| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
|
Data corrente: |
20/08/2012 |
|
Data da última atualização: |
30/09/2014 |
|
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
|
Autoria: |
FERRARESI, T. M.; FERREIRA, E. P. de B.; SILVA, W. T. L. da; MARTIN NETO, L. |
|
Afiliação: |
TATIANA MARIS FERRARESI, CNPAF; ENDERSON PETRONIO DE BRITO FERREIRA, CNPAF; WILSON TADEU LOPES DA SILVA, CNPDIA; LADISLAU MARTIN NETO, CNPDIA. |
|
Título: |
Aplicação da espectroscopia no infravermelho próximo e médio na avaliação da biomassa microbiana do solo. |
|
Ano de publicação: |
2012 |
|
Fonte/Imprenta: |
Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. |
|
Páginas: |
36 p. |
|
Série: |
(Embrapa Arroz e Feijão. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 38). |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
A biomassa microbiana tem sido um bom indicador da qualidade do solo devido à sua importante participação nos ciclos biogeoquímicos e à sua interação com a matéria orgânica e minerais presentes no solo. O método comumente utilizado em laboratório para sua determinação é o proposto por Vance et al. (1987), que envolve processos de fumigação e extração, além etapas de preparação de amostras. Por outro lado, a espectroscopia de infravermelho tem sido proposta para a análise de solos e produtos agrícolas, em substituição aos métodos clássicos, pela economia de tempo e custo. Entretanto, a utilização da espectroscopia de infravermelho próximo (NIRS) e médio (DRIFTS) nas análises de solos depende da construção de modelos preditivos que correlacionem os dados espectroscópicos com os valores obtidos com um método de referência. Desse modo, para avaliar a aplicabilidade dessas técnicas na determinação de carbono microbiano (CMIC), nitrogênio microbiano (NMIC) e respiração basal do solo (RB), foram utilizadas amostras provenientes da Fazenda Capivara, pertencente à Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF), em Santo Antônio de Goiás-GO, e da Fazenda Canchim, pertencente à Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE), em São Carlos-SP. Os dados de biomassa obtidos com o método utilizado como referência (fumigação-extração) foram correlacionados com os dados de absorbância em infravermelho pelo método PLS (Partial Least Squares), em dois subgrupos amostrais segundo a localidade (CNPAF e CPPSE), assim como em todas as amostras. Os testes de validação dos modelos de regressão construídos confirmaram que há relação quantitativa entre os espectros de infravermelho e os parâmetros de biomassa microbiana, sendo os coeficientes de regressão máximos encontrados iguais a 0,82 para CMIC; 0,76 para NMIC e 0,70 para RB. MenosA biomassa microbiana tem sido um bom indicador da qualidade do solo devido à sua importante participação nos ciclos biogeoquímicos e à sua interação com a matéria orgânica e minerais presentes no solo. O método comumente utilizado em laboratório para sua determinação é o proposto por Vance et al. (1987), que envolve processos de fumigação e extração, além etapas de preparação de amostras. Por outro lado, a espectroscopia de infravermelho tem sido proposta para a análise de solos e produtos agrícolas, em substituição aos métodos clássicos, pela economia de tempo e custo. Entretanto, a utilização da espectroscopia de infravermelho próximo (NIRS) e médio (DRIFTS) nas análises de solos depende da construção de modelos preditivos que correlacionem os dados espectroscópicos com os valores obtidos com um método de referência. Desse modo, para avaliar a aplicabilidade dessas técnicas na determinação de carbono microbiano (CMIC), nitrogênio microbiano (NMIC) e respiração basal do solo (RB), foram utilizadas amostras provenientes da Fazenda Capivara, pertencente à Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF), em Santo Antônio de Goiás-GO, e da Fazenda Canchim, pertencente à Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE), em São Carlos-SP. Os dados de biomassa obtidos com o método utilizado como referência (fumigação-extração) foram correlacionados com os dados de absorbância em infravermelho pelo método PLS (Partial Least Squares), em dois subgrupos amostrais segundo a localidade (CNPAF e CPPSE), assim como em ... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Carbono microbiano; DRIFTS; NIRS; Nitrogênio microbiano; Respiração basal do solo. |
|
Thesagro: |
Biomassa; Microbiologia do solo; Recurso energético. |
|
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/64194/1/boletimdepesquisa-38.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02740nam a2200265 a 4500
001 1931558
005 2014-09-30
008 2012 bl uuuu u0uu1 u #d
100 1 $aFERRARESI, T. M.
