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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
Data corrente: |
29/06/2011 |
Data da última atualização: |
25/07/2011 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
GARCIA, R. A. V.; RANGEL, P. N.; BRONDANI, C.; MARTINS, W. S.; MELO, L. C.; CARNEIRO, M. S.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, R. P. V. |
Afiliação: |
ROBERTHA A. V. GARCIA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; PRISCILA NASCIMENTO RANGEL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; WELLINGTON S. MARTINS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; LEONARDO CUNHA MELO, CNPAF; MONALISA S. CARNEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO BRONDANI, CNPAF. |
Título: |
The characterization of a new set of EST-derived simple sequence repeat (SSR) markers as a resource for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, v. 12, n. 41, 2011. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Background: Over recent years, a growing effort has been made to develop microsatellite markers for the genomic analysis of the common bean (Phaseolus vulgaris) to broaden the knowledge of the molecular genetic basis of this species. The availability of large sets of expressed sequence tags (ESTs) in public databases has given rise to an expedient approach for the identification of SSRs (Simple Sequence Repeats), specifically EST-derived SSRs. In the present work, a battery of new microsatellite markers was obtained from a search of the Phaseolus vulgaris EST database. The diversity, degree of transferability and polymorphism of these markers were tested. Results: From 9,583 valid ESTs, 4,764 had microsatellite motifs, from which 377 were used to design primers, and 302 (80.11%) showed good amplification quality. To analyze transferability, a group of 167 SSRs were tested, and the results showed that they were 82% transferable across at least one species. The highest amplification rates were observed between the species from the Phaseolus (63.7%), Vigna (25.9%), Glycine (19.8%), Medicago (10.2%), Dipterix (6%) and Arachis (1.8%) genera. The average PIC (Polymorphism Information Content) varied from 0.53 for genomic SSRs to 0.47 for EST-SSRs, and the average number of alleles per locus was 4 and 3, respectively. Among the 315 newly tested SSRs in the BJ (BAT93 X Jalo EEP558) population, 24% (76) were polymorphic. The integration of these segregant loci into a framework map composed of 123 previously obtained SSR markers yielded a total of 199 segregant loci, of which 182 (91.5%) were mapped to 14 linkage groups, resulting in a map length of 1,157 cM. Conclusions: A total of 302 newly developed EST-SSR markers, showing good amplification quality, are available for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris. These markers showed satisfactory rates of transferability, especially between species that have great economic and genomic values. Their diversity was comparable to genomic SSRs, and they were incorporated in the common bean reference genetic map, which constitutes an important contribution to and advance in Phaseolus vulgaris genomic research. MenosBackground: Over recent years, a growing effort has been made to develop microsatellite markers for the genomic analysis of the common bean (Phaseolus vulgaris) to broaden the knowledge of the molecular genetic basis of this species. The availability of large sets of expressed sequence tags (ESTs) in public databases has given rise to an expedient approach for the identification of SSRs (Simple Sequence Repeats), specifically EST-derived SSRs. In the present work, a battery of new microsatellite markers was obtained from a search of the Phaseolus vulgaris EST database. The diversity, degree of transferability and polymorphism of these markers were tested. Results: From 9,583 valid ESTs, 4,764 had microsatellite motifs, from which 377 were used to design primers, and 302 (80.11%) showed good amplification quality. To analyze transferability, a group of 167 SSRs were tested, and the results showed that they were 82% transferable across at least one species. The highest amplification rates were observed between the species from the Phaseolus (63.7%), Vigna (25.9%), Glycine (19.8%), Medicago (10.2%), Dipterix (6%) and Arachis (1.8%) genera. The average PIC (Polymorphism Information Content) varied from 0.53 for genomic SSRs to 0.47 for EST-SSRs, and the average number of alleles per locus was 4 and 3, respectively. Among the 315 newly tested SSRs in the BJ (BAT93 X Jalo EEP558) population, 24% (76) were polymorphic. The integration of these segregant loci into a framework map co... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Análise genética; Microssatélite. |
Thesagro: |
Feijão; Genética; Marcador molecular; Phaseolus vulgaris. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/36872/1/bmc.pdf
