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41. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | DROVAL, A. A.; BINNECK, E.; MARIN, S. R. R.; PAIÃO, F. G.; OBA, A.; NEPOMUCENO, A. L.; SHIMOKOMAKI, M. A new single nucleotide polymorphism in the ryanodine gene of chicken skeletal muscle. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 11, n. 2, p. 821-829, 2012. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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42. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BARBOSA, E. G. G.; IWATA, M.; SILLA, P. R.; ALMEIDA, A. M. R.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E. Sintenia de duas regiões genômicas da soja contendo genes de resistência à ferrugem-asiática com outras plantas modelo. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 37-41. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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43. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C.; BINNECK, E.; ALMEIDA, A. M. Soybean drought tolerance and asian rust resistance: searching for solutions in Brazil. Journal of Basic & Applied Genetics, Buenos Aires, v. 18, p. S-65, Sept. 2007. Resumo apresentado no XXXVI Congreso Argentino de Genetica, 2007, Buenos Aires. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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44. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SOSA-GÓMEZ, D. R.; SILVA, J. J. da; COSTA, F.; BINNECK, E.; MARIN, S. R. R.; NEPOMUCENO, A. L. Population structure of the Brazilian southern green stink bug, Nezara viridula. Journal of Insect Science, 5, n. 23, p. 1-14, Oct. 2005. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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45. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | TURCHETTO, C.; GONZÁLES, H. H. S.; FERREIRA, J. R.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; NHANI JUNIOR, A.; BINNECK, E. Prospecção de genes relacionados à interação de Magnaporthe oryzae com trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 7., 2015, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2015. Pós-Graduação. p. 45. Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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46. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SOSA-GOMEZ, D. R.; HUMBER, R. A.; HODGE, K. T.; BINNECK, E.; SILVA-BRANDÃO, K. L. da. Variability of the mitochondrial SSU rDNA of Nomuraea species and other entomopathogenic fungi from Hypocreales. Mycopathologia, Netherlands, v. 167, n. 3, p. 145-154, mar. 2009. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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47. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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48. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BINNECK, E.; IWATA, M.; SANTOS, L. G. A. dos; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. VSQUAL: a visual system to assist DNA sequencing quality control. In: SIMPOSIO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA REDBIO-ARGENTINA, 7.; CONGRESO INTERNACIONAL-REDBIO-ARGENTINA, 2., 2009, Rosario. La biotecnologia y los futuros escenarios mundiales: [resumenes]. Rosario: INTA, 2009. p. 59. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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49. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da expressão de fatores de transcrição relacionados com tolerância à seca, em soja, através da técnica de PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 245. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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50. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BRITO JÚNIOR, S. L.; MARCELINO, F. C.; POLIZEL, A. L.; STOLF, R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; BORÉM, A.; ABDELNOOR, R. V. Análise da expressão de genes relacionados a estresses em soja em resposta ao fungo Phakopsora pachyrhizi. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S 202, ago. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos apresentado no XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago., 2008. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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51. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MORALES, A. M. R.; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; NEPOMUCENO, A. L.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E. Análise dos genes expressos em raízes de soja submetidas a déficit hídrico. In: SIMPOSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIFIL, 12., 2004, Londrina. Resumos... Londrina: UniFil, 2004. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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52. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | VITORINO, J. C.; BARBOSA, E. G. G.; IWATA, M.; SILLA, P. R.; SARAIVA, O. F.; FRANCHINI, J. C.; GONÇALVES, S. L.; BINNECK, E. Base de dados sobre a dinâmica de decomposição de resíduos vegetais em sistemas de manejo do solo. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 175-179. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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53. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MARTINS, P. K.; JORDÃO, B. Q.; BRETON, M. C.; PEDROSO, J. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; OYA, T.; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação dos efeitos do déficit hídrico na expressão gênica em raízes de soja [Glycine max (l.) Merrill] In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 48., 2002, Águas de Lindóia. A genética na inclusão social: resumos. Águas de Lindóia: SBG, 2002. 1 CD-ROM. Resumo Área MG pdf.091. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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54. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | LEMOS, N. G.; MOLINA, J. C.; STOLF, R.; MORALES, A. M. R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E, FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Expressão de aquaporinas e outros genes em raízes de soja sob condições de deficiência hídrica. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 069. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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55. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BRETON, M. N.; RUAS, C. F.; NEUMAIER, N.; MARTINS, P. K.; PEDROSO, J. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Expressão diferencial de genes em plantas de soja [Glycine max (L.) Merrill] submetidas a dois fotoperíodos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 2.; MERCOSOJA 2002, 2002, Foz do Iguaçu. Perspectivas do agronegócio da soja: resumos. Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 19. (Embrapa Soja. Documentos, 181). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann-Campo. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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56. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; MORALES, A. M.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Expressão gênica em raízes de soja durante o déficit hídrico. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 068. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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57. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Expression analysis of transcription factors involved in drought tolerance in soybean roots. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 160. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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58. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | KIDO, E. A.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; BINNECK, E.; SILVA, M. da; SILVA JUNIOR, W. da; BENKO-ISEPPON, A. M. Explore the RNA-sequencing and the next-generation sequencing in crops responding to abiotic stress. In: SHARMA, P.; YADAV, D.; GAUR, R. K. (ed.). Bioinformatics in Agriculture: Next Generation Sequencing Era. [S. l.]: Elsevier Academic Press, c2022. CHAP. 10, p. 161-175. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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59. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação de um método de determinação do número de cópias de transgenes no genoma da soja por quantificação relativa por QPCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 100, trab. 168. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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60. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | PASSIANOTTO, A. L. de L.; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação do sistema de genotipagem molecular de cultivares de soja via sequenciador automático com marcadores microssatélites. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 209-213. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
18/06/2012 |
Data da última atualização: |
13/07/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 2 |
Autoria: |
NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. |
Afiliação: |
LEANDRO COSTA DO NASCIMENTO, UNICAMP; GUSTAVO GILSON LACERDA COSTA, UNICAMP; ELISEU BINNECK, CNPSO; GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES PEREIRA, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP. |
Título: |
A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive cDNA libraries), as well as web interfaces to access information about soybean gene annotation and expression. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Expressão genética. |
Thesagro: |
Gene; Soja. |
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Gene expression; Genes; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61065/1/gmb.web-based.v35n1s.203-211.2012.pdf
|
Marc: |
LEADER 01639naa a2200265 a 4500 001 1926586 005 2017-07-13 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aNASCIMENTO, L. C. do 245 $aA web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project$bdatabases and pipelines. 260 $c2012 520 $aThe Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive cDNA libraries), as well as web interfaces to access information about soybean gene annotation and expression. 650 $aBioinformatics 650 $aGene expression 650 $aGenes 650 $aSoybeans 650 $aGene 650 $aSoja 653 $aBioinformática 653 $aExpressão genética 700 1 $aCOSTA, G. G. L. 700 1 $aBINNECK, E. 700 1 $aPEREIRA, G. A. G. 700 1 $aCARAZZOLLE, M. F. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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