|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sul. Para informações adicionais entre em contato com cppsul.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
Data corrente: |
02/09/2021 |
Data da última atualização: |
02/09/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
FERREIRA, C. E. R.; CAMPOS, G. S.; SCHMIDT, P. I.; SOLLERO, B. P.; GOULARTE, K. L.; CORCINI, C. D.; GASPERIN, B. G.; LUCIA JUNIOR, T.; BOLIGON, A. A.; CARDOSO, F. F. |
Afiliação: |
CARLOS E. R. FERREIRA, UFPEL; GABRIEL S. CAMPOS, UFPEL; PATRICIA I. SCHMIDT, UNESP; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; KARINA L. GOULARTE, UFPEL; CARINE D. CORCINI, UFPEL; BERNARDO G. GASPERIN, UFPEL; THOMAZ LUCIA JUNIOR, UFPEL; ARIONE A. BOLIGON, UFPEL; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
Título: |
Genome-wide association and genomic prediction for scrotal circumference in Hereford and Braford bulls. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Theriogenology, v. 172, p. 268-280, Sept. 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.theriogenology.2021.07.007 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Scrotal circumference (SC) is widely used as a selection criterion for bulls in breeding programs, since it is easily assessed and correlated with several desirable reproductive traits. The objectives of this study were: to perform a genome-wide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with SC adjusted for age (SCa) and for both age and weight (SCaw); to select Tag SNPs from GWAS to construct low-density panel for genomic prediction; and to compare the prediction accuracy of the SC through different methods for Braford and Hereford bulls from the same genetic breeding program. Data of SC from 18,172 bulls (30.4 ± 3.7 cm) and of genotypes from 131 sires and 3,545 animals were used. From GWAS, the top 1% of 1-Mb windows were observed on chromosome (BTA) 2, 20, 7, 8, 15, 3, 16, 27, 6 and 8 for SCa and on BTA 8, 15, 16, 21, 19, 2, 6, 5 and 10 for SCaw, representing 17.4% and 18.8% of the additive genetic variance of SCa and SCaw, respectively. The MeSH analysis was able to translate genomic information providing biological meanings of more specific gene functions related to the SCa and SCaw. The genomic enhancement methods, especially single step GBLUP, that combined phenotype and pedigree data with direct genomic values generated gains in accuracy in relation to pedigree BLUP, suggesting that genomic predictions should be applied to improve genetic gain and to narrow the generation interval compared to traditional methods. The proposed Tag-SNP panels may be useful for lower-cost commercial genomic prediction applications in the future, when the number of bulls in the reference population increases for SC in Hereford and Braford breeds. MenosScrotal circumference (SC) is widely used as a selection criterion for bulls in breeding programs, since it is easily assessed and correlated with several desirable reproductive traits. The objectives of this study were: to perform a genome-wide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with SC adjusted for age (SCa) and for both age and weight (SCaw); to select Tag SNPs from GWAS to construct low-density panel for genomic prediction; and to compare the prediction accuracy of the SC through different methods for Braford and Hereford bulls from the same genetic breeding program. Data of SC from 18,172 bulls (30.4 ± 3.7 cm) and of genotypes from 131 sires and 3,545 animals were used. From GWAS, the top 1% of 1-Mb windows were observed on chromosome (BTA) 2, 20, 7, 8, 15, 3, 16, 27, 6 and 8 for SCa and on BTA 8, 15, 16, 21, 19, 2, 6, 5 and 10 for SCaw, representing 17.4% and 18.8% of the additive genetic variance of SCa and SCaw, respectively. The MeSH analysis was able to translate genomic information providing biological meanings of more specific gene functions related to the SCa and SCaw. The genomic enhancement methods, especially single step GBLUP, that combined phenotype and pedigree data with direct genomic values generated gains in accuracy in relation to pedigree BLUP, suggesting that genomic predictions should be applied to improve genetic gain and to narrow the generation interval compared to traditional methods. The proposed Tag-SNP panels may ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Desempenho reprodutivo; Predição genômica. |
