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| Registros recuperados : 200 | |
| 161. |  | SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de A.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA. R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Plant Growth Regulation, v. 83, p. 157-170, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 162. | | SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Plant Growth Regulation, v. 83, n. 1, p. 157-170, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 165. | | CARVALHO, N; CANELA, F. M.; SOUZA, N. O.; BUSO, G. S. C.; DUSI, D. M. A.; CHIARI, L.; CARNEIRO, V. T. C. Otimizacao e avaliacao de Primers SSR para Urochloa brizantha. Journal of Basic & Applied Genetics, Buenos Aires, v. 30, n. 1, p. 246, 2019. Edição dos Resumos do XVII Congreso Latinoamericano de Genética, XLVII Congreso Argentino de Genética, LII Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile, VI Congreso de la Sociedad Uruguaya de Genética, V Congreso Latinoamericano de...| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 166. | | CHIARI, L.; SALGADO, L. R.; VALLE, C. B. do; CANÇADO, L. J.; VALLE, J. V. R. do; LEGUIZAMON, G. O. de C. Estimativa da variabilidade genética em acessos de "Brachiaria humidicola" utilizando marcadores RAPD. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Produção animal em biomas tropicais: anais. João Pessoa: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UFPB, 2006. 4 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 167. | | BLUMA-MARQUES, A. C.; JANK, L.; CHIARI, L.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; MELLO, R. C. B. P. de; SILVA, P. M. P. da; ZAGO, J. P. Aplicação de técnicas multivariadas para a determinação da diversidade genética em híbridos de Panicum maximum Jacq. usando marcadores RAPD. In:SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE MELHORAMENTO DE FORRAGEIRAS, 2., 2009, Campo Grande, MS. [Anais]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. II SIMF. Comitê editorial: Liana Jank; Lucimara Chiari; Rosângela Maria Simeão Resende. 4 p. 1 CD-ROM. Resumo B 06.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 168. | | ARGUELHO, E. G.; MATIDA, E. T.; BOTH, D. P.; FERNANDES, C. D.; RESENDE R. M. S.; CHIARI, L.; LAZAROTTO-FORMAGINI, E. Classificação de acessos de Stylosanthes guianensis cv. Bela em variedades botânicas conhecidas. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 58., 2007, São Paulo. A botânica no Brasil: pesquisa, ensino e políticas públicas ambientais. [S.l.]: Sociedade Botânica do Brasil, 2007. 1 p. 1 CD-ROM. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 169. | | ARGUELHO, E. G.; MATIDA, E. T.; BOTH, D. P.; RESENDE, R. M. S.; CHIARI, L.; LAZAROTTO-FORMAGINI, E.; FERNANDES, C. D. Caracterização morfológica e classificação de acessos de Stylosanthes guianensis cv. Bela em variedades botânicas conhecidas. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 3., 2007, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2007. p.40 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 170. | | EBINA, M.; VALLE, C. B. do; SUENAGA, K.; AKASHI, R.; CHIARI, L.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; SHIMODA, K.; OSHIO, S.; KOUKI, K.; NAKAGAWA, H. Preliminary development of AFLP markers co-segregated with apomixis in Brachiaria spp. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON THE MOLECULAR BREEDING OF FORAGE AND TURF, 5., 2007, Hokkaido. Program and abstracts. Hokaido: Hokkaido University, 2007. p. 124 CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 171. | | LARA, L. A. de C.; SANTOS, J. P. R. dos; SANTOS, M. F.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; JANK, L.; GARCIA, A. A. F. Predictive ability of G-Blup model in a tetraploid sexual population of Panicum maximum. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 93| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 172. | | ALMEIDA, M. C. C.; CHIARI, L.; GALVÃO, A. R. T.; ZORZATTO, C.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C. Seleção assistida por marcadores moleculares para apomixia em híbridos de Braquiaria humidicola. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. 2 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 173. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; LEGUIZÁMON, G. O. de C.; JANK, L.; RESENDE, R. M. S.; PAGLIARINI, M. S. Search of RAPD molecular markers linked to apomixis in Brachiaria humidicola. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE REPRODUÇÃO SEXUAL EM PLANTAS, 20., 2008, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 240 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 259). Capa e conteúdo em inglês. Título em inglês: XX International Congress on Sexual Plant Reproduction. p. 211-213 CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 174. | | RESENDE, R. M. S.; LAURA, V. A.; RESENDE, M. D. V. de; CANÇADO, L. J.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; CHIARI, L. Teste clonal de indivíduos elite das leguminosas forrageiras "Stylosanthes guianensis" e "S. capitata". In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Universidade Federal de Goiás, 2005. 4 p. 1 CD-ROM. Forragem. