Data/hora: 23/06/2024 07:45:34

Biblioteca(s): | Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais.
Data corrente: | 14/02/2017
Data da última atualização: | 18/12/2017
Autoria: | ALMEIDA, I. F. de; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de.
Afiliação: | ÍSIS FERNANDA DE ALMEIDA, Instituto Federal do Triângulo Mineiro; COSME DAMIÃO CRUZ, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF.
Título: | Validação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla.
Ano de publicação: | 2016
Fonte/Imprenta: | Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 12, p. 1973-1982, dez. 2016.
Idioma: | Português
Notas: | Título em ingles: Validation and phenotypic correction in genome-wide selection.

Conteúdo:

O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores ? 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na 
validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RRBlup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas.
No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado.

Palavras-Chave: | Acurácia; Blasso; Genotipagem em larga escala; Large-scale genotyping; RR-Blup.
Thesagro: | Marcador molecular.
Thesaurus Nal: | Accuracy; Genetic markers.

Categoria do assunto:

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G Melhoramento Genético

URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155551/1/Validacao-e-correcao-de-fenotipos.pdf
Registro original: | Embrapa Florestas (CNPF)

Exemplares:

AI-SEDE - (60753-1) - UPE - AP - PP - 630.72081 - P474 -  - DIS
CNPF - (56170-1) - UPC - AP - PP -  -  -  - DIS