Thesagro: |
Bovino; Gado de Corte; Performance. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02599naa a2200301 a 4500 001 2134027 005 2021-09-02 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.theriogenology.2021.07.007$2DOI 100 1 $aFERREIRA, C. E. R. 245 $aGenome-wide association and genomic prediction for scrotal circumference in Hereford and Braford bulls.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aScrotal circumference (SC) is widely used as a selection criterion for bulls in breeding programs, since it is easily assessed and correlated with several desirable reproductive traits. The objectives of this study were: to perform a genome-wide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with SC adjusted for age (SCa) and for both age and weight (SCaw); to select Tag SNPs from GWAS to construct low-density panel for genomic prediction; and to compare the prediction accuracy of the SC through different methods for Braford and Hereford bulls from the same genetic breeding program. Data of SC from 18,172 bulls (30.4 ± 3.7 cm) and of genotypes from 131 sires and 3,545 animals were used. From GWAS, the top 1% of 1-Mb windows were observed on chromosome (BTA) 2, 20, 7, 8, 15, 3, 16, 27, 6 and 8 for SCa and on BTA 8, 15, 16, 21, 19, 2, 6, 5 and 10 for SCaw, representing 17.4% and 18.8% of the additive genetic variance of SCa and SCaw, respectively. The MeSH analysis was able to translate genomic information providing biological meanings of more specific gene functions related to the SCa and SCaw. The genomic enhancement methods, especially single step GBLUP, that combined phenotype and pedigree data with direct genomic values generated gains in accuracy in relation to pedigree BLUP, suggesting that genomic predictions should be applied to improve genetic gain and to narrow the generation interval compared to traditional methods. The proposed Tag-SNP panels may be useful for lower-cost commercial genomic prediction applications in the future, when the number of bulls in the reference population increases for SC in Hereford and Braford breeds. 650 $aBovino 650 $aGado de Corte 650 $aPerformance 653 $aDesempenho reprodutivo 653 $aPredição genômica 700 1 $aCAMPOS, G. S. 700 1 $aSCHMIDT, P. I. 700 1 $aSOLLERO, B. P. 700 1 $aGOULARTE, K. L. 700 1 $aCORCINI, C. D. 700 1 $aGASPERIN, B. G. 700 1 $aLUCIA JUNIOR, T. 700 1 $aBOLIGON, A. A. 700 1 $aCARDOSO, F. F. 773 $tTheriogenology$gv. 172, p. 268-280, Sept. 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
19/02/2016 |
Data da última atualização: |
01/08/2016 |
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Autoria: |
COSTA, R. V. da; SILVA, D. D. da; COTA, L. V.; UMMUS, M. E. |
Afiliação: |
RODRIGO VERAS DA COSTA, CNPMS; DAGMA DIONISIA DA SILVA, CNPMS; LUCIANO VIANA COTA, CNPMS; MARTA EICHEMBERGER UMMUS, CNPASA. |
Título: |
Levantamento de fungos causadores de podridões de colmo em milho na região Centro Oeste do Brasil. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2015. |
Série: |
(Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 133). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
As podridões de colmo estão entre as mais importantes doenças da cultura do milho. Vários são os patógenos causadores de podridões de colmo em plantas de milho, incluindo fungos e bactérias. Entre os principais, destacam-se Fusarium verticillioides, Fusarium graminearum, Colletotrichum graminicola, Stenocarpella macrospora, Stenocarpella maydis e Macrophomina phaseolina. O presente trabalho teve como objetivo realizar um levantamento da incidência de fungos causadores de podridões de colmo em milho na região Centro-Oeste do Brasil. Foram realizadas coletas de amostras nos estados de Goiás, Mato Grosso e Mato Grosso do Sul. Durante as coletas das amostras foi possível verificar uma elevada incidência de plantas apresentando sintomas de podridão de colmo em, praticamente, todas as regiões. Dentre os patógenos detectados, as maiores frequências foram verificadas para Fusarium spp. Nigrospora spp. e Stenocarpella spp., com freqüência de 45,7, 38,3 e 29,9%, respectivamente. Coletotrichum graminicola e Rhizoctonia spp. apresentaram frequência de 5,8 e 3,4%. Os demais fungos apresentaram menos de 3% de ocorrência nos isolamentos. Esses resultados demonstram a grande variabilidade