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| Registros recuperados : 23 | |
| 1. |  | COSTA, L. F.; AMORIM, T. B. do; HADDAD, F.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P. Comportamento agronômico de diferentes genótipos de bananeira em área infestada com mal-do-Panamá (Fusarium oxysporum f.sp. cubense) In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro: [anais]. Cruz das Almas, BA, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 6. | | PEREIRA, M. F. L.; SAITO, J. H.; COSTA, L. F.; CRUVINEL, P. E.; MINATEL, E. R.; SILVA, J. L. Análise do desempenho de uma arquitetura paralela de processadores DSP para reconstrução de imagens temográficas com diferentes algorítmos de comunicação entre processos. In: WORKSHOP EM SISTEMAS COMPUTACIONAIS DE ALTO DESEMPENHO, 4., nov. 2003, São Paulo, SP. Anais... São Paulo: Sociedade Brasileira de Computação, 2003. p. 88-95.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 7. | | TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; TOMAZIN, T.; COSTA, L. F. M. M.; ALBUQUERQUE, A. C. S. Genótipos de trigo e sua composição em gluteninas de alto e baixo peso molecular. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 2., 2008, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Embrapa Trigo: Embrapa Transferência de Tecnologia, 2008. 1 p. 1 CD-ROM. Melhoramento, 29. Área: Melhoramento, Aptidão Industrial e Sementes.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 9. | | CARAMBULA, S. F.; GONÇALVES, P. B. D.; FIGUEIREDO, J. R.; NEVES, J. P.; COSTA, L. F. S. Estudos preliminares sobre resgate de folículos pré-antrais de ovários de fetos ovinos. Arquivos da Faculdade de Veterinária UFRGS, v. 24, supl. p. 236, 1996. Edição dos anais da 11a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Transferencia de Embrião, 1996, Cauela.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 10. | | SACRAMENTO, E. R. S.; MARTINS-COSTA, L. F. M.; WETZEL, M. M. V. S.; FERREIRA, F. R. Resgate de pseudananas sagenarius (arr. cam.) camargo e a conservação a longo prazo. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 9., 2004, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2004. p. 103.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | COUTO, C. S.; PEREIRA NETO, L. G.; WETZEL, M. M. V. S.; COSTA, L. F. M. M.; MAMÃO, J. B. Multiplicação de sementes de acessos de bucha (Luffa cylindrica (L.) Roema) conservados a longo prazo na Embrapa. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 181.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | CARVALHO JUNIOR, C. A.; XAVIER, M. N.; COSTA, L. F.; SILVEIRA, S. S.; SANT'ANNA, F. M.; BORGES, A. M.; GOUVEIA, A. M. G.; SANTOS, R. L. Agentes infecciosos que podem promover infertilidade em machos da espécie ovina. Revista Brasileira de Reprodução Animal, Belo Horizonte, v. 34, n. 3, p. 160-167, jul./set. 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 14. | | COSTA, L. F. dos S.; CUNHA, A. H. N.; FERREIRA, E. de M.; BRASIL, E. P. F.; FERREIRA, E. P. de B. Aplicação de boro em feijoeiro e aspectos microbiológicos do solo. Revista Mirante, Anápolis, v. 7, n. 2, p. 157-167, dez. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 15. | | GUEDES, M. T.; SOUZA, B. C.; SOUSA, T. J.; LOUREIRO, D.; MOURA-COSTA, L. F.; AZEVEDO, V.; MEYER, R.; PORTELA, R W. Infecção por Corynebacterium pseudotuberculosis em equinos: aspectos microbiológicos, clínicos e preventivos. Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília,DF, v.35, n.8, p.701-708, ago. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 16. | | FREITAS, L. S. de; LOPES, D. C.; FREITAS, A. F. de; CARNEIRO, J. da C.; CORASSA, A.; PENA, S. de M.; COSTA, L. F. Avaliação de ácidos orgânicos em dietas para leitões de 21 a 49 dias de idade. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 35, n. 4, p. 1711-1719, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | FONSECA, L. dos S.; COSTA, L. F. da; SOUSA JÚNIOR, J. H. T. de; ROCHA JÚNIOR, J. N.; SILVA, T. A. da; GADELHA, C. R. F. Avaliação de parâmetros etológicos da reprodução de ovinos deslanados durante estação de monta no Nordeste brasileiro. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 7.; FÓRUM DE COORDENADORES DE PÓS GRADUAÇÃO EM PRODUÇÃO ANIMAL DO NORDESTE, 1.; FÓRUM DE AGROECOLOGIA RO RIO GRANDE DO NORTE, 1., 2010, Mossoró. Anais... Mossoró: Sociedade Nordestina de Producao Animal; UFERSA, 2010. 5 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 18. | | CORREIA, B. S. B.; ARRUDA, H. F.; SPRICIGO, P. C.; CERIBELI, C.; ALMEIDA, L. S.; CARDOSO, D. R.; JACOMINO, A. P.; COSTA, L. F.; COLNAGO, L. A. Emerging studies of NMR-based metabolomics of fruits regarding botanic family species associated with postharvest quality. Journal of Food Composition and Analysis, v. 130, 106136, 2024. 13 p.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 19. | | COSTA, L. F.; NOZAKI, C. N.; LIRA, N. S. C.; ANTUNES, J. M. A. P; XAVIER, M. N; PAIXÃO, T. A.; SANTOS, R. L.; MEGID, J. Nested PCR espécie-específica para o diagnóstico da infecção por Brucella ovis em carneiros. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 1, p. 55-60, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 20. | | LIMA, E. M. B.; OLIVEIRA, R. N.; MIDDEA, A.; CASTRO, I. M. de; MATTOS, M. da C.; NEVES, T. T. M.; COSTA, L. F. DA; NEUMANN, R.; TAVARES, M. I. B. Degradation of PLA Biocomposites Containing Mango Seed and Organo Montmorillonite Minerals. Journal of Natural Fibers, 9 p.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| Registros recuperados : 23 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