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 175. | | BLUMA-MARQUES, A. C.; JANK, L.; CHIARI, L.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; MELLO, R. C. B. P. de; SILVA, P. M. P. da; ZAGO, J. P. Uso de RAPD para auxiliar à identificação de genótipos de Panicum maximum Jacq. In:SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE MELHORAMENTO DE FORRAGEIRAS, 2., 2009, Campo Grande, MS. [Anais]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. II SIMF. Comitê editorial: Liana Jank; Lucimara Chiari; Rosângela Maria Simeão Resende. 3 p. 1 CD-ROM. Resumo B 07.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 176. | | DÉO, T. G.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; SANTOS, M. F.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; JANK, L. Validação de um gene candidato ligado à apomixia em uma população segregante de Brachiaria decumbens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro: resumos das palestras. p. 635| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 177. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; MELLO, M. V. de; FARIA, M. A. de; ROCHA, M. da; LEGUIZÁMON, G. O. C. Variabilidade genética de acessos de Brachiaria dictyoneura utilizando RAPD. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 2., 2006, Campo Grande, MS. Anais [da]... 2. ed. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2006. 1 p. 1 CD-ROM. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 178. | | SALGADO, L. R.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; CANCADO, L. J.; VALLE, J. V. R. DO; LEGUIZAMON, G. O. de C. Variabilidade genética de acessos de Brachiaria humidicola utilizando a técnica de RAPD. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 1., 2005, Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2005. 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 179. | | CHIARI, L.; VALLE, J. V. R. do; RESENDE, R. M. S.; CANÇADO, L. J.; SALGADO, L. R.; LEGUIZÁMON, G. O. de C. Variabilidade genética em acessos de "Stylosanthes guianensis" utilizando marcadores RAPD. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Produção animal em biomas tropicais: anais. João Pessoa: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UFPB, 2006. 4 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 180. | | JANK, L.; BRAZ, T. dos S.; BARRIOS, S. C. L.; RESENDE, R. M. S.; VALLE, C. B. do; SANTOS, E. dos; FERREIRA, G.; MEIRELES, K. G. X.; CHIARI, L.; JUNGMANN, L. Breeding vemcum maximum in Brazil In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM OF FORAGE BREEDING, 4., 2013, Melbourne. Book of abstracts. Melbourne: Centre for AgriBioscience, 2013. P. 52| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Registros recuperados : 200 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
10/11/2017 |
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Data da última atualização: |
17/04/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. |
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Afiliação: |
LEONARDO RIPPEL SALGADO, Embrapa Beef Cattle, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; RODOLPHO LIMA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; BRUNO FERREIRA DOS SANTOS, Federal University of Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; KARINA TAMIE SHIRAKAWA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; MARIANE DE MENDONCA VILELA, CNPGC; NALVO FRANCO ALMEIDA, Federal University of Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; RODRIGO MATHEUS PEREIRA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; LUCIMARA CHIARI, CNPGC. |
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Título: |
De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Growth Regulation, v. 83, n. 1, p. 157-170, 2017. |
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DOI: |
10.1007/s10725-017-0291-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Acidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained, providing a reference platform for future biotechnological studies and breeding programs for this species and its close relatives. MenosAcidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Molecular markers; RNA sequencing; Urochloa genus. |
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Thesagro: |
Brachiaria Decumbens. |
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Thesaurus NAL: |
Aluminum. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/166583/1/De-novo-RNA-sequencing-and-analysis.pdf
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Marc: |
LEADER 02506naa a2200289 a 4500
001 2079489
005 2018-04-17
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s10725-017-0291-2$2DOI
100 1 $aSALGADO, L. R.
245 $aDe novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aAcidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained, providing a reference platform for future biotechnological studies and breeding programs for this species and its close relatives.
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700 1 $aCHIARI, L.
773 $tPlant Growth Regulation$gv. 83, n. 1, p. 157-170, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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