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Marc: |
LEADER 03018naa a2200277 a 4500 001 1894904 005 2011-07-25 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aGARCIA, R. A. V. 245 $aThe characterization of a new set of EST-derived simple sequence repeat (SSR) markers as a resource for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris.$h[electronic resource] 260 $c2011 520 $aBackground: Over recent years, a growing effort has been made to develop microsatellite markers for the genomic analysis of the common bean (Phaseolus vulgaris) to broaden the knowledge of the molecular genetic basis of this species. The availability of large sets of expressed sequence tags (ESTs) in public databases has given rise to an expedient approach for the identification of SSRs (Simple Sequence Repeats), specifically EST-derived SSRs. In the present work, a battery of new microsatellite markers was obtained from a search of the Phaseolus vulgaris EST database. The diversity, degree of transferability and polymorphism of these markers were tested. Results: From 9,583 valid ESTs, 4,764 had microsatellite motifs, from which 377 were used to design primers, and 302 (80.11%) showed good amplification quality. To analyze transferability, a group of 167 SSRs were tested, and the results showed that they were 82% transferable across at least one species. The highest amplification rates were observed between the species from the Phaseolus (63.7%), Vigna (25.9%), Glycine (19.8%), Medicago (10.2%), Dipterix (6%) and Arachis (1.8%) genera. The average PIC (Polymorphism Information Content) varied from 0.53 for genomic SSRs to 0.47 for EST-SSRs, and the average number of alleles per locus was 4 and 3, respectively. Among the 315 newly tested SSRs in the BJ (BAT93 X Jalo EEP558) population, 24% (76) were polymorphic. The integration of these segregant loci into a framework map composed of 123 previously obtained SSR markers yielded a total of 199 segregant loci, of which 182 (91.5%) were mapped to 14 linkage groups, resulting in a map length of 1,157 cM. Conclusions: A total of 302 newly developed EST-SSR markers, showing good amplification quality, are available for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris. These markers showed satisfactory rates of transferability, especially between species that have great economic and genomic values. Their diversity was comparable to genomic SSRs, and they were incorporated in the common bean reference genetic map, which constitutes an important contribution to and advance in Phaseolus vulgaris genomic research. 650 $aFeijão 650 $aGenética 650 $aMarcador molecular 650 $aPhaseolus vulgaris 653 $aAnálise genética 653 $aMicrossatélite 700 1 $aRANGEL, P. N. 700 1 $aBRONDANI, C. 700 1 $aMARTINS, W. S. 700 1 $aMELO, L. C. 700 1 $aCARNEIRO, M. S. 700 1 $aBORBA, T. C. O. 700 1 $aBRONDANI, R. P. V. 773 $tBMC Genetics$gv. 12, n. 41, 2011.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
15/01/2018 |
Data da última atualização: |
15/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
MAGRIN, F. P.; MACEDO, C. K. B. de; MAUTA, D. de S.; COSER, G. M. de A. G.; AMARANTE, C. V. T. do; GOULARTE, N. A. de A.; HAWERROTH, F. J. |
Afiliação: |
Fernanda Pelizzari Magrin; Charle Kramer Borges de Macedo; Danyelle de Sousa Mauta; Giovanni Marcello de Angeli Gilli Coser; Cassandro Vidal Talamini do Amarante; Natália Aparecida de Almeida Goularte; FERNANDO JOSE HAWERROTH, CNPUV. |
Título: |
Múltiplas aplicações de proexadiona cálcica em macieiras e seus efeitos na redução do crescimento vegetativo e na qualidade dos frutos. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA-CONGREGA URCAMP, 14., 2017, Bagé. Revista da 14ª Jornada de Pós-Graduação e Pesquisa-Congrega Urcamp. Bagé: Congrega URCAMP, 2017. v.1. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
RESUMO O adequado equilíbrio entre o desenvolvimento vegetativo e o reprodutivo em macieiras pode ser alcançado com a utilização de reguladores de crescimento, como a proexadiona cálcica (PCa). Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de diferentes concentrações de PCa e múltiplas aplicações em macieiras ?Maxi Gala? e ?Fuji Kiku? e seus efeitos na redução do crescimento vegetativo e na qualidade dos frutos nas condições de Vacaria, Rio Grande do Sul. O experimento foi realizado em pomar comercial de macieiras durante a safra 2015/2016. Foram utilizadas as cultivares Maxi Gala e Fuji Kiku, enxertadas sob Marubakaido com interenxerto de M9 e cultivadas a pleno sol. Foram utilizadas diferentes concentrações de PCa (330, 165 e 275 mg L-1) e uma testemunha (sem aplicação) em múltiplas aplicações (no dia 19/10/2015 e aos 21, 32 e 58 dias após a aplicação - DAPA) no período de crescimento vegetativo das plantas. Na ?Maxi Gala?, a segunda avaliação do comprimento dos ramos e a maior taxa de crescimento dos ramos foi verificada no