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| Registros recuperados : 78 | |
| 41. |  | OLIVEIRA, G. B.; REGITANO, L. C. de A.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; DEGAKI, K. Y.; POLETI, M. D.; FELICIO, A. M.; KOLTES, J. E.; COUTINHO, L. L. Integrative analysis of microRNAs and mRNAs revealed regulation of composition and metabolism in Nelore cattle. BMC Genomics, v. 19, n. 126, p. 2-16, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 42. | | POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; SOUSA, G. H. M. F.; CESAR, A. S. M.; SIMAS, R. C.; SILVA-VIGNATO, B.; OLIVEIRA, G. B.; ANDRADE, S. C. S.; CAMERON, L. C.; COUTINHO, L. L. Longissimus dorsi muscle label-free quantitative proteomic reveals biological mechanisms associated with intramuscular fat deposition. Journal of Proteomics, v. 179, p. 30-41, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 43. | | CONTRICIANI, R. E.; GRADE, C. V. C.; LEITE, I. B.; VEIGA, F. C. da; LEDUR, M. C.; REVERTER, A.; ALEXANDRE, P. A.; CESAR, A. S. M.; COUTINHO, L. L.; ALVARES, L. E. Phenotypic divergence between broiler and layer chicken lines is regulated at the molecular level during development. BMC Genomics, v. 25, n.168, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 44. | | DEFANT, H.; MEIRA, A. N.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; MOREIRA, G. C. M.; PADUAN, M.; MARIANI, P.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; CESAR, A. S. M. Novel polymorphisms in the PLIN2 gene of Nellore cattle. Genetics and Molecular Research, v. 18, n. 3, 2019. Não paginado. Na publicação: Luciana CA Regitano, Adhemar Zerlotini. gmr16039963.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 45. | | MOREIRA, G. C. M.; POLETI, M. D.; PÉRTILLE, F.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; LEDUR, M. C.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; COUTINHO, L. L. Unraveling genomic associations with feed efficiency and body weight traits in chickens through an integrative approach. BMC Genetics, v. 20, n. 83, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 46. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; KOLTES, J.; FRITZ-WATERS, E. R.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P. D.; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L. Transcriptome profile in Longissimus dorsi muscle from Nellore steers with extreme GEBV for intramuscular fat percentage. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.07.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 47. | | SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. In: ANNUAL INTERNACIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 23.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 14., 2015, Dublin. Posters... [S.l.]: International Society for Computacional Biology, [2015]. Não paginado. ISMB/ECCB 2015. Pôster D17.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 48. | | SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C. Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 197. X-meeting 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 49. | | SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-11, 2020. Na publicação: Adhemar Zerlotini. Article number: 10204.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 50. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; ANDRADE, S. C. da S.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LANNA, D. P. D.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; KOLTES, J. E.; WATERS, E. F.; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L. Association of skeletal muscle transcripts with fatty acid content in Nellore cattle. In: INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS CONFERENCE, 35., 2016, Salt Lake City. Proceedings... Salt Lake City: ISAG, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 51. | | SANTANA, M. H. de A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; CESAR, A. S. M.; FREUA, M. C.; GOMES, R. da C.; SILVA, S. da L.; LEME, P. R.; FUKUMASU, H.; CARVALHO, M. E.; VENTURA, R. V.; COUTINHO, L. L.; KADARMIDEEN, H. N.; FERRAZ, J. B. S. Copy number variations and genome-wide associations reveal putative genes and metabolic pathways involved with the feed conversion ratio in beef cattle. Journal of Applied Gentics, v. 57, n. 4, p. 495-504, 2016| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 52. | | SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. de A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. In:WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOK PRODUCTION, 10; . 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: American Society of animal Science, 2014| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 53. | | CARDOSO, T. F.; COUTINHO, L. L.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; POLETI, M. D.; CESAR, A. S. M.; SILVEIRA, J. C. DA; CHIARATTI, M. R.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Multi-omics approach reveals miR-SNPs affecting muscle fatty acids profile in Nelore cattle. Genes, v. 12, n. 1, p. 1-18, Jan. 2021. Article 67. Na publicação: Adhemar Zerlotini.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 54. | | OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; TIZIOTO, P. C.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P. D.; ROSA, A. do N.; SONSTEGARD, T. S.; MOURÃO, G. B.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Identification of genomic regions associated with feed efficiency in Nelore cattle. BMC Genetics, v. 15, n. 1, 2014 10 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 55. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P. D.; NASSU, R. T.; MUDADU, M. de A.; OLIVEIRA, P. S. N.