| |
|
|
| Registros recuperados : 77 | |
| 41. |  | PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOARES, T. N.; TELLES, M. P. de C.; COELHO, A. S. G.; CHAVES, L. J. A draft genome assembly of the baru tree (Dipteryx alata vogel) as a resource for domestication, breding ans conservation. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023. Resumo 667217. Na publicação: Marco Pessoa Filho.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
|    |
| 42. | | BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, R. P. V.; BRESEGHELLO, F.; COELHO, A. S. G.; MENDONÇA, J. A.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C. Association mapping for yield and grain quality traits in rice (Oryza sativa L.). Genetics and Molecular Biology, v. 33, n. 3, p. 515-524, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 43. | | MENDES, L. de M. O.; FILIPPI, M. C. C. de; SILVA-LOBO, V. L.; COELHO, A. S. G.; HOFFMANN, L. V.; ARAÚJO, L. G. de; PRABHU, A. S. Análise genômica de isolados brasileiros de Magnaporthe oryzae de arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 16., 2022, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2022. p. 86.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 44. | | MENDES, L. de M. O.; FILIPPI, M. C. C. de; SILVA-LOBO, V. L.; COELHO, A. S. G.; HOFFMANN, L. V.; ARAÚJO, L. G. de; PRABHU, A. S. Análise genômica de isolados brasileiros de Magnaporthe oryzae de arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 16., 2022, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2022. p. 86.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 45. | | MELO, A. T. O.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. de O.; MAGNABOSCO, C. de U. Caracterização molecular de genótipos de dendê (Elaeis guineensis Jacq.) através marcadores microssatélites fluorescentes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 211.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 46. | | MELO, A. T. O.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. de O.; MAGNABOSCO, C. de U. Caracterização molecular de genótipos de dendê (Elaeis guineensis jacq.) através de marcadores microssatélites fluorescentes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 47. | | AZEVEDO, B. R. de; SOUZA, I. P. de; COELHO, A. S.; SOUZA, T. L. P. O. de; BRONDANI, C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P. Caracterização dos atributos estrutural e funcional de marcadores SNPs identificados no genoma de feijão. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 27. Evento online.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 48. | | PIGOSSO, L. L.; PARENTE, A. F. A.; COELHO, A. S. G.; SILVA, L. P. da; BORGES, C. L.; BAILÃO, A. M.; SOARES, C. M. de A. Comparative proteomics in the genus Paracoccidioides. Fungal Genetics and Biology, v. 60, p. 87-100, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 49. | | ROCHA, D. C.; CRUZ, T. I. da; OLIVEIRA, J. A. V. DE; SOUZA, I. P. DE; DEDICOVA, B.; COELHO, A. S. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Physiological and phenotypical effects of the overexpression of the OVP1 gene in Japonica rice. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03167, 2023. Título em português: Efeitos fisiológicos e fenotípicos da superexpressão do gene OVP1 em arroz japonica.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 50. | | SOUZA, I. P. de; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, A. S. G.; BRONDANI, C.; SOUZA, T. L. P. O. de; VIANELLO, R. P. Haplótipos associados a genes de resistência a antracnose e a mancha angular no feijão-comum. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 13., 2021, Goiânia. Conectividade tecnológica, intensificação sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 150. Evento online.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 51. | | ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B.; CHAVES. L. J.; COELHO, A. S. G.; COUTO, M. A.; MORAIS, L. K. de; VENCOVSKY, R. Genetic structure and gene flow of Eugenia dysenterica natural populations. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 10, p. 975-980, out. 2005 Título em português: : Estrutura genética e fluxo gênico em populações naturais de cagaita.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 52. | | GARCIA, M. C. C.; REGITANO, L. C. de A.; ETCHEGARAY, M. A. L.; COELHO, A. S. G.; BORTOLOZZI, J.; COUTINHO, L. L. Genetic diversity study of seven bovin breeds by the use of SSR markers. In: GLOBAL CONFERENCE ON CONSERVATION OF DOMESTIC ANIMAL GENETIC RESOURCES, 15., 2000, Brasilia, DF. Conservation and biotecnology: a balaced appoach for the new millennium. Proceedings... Brasilia: Embrapa Genetic Resourches Genetic and Biotecnology, 2000. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 53. | | MORAIS JÚNIOR, O. P.; DUARTE, J. B.; BRESEGHELLO, F.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; AGUIAR, J. T.; NEVES, P. C. F.; MORAIS, O. P. Relevance of additive and non-additive genetic relatedness for genomic prediction in rice population under recurrent selection breeding Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 4, gmr16039849, Dec. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 54. | | CANÊDO, M. DE G.; MAGNABOSCO, C. de U.; MAMEDE, M. M. S.; COELHO, A. S. G.; TAVARES, R. Z.; CASTRO, L. M DE. Relações entre o mérito de touros avaliados e o desempenho animal real em teste de desempenho de touros jovens a pasto. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 55. | | AZEVEDO, B. R. de; COELHO, A. S.; SOUZA, T. L. P. O. de; BRONDANI, C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P. Ressequenciamento de feijão para identificação de variantes nucleotídicas (SNPs) em genes de valor agronômico. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 14., 2020, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 25.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 56. | | GONÇALVES, F. J.; FILIPPI, M. C. C. de; LOBO, V. L. S.; ARAÚJO, L. G.; SILVA, G. B.; COELHO, A. S. G.; PRABHU, A. S. Polymorphism detection by microsatellite markers in a Magnaporthe oryzae population from different geographical areas of Brazil. Journal of Phytopathology, v. 164, n. 9, p. 620-630, Sept. 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
