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| Registros recuperados : 64 | |
| 41. |  | SOUZA, I. P. de; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, A. S. G.; BRONDANI, C.; SOUZA, T. L. P. O. de; VIANELLO, R. P. Haplótipos associados a genes de resistência a antracnose e a mancha angular no feijão-comum. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 13., 2021, Goiânia. Conectividade tecnológica, intensificação sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 150. Evento online.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 42. | | ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B.; CHAVES. L. J.; COELHO, A. S. G.; COUTO, M. A.; MORAIS, L. K. de; VENCOVSKY, R. Genetic structure and gene flow of Eugenia dysenterica natural populations. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 10, p. 975-980, out. 2005 Título em português: : Estrutura genética e fluxo gênico em populações naturais de cagaita.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 43. | | GARCIA, M. C. C.; REGITANO, L. C. de A.; ETCHEGARAY, M. A. L.; COELHO, A. S. G.; BORTOLOZZI, J.; COUTINHO, L. L. Genetic diversity study of seven bovin breeds by the use of SSR markers. In: GLOBAL CONFERENCE ON CONSERVATION OF DOMESTIC ANIMAL GENETIC RESOURCES, 15., 2000, Brasilia, DF. Conservation and biotecnology: a balaced appoach for the new millennium. Proceedings... Brasilia: Embrapa Genetic Resourches Genetic and Biotecnology, 2000. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 44. | | MORAIS JÚNIOR, O. P.; BRESEGHELLO, F.; DUARTE, J. B.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; AGUIAR, J. T.; NEVES, P. C. F.; MORAIS, O. P. Assessing prediction models for different traits in a rice population derived from a Recurrent Selection Program. Crop Science, v. 58, n. 6, p. 2347-2359, Nov./Dec. 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 45. | | GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; MAMANI, E. M.; MISSIAGGIA, A. A.; PAPPAS, M. C. R.; BRONDANI, R. P. V.; PÁDUA, J. G.; COELHO, A. S. G. Wood quality QTLs: detection and validation across multiple pedigrees of eucalyptus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1051.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 46. | | PIGOSSO, L. L.; PARENTE, A. F. A.; COELHO, A. S. G.; SILVA, L. P. da; BORGES, C. L.; BAILÃO, A. M.; SOARES, C. M. de A. Comparative proteomics in the genus Paracoccidioides. Fungal Genetics and Biology, v. 60, p. 87-100, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 47. | | OLIVEIRA, R. de S.; RIBEIRO, C. V. G.; NERES, D. F.; PORTO, A. C. da M.; RIBEIRO, D.; SIQUEIRA, L. de; ZAUZA, E. A. V.; COELHO, A. S. G.; REIS, C. A. F.; ALFENAS, A. C.; NOVAES, E. Evaluation of genetic parameters and clonal selection of Eucalyptus in the Cerrado region. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 20, n. 3, e29982031, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 48. | | PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BUENO, L. G.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; CORDEIRO, A. C. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIEIRA, A. F.; BRONDANI, C. Development of SNP markers for grain yield screening of Brazilian rice cultivars. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01643, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Roraima; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 49. | | BASTOLLA, F. M.; PAZZINI, F.; CARAZZOLLE, M. F.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; GRATTAPAGLIA, D.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PEREIRA, G. A. G.; PASQUALI, G.; CASCARDO, J. C. M. Differential expression of xylem specific genes involved in cellulose quality for two contrasting Eucalyptus species. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 627.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 50. | | LOPES, F. A. C.; STEINDORFF, A. S.; GERALDINE, A. M.; BRANDÃO, R. S.; MONTEIRO, V. N.; LOBO JUNIOR, M.; COELHO, A. S. G.; ULHOA, C. J.; SILVA, R. N. Biochemical and metabolic profiles of Trichoderma strains isolated from common bean crops in the Brazilian Cerrado, and potential antagonism against Sclerotinia sclerotiorum. Fungal Biology, Oxford, v. 116, p. 815-824, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 51. | | BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C. Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 47, n. 2, p. 216-226, fev. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Rondônia; Embrapa Roraima; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 52. | | PASQUALI, G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; BASTOLLA, F. M.; VOM ENDT, D.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PEREIRA, G. A. G.; CASCARDO, J. C. M.; GRATTAPAGLIA, D. Microarray analysis of eucalyptus gene expression. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 35., 2006, Águas de Lindóia, SP. Programas e resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 53. | | GOMES-MESSIAS, L. M.; VIANELLO, R. P.; MARINHO, G. R.; RODRIGUES, L. A.; COELHO, A. S. G.; PEREIRA, H. S.; MELO, L. C.; SOUZA, T. L. P. O. de. Genetic mapping of the Andean anthracnose resistance gene present in the common bean cultivar BRSMG Realce. Frontiers in Plant Science, v, 13, 1033687, Nov. 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 54. | | LOUZADA, G. A. S.; BANDEIRA, L. F.; BRONDANI, R. P. V.; TRIGUEIRO, E. L.; MIRANDA, D. D.; PAULA, D. P. COELHO, A. S. G.