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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
15/01/2013 |
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Data da última atualização: |
15/01/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALMEIDA, I. F. de; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de; ALMEIDA, R. V. de. |
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Afiliação: |
Ísis Fernanda de Almeida, Universidade Estadual de Goiás; Cosme Damião Cruz, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Ramon Vinícius de Almeida, Universidade Estadual de Goiás. |
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Título: |
Método de estimação e validação na seleção genômica. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Agrotecnologia, Anápolis, v. 3, n. 2, 2012. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A seleção genômica ampla (GWS) consiste na utilização simultânea de centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores. Este trabalho teve por objetivo avaliar a acurácia ao se aplicar diferentes métodos estatísticos de seleção genômica (RR-BLUP e BLASSO) e diferentes formas de validação. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação contendo 100 marcas bi-alélicas e co-dominantes por grupo, totalizando 1010 marcadores apresentando intervalos entre marcas adjacentes equidistantes. Esses genomas foram utilizados para a geração da população simulada de famílias de meios-irmãos com 1.000 indivíduos. As diferentes características quantitativas, uniformes e binomiais, de herdabilidade 0,40, foram avaliadas. Para um tipo de validação criou-se uma população de validação independente com 1000 indivíduos e para outro tipo, aplicou-se a validação cruzada de Jacknife, usando a mesma população para estimação e validação. Os programas estatísticos utilizados foram GENES, SELEGEN GENÔMICA e R. As acurácias apresentaram valores entre 0,55 e 0,92. De forma geral, a validação feita através da população independente apresentou valores mais elevados de acurácia. Para famílias de meios-irmãos e com distribuição binomial dos efeitos genéticos, o método BLASSO foi ligeiramente superior ao RR-BLUP. Para a distribuição uniforme, os dois métodos de análise apresentaram valores superiores de acurácia a depender da forma de validação. MenosA seleção genômica ampla (GWS) consiste na utilização simultânea de centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores. Este trabalho teve por objetivo avaliar a acurácia ao se aplicar diferentes métodos estatísticos de seleção genômica (RR-BLUP e BLASSO) e diferentes formas de validação. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação contendo 100 marcas bi-alélicas e co-dominantes por grupo, totalizando 1010 marcadores apresentando intervalos entre marcas adjacentes equidistantes. Esses genomas foram utilizados para a geração da população simulada de famílias de meios-irmãos com 1.000 indivíduos. As diferentes características quantitativas, uniformes e binomiais, de herdabilidade 0,40, foram avaliadas. Para um tipo de validação criou-se uma população de validação independente com 1000 indivíduos e para outro tipo, aplicou-se a validação cruzada de Jacknife, usando a mesma população para estimação e validação. Os programas estatísticos utilizados foram GENES, SELEGEN GENÔMICA e R. As acurácias apresentaram valores entre 0,55 e 0,92. De forma geral, a validação feita através da população independente apresentou valores mais elevados de acurácia. Para famílias de meios-irmãos e com distribuição binomial dos efeitos genéticos, o método BLASSO foi ligeiramente superior ao RR-BLUP. Para a distribuição uniforme, os dois m... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análise genômica. |
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Thesagro: |
Genética; Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/74155/1/2012-M.Deon-RAgrotec-Metodos.pdf
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Marc: |
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520 $aA seleção genômica ampla (GWS) consiste na utilização simultânea de centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores. Este trabalho teve por objetivo avaliar a acurácia ao se aplicar diferentes métodos estatísticos de seleção genômica (RR-BLUP e BLASSO) e diferentes formas de validação. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação contendo 100 marcas bi-alélicas e co-dominantes por grupo, totalizando 1010 marcadores apresentando intervalos entre marcas adjacentes equidistantes. Esses genomas foram utilizados para a geração da população simulada de famílias de meios-irmãos com 1.000 indivíduos. As diferentes características quantitativas, uniformes e binomiais, de herdabilidade 0,40, foram avaliadas. Para um tipo de validação criou-se uma população de validação independente com 1000 indivíduos e para outro tipo, aplicou-se a validação cruzada de Jacknife, usando a mesma população para estimação e validação. Os programas estatísticos utilizados foram GENES, SELEGEN GENÔMICA e R. As acurácias apresentaram valores entre 0,55 e 0,92. De forma geral, a validação feita através da população independente apresentou valores mais elevados de acurácia. Para famílias de meios-irmãos e com distribuição binomial dos efeitos genéticos, o método BLASSO foi ligeiramente superior ao RR-BLUP. Para a distribuição uniforme, os dois métodos de análise apresentaram valores superiores de acurácia a depender da forma de validação.