|  |
| 57. | | SOUZA, I. P. de; AZEVEDO, B. R. de; COELHO, A. S. G.; SOUZA, T. L. P. O. de; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Tecnologia de análise genômica (SNP assay) aplicada aos recursos genéticos e melhoramento do feijão. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 13., 2021, Goiânia. Conectividade tecnológica, intensificação sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 149. Evento online.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 58. | | GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; MAMANI, E. M.; MISSIAGGIA, A. A.; PAPPAS, M. C. R.; BRONDANI, R. P. V.; PÁDUA, J. G.; COELHO, A. S. G. Wood quality QTLs: detection and validation across multiple pedigrees of eucalyptus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1051.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 59. | | BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C. Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 47, n. 2, p. 216-226, fev. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Rondônia; Embrapa Roraima; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 60. | | BASTOLLA, F. M.; PAZZINI, F.; CARAZZOLLE, M. F.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; GRATTAPAGLIA, D.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PEREIRA, G. A. G.; PASQUALI, G.; CASCARDO, J. C. M. Differential expression of xylem specific genes involved in cellulose quality for two contrasting Eucalyptus species. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 627.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| Registros recuperados : 77 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
|
Data corrente: |
26/09/2017 |
|
Data da última atualização: |
31/10/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; ALMEIDA FILHO, J. E.; MÜLLER, B. S. F.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; LANNA, A. C.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; MORAES, A. da C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. |
|
Afiliação: |
PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; WENDELL J. PEREIRA, UNB; JANEO E. ALMEIDA FILHO, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, Rio de Janeiro-; BARBARA S. F. MULLER, UNB; GESIMARIA RIBEIRO COSTA COELHO, CNPAF; IVANDILSON P. P. DE MENEZES, INSTITUTO FEDERAL GOIANO, Urutaí-GO; JOÃO P. G. VIANNA, UNICAMP; MARIA I. ZUCCHI, UNICAMP; ANNA CRISTINA LANNA, CNPAF; ALEXANDRE S. G. COELHO, UFG; JAISON PEREIRA DE OLIVEIRA, CNPAF; ALESSANDRA DA CUNHA MORAES, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
|
Título: |
In-depth genome characterization of a Brazilian common bean core collection using DArTseq high-density SNP genotyping. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 18, Article 423, 30 mai. 2017. |
|
DOI: |
10.1186/s12864-017-3805-4 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Background: Common bean is a legume of social and nutritional importance as a food crop, cultivated worldwide especially in developing countries, accounting for an important source of income for small farmers. The availability of the complete sequences of the two common bean genomes has dramatically accelerated and has enabled new experimental strategies to be applied for genetic research. DArTseq has been widely used as a method of SNP genotyping allowing comprehensive genome coverage with genetic applications in common bean breeding programs. Results: Using this technology, 6286 SNPs (1 SNP/86.5 Kbp) were genotyped in genic (43.3%) and non-genic regions (56. 7%). Genetic subdivision associated to the common bean gene pools (K = 2) and related to grain types (K = 3 and K = 5) were reported. A total of 83% and 91% of all SNPs were polymorphic within the Andean and Mesoamerican gene pools, respectively, and 26% were able to differentiate the gene pools. Genetic diversity analysis revealed an average HE of 0.442 for the whole collection, 0.102 for Andean and 0.168 for Mesoamerican gene pools (FST = 0.747 between gene pools), 0. 