245 $aAplicação da espectroscopia no infravermelho próximo e médio na avaliação da biomassa microbiana do solo.$h[electronic resource]
260 $aSanto Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão$c2012
300 $a36 p.
490 $a(Embrapa Arroz e Feijão. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 38).
520 $aA biomassa microbiana tem sido um bom indicador da qualidade do solo devido à sua importante participação nos ciclos biogeoquímicos e à sua interação com a matéria orgânica e minerais presentes no solo. O método comumente utilizado em laboratório para sua determinação é o proposto por Vance et al. (1987), que envolve processos de fumigação e extração, além etapas de preparação de amostras. Por outro lado, a espectroscopia de infravermelho tem sido proposta para a análise de solos e produtos agrícolas, em substituição aos métodos clássicos, pela economia de tempo e custo. Entretanto, a utilização da espectroscopia de infravermelho próximo (NIRS) e médio (DRIFTS) nas análises de solos depende da construção de modelos preditivos que correlacionem os dados espectroscópicos com os valores obtidos com um método de referência. Desse modo, para avaliar a aplicabilidade dessas técnicas na determinação de carbono microbiano (CMIC), nitrogênio microbiano (NMIC) e respiração basal do solo (RB), foram utilizadas amostras provenientes da Fazenda Capivara, pertencente à Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF), em Santo Antônio de Goiás-GO, e da Fazenda Canchim, pertencente à Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE), em São Carlos-SP. Os dados de biomassa obtidos com o método utilizado como referência (fumigação-extração) foram correlacionados com os dados de absorbância em infravermelho pelo método PLS (Partial Least Squares), em dois subgrupos amostrais segundo a localidade (CNPAF e CPPSE), assim como em todas as amostras. Os testes de validação dos modelos de regressão construídos confirmaram que há relação quantitativa entre os espectros de infravermelho e os parâmetros de biomassa microbiana, sendo os coeficientes de regressão máximos encontrados iguais a 0,82 para CMIC; 0,76 para NMIC e 0,70 para RB.
650 $aBiomassa
650 $aMicrobiologia do solo
650 $aRecurso energético
653 $aCarbono microbiano
653 $aDRIFTS
653 $aNIRS
653 $aNitrogênio microbiano
653 $aRespiração basal do solo
700 1 $aFERREIRA, E. P. de B.
700 1 $aSILVA, W. T. L. da
700 1 $aMARTIN NETO, L.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
|
Data corrente: |
02/09/2013 |
|
Data da última atualização: |
04/04/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
LOPES-CAITAR, V. S.; CARVALHO, M. C. C. G. de; LUANA M. DARBEN; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; DIAS, W. P.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
|
Afiliação: |
VALÉRIA S. LOPES-CAITAR; MAYRA C. C. G. DE CARVALHO, UENP; MARCIA KAMOGAE KUWAHARA, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; WALDIR PEREIRA DIAS, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARA, CNPSO. |
|
Título: |
Genome-wide analysis of the Hsp20 gene family in soybean: comprehensive sequence, genomic organization and expression profile analysis under abiotic and biotic stresses. |
|
Ano de publicação: |
2013 |
|
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 14, article 577, 2013. |
|
Páginas: |
17 p. |
|
ISSN: |
1471-2164 |
|
DOI: |
10.1186/1471-2164-14-577 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The Hsp20 genes are associated with stress caused by HS and other abiotic factors, but have recently been found to be associated with the response to biotic stresses. These genes represent the most abundant class among the HSPs in plants, but little is known about this gene family in soybean. Because of their apparent multifunctionality, these proteins are promising targets for developing crop varieties that are better adapted to biotic and abiotic stresses. Thus, in the present study an in silico identification of GmHsp20 gene family members was performed, and the genes were characterized and subjected to in vivo expression analysis under biotic and abiotic stresses. A search of the available soybean genome databases revealed 51 gene models as potential GmHsp20 candidates. The 51 GmHsp20 genes were distributed across a total of 15 subfamilies where a specific predicted secondary structure was identified. Based on in vivo analysis, only 47 soybean Hsp20 genes were responsive to heat shock stress. Among the GmHsp20 genes that were potentials HSR, five were also cold-induced, and another five, in addition to one GmAcd gene, were responsive to Meloidogyne javanica infection. Furthermore, one predicted GmHsp20 was shown to be responsive only to nematode infection; no expression change was detected under other stress conditions. Some of the biotic stress-responsive GmHsp20 genes exhibited a divergent expression pattern between resistant and susceptible soybean genotypes under M. javanica infection. The putative regulatory elements presenting some conservation level in the GmHsp20 promoters included HSE, W-box, CAAT box, and TA-rich elements. Some of these putative elements showed a unique occurrence pattern among genes responsive to nematode infection. The evolution of Hsp20 family in soybean genome has most likely