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; ALENCAR, M. M. de; SONSTEGRAD, T. S.; GARRICK, D. J.; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association study for intramuscular fat deposition and composition in Nellore cattle. BMC Genetics, v. 15, p. 39, 2014| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 56. | | AFONSO, J.; FORTES, M. R. S.; REVERTER, A.; DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; LIMA, A. O. de; PETRINI, J.; SOUZA, M. de S.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. A.; REGITANO, L. C. de A. Genetic regulators of mineral amount in Nelore cattle muscle predicted by a new co-expression and regulatory impact factor approach. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-16, 2020 Article: 8436.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 57. | | SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; LIMA, A. O.; AFONSO, J.; CESAR, A. S. M; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018. 5 p. Na publicação: A. Zerlotini, L. C. A. Regitano. WCGALP 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 58. | | SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; AFONSO, J.; CESAR, A. S. M; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOOCK PRODUCTION, 2018, Auckland, New Zealand. proceedings... Auckland, New Zealand: Massey University, 2018, v. 892.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 59. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; REECY, J. M.; POLETI, M. D.; OLIVEIRA, P. S. N. de; OLIVEIRA, G. B. de; MOREIRA, G. C. M.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. L.; KOLTES, J. E.; Fritz-Waters, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; BEIKI, H.; GEISTLINGER, L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L. Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. BMC Genomics, v. 19, p. 1-20, 2018. Article number: 499. Na publicação: Luciana C. A. Regitano, Maurício A. Mudadu, Adhemar Zerlotini.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 60. | | NASCIMENTO, M. L.; SOUZA, A. R. D. L.; CHAVES, A. S.; CESAR, A. S. M.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; MOURÃO, G. B.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; ALENCAR, M. M. de; LANNA, D. P. D. Feed efficiency indexes and their relationships with carcass, non-carcass and meat quality traits in Nellore steers. Meat Science, v. 116, p. 78-85, June, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 78 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sudeste. Para informações adicionais entre em contato com cppse.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
08/03/2023 |
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Data da última atualização: |
08/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 4 |
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Autoria: |
BUSS, C. E.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N. DE; PETRINI, J.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; GUSTANI-BUSS, E. C.; CARDOSO, T. F.; ROVADOSKI, G. A.; DINIZ, W. J. DA S.; LIMA, A. O. DE; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; WOLF, J. B.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
CARLOS EDUARDO BUSS, Federal University of São Carlos; JULIANA AFONSO; PRISCILA S. N. DE OLIVEIRA, Federal University of São Carlos; JULIANA PETRINI, University of São Paulo/ESALQ, Piracicaba; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, NGS Soluções Genômicas; ALINE S. M. CESAR, University of São Paulo/ESALQ; EMANUELE CRISTINA GUSTANI-BUSS, Mindflow Genomics, Leuven, Flanders, Belgium.; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; GREGORI A. ROVADOSKI, University of São Paulo/ESALQ; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, Auburn University; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, University of Washington; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, Federal University of São Carlos; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE, Munster Technological University/MTU; JASON B. WOLF, University of Bath; LUIZ LEHMANN COUTINHO, University of São Paulo/ESALQ; GERSON BARRETO MOURÃO, University of São Paulo/ESALQ; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Bivariate GWAS reveals pleiotropic regions among feed efficiency and beef quality-related traits in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 90-103, dec. 2022. |
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DOI: |
10.1007/s00335-022-09969-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Feed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement. |
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Palavras-Chave: |
Bi GWAS; Efciency and meat quality; Phenotypic variations; Pleiotropic modulation; QTL. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02281naa a2200385 a 4500
001 2152195
005 2023-03-08
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s00335-022-09969-6$2DOI
100 1 $aBUSS, C. E.
245 $aBivariate GWAS reveals pleiotropic regions among feed efficiency and beef quality-related traits in Nelore cattle.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aFeed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement.
653 $aBi GWAS
653 $aEfciency and meat quality
653 $aPhenotypic variations
653 $aPleiotropic modulation
653 $aQTL
700 1 $aAFONSO, J.
700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. DE
700 1 $aPETRINI, J.
700 1 $aTIZIOTO, P. C.
700 1 $aCESAR, A. S. M.
700 1 $aGUSTANI-BUSS, E. C.
700 1 $aCARDOSO, T. F.
700 1 $aROVADOSKI, G. A.
700 1 $aDINIZ, W. J. DA S.
700 1 $aLIMA, A. O. DE
700 1 $aROCHA, M. I. P.
700 1 $aANDRADE, B. G. N.
700 1 $aWOLF, J. B.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aMOURÃO, G. B.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tMammalian Genome$gv. 34, p. 90-103, dec. 2022.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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