440 for the group of cultivars and lines, and 0.448 for the group of landrace accessions (FST = 0.002 between cultivar/line and landrace groups). The SNP effects were predicted with predominance of impact on non-coding regions (77.8%). SNPs under selection were identified within gene pools comparing landrace and cultivar/line germplasm groups (Andean: 18; Mesoamerican: 69) and between the gene pools (59 SNPs), predominantly on chromosomes 1 and 9. The LD extension estimate corrected for population structure and relatedness (r2 SV) was~88 kbp, while for the Andean gene pool was~395 kbp, and for the Mesoamerican was ~ 130 kbp. Conclusions: For common bean, DArTseq provides an efficient and cost-effective strategy of generating SNPs for large-scale genome-wide studies. The DArTseq resulted in an operational panel of 560 polymorphic SNPs in linkage equilibrium, providing high genome coverage. This SNP set could be used in genotyping platforms with many applications, such as population genetics, phylogeny relation between common bean varieties and support to molecular breeding approaches. MenosBackground: Common bean is a legume of social and nutritional importance as a food crop, cultivated worldwide especially in developing countries, accounting for an important source of income for small farmers. The availability of the complete sequences of the two common bean genomes has dramatically accelerated and has enabled new experimental strategies to be applied for genetic research. DArTseq has been widely used as a method of SNP genotyping allowing comprehensive genome coverage with genetic applications in common bean breeding programs. Results: Using this technology, 6286 SNPs (1 SNP/86.5 Kbp) were genotyped in genic (43.3%) and non-genic regions (56. 7%). Genetic subdivision associated to the common bean gene pools (K = 2) and related to grain types (K = 3 and K = 5) were reported. A total of 83% and 91% of all SNPs were polymorphic within the Andean and Mesoamerican gene pools, respectively, and 26% were able to differentiate the gene pools. Genetic diversity analysis revealed an average HE of 0.442 for the whole collection, 0.102 for Andean and 0.168 for Mesoamerican gene pools (FST = 0.747 between gene pools), 0. 440 for the group of cultivars and lines, and 0.448 for the group of landrace accessions (FST = 0.002 between cultivar/line and landrace groups). The SNP effects were predicted with predominance of impact on non-coding regions (77.8%). SNPs under selection were identified within gene pools comparing landrace and cultivar/line germplasm groups (Andean: 1... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Core collection; Diversity analysis; Diversity arrays technology; Loci under selection. |
|
Thesagro: |
Feijão; Genética vegetal; Phaseolus vulgaris. |
|
Thesaurus NAL: |
Genotyping; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism. |
|
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/164318/1/CNPAF-2017-bmc.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03492naa a2200409 a 4500
001 2076278
005 2017-10-31
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1186/s12864-017-3805-4$2DOI
100 1 $aVALDISSER, P. A. M. R.
245 $aIn-depth genome characterization of a Brazilian common bean core collection using DArTseq high-density SNP genotyping.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aBackground: Common bean is a legume of social and nutritional importance as a food crop, cultivated worldwide especially in developing countries, accounting for an important source of income for small farmers. The availability of the complete sequences of the two common bean genomes has dramatically accelerated and has enabled new experimental strategies to be applied for genetic research. DArTseq has been widely used as a method of SNP genotyping allowing comprehensive genome coverage with genetic applications in common bean breeding programs. Results: Using this technology, 6286 SNPs (1 SNP/86.5 Kbp) were genotyped in genic (43.3%) and non-genic regions (56. 7%). Genetic subdivision associated to the common bean gene pools (K = 2) and related to grain types (K = 3 and K = 5) were reported. A total of 83% and 91% of all SNPs were polymorphic within the Andean and Mesoamerican gene pools, respectively, and 26% were able to differentiate the gene pools. Genetic diversity analysis revealed an average HE of 0.442 for the whole collection, 0.102 for Andean and 0.168 for Mesoamerican gene pools (FST = 0.747 between gene pools), 0. 440 for the group of cultivars and lines, and 0.448 for the group of landrace accessions (FST = 0.002 between cultivar/line and landrace groups). The SNP effects were predicted with predominance of impact on non-coding regions (77.8%). SNPs under selection were identified within gene pools comparing landrace and cultivar/line germplasm groups (Andean: 18; Mesoamerican: 69) and between the gene pools (59 SNPs), predominantly on chromosomes 1 and 9. The LD extension estimate corrected for population structure and relatedness (r2 SV) was~88 kbp, while for the Andean gene pool was~395 kbp, and for the Mesoamerican was ~ 130 kbp. Conclusions: For common bean, DArTseq provides an efficient and cost-effective strategy of generating SNPs for large-scale genome-wide studies. The DArTseq resulted in an operational panel of 560 polymorphic SNPs in linkage equilibrium, providing high genome coverage. This SNP set could be used in genotyping platforms with many applications, such as population genetics, phylogeny relation between common bean varieties and support to molecular breeding approaches.
650 $aGenotyping
650 $aLinkage disequilibrium
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aFeijão
650 $aGenética vegetal
650 $aPhaseolus vulgaris
653 $aCore collection
653 $aDiversity analysis
653 $aDiversity arrays technology
653 $aLoci under selection
700 1 $aPEREIRA, W. J.
700 1 $aALMEIDA FILHO, J. E.
700 1 $aMÜLLER, B. S. F.
700 1 $aCOELHO, G. R. C.
700 1 $aMENEZES, I. P. P. de
700 1 $aVIANNA, J. P. G.
700 1 $aZUCCHI, M. I.
700 1 $aLANNA, A. C.
700 1 $aCOELHO, A. S. G.
700 1 $aOLIVEIRA, J. P. de
700 1 $aMORAES, A. da C.
700 1 $aBRONDANI, C.
700 1 $aVIANELLO, R. P.
773 $tBMC Genomics$gv. 18, Article 423, 30 mai. 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
