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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
06/05/2019 |
Data da última atualização: |
06/05/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SANT'ANA, G. C.; PEREIRA, L. F. P.; POT, D.; IVAMOTO, S. T.; DOMINGUES, D. S.; FERREIRA, R. V.; PAGIATTO, N. F.; SILVA, B. S. R. da; NOGUEIRA, L. M.; KITZBERGER, C. S. G.; SCHOLZ, M. B. S.; OLIVEIRA, F. F. de; SERA, G. H.; PADILHA, L.; LABOUISSE, J-P.; GUYOT, R.; CHARMETANT, P.; LEROY, T. |
Afiliação: |
Gustavo C. Sant'Ana, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; David Pot, CIRAD, UMR AGAP; Suzana T. Ivamoto, Universidade Estadual Paulista/Instituto de Biociências; Douglas S. Domingues, Universidade Estadual Paulista/Instituto de Biociências; Rafaelle V. Ferreira, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Natalia F. Pagiatto, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Bruna S. R. da Silva, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Lívia M. Nogueira, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Cintia S. G. Kitzberger, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Maria B. S. Scholz, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Fernanda F. de Oliveira, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Gustavo H. Sera, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; LILIAN PADILHA, CNPCa; Jean-Pierre Labouisse, AGAP, University Montpellier, CIRAD, INRA, Montpellier SupAgro; Romain Guyot, IRD, CIRAD, Universit Montpellier; Pierre Charmetant, AGAP, University Montpellier, CIRAD, INRA, Montpellier SupAgro; Thierry Leroy, AGAP, University Montpellier, CIRAD, INRA, Montpellier SupAgro. |
Título: |
Genome-wide association study reveals candidate genes influencing lipids and diterpenes contents in Coffea arabica L . |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, n. 465, p. 1-12, 2018 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Lipids, including the diterpenes cafestol and kahweol, are key compounds that contribute to the quality of coffee beverages. We determined total lipid content and cafestol and kahweol concentrations in green beans and genotyped 107 Coffea arabica accessions, including wild genotypes from the historical FAO collection from Ethiopia. A genome-wide association study was performed to identify genomic regions associated with lipid, cafestol and kahweol contents and cafestol/kahweol ratio. Using the diploid Coffea canephora genome as a reference, we identified 6,696 SNPs. Population structure analyses suggested the presence of two to three groups (K = 2 and K = 3) corresponding to the east and west sides of the Great Rift Valley and an additional group formed by wild accessions collected in western forests. We identified 5 SNPs associated with lipid content, 4 with cafestol, 3 with kahweol and 9 with cafestol/kahweol ratio. Most of these SNPs are located inside or near candidate genes related to metabolic pathways of these chemical compounds in coffee beans. In addition, three trait-associated SNPs showed evidence of directional selection among cultivated and wild coffee accessions. Our results also confirm a great allelic richness in wild accessions from Ethiopia, especially in accessions originating from forests in the west side of the Great Rift Valley. |
Palavras-Chave: |
Quality of coffee beverages. |
Thesaurus Nal: |
Genome; Genomics; Green beans; Lipids. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/196973/1/Genome-wide-association-study-reveals.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Registros recuperados : 12 | |
1. | | MONTEIRO NETTO, M.; BALARO, M. F. A.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; COSENTINO, I. O.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Indução e sincronização do estro por programa de luz e d-cloprostenol em cabras leiteiras na contra-estação reprodutiva. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 43, n. 2, p. 539, abr./jun. 2019. Edição dos resumos do XXIII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal, Gramado, RS, Brasil, 15 a 17 de maio 2019.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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2. | | TREVIZAN, J. T.; PEDROSA, A. C.; BRAIR, V. L.; PRATES, J. F.; BARRETO, C. K.; COSENTINO, I. O.; FONSECA, J. F. da; OLIVEIRA, M. E. F. Gonadotrofinas alternativas para indução do estro sincronizado em cabras: resultados preliminares. Revista Brasileira de Reprodução Animal, Belo Horizonte, v. 41, n. 1, p. 495, jan./mar. 2017. Edição dos anais do XXII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal (CBRA), Santos, SP, Brasil, maio 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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3. | | MONTEIRO NETTO, M.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; COSENTINO, I. O.; BALARO, M. F. A.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Dinâmica ovariana folicular e luteal em cabras leiteiras induzidas e sincronizadas por programa de luz e d-cloprostenol na contra-estação reprodutiva. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 43, n. 2, p. 552, abr./jun. 2019. Edição dos resumos do XXIII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal, Gramado, RS, Brasil, 15 a 17 de maio 2019.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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4. | | COSENTINO, I. O.; BALARO, M. F. A.; LEAL, F. S. C.; BADE, A. L. C.; CÔRTES, L. R.; ARASHIRO, E. K. N.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Color Doppler ultrasonography for early pregnancy diagnosis in goats. Animal Reproduction, v. 15, p. 1112. 2018. Suplemento 1. Abstract 098. Edição dos Proceedings of the 10th International Ruminant Reproduction Symposium (IRRS), Foz do Iguaçu, PR, Brazil, September 16th to 20th, 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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5. | | TAIRA, A. R.; BRANDÃO, F. Z.; BRAIR, V. L.; COSENTINO, I. O.; LEAL, F. S. C.; RIBEIRO, A. C. S.; BALARO, M. F. A.; BATISTA, I. I. T. P.; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; FONSECA, J. F. da; UNGERFELD, R. Biostimulation with the ram effect increases the follicle recruitment, ovulatory diameter, and embryo viability rate in superovulated ewes. Theriogenology, v. 181, p. 140-146, Mar. 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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6. | | SANTOS, J. D. R.; UNGERFELD, R.; BALARO, M. F. A.; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; COSENTINO, I. O.; BRAIR, V. L.; SOUZA, C. V. de; PINTO, P. H. N.; BADE, A. L. C.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Transcervical vs. laparotomy embryo collection in ewes: The effectiveness and welfare implications of each technique. Theriogenology, v. 153, p. 112-121, Sept. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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7. | | PINTO, P. H. N.; BALARO, M. F. A.; SARAIVA, H. F. R. de A.; BRAIR, V. L.; ALFRADIQUE, V. A. P.; CÔRTESA, L. R.; COSENTINO, I. O.; SOUZA-FABJANA, J. M. G.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Successive in vivo embryo production in Santa Inês sheep. Animal Production Science, v. 60, n. 4, p. 497-502, Dec. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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8. | | SARAIVA, H. F. R. A.; PINTO, P. H. N.; BRAGANÇA, G. M.; SANTOS, G. B.; RIBEIRO, L. S.; BATISTA, R. I. T. P.; COSENTINO, I. O.; FABJAN, J. M. G. S.; FONSECA, J. F. da; BRANDAO, F. Z. Follicular population on the estimation of the superovulatory response in Santa Ines sheep. Animal Reproduction, v. 13, n. 3, p. 532, Jul./Sept. 2016. Proceedings of the 30th Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE); Foz do Iguaçu, PR, Brazil, August 25th to 27th, 2016, and 32nd Meeting of the European Embryo Transfer Association (AETE); Barcelona, Spain,...Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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9. | | TAIRA, A. R.; SANTOS, J. D. R.; COSENTINO, I. O.; BRAIR, V. L.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; PINTO, P. H. N.; SOUZA-FABJAN, J. M. G. de; FONSECA, J. F. da; UNGERFELD, R.; BRANDÃO, J. Z. The use of exogenous progesterone in sheep superovulation protocols influences the percentage of viable embryos. Animal Reproduction, v. 17, n. 3, 2020. Edição dos Abstracts of the 34nd Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE), 2020 (online).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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10. | | MONTEIRO NETTO, M.; BALARO, M. F. A.; COSENTINO, I. O.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; OLIVEIRA, R. V. de; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Use of two cloprostenol administrations 11.5 days apart efficiently synchronizes oestrus in photostimulated multiparous dairy goats in the non-breeding season. Reproduction in Domestic Animals, v. 55, n. 8, p. 965-973, Aug. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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11. | | BRAGANÇA, G. M.; BATISTA, R. I. T. P.; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; ALFRADIQUE, V. A. P.; ARASHIRO, E. K. N.; COSENTINO, I. O.; PINTO, P. H. N.; CAMARGO, L. S. de A.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Dose and administration protocol for FSH used for ovarian stimulation affect gene expression in sheep cumulus-oocyte complexes. Reproduction, Fertility and Development, v. 30, n. 9, p. 1234-1244, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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12. | | SANTOS, J. D. R.; BATISTA, R. I. T. P.; UNGERFELD, R.; TAIRA, A. R.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; FERNANDES, D. A. de M.; BALARO, M. F. A.; COSENTINO, I. O.; BRAIR, V. L.; PINTO, P. H. N.; CARVALHO, A. B. da S.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Hormonal protocol used for cervical dilation in ewes does not affect morphological embryo quality but reduces recovery rate and temporarily alters gene expression. Veterinary Record, e1064, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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