650 $aGenética
650 $aMarcador Molecular
653 $aAnálise genômica
700 1 $aCRUZ, C. D.
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aALMEIDA, R. V. de
773 $tRevista Agrotecnologia, Anápolis$gv. 3, n. 2, 2012.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 65 | |
| 6. |  | BORGHI, E.; AVANZI, J. C.; BORTOLON, L.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BORTOLON, E. S. O. Adoption and use of precision agriculture in Brazil: perception of growers and service dealership. Journal of Agricultural Science, Cambridge, v. 8, n. 11, p. 89-104, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 9. | | BORTOLON, L.; BORGHI, E.; BORTOLON, E. S.; CAMARGO, F. P. de. LPF: lavoura como alternativa na recuperação de pastagens. In: SIMPÓSIO DE PECUÁRIA INTEGRADA, 2., 2018, Sinop. Recuperação de pastagens: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 203-239. Editores técnicos: Dalton Henrique Pereira, Bruno Carneiro e Pedreira.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 14. | | BORTOLON, L.; BORTOLON, E. S. O.; GIANELLO, C.; NICOLODI, M.; ROGERI, D. A. Possibilidades para aumentar a eficiência do uso do fósforo na agricultura e a proteção ambiental. Revista Plantio Direto, Passo Fundo, v. 27, n. 157, p. 33-40, maio/jun. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 15. | | BORTOLON, L.; BORTOLON, E. S. O.; CAMARGO, F. P. de; BORGHI, E.; SILVA, R. R. da; FIDELIS, R. R. Integração lavoura-pecuária: manejo ante seca e para recuperar áreas. A Granja, Porto Alegre, v. 72, n. 812, p. 44-46, ago. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 16. | | BORGHI, E.; AVANZI, J. C.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BORTOLON, L.; BORTOLON, E. S. O.; INAMASU, R. Y. Avaliação do padrão tecnológico e tendências da agricultura de precisão - safra 2011/12. In: BERNARDI, A. C. de C.; NAIME, J. de M.; RESENDE, A. V. de; BASSOI, L. H.; INAMASU, R. Y. (Ed.). Agricultura de precisão: resultados de um novo olhar. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 578-584.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 17. | | BORGHI, E.; INAMASU, R. Y.; AVANZI, J. C.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BORTOLON, L.; BORTOLON, E. S. O. Avaliação do padrão tecnológico e tendências da Agricultura de Precisão - Safra 2011/12. In: BERNARDI, A. C. de C.; NAIME, J. de M.; RESENDE, A. V. de; BASSOI, L. H.; INAMASU, R. Y. (Ed.). Agricultura de precisão: resultados de um novo olhar. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 578-584.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | VIANA, J. H. M.; DONAGEMMA, G. K.; FONTANA, A.; AVANZI, J. C.; BORTOLON, E. S. O.; BORTOLON, L. Fracionamento da areia na distinção de solos arenosos de Guaraí-TO. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SOLOS ARENOSOS, 1., 2014, Presidente Prudente. [Anais...]. Presidente Prudente: Universidade do Oeste Paulista, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Solos. |
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| 19. | | VIANA, J. H. M.; DONAGEMMA, G. K.; FONTANA, A.; AVANZI, J. C.; BORTOLON, E. S. O.; BORTOLON, L. Fracionamento da Areia na distinção de solos arenosos de Guaraí-TO. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SOLOS ARENOSOS, 1., 2014, Presidente Prudente, SP. [Anais...]. Presidente Prudente, SP: Universidade do Oeste Paulista, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 20. | | BORGHI, E.; BORTOLON, L.; BORTOLON, E. S. O.; AVANZI, J. C.; CAMPOS, L. J. M.; CORREA, L. V. T. Cultivo do milho segunda safra e sorgo no Estado do Tocantins: situação atual e demandas de pesquisa. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Soja. |
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