involved a total of 23 gene duplications. The obtained expression profiles revealed that the majority of the 51 GmHsp20 candidates are induced under HT, but other members of this family could also be involved in normal cellular functions, unrelated to HT. Some of the GmHsp20 genes might be specialized to respond to nematode stress, and the predicted promoter structure of these genes seems to have a particular conserved pattern related to their biological function. MenosThe Hsp20 genes are associated with stress caused by HS and other abiotic factors, but have recently been found to be associated with the response to biotic stresses. These genes represent the most abundant class among the HSPs in plants, but little is known about this gene family in soybean. Because of their apparent multifunctionality, these proteins are promising targets for developing crop varieties that are better adapted to biotic and abiotic stresses. Thus, in the present study an in silico identification of GmHsp20 gene family members was performed, and the genes were characterized and subjected to in vivo expression analysis under biotic and abiotic stresses. A search of the available soybean genome databases revealed 51 gene models as potential GmHsp20 candidates. The 51 GmHsp20 genes were distributed across a total of 15 subfamilies where a specific predicted secondary structure was identified. Based on in vivo analysis, only 47 soybean Hsp20 genes were responsive to heat shock stress. Among the GmHsp20 genes that were potentials HSR, five were also cold-induced, and another five, in addition to one GmAcd gene, were responsive to Meloidogyne javanica infection. Furthermore, one predicted GmHsp20 was shown to be responsive only to nematode infection; no expression change was detected under other stress conditions. Some of the biotic stress-responsive GmHsp20 genes exhibited a divergent expression pattern between resistant and susceptible soybean genotypes under M. ... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Soja. |
|
Thesaurus NAL: |
Soybeans. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/102608/1/genome-wide.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03155naa a2200265 a 4500
001 1965345
005 2022-04-04
008 2013 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1471-2164
024 7 $a10.1186/1471-2164-14-577$2DOI
100 1 $aLOPES-CAITAR, V. S.
245 $aGenome-wide analysis of the Hsp20 gene family in soybean$bcomprehensive sequence, genomic organization and expression profile analysis under abiotic and biotic stresses.$h[electronic resource]
260 $c2013
300 $a17 p.
520 $aThe Hsp20 genes are associated with stress caused by HS and other abiotic factors, but have recently been found to be associated with the response to biotic stresses. These genes represent the most abundant class among the HSPs in plants, but little is known about this gene family in soybean. Because of their apparent multifunctionality, these proteins are promising targets for developing crop varieties that are better adapted to biotic and abiotic stresses. Thus, in the present study an in silico identification of GmHsp20 gene family members was performed, and the genes were characterized and subjected to in vivo expression analysis under biotic and abiotic stresses. A search of the available soybean genome databases revealed 51 gene models as potential GmHsp20 candidates. The 51 GmHsp20 genes were distributed across a total of 15 subfamilies where a specific predicted secondary structure was identified. Based on in vivo analysis, only 47 soybean Hsp20 genes were responsive to heat shock stress. Among the GmHsp20 genes that were potentials HSR, five were also cold-induced, and another five, in addition to one GmAcd gene, were responsive to Meloidogyne javanica infection. Furthermore, one predicted GmHsp20 was shown to be responsive only to nematode infection; no expression change was detected under other stress conditions. Some of the biotic stress-responsive GmHsp20 genes exhibited a divergent expression pattern between resistant and susceptible soybean genotypes under M. javanica infection. The putative regulatory elements presenting some conservation level in the GmHsp20 promoters included HSE, W-box, CAAT box, and TA-rich elements. Some of these putative elements showed a unique occurrence pattern among genes responsive to nematode infection. The evolution of Hsp20 family in soybean genome has most likely involved a total of 23 gene duplications. The obtained expression profiles revealed that the majority of the 51 GmHsp20 candidates are induced under HT, but other members of this family could also be involved in normal cellular functions, unrelated to HT. Some of the GmHsp20 genes might be specialized to respond to nematode stress, and the predicted promoter structure of these genes seems to have a particular conserved pattern related to their biological function.
650 $aSoybeans
650 $aSoja
700 1 $aCARVALHO, M. C. C. G. de
700 1 $aLUANA M. DARBEN
700 1 $aKUWAHARA, M. K.
700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
700 1 $aDIAS, W. P.
700 1 $aABDELNOOR, R. V.
700 1 $aMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.
773 $tBMC Genomics$gv. 14, article 577, 2013.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
