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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
20/01/2017 |
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Data da última atualização: |
25/01/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VASCONCELOS, L. M.; BRITO, A. C.; CARMO, C. D.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
L. M. VASCONCELOS, UFRB; A. C. BRITO; C. D. CARMO, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Polymorphism of starch pathway genes in cassava. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n.4,[2016?]. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The distribution and frequency of single nucleotide polymorphisms (SNPs) can help to understand changes associated with characteristics of interest. We aimed to evaluate nucleotide diversity in six genes involved in starch biosynthesis in cassava using a panel of 96 unrelated accessions. The genes were sequenced, aligned, and used to obtain values for nucleotide diversity (?), segregating sites (?), Tajima?s D test, and neighbor-joining (NJ) clustering. On average, one SNP per 147 and 171 bp was identified in exon and intron regions, respectively. Thirteen heterozygous loci were found. Three of seven SNPs in the exon region resulted in non-synonymous replacement or four synonymous substitutions. However, no associations were noted between SNPs and root dry-matter content. The parameter ? ranged from 0.0001 (granule bound starch synthase I) to 0.0033 (?-amylase), averaging 0.0011, while ? ranged from 0.00014 (starch branching enzyme) to 0.00584 (starch synthase I), averaging 0.002353. The diversity value was typically double that of the ?. Results of the D test did not suggest any evidence of deviance of neutrality in these genes. Among the evaluated accession, 82/96 were clustered using the NJ method but without a clear separation of the root dry-matter content, root pulp coloration, and classification of the cyanogenic compound content. High variation in genes of the starch biosynthetic pathway can be used to identify associations with the functional properties of starch for the use of polymorphisms for selection purposes. MenosThe distribution and frequency of single nucleotide polymorphisms (SNPs) can help to understand changes associated with characteristics of interest. We aimed to evaluate nucleotide diversity in six genes involved in starch biosynthesis in cassava using a panel of 96 unrelated accessions. The genes were sequenced, aligned, and used to obtain values for nucleotide diversity (?), segregating sites (?), Tajima?s D test, and neighbor-joining (NJ) clustering. On average, one SNP per 147 and 171 bp was identified in exon and intron regions, respectively. Thirteen heterozygous loci were found. Three of seven SNPs in the exon region resulted in non-synonymous replacement or four synonymous substitutions. However, no associations were noted between SNPs and root dry-matter content. The parameter ? ranged from 0.0001 (granule bound starch synthase I) to 0.0033 (?-amylase), averaging 0.0011, while ? ranged from 0.00014 (starch branching enzyme) to 0.00584 (starch synthase I), averaging 0.002353. The diversity value was typically double that of the ?. Results of the D test did not suggest any evidence of deviance of neutrality in these genes. Among the evaluated accession, 82/96 were clustered using the NJ method but without a clear separation of the root dry-matter content, root pulp coloration, and classification of the cyanogenic compound content. High variation in genes of the starch biosynthetic pathway can be used to identify associations with the functional properties of starch fo... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
10/08/2011 |
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Data da última atualização: |
10/08/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CONCEIÇÃO, O. P.; RESENDE, A. V. de; MARRIEL, I. E.; FURTINI NETO, A. E.; BATISTA, R. O.; GOTT, R. M.; HICKAMNN, C. |
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Afiliação: |
OTÁVIO PRATES DA CONCEIÇÃO, BOLSISTA; ALVARO VILELA DE RESENDE, CNPMS; IVANILDO EVODIO MARRIEL, CNPMS; ANTONIO EDUARDO FURTINI NETO, UFLA; RAQUEL OLIVEIRA BATISTA, BOLSISTA; RONEY MENDES GOTT; CLERIO HICKMANN. |
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Título: |
Resposta do milho à inoculação com bactérias diazotróficas em solo de alto potencial produtivo no cerrado. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia. Solos nos biomas brasileiros: sustentabilidade e mudanças climáticas. Uberlândia: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2011. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A inoculação de bactérias diazotróficas pode ser uma alternativa para a redução do uso de fertilizantes nitrogenados no cultivo de milho. Com o objetivo de avaliar o efeito da inoculação de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio, foi realizado um experimento em condições de campo com milho em rotação à soja, na área experimental da Embrapa Milho e Sorgo. O delineamento utilizado foi o de blocos ao acaso, constituído por seis tratamentos e quatro repetições. Foram empregados dois inoculantes (inoculante comercial à base de Azospirillum brasilense e inoculante à base de Azospirillum sp. da coleção de microrganismos da Embrapa Milho e Sorgo) combinados com a aplicação ou não de 83 kg ha-1 de N em cobertura, mais um tratamento sem inoculação e sem N em cobertura e outro de adubação tradicional, com 134 kg ha-1 de N em cobertura. Na colheita, foram quantificadas a população de plantas e a produtividade de grãos. Não foram observadas diferenças estatísticas entre os tratamentos, fato atribuído à contribuição dos créditos de N do cultivo anterior com soja. Em valores absolutos, o uso de inoculantes promoveu ganhos de produtividade em relação ao tratamento sem N em cobertura. |
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Palavras-Chave: |
Crédito de nitrogênio; Fixação biológico de nitrogênio. |
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Thesagro: |
Milho; Rotação de cultura; Zea Mays. |
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Thesaurus NAL: |
Corn; Crop rotation; Nitrogen fixation. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/39567/1/Resposta-milho.pdf
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Marc: |
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300 $c1 CD-ROM.
520 $aA inoculação de bactérias diazotróficas pode ser uma alternativa para a redução do uso de fertilizantes nitrogenados no cultivo de milho. Com o objetivo de avaliar o efeito da inoculação de estirpes bacterianas fixadoras de nitrogênio, foi realizado um experimento em condições de campo com milho em rotação à soja, na área experimental da Embrapa Milho e Sorgo. O delineamento utilizado foi o de blocos ao acaso, constituído por seis tratamentos e quatro repetições. Foram empregados dois inoculantes (inoculante comercial à base de Azospirillum brasilense e inoculante à base de Azospirillum sp. da coleção de microrganismos da Embrapa Milho e Sorgo) combinados com a aplicação ou não de 83 kg ha-1 de N em cobertura, mais um tratamento sem inoculação e sem N em cobertura e outro de adubação tradicional, com 134 kg ha-1 de N em cobertura. Na colheita, foram quantificadas a população de plantas e a produtividade de grãos. Não foram observadas diferenças estatísticas entre os tratamentos, fato atribuído à contribuição dos créditos de N do cultivo anterior com soja. Em valores absolutos, o uso de inoculantes promoveu ganhos de produtividade em relação ao tratamento sem N em cobertura.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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