tratamento testemunha. Já na cultivar Fuji Kiku essas variáveis não foram afetadas pela aplicação de diferentes concentrações e múltiplas aplicações de PCa. Os índices produtivos não foram alterados pelo uso de PCa nas cultivares Maxi Gala e Fuji Kiku. Na ?Maxi Gala? a aplicação de PCa reduziu o crescimento vegetativo, independentemente da concentração ou das múltiplas aplicações de PCa, entretanto a ?Fuji Kiku? não foi afetada pela utilização do fitorregulador. Palavras-chave: Malus domestica, regulador de crescimento, biossíntese de giberelinas. MenosRESUMO O adequado equilíbrio entre o desenvolvimento vegetativo e o reprodutivo em macieiras pode ser alcançado com a utilização de reguladores de crescimento, como a proexadiona cálcica (PCa). Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de diferentes concentrações de PCa e múltiplas aplicações em macieiras ?Maxi Gala? e ?Fuji Kiku? e seus efeitos na redução do crescimento vegetativo e na qualidade dos frutos nas condições de Vacaria, Rio Grande do Sul. O experimento foi realizado em pomar comercial de macieiras durante a safra 2015/2016. Foram utilizadas as cultivares Maxi Gala e Fuji Kiku, enxertadas sob Marubakaido com interenxerto de M9 e cultivadas a pleno sol. Foram utilizadas diferentes concentrações de PCa (330, 165 e 275 mg L-1) e uma testemunha (sem aplicação) em múltiplas aplicações (no dia 19/10/2015 e aos 21, 32 e 58 dias após a aplicação - DAPA) no período de crescimento vegetativo das plantas. Na ?Maxi Gala?, a segunda avaliação do comprimento dos ramos e a maior taxa de crescimento dos ramos foi verificada no tratamento testemunha. Já na cultivar Fuji Kiku essas variáveis não foram afetadas pela aplicação de diferentes concentrações e múltiplas aplicações de PCa. Os índices produtivos não foram alterados pelo uso de PCa nas cultivares Maxi Gala e Fuji Kiku. Na ?Maxi Gala? a aplicação de PCa reduziu o crescimento vegetativo, independentemente da concentração ou das múltiplas aplicações de PCa, entretanto a ?Fuji Kiku? não foi afetada pela utili... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
BIossíntese de giberelinas; Maçã Fuji Kiku; Maçã Maxi Gala; Macieira. |
Thesagro: |
Maçã; Malus doméstica; Regulador de Crescimento. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/171086/1/2219-6592-1-PB.pdf
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Marc: |
LEADER 02664nam a2200265 a 4500 001 2085431 005 2018-01-15 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMAGRIN, F. P. 245 $aMúltiplas aplicações de proexadiona cálcica em macieiras e seus efeitos na redução do crescimento vegetativo e na qualidade dos frutos.$h[electronic resource] 260 $aIn: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA-CONGREGA URCAMP, 14., 2017, Bagé. Revista da 14ª Jornada de Pós-Graduação e Pesquisa-Congrega Urcamp. Bagé: Congrega URCAMP, 2017. v.1.$c2017 520 $aRESUMO O adequado equilíbrio entre o desenvolvimento vegetativo e o reprodutivo em macieiras pode ser alcançado com a utilização de reguladores de crescimento, como a proexadiona cálcica (PCa). Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de diferentes concentrações de PCa e múltiplas aplicações em macieiras ?Maxi Gala? e ?Fuji Kiku? e seus efeitos na redução do crescimento vegetativo e na qualidade dos frutos nas condições de Vacaria, Rio Grande do Sul. O experimento foi realizado em pomar comercial de macieiras durante a safra 2015/2016. Foram utilizadas as cultivares Maxi Gala e Fuji Kiku, enxertadas sob Marubakaido com interenxerto de M9 e cultivadas a pleno sol. Foram utilizadas diferentes concentrações de PCa (330, 165 e 275 mg L-1) e uma testemunha (sem aplicação) em múltiplas aplicações (no dia 19/10/2015 e aos 21, 32 e 58 dias após a aplicação - DAPA) no período de crescimento vegetativo das plantas. Na ?Maxi Gala?, a segunda avaliação do comprimento dos ramos e a maior taxa de crescimento dos ramos foi verificada no tratamento testemunha. Já na cultivar Fuji Kiku essas variáveis não foram afetadas pela aplicação de diferentes concentrações e múltiplas aplicações de PCa. Os índices produtivos não foram alterados pelo uso de PCa nas cultivares Maxi Gala e Fuji Kiku. Na ?Maxi Gala? a aplicação de PCa reduziu o crescimento vegetativo, independentemente da concentração ou das múltiplas aplicações de PCa, entretanto a ?Fuji Kiku? não foi afetada pela utilização do fitorregulador. Palavras-chave: Malus domestica, regulador de crescimento, biossíntese de giberelinas. 650 $aMaçã 650 $aMalus doméstica 650 $aRegulador de Crescimento 653 $aBIossíntese de giberelinas 653 $aMaçã Fuji Kiku 653 $aMaçã Maxi Gala 653 $aMacieira 700 1 $aMACEDO, C. K. B. de 700 1 $aMAUTA, D. de S. 700 1 $aCOSER, G. M. de A. G. 700 1 $aAMARANTE, C. V. T. do 700 1 $aGOULARTE, N. A. de A. 700 1 $aHAWERROTH, F. J.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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