de fungos envolvidos com as podridões de colmo na cultura do milho no Centro-Oeste do Brasil. Revelam, também, a elevada ocorrência de fungos do gênero Fusarium spp. e Stenocarpella spp., os quais predominaram nas amostras analisadas no presente trabalho. Os trabalhos de monitoramento da ocorrência de fungos causadores de podridões de colmo são fundamentais para o desenvolvimento e a adoção das melhores estratégias de controle desta doença na cultura do milho. MenosAs podridões de colmo estão entre as mais importantes doenças da cultura do milho. Vários são os patógenos causadores de podridões de colmo em plantas de milho, incluindo fungos e bactérias. Entre os principais, destacam-se Fusarium verticillioides, Fusarium graminearum, Colletotrichum graminicola, Stenocarpella macrospora, Stenocarpella maydis e Macrophomina phaseolina. O presente trabalho teve como objetivo realizar um levantamento da incidência de fungos causadores de podridões de colmo em milho na região Centro-Oeste do Brasil. Foram realizadas coletas de amostras nos estados de Goiás, Mato Grosso e Mato Grosso do Sul. Durante as coletas das amostras foi possível verificar uma elevada incidência de plantas apresentando sintomas de podridão de colmo em, praticamente, todas as regiões. Dentre os patógenos detectados, as maiores frequências foram verificadas para Fusarium spp. Nigrospora spp. e Stenocarpella spp., com freqüência de 45,7, 38,3 e 29,9%, respectivamente. Coletotrichum graminicola e Rhizoctonia spp. apresentaram frequência de 5,8 e 3,4%. Os demais fungos apresentaram menos de 3% de ocorrência nos isolamentos. Esses resultados demonstram a grande variabilidade de fungos envolvidos com as podridões de colmo na cultura do milho no Centro-Oeste do Brasil. Revelam, também, a elevada ocorrência de fungos do gênero Fusarium spp. e Stenocarpella spp., os quais predominaram nas amostras analisadas no presente trabalho. Os trabalhos de monitoramento da ocorrência de fung... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Doença de planta; Fungo; Zea mays. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/145936/1/bol-133.pdf
|
Marc: |
LEADER 02312nam a2200193 a 4500 001 2037748 005 2016-08-01 008 2015 bl uuuu u0uu1 u #d 100 1 $aCOSTA, R. V. da 245 $aLevantamento de fungos causadores de podridões de colmo em milho na região Centro Oeste do Brasil.$h[electronic resource] 260 $aSete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo$c2015 490 $a(Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 133). 520 $aAs podridões de colmo estão entre as mais importantes doenças da cultura do milho. Vários são os patógenos causadores de podridões de colmo em plantas de milho, incluindo fungos e bactérias. Entre os principais, destacam-se Fusarium verticillioides, Fusarium graminearum, Colletotrichum graminicola, Stenocarpella macrospora, Stenocarpella maydis e Macrophomina phaseolina. O presente trabalho teve como objetivo realizar um levantamento da incidência de fungos causadores de podridões de colmo em milho na região Centro-Oeste do Brasil. Foram realizadas coletas de amostras nos estados de Goiás, Mato Grosso e Mato Grosso do Sul. Durante as coletas das amostras foi possível verificar uma elevada incidência de plantas apresentando sintomas de podridão de colmo em, praticamente, todas as regiões. Dentre os patógenos detectados, as maiores frequências foram verificadas para Fusarium spp. Nigrospora spp. e Stenocarpella spp., com freqüência de 45,7, 38,3 e 29,9%, respectivamente. Coletotrichum graminicola e Rhizoctonia spp. apresentaram frequência de 5,8 e 3,4%. Os demais fungos apresentaram menos de 3% de ocorrência nos isolamentos. Esses resultados demonstram a grande variabilidade de fungos envolvidos com as podridões de colmo na cultura do milho no Centro-Oeste do Brasil. Revelam, também, a elevada ocorrência de fungos do gênero Fusarium spp. e Stenocarpella spp., os quais predominaram nas amostras analisadas no presente trabalho. Os trabalhos de monitoramento da ocorrência de fungos causadores de podridões de colmo são fundamentais para o desenvolvimento e a adoção das melhores estratégias de controle desta doença na cultura do milho. 650 $aDoença de planta 650 $aFungo 650 $aZea mays 700 1 $aSILVA, D. D. da 700 1 $aCOTA, L. V. 700 1 $aUMMUS, M. E.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|