| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Florestas. Para informações adicionais entre em contato com cnpf.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
30/08/2018 |
|
Data da última atualização: |
11/02/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
DUARTE, D. A. S.; FORTES, M. R. S.; DUARTE, M. de S.; GUIMARÃES, S. E. F.; VERARDO, L. L.; VERONEZE, R.; RIBEIRO, A. M. F.; LOPES, P. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. |
|
Afiliação: |
Darlene Ana S. Duarte, UFV; Marina Rufino S. Fortes, University of Queensland; Marcio de Souza Duarte, UFV; Simone E. F. Guimarães, UFV; Lucas L. Verardo, UFV; Renata Veroneze, UFV; Andre Mauric F. Ribeiro, UFV; Paulo Sávio Lopes, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Fabyano Fonseca e Silva, UFV. |
|
Título: |
Genome-wide association studies, meta-analyses and derived gene network for meat quality and carcass traits in pigs. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Animal Production Science, v. 58, n. 6, p. 1100-1008, May 2018. |
|
DOI: |
dx.doi.org/10.1071/AN16018 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
A large number of quantitative trait loci (QTL) for meat quality and carcass traits has been reported in pigs over the past 20 years. However, few QTL have been validated and the biological meaning of the genes associated to these QTL has been underexploited. In this context, a meta-analysis was performed to compare the significant markers with meta-QTL previously reported in literature. Genome association studies were performed for 12 traits, from which 144 SNPs were found out to be significant (P < 0.05). They were validated in the meta-analysis and used to build the Association Weight Matrix, a matrix framework employed to investigate co-association of pairwise SNP across phenotypes enabling to derive a gene network. A total of 45 genes were selected from the Association Weight Matrix analysis, from which 25 significant transcription factors were identified and used to construct the networks associated to meat quality and carcass traits. These networks allowed the identification of key transcription factors, such as SOX5 and NKX2–5, gene–gene interactions (e.g. ATP5A1, JPH1, DPT and NEDD4) and pathways related to the regulation of adipose tissue metabolism and skeletal muscle development. Validated SNPs and knowledge of key genes driving these important industry traits might assist future strategies in pig breeding. |
|
Palavras-Chave: |
Biological pathways; Post-GWAS; SNP-derived gene networks. |
|
Thesagro: |
Melhoramento Genético Animal; Suíno. |
|
Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Pork. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02343naa a2200325 a 4500
001 2094834
005 2019-02-11
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $adx.doi.org/10.1071/AN16018$2DOI
100 1 $aDUARTE, D. A. S.
245 $aGenome-wide association studies, meta-analyses and derived gene network for meat quality and carcass traits in pigs.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aA large number of quantitative trait loci (QTL) for meat quality and carcass traits has been reported in pigs over the past 20 years. However, few QTL have been validated and the biological meaning of the genes associated to these QTL has been underexploited. In this context, a meta-analysis was performed to compare the significant markers with meta-QTL previously reported in literature. Genome association studies were performed for 12 traits, from which 144 SNPs were found out to be significant (P < 0.05). They were validated in the meta-analysis and used to build the Association Weight Matrix, a matrix framework employed to investigate co-association of pairwise SNP across phenotypes enabling to derive a gene network. A total of 45 genes were selected from the Association Weight Matrix analysis, from which 25 significant transcription factors were identified and used to construct the networks associated to meat quality and carcass traits. These networks allowed the identification of key transcription factors, such as SOX5 and NKX2–5, gene–gene interactions (e.g. ATP5A1, JPH1, DPT and NEDD4) and pathways related to the regulation of adipose tissue metabolism and skeletal muscle development. Validated SNPs and knowledge of key genes driving these important industry traits might assist future strategies in pig breeding.
650 $aAnimal breeding
650 $aPork
650 $aMelhoramento Genético Animal
650 $aSuíno
653 $aBiological pathways
653 $aPost-GWAS
653 $aSNP-derived gene networks
700 1 $aFORTES, M. R. S.
700 1 $aDUARTE, M. de S.
700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F.
700 1 $aVERARDO, L. L.
700 1 $aVERONEZE, R.
700 1 $aRIBEIRO, A. M. F.
700 1 $aLOPES, P. S.