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PEREIRA, G. A. G.; GRATTAPAGLIA, D. Caracterização genômica de Eucalyptus através do seqüenciamento de pontas de BACs. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 597.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 55. | | REVERS, L. F.; IRALA, P. B.; SERAFIM, D. C. da S.; COELHO, A. S. G.; MACHADO, C. A. E.; LAMPE, V. S.; OLIVEIRA, P. R. D. de; GARRIDO, L. da R. Construção de um mapa genético de referência para o desenvolvimento de ferramentas moleculares aplicadas ao melhoramento da videira. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 11.; SEMINÁRIO FRANCO-BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 2., 2005, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2005. p. 300.| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 56. | | SOUZA, I. P. de; AZEVEDO, B. R. de; COELHO, A. S. G.; SOUZA, T. L. P. O. de; VALDISSER, P. A. M. R.; GOMES-MESSIAS, L. M.; FUNICHELI, B. W.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Whole-genome resequencing of common bean elite breeding lines. Scientific Reports, v. 13, 12721, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 57. | | PASQUALI, G.; BASTOLLA, F. M.; KIRCH, R. P.; PIZZOLI, G.; ROESLER, G. A.; PAZZINI, F.; CARAZZOLLE, M. F.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEREIRA, G. A. G.; CASCARDO, J. C. M.; GRATTAPAGLIA, D. Expressão gênica em Eucalyptus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 508.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 58. | | BASTOLLA, F. M.; VOM ENDT, D.; JAHNS, M.; PIZZOLI, G.; PAZZINI, F.; KIRCH, R. P.; CARAZZOLE, M. F.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PEREIRA, G. A. G.; GRATTAPAGLIA, D.; CASCARDO, J. C. M.; PASQUALI, G. Differential gene expression in two Eucalyptus species. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1123.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 59. | | VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; ALMEIDA FILHO, J. E.; MÜLLER, B. S. F.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; LANNA, A. C.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; MORAES, A. da C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. In-depth genome characterization of a Brazilian common bean core collection using DArTseq high-density SNP genotyping. BMC Genomics, v. 18, Article 423, 30 mai. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 60. | | PEREIRA, W. J.; ABREU, F. R. M.; MELO, A. T. de O.; COELHO, A. S. G.; RODRIGUES, F. A.; MAMIDI, S.; ALENCAR, S. A. de; LANNA, A. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; NASCIMENTO JUNIOR, I. R. do; BORBA, T. C. de O.; VIANELLO, R. P. Transcriptoma para seca revela novos genes para o germoplasma do feijão comum mesoamericano. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 32. CONAFE| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| Registros recuperados : 64 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Roraima; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
04/09/2006 |
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Data da última atualização: |
07/08/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BUENO, L. G.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; CORDEIRO, A. C. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIEIRA, A. F.; BRONDANI, C. |
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Afiliação: |
GABRIEL FERESIN PANTALIAO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; LUICE GOMES BUENO GALVANI, CNPC; JOAO ANTONIO MENDONCA, CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UFG; ANTONIO CARLOS CENTENO CORDEIRO, CPAF-RR; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; ARIADNA FARIA VIEIRA; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF. |
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Título: |
Development of SNP markers for grain yield screening of Brazilian rice cultivars. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01643, 2020. |
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ISSN: |
1678-3921 |
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DOI: |
https://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2020.v55.01643 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstrct - The objective of this work was to identify and validate single nucleotide polymorphism (SNP) markers related to grain yield in rice (Oryza sativa) core collection. The genome-wide association studies (GWAS) methodology was applied for genotyping of 541 rice accessions by 167,470 SNPs. The grain yield of these accessions was estimated through the joint analysis of nine field experiments carried out in six Brazilian states. Fifteen SNPs were significantly associated with grain yield, and out of the ten SNPs converted to TaqMan assays, four discriminated the most productive accessions. These markers were used for the screening of rice accessions with favorable alleles. The selected accessions were, then, evaluated in field experiments in target environments, in order to select the most productive ones. This screening reduces the number of accessions evaluated experimentally, making it possible to prioritize those with higher productive potential, which allows of the increase of the number of replicates and, consequently, of the experimental accuracy.
