| |
|
|
| Registros recuperados : 311 | |
| 63. |  | SILVA, J. M. da; ROMANIUC, A. R.; CAETANO, A. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Java Merging Copy Number Variants (JM-CNV): a new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. Não paginado. PAG 2015. Pôster P1170.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
|    |
| 64. | | PIMENTEL, F.; MCMANUS, C.; SOARES, K.; CAETANO, A. R.; FARIA, D. A. de; PAIVA, S. R.; IANELLA, P. Landscape genetics for Brazilian equines. Journal of Equine Veterinary Science, v. 126, 104251, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 66. | | VINOCUR, M. E.; BRASS, K. E.; CAETANO, A. R.; SILVA, L. F.; SILVA, A. C.; SILVA, C. A. M. Equine protease inhibitor system as a marker for the diagnosis of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Genetics and Molecular Biology, v. 28, n. 3, p. 382-385, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 67. | | COSTA, N. S.; SILVEIRA, M. M.; VARGAS, L. N.; CAETANO, A. R.; RUMPF, R.; FRANCO, M. M. Epigenetic characterization of the H19/IGF2 locus in calf clones placenta. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 40, n. 12, p. 1063-1072, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 68. | | CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R. Estimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 69. | | CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R. Estimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 f. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 70. | | CARREIRO, C. de M.; McMANUS, C.; SANTOS, S. A.; MARTINS, C. F.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estudo da Origem do Ovino Crioulo do Pantanal por Marcadores Mitocondriais e do Cromossomo Y. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. Anais... Brasília: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 71. | | CARREIRO, C. de M.; McMANUS, C.; SANTOS, S. A.; MARTINS, C. F.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estudo da Origem do Ovino Crioulo do Pantanal por Marcadores Mitocondriais e do Cromossomo Y. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. Anais... Brasília: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012. (CD-ROM). 3p.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
| |
| 72. | | BLACKBURN, H. D.; PAIVA, S. R.; SOLLERO, B. P.; BIEGELMEYER, P.; CAETANO, A. R.; CARDOSO, F. F. A dedicated SNP panel for evaluating genetic diversity in a composite cattle breed. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 73. | | BLACKBURN, H. D.; PAIVA, S. R.; SOLLERO, B. P.; BIEGELMEYER, P.; CAETANO, A. R.; CARDOSO, F. F. A dedicated SNP panel for evaluating genetic diversity in a composite cattle breed. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 74. | | FERREIRA; SILVA, E. C. da; SOUSA, M. A. N. de; FAÇANHA, D. A. E.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Diversidade genética de duas variedades da raça ovina Morada Nova por meio de sequenciamento de regiões do mtDNA. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 75. | | IANELLA, P.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; CAETANO, A. R.; BIAZIO, G. R.; PAIVA, S. R.; MCMANUS, C. M. Diversidade genética e estrutura de populações de raças localmente adaptadas de equinos no Brasil. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 71, 2018 Edição especial com os Anais do V Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 76. | | MUNIZ, M. M. M.; CAVALCANTI, L. C. G.; FAÇANHA, D. A. E.; FACO, O.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Diversidade genética de diferentes variedades da raça Morada Nova por meio de marcadores SNP. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo 663. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 77. | | SILVA, E. C. da; DUTRA, JÚNIOR, W. M.; PAIVA, S. R.; GOMES FILHO, M. A.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R. Distância genética entre suínos locais e comerciais do semi-árido do Nordeste utilizando marcadores microssatélites. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 79. | | PANZITTA, F.; NARDELLI-COSTA, J.; LAZZARI, B.; GANDINI, G.; STELLA, A.; BOETTCHER, P. J.; CAETANO, A. R.; MARIANI, P. Discovery and use of SNPs for estimating genetic distances among italian goat breeds. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 13., 2005, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2005. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 80. | | NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; CAETANO, A. R.; COUTINHO, L. L. Associação de poliformismos de base única (SNP) no íntron 8 gene do receptor da leptina em galinhas com rendimento de órgãos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. O avanço científico e tecnológico na produção animal: anais. Jaboticabal: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UNESP, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, 2007. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| Registros recuperados : 311 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
15/01/2016 |
|
Data da última atualização: |
21/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SILVA, J. M. da; ROMANIUC, A. R.; CAETANO, A. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. |
|
Afiliação: |
JOAQUIM MANOEL DA SILVA, Unemat; ALAN ROBERTO ROMANIUC, CNPTIA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA. |
|
Título: |
Java Merging Copy Number Variants (JM-CNV): a new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR). |
|
Ano de publicação: |
2015 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. |
|
Páginas: |
Não paginado. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
PAG 2015. Pôster P1170. |
|
Conteúdo: |
CNVs (Copy Number Variations) are defined as copy number variations of DNA fragments typically larger than one kilobase (Kb), but less than five megabases (Mb). They represent a genomic disequilibrium that alters the ploidy in a specific locus within an individual, which may also be observed with varying frequencies within a population. An initial study estimated that 12% of the human genome shows this type of structural variation. Reliable tools have been developed to detect CNVs from molecular data produced with three main platforms: Comparative Genomic Hybridization (CGH) arrays, Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotyping arrays, and DNA Next-Generation Sequencing (NGS). However, processes for merging overlapping CNVs into a meaningful set of discrete Copy Number Variable Regions (CNVRs) need improvement, particularly when several CNV patterns co-exist within the same genomic locus. Available algorithms frequently merge noncontiguous CNVRs or fragment large CNVRs into multiple regions. A new web-based software (Java Merging Copy Number Variants: JM-CNV) was developed to address the aforementioned issues. |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Copy Number Variations. |
|
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Computer software. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/137048/1/Java-Silva-PAG.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01911nam a2200229 a 4500
001 2034001
005 2020-01-21
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, J. M. da
245 $aJava Merging Copy Number Variants (JM-CNV)$ba new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR).$h[electronic resource]
260 $aIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.]$c2015
300 $aNão paginado.
500 $aPAG 2015. Pôster P1170.
520 $aCNVs (Copy Number Variations) are defined as copy number variations of DNA fragments typically larger than one kilobase (Kb), but less than five megabases (Mb). They represent a genomic disequilibrium that alters the ploidy in a specific locus within an individual, which may also be observed with varying frequencies within a population. An initial study estimated that 12% of the human genome shows this type of structural variation. Reliable tools have been developed to detect CNVs from molecular data produced with three main platforms: Comparative Genomic Hybridization (CGH) arrays, Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotyping arrays, and DNA Next-Generation Sequencing (NGS). However, processes for merging overlapping CNVs into a meaningful set of discrete Copy Number Variable Regions (CNVRs) need improvement, particularly when several CNV patterns co-exist within the same genomic locus. Available algorithms frequently merge noncontiguous CNVRs or fragment large CNVRs into multiple regions. A new web-based software (Java Merging Copy Number Variants: JM-CNV) was developed to address the aforementioned issues.
650 $aBioinformatics
650 $aComputer software
653 $aBioinformática
653 $aCopy Number Variations
700 1 $aROMANIUC, A. R.
700 1 $aCAETANO, A. R.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