25/04/2022 |
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Data da última atualização: |
25/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
LEAL, T. P.; FURLAN, V. C.; GOUVEIA, M. H.; DUARTE, J. M. S.; FONSECA, P. A. S.; TOU, R.; SCLIAR, M. de O.; ARAUJO, G. S. de; COSTA, L. F.; ZOLINI, C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. dos S.; LIMA-COSTA, M. F.; GILMAN, R. H.; TARAZONA-SANTOS, E.; RODRIGUES, M. R. |
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Afiliação: |
THIAGO PEIXOTO LEAL, Universidade Federal de Minas Gerais; VINICIUS C. FURLAN, Universidade Federal de Minas Gerais; MATEUS HENRIQUE GOUVEIA, Universidade Federal de Minas Gerais; JULIA MARIA SARAIVA DUARTE, Universidade Federal de Minas Gerais; PABLO A. S. FONSECA, Universidade Federal de Minas Gerais; RAFAEL TOU, Universidade Federal de Minas Gerais; MARILIA DE OLIVEIRA SCLIAR, Universidade de São Paulo; GILDERLANIO SANTANA DE ARAUJO, Universidade Federal do Pará; LUCAS F. COSTA, Universidade Federal de Minas Gerais; CAMILA ZOLINI, Universidade Federal de Minas Gerais; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; MARIA RAQUEL SANTOS CARVALHO, Universidade Federal de Minas Gerais; MARIA FERNANDA LIMA-COSTA, Fundação Oswaldo Cruz; ROBERT H. GILMAN, Universidad Peruana Cayetano Heredia; EDUARDO TARAZONA-SANTOS, Universidade Federal de Minas Gerais; MAÍRA RIBEIRO RODRIGUES, Universidade Federal de Minas Gerais. |
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Título: |
NAToRA, a relatedness-pruning method to minimize the loss of dataset size in genetic and omics analyses. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Computational and Structural Biotechnology Journal, v. 20, p. 1821-1828, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.04.009 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genetic and omics analyses frequently require independent observations, which is not guaranteed in real datasets. When relatedness cannot be accounted for, solutions involve removing related individuals (or observations) and, consequently, a reduction of available data. We developed a network-based relatedness-pruning method that minimizes dataset reduction while removing unwanted relationships in a dataset. It uses node degree centrality metric to identify highly connected nodes (or individuals) and implements heuristics that approximate the minimal reduction of a dataset to allow its application to complex datasets. When compared with two other popular population genetics methodologies (PLINK and KING), NAToRA shows the best combination of removing all relatives while keeping the largest possible number of individuals in all datasets tested and also, with similar effects on the allele frequency spectrum and Principal Component Analysis than PLINK and KING. NAToRA is freely available, both as a standalone tool that can be easily incorporated as part of a pipeline, and as a graphical web tool that allows visualization of the relatedness networks. NAToRA also accepts a variety of relationship metrics as input, which facilitates its use. We also release a genealogies simulator software used for different tests performed in this study. |
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Palavras-Chave: |
Complex network theory; Genealogies simulator; Genetic kinship; Genética de populações; Parentesco genético; Simulador de genealogias; Teoria de redes complexas. |
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Thesagro: |
Genética. |
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Thesaurus NAL: |
Population genetics. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02661naa a2200421 a 4500
001 2142362
005 2022-04-25
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.04.009$2DOI
100 1 $aLEAL, T. P.
245 $aNAToRA, a relatedness-pruning method to minimize the loss of dataset size in genetic and omics analyses.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aGenetic and omics analyses frequently require independent observations, which is not guaranteed in real datasets. When relatedness cannot be accounted for, solutions involve removing related individuals (or observations) and, consequently, a reduction of available data. We developed a network-based relatedness-pruning method that minimizes dataset reduction while removing unwanted relationships in a dataset. It uses node degree centrality metric to identify highly connected nodes (or individuals) and implements heuristics that approximate the minimal reduction of a dataset to allow its application to complex datasets. When compared with two other popular population genetics methodologies (PLINK and KING), NAToRA shows the best combination of removing all relatives while keeping the largest possible number of individuals in all datasets tested and also, with similar effects on the allele frequency spectrum and Principal Component Analysis than PLINK and KING. NAToRA is freely available, both as a standalone tool that can be easily incorporated as part of a pipeline, and as a graphical web tool that allows visualization of the relatedness networks. NAToRA also accepts a variety of relationship metrics as input, which facilitates its use. We also release a genealogies simulator software used for different tests performed in this study.
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700 1 $aRODRIGUES, M. R.
773 $tComputational and Structural Biotechnology Journal$gv. 20, p. 1821-1828, 2022.
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Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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