Resumo - O objetivo deste trabalho foi identificar e validar marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) relacionados à produtividade de grãos em coleção nuclear de arroz (Oryza sativa). A metodologia de estudos de associação genômica ampla (GWAS) foi aplicada à genotipagem de 541 genótipos por 167.470 SNPs. A produtividade de grãos desses acessos foi estimada por meio da análise conjunta de nove experimentos de campo, realizados em seis estados brasileiros. Quinze SNPs foram significativamente associados à produtividade de grãos e, dos dez SNPs que foram convertidos em ensaios TaqMan, quatro discriminaram os acessos com maior produtividade. Esses marcadores foram utilizados para identificar acessos de arroz com os alelos favoráveis. Em seguida, os acessos selecionados foram avaliados em experimentos de campo, em ambientes-alvo, para identificar os mais produtivos. Essa triagem reduz o número de acessos avaliados experimentalmente, pois torna possível priorizar aqueles com maior potencial produtivo, o que permite aumentar o número de repetições e, consequentemente, a precisão experimental MenosAbstrct - The objective of this work was to identify and validate single nucleotide polymorphism (SNP) markers related to grain yield in rice (Oryza sativa) core collection. The genome-wide association studies (GWAS) methodology was applied for genotyping of 541 rice accessions by 167,470 SNPs. The grain yield of these accessions was estimated through the joint analysis of nine field experiments carried out in six Brazilian states. Fifteen SNPs were significantly associated with grain yield, and out of the ten SNPs converted to TaqMan assays, four discriminated the most productive accessions. These markers were used for the screening of rice accessions with favorable alleles. The selected accessions were, then, evaluated in field experiments in target environments, in order to select the most productive ones. This screening reduces the number of accessions evaluated experimentally, making it possible to prioritize those with higher productive potential, which allows of the increase of the number of replicates and, consequently, of the experimental accuracy.
Resumo - O objetivo deste trabalho foi identificar e validar marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) relacionados à produtividade de grãos em coleção nuclear de arroz (Oryza sativa). A metodologia de estudos de associação genômica ampla (GWAS) foi aplicada à genotipagem de 541 genótipos por 167.470 SNPs. A produtividade de grãos desses acessos foi estimad... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
GWAS; Seleção assistida por marcadores. |
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Thesagro: |
Arroz; Marcador Molecular; Oryza Sativa; Produtividade; Seleção Genética. |
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Thesaurus NAL: |
Genome-wide association study; Marker-assisted selection; Rice; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/214500/1/Development-snp-markers.pdf
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Marc: |
LEADER 03457naa a2200373 a 4500
001 1214326
005 2020-08-07
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1678-3921
024 7 $ahttps://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2020.v55.01643$2DOI
100 1 $aPANTALIÃO, G. F.
245 $aDevelopment of SNP markers for grain yield screening of Brazilian rice cultivars.$h[electronic resource]
260 $c2020
520 $aAbstrct - The objective of this work was to identify and validate single nucleotide polymorphism (SNP) markers related to grain yield in rice (Oryza sativa) core collection. The genome-wide association studies (GWAS) methodology was applied for genotyping of 541 rice accessions by 167,470 SNPs. The grain yield of these accessions was estimated through the joint analysis of nine field experiments carried out in six Brazilian states. Fifteen SNPs were significantly associated with grain yield, and out of the ten SNPs converted to TaqMan assays, four discriminated the most productive accessions. These markers were used for the screening of rice accessions with favorable alleles. The selected accessions were, then, evaluated in field experiments in target environments, in order to select the most productive ones. This screening reduces the number of accessions evaluated experimentally, making it possible to prioritize those with higher productive potential, which allows of the increase of the number of replicates and, consequently, of the experimental accuracy. Resumo - O objetivo deste trabalho foi identificar e validar marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) relacionados à produtividade de grãos em coleção nuclear de arroz (Oryza sativa). A metodologia de estudos de associação genômica ampla (GWAS) foi aplicada à genotipagem de 541 genótipos por 167.470 SNPs. A produtividade de grãos desses acessos foi estimada por meio da análise conjunta de nove experimentos de campo, realizados em seis estados brasileiros. Quinze SNPs foram significativamente associados à produtividade de grãos e, dos dez SNPs que foram convertidos em ensaios TaqMan, quatro discriminaram os acessos com maior produtividade. Esses marcadores foram utilizados para identificar acessos de arroz com os alelos favoráveis. Em seguida, os acessos selecionados foram avaliados em experimentos de campo, em ambientes-alvo, para identificar os mais produtivos. Essa triagem reduz o número de acessos avaliados experimentalmente, pois torna possível priorizar aqueles com maior potencial produtivo, o que permite aumentar o número de repetições e, consequentemente, a precisão experimental
650 $aGenome-wide association study
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650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aArroz
650 $aMarcador Molecular
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650 $aProdutividade
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700 1 $aVIANELLO, R. P.
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700 1 $aMENDONÇA, J. A.
700 1 $aCOELHO, A. S. G.
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700 1 $aBRONDANI, C.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira$gv. 55, e01643, 2020.
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Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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