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| Registros recuperados : 417 | |
| 121. |  | TAMBASCO, D. D.; ALENCAR, M. M. de; COUTINHO, L. L.; TAMBASCO, A. J.; TAMBASCO, M. D.; REGITANO, L. C. de A. Caracterização da raça Nelore com base em seis marcadores moleculares. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 36.,1999, Porto Alegre, RS. Anais... Porto Alegre: SBZ, 1999. p.140. 4 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 122. | | ROSA, A. J. de M.; PACKER, I. U.; REGITANO, L. C. de A.; RAZOOK, A.; FIGUEIREDO, L. G.; COUTINHO, L. L. Caracterização da raça Nelore e teste de paternidade e por marcadores moleculares. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 34., 1997, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: SBZ, 1997. p.62-64.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 123. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; GARCIA, A.; COUTINHO, L. L. Multitrait composite interval mapping reveals pleiotropic QTL on chicken chromosome 1. In: CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 33., 2012, Cairns. Programme and abstract book... Cairns: ISAG, 2012. p.40.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 124. | | VIGNATO, B. S.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; BALIEIRO, J. C. de C. NEDD4: a putative candidate gene for ribeye area in Nellore steers. In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. p. 15. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125) Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti,...| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 125. | | REGITANO, L. C. de A.; JORGE, E. C.; TAMBASCO, D. D.; TAMBASCO, M. D.; FERREIRA, E. J.; ALENCAR, M. M. de; PACKER, I. H.; COUTINHO, L. L. Multilocus genetic distance among Canchim, Charolais and Nelore bovine breeds. Genetics and Molecuar Bilogy, v.22, n.3, Suppl., p.591-592, 1999.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 126. | | LEDUR, M. C. ZANELLA, E. L. SCHMIDT, G. S. JAENISCH, F. R. F. SAATKAMP, M. G. BASSI, L. J. COUTINHO, L. L. Peso e características de carcaça em linhagens utilizadas no desenvolvimento de populaçoes referência para detecçao de QTL em aves. Revista Brasileira de Ciência Avícola, Campinas, supl. 2, 2000. p. 73. Prêmio de Pesquisa Avícola "José Maria Lamas da Silva". APINCO 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 127. | | KOWALSKI, R.; TESMANN, A. L; BRIGHENTI, F. C.; JARDIN, S. N.; RIBEIRO, J. B.; PEIXOTO, J. O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Otimização das condições de amplificação de um fragmento do gene que codifica ferritina em galinhas. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA UnC/EMBRAPA, 1., 2007, Concórdia. Anais. Concórdia: Unc : Embrapa Suínos e Aves, 2007. 1 CD-ROM. Projeto n. 16.00.30001-16| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 129. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. S. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. Journal of Applied Genetics, Pozna, on line 28 nov. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 130. | | AQUINO, L. M. de; CONTEVILLE, L. C.; ANDRADE, B. G. N.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Identificação de genes de resistência e elementos móveis no microbioma ruminal e fecal de touros Nelore. JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 15., 2023, São Carlos, SP. Anais [...]. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Instrumentação, 2023. p. 40. (Embrapa Pecuária Sudeste, Eventos técnicos & científicos, 01). Organizadores: Cintia Righetti Marcondes; Daniel Souza Corrêa. Evento virtual.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 131. | | FELÍCIO, A. M.; BOSCHIERO, C.; BALIEIRO, J. C. C.; LEDUR, M. C.; FERRAZ J. B. S.; MICHELAN FILHO, T.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Identification and association of polymorphisms in CAPN1 and CAP3 candidate genes related to performance and meat quality traits in chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 12, n. 1, p. 472-482, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 132. | | COUTINHO, L. L.; MOROSINI, N. S.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; MARGARIDO, G. R. A. Identification and characterization of euchromatic regions associated with gene expression and intramuscular fat in Nelore cattle. Journal of Animal Science, v. 96, suppl. S3, p. 233-234, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 133. | | ANDREOTE, A. P. D.; ROSÁRIO, M. F. do; LEDUR, M. C.; JORGE, E. C.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; COUTINHO, L. L. Identification and characterization of microRNAs expressed in chicken skeletal muscle. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 1, p. 1465-1479, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 134. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; SILVA, V. H.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Identification of CNVs on the genome of Brazilian chicken lines. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0646.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 135. | | MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of mutations in a QTL region on chromosome 3 associated with fatness in chickens. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 38. ISAFG 2013. AB.31| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 136. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of polymorphisms in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 39. ISAFG 2013.AB.32| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 137. | | GONÇALVES, T. M.; ANDRADE, S. C. S.; GASPARIN, G.; SILVA, V. H. da; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. Glutathione pathway could be associated with meat tenderness in Nellore. