEIRO, J. C. de C.; MATTOS, E. C. de; BALIEIRO, C. de C.; ELER, J. P.; FERRAZ, J. B. S. Estimativas de parâmetros genéticos para fertilidade ao parto e número de cordeiros nascidos ao parto em ovinos da raça Santa Inês. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. O avanço científico e tecnológico na produção animal: anais. Jaboticabal: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UNESP, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, 2007. 3 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 47. | | COSTA, K. C. P. da; FERRAZ, J. B. S.; BASTOS, R. P.; REIS, T. da S.; FERREIRA, M. J.; GUIMARÃES, G. P. Estoques de biomassa e nutrientes em três espécies de Parkia em plantios jovens sobre área degradada na Amazônia Central. Floresta, Curitiba, v. 44, n. 4, p. 637-646, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 48. | | CARVALHO, M. E.; ELER, J. P.; AFAZ, A. L. M.; FERRAZ, J. B. S.; REGITANO, L. C. de A.; MEIRELLES, F. V.; BALIEIRO, J. C. de C. A. Avaliação de diferentes combinações genotípicas para polimorfismo no gene u-calpaína e calpastatina associados com a maciez da carne em bovinos da raça Nelore. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE CARNES, 4., 2007, Campinas, SP. Mercado do Século XXI: qualidade, segurança alimentar, certificação e rastreabilidade - Anais... Campinas: ITAL: CTC, 2007. p. 253-255. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 49. | | CARVALHO, M. E.; ELER, J. P.; BALIEIRO, J. C. de C.; REGITANO, L. C. de A.; MEIRELLES, F. V.; FERRAZ, J. B. S. Associação de polimorfismos no gene da u-calpaína com a maciez da carne em animais da raça Nelore. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., Jaboticabal, SP. Anais... Jaboticabal: SBZ: UNESP, 2007. 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 50. | | SILVA, M. V. G. B. da; BERGMANN, J. A. G.; MARTINEZ, M. L.; PEREIRA, C. S.; FERRAZ, J. B. S.; SILVA, H. C. M. da. Associação genética, fenotípica e de ambiente entre medidas de eficiência reprodutiva e produção de leite na raça Holandesa. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 27, n. 6, p. 1115-1122, 1998.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 51. | | SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA JUNIOR, G.; REY, F. S. B.; GIACHETTO, P. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; FERRAZ, J. B. S. Descriptive analysis of copy number variation regions in a population of dairy Gyr cattle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: American Society of Animal Science, 2014. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite. |
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| 53. | | SILVA, S. da L. e; TAROUCO, J. U.; FERRAZ, J. B. S.; GOMES, R. da C.; LEME, P. R.; NAVAJAS, E. A. Prediction of retail beef yield, trim fat and proportion of high-valued cuts in Nellore cattle using ultrasound live measurements. Revista Brasileira de Zootecnia, v.41, n.9, p.2025-2031, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 54. | | FELÍCIO, A. M.; BOSCHIERO, C.; BALIEIRO, J. C. C.; LEDUR, M. C.; FERRAZ J. B. S.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Polymorphisms in FGFBP1 and FGFBP2 genes associated with carcass and meat quality traits in chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 12, n. 1, p. 208-222, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 55. | | SALVIAN, M.; RAMÍREZ-DÍAZ, J.; CUCCO, D. C.; SANTANA, M. H.; BONIN, M. N.; GOMES, R. da C.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B. Multivariate analyses of live-animal ultrasound carcass traits of composite cattle. In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of Knowledge in animal production - abstracts. Campinas: SBZ, 2013 1 CD ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 56. | | MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; BRAUNER, C. C.; PIMENTEL, M. A.; BENAVIDES, M. V.; FERRAZ, J. B. S. Utilização do escore de condição corporal pós-parto na identificação de vacas de corte mais férteis criadas em sistemas extensivos. Archivos Latinoamericanos de Producción Animal, Maracaibo, v. 21, n. 3, p. 149-155, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 57. | | ALEXANDRE, P. A.; GOMES, R. da C.; SANTANA, M. H. A.; SILVA, S. L.; LEMES, P. R.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; MEIRELLES, F. V.; FERRAZ, J. B. S.; FUKUMASU, H. Bovine NR1I3 gene polymorphisms and its association with feed efficiency traits in Nellore cattle. Meta Gene, v. 2, p. 206-217, dec. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 58. | | OLIVEIRA JÚNIOR, G. A.; CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MUNARI, D. P.; FERRAZ, J. B. S.; MULLART, E.; DeNISE, S.; SMITH, S.; SILVA, M. V. G. B. Genotype imputation in a tropical crossbred dairy cattle population. Journal of Dairy Science, v. 100, n. 12, p. 9623-9634, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 59. | | CARVALHO, M. E.; ELER, J. P.; BONIN, M. N.; REZENDE, F. M.; BIASE, F. H.; MEIRELLES, F. V.