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aSILVA, F. F. e
773 $tAnimal Production Science$gv. 58, n. 6, p. 1100-1008, May 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
|
Data corrente: |
03/01/2012 |
|
Data da última atualização: |
03/01/2012 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
AMABILE, R. F.; CARVALHO, C. G. P. de; SAYD, R. M.; MONTEIRO, V. A.; RIBEIRO JUNIOR, W. Q. |
|
Afiliação: |
RENATO FERNANDO AMABILE, CPAC; CLAUDIO GUILHERME PORTELA CARVALHO, CNPSO; RICARDO MENESES SAYD, UNB; VÍTOR ANTUNES MONTEIRO, UNB; WALTER QUADROS RIBEIRO JUNIOR, CPAC. |
|
Título: |
Avaliação de genótipos de girassol em safrinha no cerrado do Distrito Federal em 2011 em ensaio de segundo ano. |
|
Ano de publicação: |
2011 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE GIRASSOL, 19.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 7., 2011, Aracaju. Anais... Londrina: Embrapa Soja; Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2011. 1 CD-ROM. |
|
Páginas: |
p. 354-356. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O experimento foi instalado na Embrapa Cerrados e avaliou o comportamento de 10 genótipos de girassol em safrinha, em ensaio de segundo ano. Foram avaliados: rendimento de grãos, altura de plantas, número de plantas quebradas, peso de mil aquênios e dias para floração plena no período de 16/02/2011 a 15/06/2011. O rendimento médio ficou em 2.912,60 kg.ha-1e o rendimento máximo foi apresentado pelo genótipo BRS G 29 (3.410,29 kg.ha ). A altura média das plantas foi de 169,75 cm, o peso médio de mil aquênios foi de 52,8 g e o número médio de dias para floração foi de 62. As condições ambientais expressas pela safrinha no Cerrado do Distrito Federal em 2011 colocam o girassol como uma opção de cultivo no sistema de produção agrícola dessa região. EVALUATION SUNFLOWER GENOTYPES ON OUT OF SEASON CROP AT DISTRITO FEDERAL SAVANNA IN 2011 IN SECOND YEAR TEST. The experiment was conducted at Embrapa Cerrados and were evaluated the behaviors of 10 sunflower genotypes in off-season, in second year test. Were evaluated: yield, plants height, number of broken plants, weight of a thousand seeds and days to complete flowering between February 16thand June 15th. The average grain yield was 2.912,60 kg.ha and the highest yield was presented by BRS G 29 (3.410,29 kg.ha-1). The mean value for plants height was 169,75 cm. The average weight of a thousand seeds and number of days to complete flowering were 52,8 g and 62 days, respectively. Environmental conditions expressed in offseason period at Distrito Federal savanna in 2011 puts sunflower as an option in agricultural production system in this region. MenosO experimento foi instalado na Embrapa Cerrados e avaliou o comportamento de 10 genótipos de girassol em safrinha, em ensaio de segundo ano. Foram avaliados: rendimento de grãos, altura de plantas, número de plantas quebradas, peso de mil aquênios e dias para floração plena no período de 16/02/2011 a 15/06/2011. O rendimento médio ficou em 2.912,60 kg.ha-1e o rendimento máximo foi apresentado pelo genótipo BRS G 29 (3.410,29 kg.ha ). A altura média das plantas foi de 169,75 cm, o peso médio de mil aquênios foi de 52,8 g e o número médio de dias para floração foi de 62. As condições ambientais expressas pela safrinha no Cerrado do Distrito Federal em 2011 colocam o girassol como uma opção de cultivo no sistema de produção agrícola dessa região. EVALUATION SUNFLOWER GENOTYPES ON OUT OF SEASON CROP AT DISTRITO FEDERAL SAVANNA IN 2011 IN SECOND YEAR TEST. The experiment was conducted at Embrapa Cerrados and were evaluated the behaviors of 10 sunflower genotypes in off-season, in second year test. Were evaluated: yield, plants height, number of broken plants, weight of a thousand seeds and days to complete flowering between February 16thand June 15th. The average grain yield was 2.912,60 kg.ha and the highest yield was presented by BRS G 29 (3.410,29 kg.ha-1). The mean value for plants height was 169,75 cm. The average weight of a thousand seeds and number of days to complete flowering were 52,8 g and 62 days, respectively. Environmental conditions expressed in offseason period a... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Sunflower. |
|
Thesagro: |
Cerrado; Girassol. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/51042/1/354.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02420naa a2200217 a 4500
001 1911492
005 2012-01-03
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aAMABILE, R. F.
245 $aAvaliação de genótipos de girassol em safrinha no cerrado do Distrito Federal em 2011 em ensaio de segundo ano.
260 $c2011
300 $ap. 354-356.
520 $aO experimento foi instalado na Embrapa Cerrados e avaliou o comportamento de 10 genótipos de girassol em safrinha, em ensaio de segundo ano. Foram avaliados: rendimento de grãos, altura de plantas, número de plantas quebradas, peso de mil aquênios e dias para floração plena no período de 16/02/2011 a 15/06/2011. O rendimento médio ficou em 2.912,60 kg.ha-1e o rendimento máximo foi apresentado pelo genótipo BRS G 29 (3.410,29 kg.ha ). A altura média das plantas foi de 169,75 cm, o peso médio de mil aquênios foi de 52,8 g e o número médio de dias para floração foi de 62. As condições ambientais expressas pela safrinha no Cerrado do Distrito Federal em 2011 colocam o girassol como uma opção de cultivo no sistema de produção agrícola dessa região. EVALUATION SUNFLOWER GENOTYPES ON OUT OF SEASON CROP AT DISTRITO FEDERAL SAVANNA IN 2011 IN SECOND YEAR TEST. The experiment was conducted at Embrapa Cerrados and were evaluated the behaviors of 10 sunflower genotypes in off-season, in second year test. Were evaluated: yield, plants height, number of broken plants, weight of a thousand seeds and days to complete flowering between February 16thand June 15th. The average grain yield was 2.912,60 kg.ha and the highest yield was presented by BRS G 29 (3.410,29 kg.ha-1). The mean value for plants height was 169,75 cm. The average weight of a thousand seeds and number of days to complete flowering were 52,8 g and 62 days, respectively. Environmental conditions expressed in offseason period at Distrito Federal savanna in 2011 puts sunflower as an option in agricultural production system in this region.
650 $aCerrado
650 $aGirassol
653 $aSunflower
700 1 $aCARVALHO, C. G. P. de
700 1 $aSAYD, R. M.
700 1 $aMONTEIRO, V. A.
700 1 $aRIBEIRO JUNIOR, W. Q.
773 $tIn: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE GIRASSOL, 19.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 7., 2011, Aracaju. Anais... Londrina: Embrapa Soja; Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2011. 1 CD-ROM.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