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.40.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 138. | | PÉRTILLE, F.; BOSAGNA, C. G.; SILVA, V. H. da; BOSCHIERO, C.; NUNES, J. de R. da S.; LEDUR, M. C.; JENSEN, P.; COUTINHO, L. L. High-throughput and cost-effective chicken genotyping using next-generation sequencing. Scientific Reports, v. 6, n. 26929, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 139. | | PÉRTILLE, F.; FELÍCIO, A. M.; ROSÁRIO, M. F. do; SILVA, V. H.; MANGUETTI, T.; SILVA, N. A.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. PPARGC1A indel polymorphism is associated with performance and carcass traits in chickens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: SBG, 2012. p. 72| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 140. | | CASSOLI, C. S. da S.; JORGE, E. C.; PATRÍCIO, M.; ALVES, H. J.; ALMEIDA, E. A. de; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. ESTs and putative line-specific (broiler and layer) SNPs identified in genes expressed in Gallus gallus pituitary and hypothalamus. Genetics and Molecular Biology, v.30, n.4, p.1077-1081, 2007. Projeto n. 01.02.10.210-10.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| Registros recuperados : 417 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
15/02/2019 |
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Data da última atualização: |
29/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
VIGNATO B. S.; COUTINHO, L. L.; POLETI, M. D.; CESAR, A. S. M.; MONCAU, C. T.; REGITANO, L. C. de A.; BALIEIRO, J. C. C. |
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Afiliação: |
Bárbara Silva-Vignato, USP; Luiz L. Coutinho, USP; Mirele D. Poleti, USP; Aline S. M. Cesar, USP; Cristina T. Moncau, Universidade Federal de Lavras; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Júlio C. C. Balieiro, USP. |
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Título: |
Gene co-expression networks associated with carcass traits reveal new pathways for muscle and fat deposition in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Genomics, v. 20, n. 32, p. 2-13, 2019. |
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DOI: |
10.1186/s12864-018-5345-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Positively correlated with carcass weight and animal growth, the ribeye area (REA) and the backfat thickness (BFT) are economic important carcass traits, which impact directly on producer's payment. The selection of these traits has not been satisfactory since they are expressed later in the animal's life and multigene regulated. So, next-generation technologies have been applied in this area to improve animal's selection and better understand the molecular mechanisms involved in the development of these traits. Correlation network analysis, performed by tools like WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis), has been used to explore gene-gene interactions and gene-phenotype correlations. Thus, this study aimed to identify putative candidate genes and metabolic pathways that regulate REA and BFT by constructing a gene co-expression network using WGCNA and RNA sequencing data, to better understand genetic and molecular variations behind these complex traits in Nelore cattle. |
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Palavras-Chave: |
Functional enrichment analysis; Ribeye area; RNA-Seq data; WGCNA. |
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Thesagro: |
Carcaça; Gado Nelore; Gordura Animal. |
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Thesaurus NAL: |
Backfat; Beef carcasses; Thickness. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/192864/1/1-Gene-co-expression-networks-associatedwith-carcass-traits-reveal-new-pathways-formuscle-and-fat-deposition-in-Nelore-cattle.pdf
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Marc: |
LEADER 01936naa a2200325 a 4500
001 2106063
005 2019-11-29
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1186/s12864-018-5345-y$2DOI
100 1 $aVIGNATO B. S.
245 $aGene co-expression networks associated with carcass traits reveal new pathways for muscle and fat deposition in Nelore cattle.$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aPositively correlated with carcass weight and animal growth, the ribeye area (REA) and the backfat thickness (BFT) are economic important carcass traits, which impact directly on producer's payment. The selection of these traits has not been satisfactory since they are expressed later in the animal's life and multigene regulated. So, next-generation technologies have been applied in this area to improve animal's selection and better understand the molecular mechanisms involved in the development of these traits. Correlation network analysis, performed by tools like WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis), has been used to explore gene-gene interactions and gene-phenotype correlations. Thus, this study aimed to identify putative candidate genes and metabolic pathways that regulate REA and BFT by constructing a gene co-expression network using WGCNA and RNA sequencing data, to better understand genetic and molecular variations behind these complex traits in Nelore cattle.
650 $aBackfat
650 $aBeef carcasses
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653 $aFunctional enrichment analysis
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773 $tGenomics$gv. 20, n. 32, p. 2-13, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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