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L.; BALIEIRO, J. C. C.; FERRAZ, J. B. S. Genotypic and allelic frequencies of gene polymorphisms associated with meat tenderness in Nellore beef cattle. Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 1, p. 1-15, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 60. | | LOBO, A. M. B. O.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; FONSECA, J. F. da; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; CAETANO, A. R.; FERRAZ, J. B. S.; BIAZIO, G. R. de. Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros Capragene®, 1º sumário de avaliação genética genômica, 2º sumário de avaliação genética, raça Saanen - Ano 2017. 2. ed. rev. ampl. Brasília, DF: Embrapa, 2017. 51 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| Registros recuperados : 78 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
23/01/2023 |
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Data da última atualização: |
23/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
BRUSCADIN, J. J.; CARDOSO, T. F.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; AFONSO, J.; VIEIRA, D.; MALHEIROS, J. M.; ANDRADE, B. G. N.; PETRINI, J.; FERRAZ, J. B. S.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
JENNIFER JESSICA BRUSCADIN, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, AUBURN UNIVERSITY; MARCELA MARIA DE SOUZA, IOWA STATE UNIVERSITY; JULIANA AFONSO; DIELSON VIEIRA, YALE UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE; JESSICA MORAES MALHEIROS, UNIVERSIDADE FEDERAL DA INTEGRAÇÃO LATINO-AMERICANA; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE, MUNSTER TECHNOLOGICAL UNIVERSITY; JULIANA PETRINI, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; JOSÉ BENTO STERMAN FERRAZ, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; GERSON BARRETO MOURÃO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LUIZ LEHMANN COUTINHO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Differential allele-specific expression revealed functional variants and candidate genes related to meat quality traits in B. indicus muscle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Genes, v. 13, n. 12, 2336, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/ genes13122336 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Traditional transcriptomics approaches have been used to identify candidate genes affecting economically important livestock traits. Regulatory variants affecting these traits, however, remain under covered. Genomic regions showing allele-specific expression (ASE) are under the effect of cis-regulatory variants, being useful for improving the accuracy of genomic selection models. Taking advantage of the better of these two methods, we investigated single nucleotide polymorphisms (SNPs) in regions showing differential ASE (DASE SNPs) between contrasting groups for beef quality traits. For these analyses, we used RNA sequencing data, imputed genotypes and genomic estimated breeding values of muscle-related traits from 190 Nelore (Bos indicus) steers. We selected 40 contrasting unrelated samples for the analysis (N = 20 animals per contrasting group) and used a beta-binomial model to identify ASE SNPs in only one group (i.e., DASE SNPs). We found 1479 DASE SNPs (FDR 0.05) associated with 55 beef-quality traits. Most DASE genes were involved with tenderness and muscle homeostasis, presenting a co-expression module enriched for the protein ubiquitination process. The results overlapped with epigenetics and phenotype-associated data, suggesting that DASE SNPs are potentially linked to cis-regulatory variants affecting simultaneously the transcription and phenotype through chromatin state modulation. |
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Palavras-Chave: |
Allele-specific expression; ASE; Cis-regulation; Expressão alelo específica; Expressão gênica; Polimorfismos de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Fenótipo. |
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Thesaurus NAL: |
Beef; Gene expression; Phenotype; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151168/1/DifferentialAlleleSpecific.pdf
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Marc: |
LEADER 02705naa a2200421 a 4500
001 2151149
005 2023-01-23
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024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/ genes13122336$2DOI
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653 $aAllele-specific expression
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700 1 $aCARDOSO, T. F.
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700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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